Pédro 1 : Récepteurs nucléaires Flashcards
Quels sont les arrangements en trois dimensions de l’ADN? À quoi servent-ils?
Nucléosomes et chromatines. Permet de faire une régulation fine de l’expression des gènes en limitant leur accèssibilité, permet ainsi d’éviter l’amplification des gènes qu’on ne veut pas dans le moment.
Nommez les 4 grandes étapes entre l’ADN et la protéine mature.
Transcription, Maturation (épissage alternatif), Traduction et Maturation (repliement)
Quels sont les 5 sphères de processus régulées par les récepteurs nucléaires?
Développement Homéostasie Survie cellulaire Métabolisme Reproduction
Comment est-ce que les récepteurs nucléaires influencent l’expression génique?
En se liant au promoteur des gènes cibles (présence de co-facteurs importante!)
Quelles sont les 3 sous-familles de récepteurs nucléaires?
Non-stéroïdiens
Stéroïdiens
Orphelins
Décrire le type I des récepteurs nucléaires
- Récepteurs stéroïdiens (GR, MR, PR, AR, ER)
- Localisation cytoplasmique et nucléaire
- Liaison à L’ADN seulement en présence du ligand
- Éléments de réponse palindromiques
- Homodimère favorisé
- Associations aux HSP
Décrire le type II des récepteurs nucléaires
- Récepteurs TR, RAR, RXR, ER, VDR, PPAR
- Localisation nucléaire prédominante
- Liaison à l’ADN en absence et en présence du ligand
- Éléments de réponse divers
- Monomère, homodimère, hétérodimère
Quelle est la structure générale des récepteurs nucléaires? Quelles sont les fonctions de chaque région?
Sections A à F
Région AB :
- Domaine d’activation d’AF-1 (régions associées d’activation)
- Corégulateurs
- Site de phosphorylation
Région C :
- Domaine de liaison à l’ADN
- Dimérisation
- Import/Export nucléaire
Région D :
- Signal de localisation nucléaire (NLS)
- Corégulateurs
Région EF :
- Liaison du ligand
- Domaine d’activation d’AF-2 (région associée d’activation)
- Dimérisation
- Site de liaison des HSP
- Corégulateurs
Décrivez le mécanisme de changement de conformation de la queue C-terminale
La liaison du ligand au récepteur nucléaire entraîne un changement dans la position de l’hélice 12 qui est importante pour l’action des facteurs de transcription
Quelle région présente le moins d’homologie entre les différents récepteurs nucléaires?
Région AB
Expliquer le rôle des Heat Shock Proteins (HSPs)
Elle s’associe aux récepteurs en l’absence de ligand et empêche ainsi l’activation de la transcription. La liaison de l’hormone à son récepteur entraîne la dissociation des HSPs du récepteur, ce qui permet sa dimérisation et ainsi l’activation de la transcription.
Particularités:
Le retrait des HSPs uniquement n’active rien, il faut absolument avoir un ligand (type I)
Les récepteurs peuvent lier l’ADN en présence de HSPs, mais la transcription ne peut pas être enclenchée
Avec quel(s) type(s) de récepteur(s) est-ce que les HSPs s’associent?
Au type I seulement.
Expliquez le rôle de la phosphorylation
Pour certains récepteurs, la présence de l’hormone seulement ne suffit pas, il faut que le récepteur soit phosphorylé (principalement région AB)
L’activation du récepteur peut se faire en absence de l’hormone si il est phosphorylé (type II)
Expliquez le rôle de l’élément de réponse à l’hormone (ERH)
Une fois activé, le récepteur nucléaire joue le rôle de facteur de transcription et s’associe à une région située en 5’ des gènes cibles (appelée ERH).
Il existe des ERHs consensus, ce qui veut dire que plus d’un récepteur nucléaire (associés à différentes hormones) peuvent reconnaître cette séquence et ainsi induire l’activation de la transcription
Expliquez le concept de ‘‘doigt de zinc’’
Régions hautement conservées entre les différents récepteurs nucléaires et riches en cystéines, qui permettent la dimérisation et la liaison à l’ADN
Quelle région est responsable de la liaison à l’ADN? Quelle région est responsable de la dimérisation?
P-box = liaison D-box = dimérisation
Quelles sont les trois orientations des éléments de réponse aux hormones? Que permettent-elles?
Palindrome
Direct Repeat
Inverted Palindrome
Elles permettent une forme de spécificité des gènes transcrits. Ex. Dans telle cellule on a un palindrome donc tel effet, dans un autre type de cellule on a un palindrome inverse donc autre effet, même si il s’agit des mêmes récepteurs nucléaires.
Quel est le rôle principal du récepteur RXR? Quels sont les deux types d’hétérodimères de RXR?
Il favorise la liaison du complexe à l’ADN et stimule son action sur les pTREs.
Les hétérodimères RXR peuvent être:
Permissifs (interaction asymétrique avec l’hélice 12 qui permet la liaison des deux ligands) ex. avec PPAR
Non-permissifs (interaction non-asymétrique qui ne permet la liaison que d’un seul ligand) ex. avec TR
Étant donné qu’il y a seulement 3 consensus aux ERH, comment est-ce que la spécificité d’une hormone est reconnue?
- Expression spécifique des récepteurs dans une cellule
- Formation d’hétérodimère vs. homodimère
- Régulation transcriptionnelle par les cofacteurs
Quels sont les deux rôles principaux des corépresseurs et coactivateurs?
- Modulation de l’activité des récepteurs nucléaires sur la transcription (contact avec la machinerie transcriptionnelle de base et remodelage de la chromatine)
- Interaction avec le récepteur selon sa conformation (absence de ligand = corépresseur, présence de ligand = coactivateur)
Il peut y avoir différents cofacteurs selon le type de la cellule ciblée, dans certaines cellules coactivateurs, dans d’autres corépresseurs
Quelle est le rôle des HDAC? Des HAT? Des HMT?
HDAC = Histone déacétylases, compactent l’ADN
HAT = Histone acétyl transférase et HMT = Histone méthyl transférase, décompactent l’ADN
La dégradation des récepteurs nucléaires se fait par quoi?
Par les protéasomes.
Pas toujours though il existe aussi le recyclage
Expliquer le mécanisme de transport nucléo-cytoplasmique
Les récepteurs nucléaires sont transportés à l’intérieur du noyau par les nucléoporines à l’aide de protéines cargo ainsi que par RanGTP pour l’import et RanGDP pour l’export
Expliquez le principe d’autorégulation
Hormone contrôle l’expression de son propre récepteur à différents niveaux :
- Transcriptionnelle (contrôle de l’expression des gènes)
- Post-transcriptionnelle (modulation de la stabilité de l’ARNm)
- Post-translationnelle (niveau de dégradation des récepteurs)
Une hormone peut également réguler l’expression des récepteurs de d’autres hormones
