monde microbien

Question 1

def microorganisme ?

Answer 1

terme large désignant : bact, virus, mycète, protozoaire.

• tres petit taille (microscope)
• omnipresent et abondant dans nature
• unicellulaire (sauf mycete qui inclut des pluri)
• eucaryote et procaryote
• niveau d’organisation relativement simple
• sauf virus : disposent dun potentiel métabolique
• sauf virus : capable de se reproduire de facon autonome

Question 2

les 3 domaines ?

Answer 2

procaryote = procaryote : cell simple sans membrane nucléaire (donc sans noyau) avec un chromosome libre (souvent des batéries) 
archéobactérie = procaryote : bactérie possédant des caractéristique particuliere qui leur permet de survivre dans des condition extrème (halophile ; salée, thermophile ; chaud et acide et méthanogène). ont des processus metabolique exceptionnel 
eucaryote = complexe et possède un noyau avec plusieurs chromosone. uni ou + souvent pluri cell. humain, animal, vegetale, microorg complexe.

Question 3

taxonomie ?

Answer 3

domaine - regne (non definit pour bact et arché. eucaryote = protiste, vegetaux, animaux, mycète) - embranchement - classe - ordre - famille - genre - espèce

Question 4

nommer une bact ?

Answer 4

binomiale : Genre (nom) + espèce (adjectif)

Question 5

définition de souche ?

Answer 5

désigne chaque isolat en culture soit, chaque ensemble de cellule fille descendant toutes d’une même cellule mère.

dans une culture pure d’une seulebactérie, toutes les espèce ne sont pas identiques : il y a différente souches.

Question 6

critère génotypique vs phénotypique

Answer 6

génotypique = désigne les caractéristique génétiques des microbes (ex. diff dans séquence nucléotidique)

phenotypique = désigne les attributs découlant du génome (morphologique, biochimique, physiologique etc)

Question 7

ou se situent les virus ?

Answer 7

aucun des 3 domaines.
ils sontt des agents infectieux acellulaire non vivant (de meme pour les prions (patho neurologique protéique) et les viroïdes (pour plante))

• absence d’organisation cellulaire et de capacité de reproduction autonome

microscopie elecronique, adn ou arn. parasite obligatoire : injecte leur matériel génétique, déternourne la machinerie cell a leur prodit, font des composante virales et les virions sortent au coup de la mort de la cell hote.

Question 8

classifier vs identifier ?

Answer 8

• classifier -= taxonomie des microbes
• ientifier = necessiter de savoir auquel on a affaire.

on utilise des outils :
morpholie, serologie, biochimie, génétique

Question 9

etre humain fait de…

Answer 9

10 a la 13 cell

10 a la 14 microorg

Question 10

bact ?

Answer 10

procaryote (pas de noyau) unicellulaire, 1 chromosome avec adn et arn. 1 um par 5 um. visible en microscopie optique. peuvent vivre a lext ou int. se developpe de facon autonome et division binaire. cultivable (sauf certaine qui sont des parasite intracell obligatoire)

Question 11

mycète ?

Answer 11

champignon, + complexe, eucaryote. saprophyte (tire É des matière en décomposition sans necessairement etre pathogène).
deux type :
- levure : unicell, reproduction par bourgeonnement : place industrie et revalorisation de dechet. parfois pathogène.
- moissisure : champi multicellulaire. détériore aliment, parfois toxique, largement utile en industrie.

Question 12

protozoaire ?

Answer 12

variété d’organisme micro ou macro qui induisent des infection (micro) et infestation (macro)
zoonose, helminthe, protozoaire.

protozoaire = eucaryote unicell qui causent infection, entité autonome oou parasitaire, cycle de vie complexe avec plusieurs espèce.

Question 13

def enveloppe ?

Answer 13

différente structure qui entoure les bact :

membrane cytoplasmique - paroi - capsule ou glycocalyx

Question 14

membrane cytoplasmique ?

Answer 14

structure mince, souple et resistante sous la paroi qui retient le cytoplasme. faite de biocouche lipique et protéine mobile qui assurent la penentration selective et régulation de transport.

Question 15

action peniciline ?

Answer 15

agit su rla peptidoglycan dans la paroi (pas de peptidoglycan chez H) en liant des protéine liant la péniciline. il faut que l’atb ai acc;ès au peptydoglycan pour etre efficace.

Question 16

paroi ?

Answer 16

enveloppe semi rigique qui donne la forme a la bactérie.
deux type avec constituant commun = peptidoglycan
Gram + = épais peptido
gram - = mince peptido recouvert d’une enveloppe externe faite de LPS (endotoxine : antigène O) qui aide a la protection de la bactérie

Question 17

antigène O?

Answer 17

’’ endotoxine ‘’ = lipopolysacc de l’enveloppe externe de la paroi des grams -

Question 18

capsule ?

