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MED2020 SF3 > physiologie bactérienne > Flashcards

physiologie bactérienne Flashcards

1
Q

croissance microbienne et culture ?

A 
X = multiplication cell (pas rapport avec la taille) 
culture = le fait de fair ecroite in vitro dans des conditions physico chimique déterminer pour identification, etude du metabolise ou de leur utilisation medicale.
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2
Q

quelques termes …

A

milieu de culture = prep nutritive necessaire a la X microbienne (doit contenir les elements nutritifs idéaux et avoir des condition de croissance optimales)
bouillon de culture = milieu liquide avec bact en suspension (favorise X rapide et abondante)
inoculum = echantillon microbien inoculé
milieu synthétique = composition chimique connue et controlé afin d’étudier les exigence nutritionnelle et role de certains microbe (en théorie)
milieu complexe = en général ce qui est utilisé : contenu indéfini riche en prot, vit et mineraux utilisé dans l’espoir de favoriser la X de tout microbe potentiellement présent.
gélose = milieu solide crée par l’ajout d’agent gélifiant (agar) a un milieu liquide. les gélose sont coulé dans les boite de pétri.

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3
Q

comment transfert on des bact dun milieu liquide a gelose ?

A

par un fil a boucle : la méthode des stries (epuisement progressif) pour avoir diverse []bactérienne sur lesplaques.

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4
Q

colonies et unity forming colony?

A

colonie = croissance bactérienne sur gélose. les colonies sont faites de millier de cellule et provienne (théoriquement) d’une seule bactérie mère initiale.

en théorie, des bactérie peuvent etre rattachée ensemble et donner naissance aux colonie : on parle donc de d’unité formant colonie

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5
Q

apparence colonie ? (morpho)

A

la morpho coloniale est propre a chaque espèce sur une gélose spécifique et différente d’espèce à l’autre.

si la culture contient plusieurs espèce (culture mixte), on peut selectionner une colonie distincte (par son apparence) et la repiquer dans une 2e boite de pétri pour avoir une culture pure (une seule espèce)

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6
Q

3 choses dont les bact ont besoin pour suivivre?

A
  • source É
    phototrophe = lumière
    chimiotrophe = composé chimique
  • nutriments (source de carbone et éléctron)
  • source carbone
    autotrophe : CO2 suffit
    hétérotrophe : divers composé organique
  • source d’électron
    inorganique (lithotrophe): NH3, NO2, S, H2, Fer
    organique (organotrophe): sucres, alcool, acide
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7
Q

bact vs humain ?

A

métabolisme 10-100X + vite (division en 20 min possible)
substrat nutritif et energétique + varié (ex. pétrole)
certaines fonctionne sans O2 ou dans des condition extrèmes.

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8
Q

milieu synthétique ?

A

composition connue et controlée (precise)

but ? etudier le role dunc omposé precis sur la croissance

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9
Q

milieu de culture complexe ?

A

composition chimique non rigoureusement déterminé

but ? favoriser la croissance de tout organisme présent ou d’exigence nutritionnelle fastidieuse.

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10
Q

agar ?

A

AGENT ajouté aux bouillon pour faire gélose (gélifiant solide jusqua 45 degré)

la culture sur gélose permet d’obtenir des colonies pure ou isolée.

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11
Q

gélose chocolaté ?

A

ajout de sang cuit qui libère de l’hémoglobine qui est un facteur de X, par exemple pour haemophilus

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12
Q

milieu enrichi ?

A

gelose additionné de produit (sang, prot, vit) afin de favoriser la X de microbe ayant des besoin nutritif complexes ou particuliers.
ex. gelose chocolat

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13
Q

milieu selectif?

A

ajout d’inhibiteurs de croissance pour inhiber les bactéries non désrié et favoriser la croissance de bactérie recherchée. inhibiteur = atb, sel, composé chimique

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14
Q

milieu différentiel ?

A

addition d’élément (sucre, indicateur ph, sang) pour différencier les colonies et espèces apparentées.

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15
Q

combinaison de milieu?

A

un milieu peut etre a la fois enrichi +/- selectif +/- différentiel
ex. gelose chapman : sert a isolé le staph: mannitol (différentiel car vérifie la fermentation du mannitol en produit acide grace a un indicateur de ph et aussi selectif car le nacl inhibe la croissance d’autre bact sauf staph qui croit jusqua 7.5% NaCl.) selectif pour staph et différenciel entre staph

ex. gélose MacConkey : inhibe les gram+ par addition de sels billiaire et cristal violet (selectif) mais différencier aussi les coliforme gram - selon leur capacité ou non de fermenté le lactose.
ex. gelose eosine bleu de méthylène : selecti fpour les entérobactérie et différentiel pour la fermentation du glucose.

