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Viro MCB > Orthomyxoviridae > Flashcards

Orthomyxoviridae Flashcards

1
Q

Étymologie du mot “Orthomyxoviridae”

A
  • Ortho : vrai, régulier
  • myxo : mucus
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Q

La famille des Orthomyxoviridae regroupe quel type de virus ?

A

Virus causant des maladies respiratoires très contagieuses et souvent graves.

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3
Q

Pourquoi les Orthomyxoviridae sont-ils soupçonnés d’être des virus anciens ?

A

Hippocrate a pris des notes sur une épidémie qui semble avoir été provoquée par un Orthomyxoviridae. Les symptômes étaient très similaires.

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4
Q

Vrai ou faux : La grippe tue peu de personnes mondialement.

A

Faux. Il s’agit d’une cause majeure de mortalité

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5
Q

Vrai ou faux : Des maladies zoonotiques ont abouti à des pandémies mortelles.

A

Vrai.

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6
Q

Combien de genres forment la famille des Orthomyxoviridae ? Quel genre est le plus important ?

A

A, B, C, D, Isavirus, Quaranjavirus et Thogotovirus.
L’Influenza A est le plus important.

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7
Q

Combien de sous-types H et combien de sous-types N existent ?

A
  • 18 sous-types H
  • 11 sous-types N
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8
Q

Structure générale des Orthomyxoviridae.

A
  • Virus enveloppés (membrane des cellules)
  • 100 nm
  • Protéines HA, NA et M2 insérées dans l’enveloppe
  • Protéine M1 forme une couche à la base de l’enveloppe et est liée à une protéine d’export nucléaire
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9
Q

Génomique des Orthomyxoviridae

A

ARN sb, polarité négative.
Entouré d’une nucléocapside.
Segmenté (Influenza A et B = 8 ; Influenza C et D =7)

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10
Q

De quelle façon de génome de l’Influenza augmente-t-il sa capacité codante ?

A
  • Épissage
  • Cadres de lecture alternatifs
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11
Q

Pour quelle protéine les trois premier segments codent-ils ?

A

La polymérase

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12
Q

Vrai ou faux : Seulement certains segments contiennent des régions 5’ et 3’ UTR.

A

Faux. Tous les segments contiennent ces régions.

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13
Q

Quels segments codent pour les protéines du spicule ?

A

Segments 4 et 6.

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14
Q

Quels segments codent pour les protéines M1 et NS1 ?

A

Segments 7 et 8, respectivement.

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15
Q

Attachement du Influenzavirus à la cellule hôte

A
  • Attachement sur les acides neuraminiques à la surface cellulaire
  • Différentes espèces/molécules HA = liens différents avec l’acide sialique (humains : alpha-2,6)
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16
Q

Quelles cellules humaines portent les récepteurs avec les bonnes liaisons pour le virus de l’Influenza ?

A

Les cellules épithéliales de la trachée.

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17
Q

Vrai ou faux : Les virus peuvent s’adapter pour se lier à un nouveau récepteur.

A

Vrai. Par exemple, le virus de la grippe de 1918 a été créé suite au changement d’un acide aminé. Ce changement a fait en sorte que le virus avait une préférence pour les récepteurs avec des liaisons alpha-(2,6)

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18
Q

Entrée du Influenzavirus dans la cellule hôte

A
  • Endocytose médiée par la clathrine
  • pH acide de l’endosome active la fusion de la membrane virale avec celle de l’endosome
  • L’activité de fusion est induite par le clivage de HA0 en HA1 et HA2
  • Le domaine HA2 est ancré dans la membrane virale et les peptides de fusion sont insérés dans la membrane de l’endosome
  • Les molécules HA ouvrent un pore qui libère les RNP dans le cytoplasme
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19
Q

La décapsidation du Influenzavirus

A
  • Protéine M2 forme un canal ionique dans la membrane virale
  • Afflux de H+ de l’endosome dans le virus
  • Les ions perturbent les liaisons entre les protéines M1 et RNP
  • RNP est libérée de la particule virale
20
Q

Combien de temps entre l’attachement du virus et la sortie du RNP dans le cytoplasme ?

A

30 minutes

21
Q

Quelles sont les rôles de la protéine HA ?

A
  • Se lie au récepteur cellulaire
  • Fusionne la membrane virale avec les membranes des vésicules
  • Est le déterminant majeur reconnu par le système immunitaire adaptatif
22
Q

Nommez les composantes du RNP.

A
  • ARNsb-
  • Nucléocapsides
  • 3 protéines du complexe RdRp
23
Q

Qu’arrive-t-il aux RNP lors de la réplication des Orthomyxoviridae ? Quelle est la conséquence majeure de ces étapes ?

A
  • Après la décapsidation, les RNP sont transportés au noyau (signal de localisation nucléaire)
  • Protéines NP se lient au squelette phosphate de l’ARN
  • L’ARN est enroulé autour des NP = les bases des nt sont exposées

Ces étapes permettent à l’ARN de prendre une forme transcriptionnellement active.

24
Q

Caractéristiques de la RdRp ?

A
  • 3 sous-unités
  • PB1 : la polymerase
  • PB2 : se lie à la coiffe 5’ du pré-ARNm cellulaire
  • PA : endonucléase qui génère les amorces à partir de l’ARNm attrapée par PB2
25
Q

Fonctionnement du promoteur viral

A
  • Élément à double brin : les 5’ et 3’-UTR se lient ensemble (complémentaires)
  • Ces séquences sont conservées entre tous les segments du virus.
26
Q

Qu’est-ce le “cap-snatching” ?