Answer 18

enveloppe visqueuse variable chez CERTAINES bactérie. (partie la + externe)
non indispensable a la survie mais confère une pouvoir pathogène et virulent en diminuant la phagocytose (augment el’adhérence)
cest l’antigene K
non visible avec coloration usuelle : on melange suspension bact avec encre de chine et la capsule crée un halo autour.
faite de polysacc.

les pneumoccoque ont 83 variante capsulaires.

Question 19

glycocalyx ?

Answer 19

pratiquement comme la capsule (feutrage polysaccharidique extracell) a la surface de certaines bact dans leur milieu naaturel qui permet de relié les bactéries entre elles et favoriser l’adhésion À DES MATÉRIAUX.

glycocalyx = bact reliée entre elle dans cette matrice extracell
capsule = polysaccharide sont confinés à des bactéries individuelles. 

’’ biofilm’’ agglutinant

Question 20

constituant interne ?

Answer 20

cytoplasme liquide aqueux qui contient un nombre de substance dissoute.
appareil nucléaire :
- ribosome: 30 et 50 s = cible ATB car plus petiti que ceux humain
- chromosome libre : 1000 x plus long que la bactérie, contient l’info essentielle
- plasmide : petite molécule d’adn extra-chromosomique circulaire douées de replication autonome, transférable d’un microbe à l’autre. code pour des gene de propriété faciliant la survie incluant des gènes de résistance et propriété pathogène (entérotoxine)

Question 21

les appendices externes ?

Answer 21

element facultatif chez les bactéries ;
- flagelle : assurent la motilité, visible avec coloration spéciale. antigénique : ANTIGÈNE H.
monotriche = 1 a une extrémité
lophotriche = plusieur à 1 extrémité
amphitriche = 1 ou + aux 2 extrémité
péritriche = flagelle sur toute la cellule.
* varie selon les genres

• pili (bcp de grasm - en ont). plus court que flagelle
  régulier = sert à ancrer la bactérie, appelé fimbriae
  sexuel = sert a la conjugaison (transfert unilatéral de matériel génétique qui contribue a la dissémination de gène de résistance par le transfert de plasmide. peu nombreux

Question 22

les spores (endospores)?

Answer 22

gram + bacillus et clostridium ont cette capacité :
si condition défavorable = sporulation : stocker element vitaux dans spores : survie pour de longue année sans eau/nourriture et condition extrème.
condition redeviennet favorable : germination : bactérie reprendre sa forme végétative active.

seul forme active = pathogène mais souvent forme sporulée qui est contractée

spore bact (survie) ne pas confondre avec spore de mycète (reproduction)

important dans ; gangrène gazeuse, tétanos, botulisme, athrax.

volume et position = propriété constante des ESPÈCE (aide à l’identitifcation)

Question 23

les antigènes?

Answer 23

K = capsule 
O = endotoxine (dans enveloppe des gram - faite de LPS) 
H= flagelle (motilité)

Question 24

composante obligatoire/facultative ?

Answer 24

obligatoire : membrane plasmatique, paroi cellulaire, cytoplasme,chromosome, ribosome

facultative = capsule, endotoxine, plasmide, flagelle, pili, spore

Question 25

morphologie bactérienne ?

Answer 25

forme : batonnet, shpère, entre-deux, virgule, spirale, variable arrangement spatial : isolé, paires, chianette, paquet organisé en cube, amas désorganisé

Question 26

morphologie coloniale (enc ulture)?

Answer 26

apparence coloniale = typique de l'espèce. pigmentation, opacité, surface, borudure, élévation, forme

Question 27

coloration simple ?

Answer 27

colorant basique qui fait ressortir la cell entière. parfois mordant ajouté = intensifie couleur

Question 28

coloration différentielle : coloration de gram ?

Answer 28

1. colorant cristal violet avec iode comme modrant = tout bact l'asborbe et sont mauve 2. lavage avec de l'éethanol = les gram - sont lavé (transparente) et les gram + garde le cristal violet (sont mauve) 3. contre colorant : safranine (rose) : les gram + qui ont été décoloré l'absorbe, les gram - reste mauve. * ziehl nielsen pour les mycobactérie.

Question 29

coloration de structuree spécifiques ?

Answer 29

- capsule (coloration négative) - endospore - flagelle

Question 30

microscopie optique...

Answer 30

- fond clair = usuelle - fond noir = microbe apparait noire sur fond clair sans coloration - microscopie a contraste de phase = augmente le contraste entre structure d'épaisseurs variable non colorée. permet dexaminer les structure interne sans les abimé par coloration - a inversion : étudier le comportement de cellules face a divers stimuli - a fluorescence ; marqueur fluorochrome souvent couplé a un ac = immunofluorescence.

Question 31

microscopie confocale ?

Answer 31

utilise fluorochrome + lase : travsere par plan successif et reconstitue les image en 3d ; étude de bact vivant sur de longue periode sur différent plan avec une clarté 40% meilleur que optique.