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16
Q

milieu de transpot ?

A

milieu suffisament pauvre pour inhiber X mais capable de préserver contre la dessication, modification ph ou O2: tulisé quand le specimen ne p eut etre ensemencé immédiatement.

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17
Q

température optimale pour la croissance bact (réaction chimique on lieu a certaines température)

A
  • psychrophile : vivre entre -10 et 25 (optimal à 15).
    sensible chaleur : cesse de croitre dans une piece chaude. bact de fond marin ou polaire et responsable de la détérioration des aliments au frigo.
  • mesophile : entre 20-50 (optimal 37). Le groupe le + abondant. cest les bact patho ou de la flore normale constitutive.
  • thermophile : se développe a température élevée entre 50 et 80 (eau chaud dans robinet). hyperthermophile : peut se developper en haut de 100 degré.
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18
Q

condition physique a la X ?

A

temperature, O2, ph

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19
Q

ph pour X ?

A

la plupart : ph etroit proche de neutralité. peu dans des ph hors de 6.5-7.5
cest pk des aliment acide se conserve bien.
3 types bact :
acidophile 8.5

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20
Q

gaz de croissance ?

A

principaux affectant X : CO2, O2
besoin de O2 = type de mecanisme utilisé pour se procurer de l’É
metabolisme avec O2 forme des radiaux oxygéné toxique (ion superoxyde et peroxyde d’H). majorité des bact ont des enzyme pour sen débarrase (catalase et superoxyde dismutase). les anaérobes nont pas ces enzyme et l’O2 leur est donc toxique

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21
Q

aérobie stricts ?

A

O2 est essentiel comme capteur d’é et H+ dans le processus de respiratoire qui metabolise les sucre pour sen procurer l’É. sans O2 : aucun développement. possède enzyme pour détoxifier le sporudit de l’O2.

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22
Q

anaérobie facultatif

A

peuvent croitre avec ou sans O2. (tulise respi aerobie, respi anaérobie ou fermentation). X de facon optimal AVEC O2 (POSSÈde les enzyme de détox)

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23
Q

anaérobie strict

A

incapable d’utiliser ou de tolérer l’O2 (ce gaz leur est fatal). utilise le mecanisme de fermentation. nont pas les enzyme de détox.
on les trouve dans le sol ou intestin.
en labo : culture dans des chambre anaérobie et culture de transport dans des jarre anaérobie contenant un composé éliminant l’O2.

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24
Q

aérotolérant

A

sont de croissance anaérobie seulement mais leur X nest toutefois pas inhibé par O2 car ils ont au moins 1 enzyme de detox.

25
Q

microaérobie ?

A

besoin essentiel d’O2 (donc X aérobie seulement mais À FAIBLE CONCENTRATION seulement.)
DONC leur croissance nest possible que lorsque la [O2]est inférieur a la [O2 ]de l’air.

26
Q

en culture comment reconnaitre les types aerobie vs anaérobie ?

A

la croissance selon les condition d’O2 se vérifie par la répartition de la turbidité refletant la localisation des microbe (aerobie croit surface, microaérobie, legèrement sous surface, anaerobie facultatif reparti partout et anaérobie strict au fond de la gelose).

27
Q

facteur de X ?

A

métabolite essentiel dont le microbe ne peut faire la synthèse lui même (il doit se le procurer de l’extérieur)
doit etre apporter des aliments, role a nimporte quel stade du metabolisme.
ces une petite molécule relatif a un microbe donné pour un milieu spécifique.
si la X bactire ne peut etre obtenue dans une culture simple, on doit additionné la culture dun extrait complexe de facteurs de X.

28
Q

mesure de la croissance bact : méthode de dénombrement su rgélose

A

LA MÉTHODE DE QUANTIFICATION LA + COURANTE.
– denombrer les colonies sur une boite de pétrie en assumant que chacun d’elles viennent d’une CFU.

puisque l’échantillion original contient bcp de bact, on va faire une dilution en série avant de déposer sur pétri afin d’obtenir environ 50 colonie par pétrie (50 CFU)

29
Q

mesure de la croissance bact : les courbes de croissance

A

obtention de courbe croissance, décroissance quand on prélève des échantillon à différent temps
4 phases principales entrecoupé de courtes phase intermédiaire :
1. latence
– phase d’acceleration
2- croissance exponentielle
– ralentissement
3- stationnaire
4- décroissance
imp pour etude des propriété pathogène et pour industrie pharmaceutique, alimentair ee tchimique.

