EXAM 1 (T7 à MS2) Flashcards

1
Q

T7 est lytique ou lysogénique ?

A

lytique

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2
Q

T7 infecte quelle bactérie ?

A

E. coli

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3
Q

T7 est il a ADN ou ARN ? double brin ou simple brin ?

A

ADN db

comme T4

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4
Q

Ou peut-on retrouver T7 et T4 ?

A

intestins des mammifères et eaux usées

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5
Q

Ou est surtout présent T7 ?

(on cherche où dans l’environnement)

A

Milieux côtiers marins.
Compost.
Sédiments
Sources hydrothermales

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6
Q

Au sujet de la capside de T7

De quelle forme est elle ?
De quelle protéine est elle composée ?

A

Icosaédrique
gp10

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7
Q

Au sujet de T7 :

Décrivez la structure (forme) du noyau

A

Cylindrique, interne

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8
Q

Au sujet du génome de T7, complétez la phrase :

Il occupe ___ % du volume de la tête, et est enroulé autour _____________

A

45% du volume, enroulé autour du noyau central

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9
Q

Vrai ou faux ?

Les têtes des phages T4 et T7 sont remplies du génome compacté

A

Faux, T7 n’a pas la tête pleine

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10
Q

Structure de T7 :

Identifiez ce qui est représenté en (C) sur le shéma ci contre. De quoi s’agit il ? Son rôle ?

A

Le portail
Un canal ouvert
Permet à l’ADN de quitter la capside

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11
Q

Structure de T7

Identifiez ce qui est représenté en (E) sur le shéma ci contre.

A

Le noyau

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12
Q

Au sujet de la structure de T7 :

Sa queue est elle longue ou courte?
Contractile ou non ?

A

Courte
Non contractile

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13
Q

6 fibres caudales sont attachées à la partie supérieure de la queue de T7. De quelle protéine sont elles composées ?

A

gp17

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14
Q

Les séquences de pb répétées aux extrémités du génome de T7 sont elles plus longues ou plus courtes que celles de T4 ?

A

Plus courtes

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15
Q

Vrai ou Faux

Le génome de T7 se circularise, comme celui de T4

A

Faux, ne se circularise pas

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16
Q

Au sujet des sites de restrictions du génome de T7 :

On dit que plusieurs sites de restrictions sont sous représentés.

Expliquez ?

A

Il devrait contenir une dizaine de sites de restriction EcoR1, mais on en retrouve aucun .

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17
Q

Pendant l’adsorption de T7, complétez la phrase

L’extrémité ____________ des fibres reconnait les ______ des bactéries G-

A

C terminale,
LPS

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18
Q

Lors de la phase d’adsorption et injection de T7

Trois séries de protéines sont libérées de la nucléocapside.
Que font ces séries respectives

A

Série 1 : formation d’un canal à travers la membrane externe
Série 2 : passe dans le canal et dégrade le peptidoglycane
Série 3 : Prolonge le canal jusqu’au cytoplasme

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19
Q

Différences T7 et T4 :

La queue de T4 est ________
Celle de T7 est __________

Choix : Extensible, contractile, mobile, fixe

A

T4 contractile
T7 extensible

20
Q

Insertion du génome de T7, vrai ou faux :

Tout le génome viral pénètre dans la cellule après la formation du canal

A

Faux, seulement 850pb

21
Q

Insertion du génome de T7

Que contient la section de 850pb du génome de T7 injectée initialement dans la cellule ?

Quel est le rôle ? Particularités ?

A

Des promoteurs forts reconnus par ARNpol de l’hote.

-Ils rendent la transcription virale prioritaire
-Sont présents dans la cellule mais seulement en cas d’urgence, inhibés en temps normal

22
Q

Différence T7 VS T4 , vrai ou faux

T4 et T7 modifient l’ARNpol cellulaire

A

Faux, chez T7 une ARNpol virale est synthétisée

23
Q

Transcription de T7

Dans quel(s) sens se fait la transcription ?

