Phage MS2 Flashcards

1
Q

Quelles sont les caractéristiques principales du phage MS2 ?

A
  • Génome d’ARN sb + (comme les ARNm)
  • Infecte E. coli
  • Retrouvé dans les eaux usées et les intestins des mammifères
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2
Q

Quels sont les différents types de molécules génomiques, par rapport à la polarité ?

A

Les brins d’ADN/ARN à polarité positive contiennent des informations directement traduisibles.
Leur brin complémentaire est -

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3
Q

Expliquez la différence fondamentale entre les virus à ARN et ADN.

A

Puisque les cellules sont incapables de copier des gabarits d’ARN, les génomes de virus à ARN doivent coder pour une polymérase d’acide nucléique pour la réplication de son génome et la synthèse de son ARN.

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4
Q

Quelle est la classification du phage MS2 ?

A
  • Classe: Leviviricetes (ciblent les entérobactéries)
  • Famille : Fiersviridae
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5
Q

Décrivez la structure du virion.

A
  • Sphérique, diamètre de 26 nm
  • Symétrie icosaédrique
  • Capside composée de 180 copies de la protéine CP et 1 copie de la protéine A
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6
Q

Combien de gènes sont codés sur le génome du MS2 ? Pourquoi est-ce particulier ?

A

4 gènes (environ 3500 nt)
La quatrième protéine chevauche la protéine CP et la réplicase (cadres de lectures différents)

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7
Q

Quelles sont les protéines codées par le génome de MS2 ?

A
  • Protéine A
  • Protéine coat
  • Réplicase
  • Protéine lyse
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8
Q

Quel est l’avantage d’avoir un génome à ARN ?

A

Dès son entrée dans la cellule, l’ARN est prêt à être traduit.

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9
Q

Comment le cycle de réplication de MS2 se déroule-t-il ?

A
  • Phage se fixe à un récepteur et l’ARN viral pénètre dans la cellule
  • Protéines sont traduites
  • Génome d’ARN est répliqué
  • Assemblage et lyse
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10
Q

Comment se déroule l’attachement à la cellule et l’entrée ?

A

MS2 se lie au pilus F (organite de conjugaison) par la protéine A

Lors du contact, la protéine A est clivée et l’ARN est libéré du virion dans le cytoplasme

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11
Q

Pourquoi l’expression des gènes est-elle régulée si étroitement?

A
  1. Différentes quantités de chaque protéine sont nécessaires (180 CP vs 1 protéine A; quelques réplicases)
  2. La réplication et la traduction simultanées de la même molécule d’ARN peuvent conduire des problèmes
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12
Q

Pourquoi est-il problématique de répliquer et traduire le même brin d’ARN ?

A
  • La réplication débute à l’extrémité 3’ et la traduction débute à l’extrémité 5’ (les fourches se déplacent l’une vers l’autre)
  • La polymérase et le ribo peuvent entrer en conflit
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13
Q

Comment le virus régule-t-il la traduction et la réplication de son ADN ?

A
  • En modifiant la structure secondaire de son ARN
  • Cela limite l’accès aux sites RBS
  • La structure secondaire fait donc en sorte que le premier site de traduction est pour la protéine CP
  • Traduction des gènes lyse et réplicases débute seulement une fois qu’un ribo se lie au site RBS de la protéine CP
  • L’avancement du ribo = structure secondaire change
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14
Q

Quelles sont les composantes de la polymérase de MS2 ?

A
  • Réplicase (ARN pol ARN dépendante)
  • Protéine S1 (protéine ribo; détecte où commencer)
  • Facteurs d’élongation EF-Tu et EF-Ts (impliqués dans l’allongement des chaînes peptidiques en croissance)
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15
Q

Comment le phage passe-t-il de la traduction à la réplication ?

A
  • La polymérase se lie à l’extrémité 3’ et à 2 positions internes S et M
  • Le site chevauche le début du gène CP (on empêche le ribo de se lier)
  • La protéine (ribo ou pol) qui arrive en premier gagne.
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16
Q

Quel est le produit de la réplication ?

A

Un brin d’ARN sb - est produit. Celui-ci sert de gabarit pour fabriquer plus d’ARN sb +

17
Q

Pourquoi les brins d’ARN sb + et - ne s’hybrident-ils pas ?

A

Car les ARN sb forment des structures secondaires qui empêchent la liaison.

18
Q

Comment se déroule l’assemblage et la libération du MS2 ?

A
  • Protéine A lie l’ARN et initie le processus
  • Protéine CP s’assemblent avec l’ARN pour former des virions
  • Protéines de lyse forment des pores dans la membrane cytoplasmique et permettent aux phages de quitter.