30
Q

phase de latence

A

periode entre ensemencement et moment ou act commence a se diviser (délai pour synthèse d’enz necessaire pour metaboliser les substrats)

31
Q

phase acceleration (intermediaire)

A

bact se divise a une vitesse croissante

32
Q

phase de croissance exponentielle

A

croissance a vitesse otpimale : prod d’É, de prot et de produitde fermentation est maximale et la vitesse de division cell est minimale
* dans les différentes industrie, les bact sont souvent maintenus dans cette phase par la mise en place de condition ouvert càd lajout de milieu frais et l’extraction en continu de produits obtenus.
PÉRIODE DE SÉCRÉTION D’EXTOTOXINE (GRAM+)

si milieu fermé = courte durée

33
Q

phase de ralentissement (interm)

A

element commence a manquer et la prod dechet commence a affecter les microbes. vitesse de X nes tplus maximale, mais encore très efficace.

34
Q

phase stationnaire

A

densité maximale de la culture est atteinte.
équilibre entre nb bactérie formé et celles qui meurent.
les dechet deviennent toxique pour les cell viable : les bact uqi peuvent sporuler le font
PHASE DE SPORULATION !!!

35
Q

phase de décroissance

A

nb cell viable decroit de facon exponentielle.
phase de RELACHEMENT DES ENDOTOXINE (dans la paroi des gram -) lorsque les cell meurent.
finalité de la phase = mort dans toute la fiole de culture (en circuit fermé)

36
Q

mtabolisme ?

A

ensemble des transformation des composés biochimiques de la cell

les réaction métaboliques de bases fondamentales osnt assez similaire chez procaryote et eucaryotes mais DIFFÈRE en ce qui a trait a la diversité : + diversifé chez les procaryotes pour : les substrats utilisés comme nutriment, les source d’É et la capacité à fonctionner en absence d’O2.

37
Q

différence eucaryote/procaryote pour metabolisme ?

A

procaryote + diversifié.
eucaryote = respiration dans les mictochondrie alors que le sprocessus respiratoire chez les procaryotes a lieu le long des membranes cytoplasmiques (car procaryote nont pas de mitochondrie).

38
Q

respiration aérobie ?

A

sucre résulte en de l’É (ATP), H2O et CO2 et utilise l’O2 comme accepteur finale d’é dans la chaine de transfert (ou chaine respiratoire)
produit bcp d’É!

  • la glycolyse est similaire en mode aérobie ou fermentaire.
39
Q

voie des penthose phosphate ?

A

voie utilisée par bcp de bact en plus de la glycolye pour oxyder le glucose.

40
Q

cycle de krebs?

A

fournaise qui brule le sucre en le degradant en CO2.
acetyl coa = seul produit qui entre dans le cycle.
reaction de décarboxylation et et oxydoreduction

exisite chez bact aérobie et eucaryote.
au terme : CO2 formé avec atp, nadh et fadh2

41
Q

3 transporteur de la chaine respiratoire ?

A
  • flavine (B2)
  • cytochrome
  • ubiquinones
42
Q

chaine respi?

A

respiration = longue série de réaction doxydoreduction = processus de deplacement d’É avec comme point de depart le glucose et arrivé des molécule pauvre en É. (aérobie = molécule H2O et CO2)

43
Q

phopshorylation ?

A

formation d’atp par ajonction dun phosphate a un adp avec accumulation d’É dans ce lien moléculaire

’’ oxydation ‘’ si reaction a lieu lors de transfert d’É sur chaine de transporteur d’é.
‘’ au niveau du substrat ‘’ = transfert direct dun PO4 d’un composé phosphorylé à un autre (fournir atp rapidement sans besoin d’O2)

44
Q

respiration anaéobique

A

une partie du cycle de krebs est en anarébiose et seulement QUELQUES transporteur participent a la chiane de transport d’é (accepteur finale est des composé inorganique simple variable)
donc LA QTE D’ATP PRODUIT EST TOUJOURS MOINDRE QUE CELLE PRODUIT PAR LES AÉROBIE.
en conséquence, les anaérobies croissent moins vite.
ex. anaérobie facultatif : altère entre repsi aerobie et anaérobie : altère entre grand prod atp et croissance rapide et petit prod et croissante lente.

45
Q

ex d,accepteur finale d’é anaérobique ?

A

ion nitrate
ion sulftate (ces 2 sont imp dans les cycle de lazote et du souffre naturel)
ion carbonate

46
Q

aérobie en bref ?