A

Toujours de gauche à droite

24
Q

Trois classes de gènes de T7

Les gènes de classe 1 sont synthétisés combien de temps après l’infection ?

Intervale en minutes

A

2 à 8min

25
Q

Trois classes de gènes de T7

A quoi servent les gènes de classe 1

A

Créer des conditions favorables dans la cellule pour développement du phage (inhibition des enzymes de restriction). Ils codent également pour l’ARNpol T7

26
Q

Trois classes de gènes de T7

Les gènes de classe 1 sont transcrits par l’ARNpol viral ou de l’hôte ?

A

de l’hôte (coli)

27
Q

ARNpol de T7

Combien de sous unités possède cette enzyme ?

A

une seule (883 AA)

28
Q

ARNpol de T7

L’ARNpol de Coli est elle plus lente ou plus rapide que l’ARNpol de T7 ?

A

plus lente. T7 est 5x plus rapide

29
Q

Classes de gènes de T7

Combien de temps après l’infection sont synthétisés les gènes de classe 2

A

6 a 15 min

30
Q

Classes de gènes de T7

Pour quoi codent les gènes de classe 2 ?

on cherche une utilité

A

Protéines qui dégradent l’ADN hote.
ADNpol virale

31
Q

Origine de réplication

Combien d’origines de réplication retrouve t’on dans le génome de T7 ?

A

une seule

VS T4 qui en a plusieurs

32
Q

La réplication du génome T7

Est elle unidirectionnelle ou bi-directionnelle ? A t’elle des fragments comme T4 ?

A

bidirectionnelle
Oui, fragments d’Okazaki

33
Q

Combien de temps après l’infection sont synthétisés les gènes de classe 3 de T7

A

8 a 25 min

34
Q

Gènes de classe 3 de T7

Dans quoi sont ils impliqués ?

A

Empaquetage ADN, Assemblage, Lyse

35
Q

Assemblage de T7

Qu’arriverait il si les protéines structurales étaient synthétisées trop tot ?

A

Formation de capsides vides

36
Q

Affinité de l’ARNpol de T7

est elle plus grande pour les gènes de classe 2 ou 3 ? Pourquoi ?

A

Classe 3, sinon, l’ADNpol serait accumulée inutilement

37
Q

Assemblage des procapsides de T7 :

De quoi sont ils composés ?

On cherche 4 protéines

A

protéines de la capside
Protéines échaffaudage (scaffold)
Protéines de liaison tête queue
Protéines interne de la nucléocapside

38
Q

Assemblage T7

L’assemblage des procapsides est suivi par quelle étape ?

A

Empaquetage de l’ADN

39
Q

Assemblage T7, vrai ou faux

L’ADN viral entre dans le procapside de façon aléatoire, par l’une ou l’autre de ses extrémités.

A

FAUX toujours la même extrémité, il sera clivé au même endroit chaque fois

40
Q

Complétez :

Les ________ perturbent la stabilité de la membrane externe, provoquant la lyse

On cherche le nom d’une protéine

A

Spanines

41
Q

Mécanismes de défense :

Quels deux mécanismes emploie la bactérie pour masquer le récepteur

A

Empêche l’accès au récepteur (EPS, capsule) ou en diminue le nombre

42
Q

Contournement de la défense

Quel mécanisme emploie le phage pour contourner le le masking des récepteurs ?

A

Une dépolymérase dégrade les EPs/la capsule

43
Q

attachement de MS2

A quoi se lie MS2 pour entrer dans la cellule hôte ? via quelle protéine ?

Précisez l’endroit sur ce site de liaison

A

Se lie sur le COTÉ du Pilus F (organite de conjugaison de coli)
VIA protéine A

44
Q

Attachement et entrée MS2

Après le contact, qu’arrive t’il à la protéine A ?

A

Elle est clivée

45
Q

Expression des gènes MS2

Quel est le ratio protéine A / protéine coat dont le virion a besoin ?

A

1 protéine A pour 180 Coat

46
Q
A