A

Le virus de l’influenza vole les coiffe 5’ des ARNm de la cellule. La coiffe est ajoutée à la molécule d’ARN virale afin de déclencher la transcription.

27
Q

Quelle protéine est responsable de l’initiation de la transcription ? Quelle protéine est activée par la suite et quelle est sa fonction ?

A

La sous-unité PB1 de la polymérase lorsqu’elle se lie à l’extrémité 5’ de l’ARN virale.

Cela active PB2. Elle se lie à la coiffe 5’ d’un pré-ARNm cellulaire.

28
Q

Qu’arrive-t-il lors de la deuxième étape de la transcription ?

A

L’extrémité 3’ de l’ARN viral se lie à PB1 (forme un complexe) et la sous-unité PA clive le pré-ARNm cellulaire.

29
Q

Quel est le rôle de la coiffe 5’ du pré-ARNm cellulaire ?

A
  • Se lie à l’extrémité 5’ de l’ARN viral
  • Initie la transcription et l’élongation (par PB1).
30
Q

Comment se fait l’addition de la queue poly-A ?

A
  • Ajoutée par la polymérase
  • Lorsqu’elle bégaye sur une séquence de poly-U
31
Q

Quel est le rôle de l’épissage ?

A
  • Étend la capacité codante du génome
  • Permet de produire 2 protéines à partir des segments 7 et 8
32
Q

L’épissage est-il contrôlé ?

A

Oui. Il y a environ 90 % moins de transcrits épissés que non épissés

33
Q

Quelles protéines sont produites par épissage ?

A

M2 à partir de M1 et NEP à partir de NS1.

34
Q

Comment se fait la régulation de l’expression des gènes ?

A

L’expression est contrôlée a/n de la traduction sélective des gène viraux et la suppression de la synthèse des protéines de l’hôte.

35
Q

Quels gènes sont traduits en premier ?

A
  • La synthèse des ARNm de NP et NS1 est favorisée au début
  • Les ARNm de HA, NA et M1 sont retardés
36
Q

Quels mécanismes sont utilisés afin de suppresser les gènes de l’hôte ?

A
  • Dégradation du pré-ARN cellulaire après “cap-snatching”
  • Inhibition de la maturation des ARNm cellulaires
  • Dégradation de l’ARN pol II cellulaire
  • Traduction préférentielle des transcrits viraux
37
Q

Comment se fait la synthèse du génome viral ?

A

Le deuxième type d’ARN produit (l’ARN complémentaire, +) sert de gabarit pour la synthèse d’ARN virale (-)

38
Q

Que sont les différences entre la synthèse d’ARNc, d’ARNv et l’ARNm ?

A
  • ARNc : copies de pleine longueur de l’ARNv
  • ARNc et ARNv n’ont pas de coiffe 5’ ni de queue poly-A
  • Conformation de la polymérase est différente lors de la synthèse d’ARNc
  • Les ARNc se lient aux protéines NP dès leur synthèse complétée
39
Q

Décrivez la sortie du génome du noyau (pour l’assemblage des virions).

A
  • M1 est importée dans le noyau
  • M1 est impliquée dans la formation du RNP
  • M1 et NEP : exportation de la RNP du noyau
  • M1 empêche le retour de la RNP dans le noyau
40
Q

Expliquez pourquoi l’expression tardive de la protéine M1 est si importante ?

A

Fait en sorte que M1 bloque l’entrée de la RNP après le cycle de réplication soit terminé.

41
Q

Quel est le rôle de la protéine NEP lors de la libération des virions ?

A
  • Recrute la machinerie cellulaire pour l’exportation
  • Permet l’orientation de l’exportation du complexe RNP+M1+NEP vers le cytoplasme
42
Q

Vrai ou faux : La libération des virions se fai suite à la lyse de la cellule hôte.

A

Faux. Les virions bourgeonnent à partir des cellules épithéliales pulmonaires.

43
Q

Quelles protéines virales sont synthétisées par les ribosomes du RE ? Où subissent-elles des modifications ?e

A

Les protéines membranaires (HA, NA et M2). Ces protéines passent par le Golgi où elles sont modifiées et dirigées vers le site d’assemblage du virus.

44
Q

Comment les protéines membranaires se rendent-elles au site d’assemblage du virus ?

A

Les protéines HA, NA et M2 ont des signaux de tri apical.

45
Q

Où se retrouve la protéine M2 dans le virion ? Quel est son rôle ?

A

Elle recouvre la couche interne de la membrane en dessous du site d’insertion des protéines intégrales.

Elle dirige les RNP vers l’emplacement des protéines intégrales.

46
Q

Que sont les deux modèles proposés pour expliquer l’encapsidation des segments génomiques ?

A
  • Modèle aléatoire : les segments sont incorporés au hasard. Un virion complet est donc formé au hasard.
  • Modèle sélectif : Signal d’emballage unique à chaque segment. Fait en sorte que chaque virion possède le contenu génomique au complet.

Le modèle réel n’est pas connu. Preuves croissantes pour soutenir le deuxième modèle.

47
Q

Vrai ou faux : Les particules virales sont activement libérées.

A

Vrai. Lors des étapes finales du bourgeonnement, la protéine NA clive le récepteur de l’acide sialique (attaché à HA).

NA clive également l’acide sialique sur l’enveloppe virale afin d’empêcher l’agrégation des virus.

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