EXAM 1 (T7 à MS2) Flashcards
T7 est lytique ou lysogénique ?
lytique
T7 infecte quelle bactérie ?
E. coli
T7 est il a ADN ou ARN ? double brin ou simple brin ?
ADN db
comme T4
Ou peut-on retrouver T7 et T4 ?
intestins des mammifères et eaux usées
Ou est surtout présent T7 ?
(on cherche où dans l’environnement)
Milieux côtiers marins.
Compost.
Sédiments
Sources hydrothermales
Au sujet de la capside de T7
De quelle forme est elle ?
De quelle protéine est elle composée ?
Icosaédrique
gp10
Au sujet de T7 :
Décrivez la structure (forme) du noyau
Cylindrique, interne
Au sujet du génome de T7, complétez la phrase :
Il occupe ___ % du volume de la tête, et est enroulé autour _____________
45% du volume, enroulé autour du noyau central
Vrai ou faux ?
Les têtes des phages T4 et T7 sont remplies du génome compacté
Faux, T7 n’a pas la tête pleine
Structure de T7 :
Identifiez ce qui est représenté en (C) sur le shéma ci contre. De quoi s’agit il ? Son rôle ?
Le portail
Un canal ouvert
Permet à l’ADN de quitter la capside
Structure de T7
Identifiez ce qui est représenté en (E) sur le shéma ci contre.
Le noyau
Au sujet de la structure de T7 :
Sa queue est elle longue ou courte?
Contractile ou non ?
Courte
Non contractile
6 fibres caudales sont attachées à la partie supérieure de la queue de T7. De quelle protéine sont elles composées ?
gp17
Les séquences de pb répétées aux extrémités du génome de T7 sont elles plus longues ou plus courtes que celles de T4 ?
Plus courtes
Vrai ou Faux
Le génome de T7 se circularise, comme celui de T4
Faux, ne se circularise pas
Au sujet des sites de restrictions du génome de T7 :
On dit que plusieurs sites de restrictions sont sous représentés.
Expliquez ?
Il devrait contenir une dizaine de sites de restriction EcoR1, mais on en retrouve aucun .
Pendant l’adsorption de T7, complétez la phrase
L’extrémité ____________ des fibres reconnait les ______ des bactéries G-
C terminale,
LPS
Lors de la phase d’adsorption et injection de T7
Trois séries de protéines sont libérées de la nucléocapside.
Que font ces séries respectives
Série 1 : formation d’un canal à travers la membrane externe
Série 2 : passe dans le canal et dégrade le peptidoglycane
Série 3 : Prolonge le canal jusqu’au cytoplasme
Différences T7 et T4 :
La queue de T4 est ________
Celle de T7 est __________
Choix : Extensible, contractile, mobile, fixe
T4 contractile
T7 extensible
Insertion du génome de T7, vrai ou faux :
Tout le génome viral pénètre dans la cellule après la formation du canal
Faux, seulement 850pb
Insertion du génome de T7
Que contient la section de 850pb du génome de T7 injectée initialement dans la cellule ?
Quel est le rôle ? Particularités ?
Des promoteurs forts reconnus par ARNpol de l’hote.
-Ils rendent la transcription virale prioritaire
-Sont présents dans la cellule mais seulement en cas d’urgence, inhibés en temps normal
Différence T7 VS T4 , vrai ou faux
T4 et T7 modifient l’ARNpol cellulaire
Faux, chez T7 une ARNpol virale est synthétisée
Transcription de T7
Dans quel(s) sens se fait la transcription ?
Toujours de gauche à droite
Trois classes de gènes de T7
Les gènes de classe 1 sont synthétisés combien de temps après l’infection ?
Intervale en minutes
2 à 8min
Trois classes de gènes de T7
A quoi servent les gènes de classe 1
Créer des conditions favorables dans la cellule pour développement du phage (inhibition des enzymes de restriction). Ils codent également pour l’ARNpol T7
Trois classes de gènes de T7
Les gènes de classe 1 sont transcrits par l’ARNpol viral ou de l’hôte ?
de l’hôte (coli)
ARNpol de T7
Combien de sous unités possède cette enzyme ?
une seule (883 AA)
ARNpol de T7
L’ARNpol de Coli est elle plus lente ou plus rapide que l’ARNpol de T7 ?
plus lente. T7 est 5x plus rapide
Classes de gènes de T7
Combien de temps après l’infection sont synthétisés les gènes de classe 2
6 a 15 min
Classes de gènes de T7
Pour quoi codent les gènes de classe 2 ?
on cherche une utilité
Protéines qui dégradent l’ADN hote.
ADNpol virale
Origine de réplication
Combien d’origines de réplication retrouve t’on dans le génome de T7 ?
une seule
VS T4 qui en a plusieurs
La réplication du génome T7
Est elle unidirectionnelle ou bi-directionnelle ? A t’elle des fragments comme T4 ?
bidirectionnelle
Oui, fragments d’Okazaki
Combien de temps après l’infection sont synthétisés les gènes de classe 3 de T7
8 a 25 min
Gènes de classe 3 de T7
Dans quoi sont ils impliqués ?
Empaquetage ADN, Assemblage, Lyse
Assemblage de T7
Qu’arriverait il si les protéines structurales étaient synthétisées trop tot ?
Formation de capsides vides
Affinité de l’ARNpol de T7
est elle plus grande pour les gènes de classe 2 ou 3 ? Pourquoi ?
Classe 3, sinon, l’ADNpol serait accumulée inutilement
Assemblage des procapsides de T7 :
De quoi sont ils composés ?
On cherche 4 protéines
protéines de la capside
Protéines échaffaudage (scaffold)
Protéines de liaison tête queue
Protéines interne de la nucléocapside
Assemblage T7
L’assemblage des procapsides est suivi par quelle étape ?
Empaquetage de l’ADN
Assemblage T7, vrai ou faux
L’ADN viral entre dans le procapside de façon aléatoire, par l’une ou l’autre de ses extrémités.
FAUX toujours la même extrémité, il sera clivé au même endroit chaque fois
Complétez :
Les ________ perturbent la stabilité de la membrane externe, provoquant la lyse
On cherche le nom d’une protéine
Spanines
Mécanismes de défense :
Quels deux mécanismes emploie la bactérie pour masquer le récepteur
Empêche l’accès au récepteur (EPS, capsule) ou en diminue le nombre
Contournement de la défense
Quel mécanisme emploie le phage pour contourner le le masking des récepteurs ?
Une dépolymérase dégrade les EPs/la capsule
attachement de MS2
A quoi se lie MS2 pour entrer dans la cellule hôte ? via quelle protéine ?
Précisez l’endroit sur ce site de liaison
Se lie sur le COTÉ du Pilus F (organite de conjugaison de coli)
VIA protéine A
Attachement et entrée MS2
Après le contact, qu’arrive t’il à la protéine A ?
Elle est clivée
Expression des gènes MS2
Quel est le ratio protéine A / protéine coat dont le virion a besoin ?
1 protéine A pour 180 Coat
