Personlig medicin Flashcards
Kobling
Når allerne i to loci sidder fysisk tæt på hinanden og ikke nedarves uafhængigt. Loci vil da nedarves sammen hyppigere end ved tilfældighed. Kobling følger ikke Mendels 2. lov.
Graden af kobling angiver
Hyppigheden for meiotisk overkrydsning. Måles i cM.
- Stor afstand -> stor sandsynlighed for overkrydsning ->
- Lille afstand -> lille sandsynlighed for overkrydsning
Koblingsanalyse bruges ved
Monogene sygdomme
5 metoder der bruges i forskellige situationer indenfor genkobling
- Direkte test (ikke kobling)
- Indirekte test - 0 cM (kobling)
- Indirekte test med risiko for overkrydsning
- Indirekte test ved flere mulige gener
- Genome-wide koblingsanalyse (når man er helt blank)
Sygdomskoblede allel
Den allel der er koblet til sygdomsallelen, men IKKE den allel som forårsager sygdommen
Sygdomsallel
Den allel der forårsager sygdommen
Direkte test i koblingsanalysen bruges når
Man kender mutationen
Indirekte test i koblingsanalysen bruges når
Man ikke kender mutationen og bruger koblede markører
Genome-wide koblingsanalyse
En måde at finde stærke sygdomsmutationer på uden apriori hypotese
Markører der anvendes til koblingsanalyse
- SNPs (hurtigt resultat)
2. Mikrosatelitter (langsomt resultat)
Next generation sequencing
Sekventeringsmetode der bruges til at opdage alle nye sygdomsgener i dag
Genmapningsstrategien i dag
Gentagne filtreringer af kodende varianter, hyppige varianter osv. hvilket dog er farligt, fordi man ikke blot kan konkludere at en variant hos to syge familiemedlemmer automatisk er patogen