A

destruction lien C-C et C-H quand glucose dégradé en CO2 fournit É sotcké en ATP.

  • les donneur d’é les + imp sont les atome H+ de molécule organique (souvent le proton H+ est transféré en meme temps qu’un é)

glycolyse donne 2 atp, des é, H+ et pyruvates. prise en charge par fad, nad dans cycle de krebs (donne des co2) et ensuite va dans chaine respiratoire (transporteur é et cytochrome) finit par donner h2o / CO2 (exhalé) et 34 atp.

47
Q

respiration anaérobie ?

A

certain microbe speuvnet utilisé un composé inorganique comme accepteur finale dans la chaine respiratoire anaérobique.
processus différent de la fermentation.
encore glycolyse, cycle kreb et chaine de transport é mais a la fin : accepteur final = composé inorg oxydé recoit H+et devient réduit.
produit moins d’atp que aerobie (seuls quelques transporteur seul efficace) environ 28 ATP

48
Q

fermentation ?

A

PAS DE CYCLE DE KREBS ET PAS DE CHAINE RESPIRATOIRE : glucose - glycolyse (pyruvate) – composé organique carboné relaché dans le milieu.
forme vrm moins atp (environ 2). pas de cycle de krebs, accepteu rfinal des é est un composé ORGANIQUE.
la NADH est réoxydé en cedant ses é à un composé organique relaché dans l’environnement.

49
Q

o2 et fermentation ?

A

certain microbe ne font que fermentation, dautre ferme t respi.
O2 non necessaire (ne l’empeche pas necessairement, mais ne lui est pas necessaire)

donc la glycolyse a leiu comme dans respi (forme du pyruvate) mais le catabolisme pyruvate ne donne pas des CO2 mais plutot arrete précocement et donne des produits intermédiaire excrété appelé ‘’ produit de fermentation ‘’ spécifique a chaque cellule.

accepteur final d’é = molécule organique SYNTHÉTISÉ DANS LA CELLULE (peut etre le pyruvate lui meme ou autre)

50
Q

produit de fermentation ?

A

dependent de la nature du microorg, du subtrat et des enzymes dans le microbe dispose.
lanalyse du produit chimique finale est utile pour identifier le microbe qui en est la cause. cest dailleur utiliser pour des test de dx (identification biochimique au lab)

inconvéninent ferm ? peu d’atp produit donc besoin de bcp de sucre au depart pour former de sproduit de fermentation
avantage = obtenir ces composé biologique utils dans industrie agroalimentaire, pharmaceutique ou chimiques qui forme une gamme de produit interessant.

51
Q

ex de type de fermentation ?

A

alcoolique, homolactique (fromage yogourt), hétérolactique(kefir, altération vin, biere), propionique (fromage pate cuite), acides mixte, acetonobutylique ou butyrique (boite de conserve avariée)

52
Q

microbiologiqu eindustrielle actuelle ?

A

basé sur la technologique pour mettre au point des atb.

53
Q

biotechnologiqe ?

A

methode de fabrication d’organisme modifié a laide de la méthode l’adn recombinant.
ex. mis au point de biocapteur qui detecte la pollution

54
Q

la fabrication industrielle de produit microbien repose sur….

A

la fermentation (fermentation industrielle = culture de grande qte de microorgpour produire une substance d’interet commerciale)
ex. insuline, H de X humiane car a des organisme genetiquement modifié (biotechnologie)
cell animal forme des anticorps clonaux

55
Q

produit industriel de la microbiologie ?

A 
aa
acide citrique
enzymes 
vitamine
gomme de xanthane
atb (cest grace a la prod d'atb que la microbio moderne a pris son essor)
vaccin 
hormone (stéroide)
56
Q

def bioréacteur ?

A

bioréacteur = les cuves utilisé pour la fermentation industrielle.

facteur a considérer dans les cuves : aération, ph et température
ex. appareils a brassage continu
rpdouction par lot = produit de ferm receuillit apres la fermentation
production a écoulement continune = milieu perpetuellement alimenté en substrat et on retire encontinu le milieu épuisé de meme que le produit rechercé

permet davoir des metabolite primaire (ex. ethanol ou secondaire (ex. peniciline)

57
Q

metabolite primaire ?

A

se forme au moment ou les cellules se divise donc pendant la phase de corissance exponentielle (les 2 courbes de pro et de x sont parallèle)

58
Q

metabolite secondaire ?

A

sont produit par les microorg APRÈS avoir terminé leur phase de croissance exponentielle et lorsqu’elles entrent dans la phase stationnaire.

MED2020 SF3 (10 decks)

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