Question 32

microscopie electronique ?

Answer 32

utilise un faisceaux d'éléctron. utilité ? grossir beaucoup le spécimen a observer (ex. utile pour le virus) à transmission = image 2d àbalayge = image 3d

Question 33

microscope a effet tunnel ?

Answer 33

taille des atome visible.

Question 34

test biochimiques ?

Answer 34

permet didentifier les bactéries une fois leur croissance obtenue en culture pure en exploitantdes propriété bactériennes : anaérobiose ou aérobiose, fermentation, produit terminaux du métabolisme, tolérance au inhibiteur ou ATB, source de carbone etc. galerie API = puit avec plusieurs substrat déshydraté dans lesquels ont rajoute des gouttes de l'échantillon qui donne des couleur caractéristique de certaine sespèce. maintenant : microscan = 96 puits avec divers réactifs colorimétrique avec analyse par ordi. le résultat final = 8 chiffre qui correspond a un genre et une espèce bactérienne . certaine rangé permet de déterminer le degré de sensibilité à un ATB

Question 35

les test sérologiques?

Answer 35

- test d'agglutination sur lame : anti sérum ajouter a des échantillon de bactérie inconnue. il y a agglutination si la bactérie corresponds aux anticorps dun sérum particulier. + précis que les test biochimique car permet de distinguer différentes souches (distinguer les serotype) - méthode élisa = dans des puits : mettre un ac ou un ag. on peut donc détecter le virus1bact présente dans le sang (ag) ou bien des ac qui sont produit par l'humain pour combattre le microbe (ac). on ajoute ensuite un agent révélateur (autre ac ou ag maruqé avec un fluorescent). elisa peut etre qualitatif ou quantitatif, direct ou indiret. la lecture finale est fait avec un lecteur de fluorescence ou spectomètre.

Question 36

les approche phénotypique ?

Answer 36

``` MORPHOLOGIE : - morphologie bactérienne - morphologie coloniale TEST COLORIMÉTRIQUES - simple - différentielle - structure spécifique OBSERVATION MICROSCOPIE (optique, confocale, electronique, a force atomique et à sonde effet tunnel) TESTS BIOCHIMIQUE TESTS SÉROLOGIQUE ```

Question 37

les approche génotypiques?

Answer 37

SÉQUENCAGE DE L'ADN : 1-5 million de nucléotide a séquencer/bactérie. on veut identifier pour chaque espece des séance d'adn qui lui sont propres afin de développer des sondes capable de reconnaitre ces sections et detecter la présence dun microbe en particulier dans un échantillon. DIAGNOSTIC MOLÉCULAIRE : une fois les section propre aux microbe identifié, on fabrique des sondes pour détecter cette espèce via des ocurts segment adn complémentaire '' oligonucléotide''. utilise des amplificateur de séquence dans lesquels agit une polymérase : TECHNIQUE PCR.

Question 38

trousse actuelle pour la détection dun microbe unique ?

Answer 38

5 microbe (5 trousse) ; - strep B chez femme enceinte et enfant a la naissance - staph résistance ou non a la methiciline - clostridium difficile donnant des diarrhée dure a traiter - enterocoques résistance a la vancomycine. * maintenant : appareil revogene de dx rapide basé sur l'ADN permet d'identifier en simultané la presence d eplus d'un microbe dans un échantillon.

Question 39

virus distinction de bactérie ?

Answer 39

- très petits (microscope électronique) : acell et structure simple - adn ou arn seulement : absence de métabolisme - parasite obligatoire : pas de reproduction autonome - cycle de réplication dans l'hote : culture sur cell hote seulement, tx par antiviraux, atb inefficace. * la capside qui protège le matériel génétique peut etre hélicoïdale ou icosaédrique ou bien un mixte des 2. nucléocapside = capside + acide nucléique : il y a symétrie entre les capside pour donner les formes helicoidale ou icosaédrique certain virus peuvent etre '' enveloppé '': bicouche par dessus la capise acquise lors de la sortie de cellule hote par bourgoennement. virus nu = pas d'enveloppe

Question 40

lacide nucléique des virus ?

Answer 40

adn ou arn : - adn (simple ou double brin) - arn (rétrovirus ) : simple brin (positif ou negatif) ou double brin il injecte son matériel dans la cell hote pour se répliquer.

Question 41

enzyme du retro virus et enzyme de influenza ?

Answer 41

influenza = neuroaminidase : relargage du virus hors des cell hote. VIH (retro virus) : transcriptase inverse (retro transcrit arn viral en adn), intégrase (intègre adn viral au chromosome de l'hote), protéase (favorise la maturation de prot virale)

Question 42

mycete ?

Answer 42

peuvent produire des pseudohyphe (reproduction par bourgennement) MAIS le + souvent se reproduise par spore votalies asexuée ``` levure = colonie lisse et muqueuse moissisure = colonie chevelue et poudreuse ```