protein folding

Question 1

Combien de ponts disulfures dans la RNAsa A?

Answer 1

4

Question 2

Cite 2 réactifs dénaturants

Answer 2

1. Urée 8M
2. Chlorure de guanidine

Question 3

Mécanismes de dépliement des protéines par les réactifs dénaturants?

Answer 3

Compétition pour les liaisons H

Question 4

Comment démontrer que la séquence d’AA est suffisante pour générer la structure en 3D?

Answer 4

1. Dénaturer les S-S (B ME)
2. Supprimer liaisons H (Urée)
   ==> Mise à plat de la protéine
3. Dialyse de l’urée et milieu oxydant
   ==> repliement correct en 3D

Question 5

Formule de l’énergie electrostatique entre 2 ions?

Answer 5

U = q1*q2/rd

r = distance
d = constante diélectrique

Question 6

Exemple de liaison electrostatique au sein d’une protéine?

Answer 6

Liaison entre COO- de aspartate et NH3+ de lysine

Question 7

Pourquoi la force électrostatique est peu importante in vivo?

Answer 7

Parce que d = 80 dans le milieu intérieur

Question 8

4 forces pour repliement des protéines

Answer 8

1. Electrostatique
2. Liaison H
3. Van Der Waals
4. Liaisons hydrophobes (principale force)

Question 9

4 types de laisons H dans des protéines (donneur –> accepteur)

Answer 9

NH –> :O=C (carbonyl)
NH –> :N-C
OH –> :N-C
OH –> :O==C

Question 10

A quoi est dû la liaison hydrophobe?

Answer 10

A l’effort pour minimier la perte d’entropie de l’eau