ORGANIZACJA GENOMU CZŁOWIEKA Flashcards
Co to jest genom?
Kompletna informacja genetyczna żywego organizmu lub wirusa. W przypadku organizmów eukariotycznych termin ten odnosi się zwykle do materiału genetycznego zawartego w podstawowym, pojedynczym (haploidalnym) zespole chromosomów.
Jakie genomy wyróżniamy u człowieka?
- genom jądrowy
- genom mitochondrialny
Co to jest projekt HUGO?
Projek Human Genome Project, którego celem było poznanie całkowitej sekwencji genomu człowieka, w 2003 roku (14 kwietnia) zakończono sekwencjonowanie 99 % genomu człowieka z trafnością 99,99%
Jaką długość ma genom człowieka?
3,2 miliardy par zasad
Ile genów liczy genom człowieka?
ok 21 500
Jaką średnią długość ma jedne gen człowieka (ile par)?
27 000 par zasad
Jaki jest najdłuższy gen człowieka i ile ma par zasad?
gen dystrofiny, 2,4 miliona par zasad
jaki jest najdłuższy produkt genu?
białko - titina - składa się z 34 350 aminokwasów
Co to jest gen?
Gen to fragment cząsteczki DNA, który odpowiada za tworzenie konkretnego białka, może mieć długość od kilku tysięcy do 2,4 milionów par nukleotydów.
Z czego zbudowany jest gen?
- sekwencji kodującej
- sekwencji niekodującej
Co to są sekwencje kodujące w genie?
Są to sekwencje, które wyznaczają kolejność aminokwasów w łańcuchu polipeptydowym (eksony) i kolejność nukleotydów w kodowanym RNA
Co to jest ekson?
Odcinek genu kodujący informację genetyczną
Co to jest intron?
Odcinek genu niekodujący informacji genetycznej
Genom (kompletny zapis informacji genetycznej)=
odcinki kodujące (geny) + odcinki niekodujące
Z jakich rejonów złożony jest gen eukariotyczny?
- rejony kodujące (eksony)
- rejony niekodujące (introny)
- promotor
Czy gen bakteryjny ma introny?
nie
Czym jest replikacja DNA?
Replikacja DNA to duplikowanie (powielanie/kopiowanie) cząsteczki DNA, jej celem jest dokładne skopiowanie informacji genetycznej zawartej w DNA i przekazanie jej komórkom potomnym (które dziedziczą informację genetyczną)
Co katalizuje proces replikacji DNA w komórce?
enzym Polimeraza DNA
Jak odbywa się powielanie DNA?
podstawianie do jednej starej nici komplementarnych nukleotydów i w ten sposób powstawanie nowej
Czym różni się replikacja u prokariontów od replikacji u eukariontów?
U prokariontów powstaje tylko jedno oczko replikacyjne (ORI) - posiadają kolistą cząsteczkę DNA, u eukariontów wiele oczek replikacyjnych - posiadają liniową cząsteczkę DNA
Jak przebiega replikacja DNA?
- powstanie oczek replikacyjnych, w których replikacja następuje w dwóch kierunkach, oczka replikacyjne powstają dzięki białkom wiążącym jednoniciowy DNA (kompleks enzymów replikujących DNA?)?
- helikaza DNA rozplata DNA?
- tworzą się nici wiodące i nici opóźnione?
Czym są fragmenty Okazaki?
Krótkie fragmenty nici DNA, dobudowywane przez polimerazę DNA do startera w procesie replikacji DNA podczas syntezy nici opóźnionej, łączone są z resztą dzięki ligazie DNA
Co to jest starter DNA?
Fragment RNA powstający z udziałem prymazy i dołączany do opóźnionej nici DNA (starterowy RNA).
Co to jest prymaza i jaką ma rolę?
Prymaza to enzym, który jest aktywowany przez helikazę DNA. Po aktywacji syntezuje na obu niciach DNA krótkie komplementarne odcinki starterowego RNA wykorzystywane przez polimerazę DNA do rozpoczęcia syntezy nowych nici DNA w procesie replikacji DNA.
Co to jest Polimeraza DNA i jaką pełni rolę?
Enzym katalizujący syntezę DNA w czasie replikacji lub naprawy DNA. Działanie typowej polimerazy DNA polega na wydłużaniu startera przez dobudowywanie nukleotydów komplementarnych do matrycy na końcu 3′ startera, a następnie dobudowywaniu kolejnych nukleotydów.
Jakie enzymy biorą udział w replikacji DNA?
- Polimeraza DNA!
- Prymaza DNA
- Ligaza DNA
- Helikaza DNA
- (topoizomeraza)
Jaka jest rola polimerazy DNA?
- synteza DNA
- rozpoznanie i usunięcie nieprawidłowo wstawionych nukleotydów
Dlaczego chromosomy ulegają skróceniu?
Każda z dwóch potomny cząstek DNA ma jedną krótszą nić, w opóźnionej nici usunięty zostaje starter co powoduje jej skrócenie
Co to jest telomeraza?
Enzym dobudowujący końcówki chromosomów,
jej zadaniem jest dobudowanie brakującego (w związku z tzw. problemem replikacji końca) 3’-końcowego odcinka nici DNA (tak zwanej nici opóźnionej). Telomeraza posługuje się w tym celu zintegrowaną z nią cząsteczką RNA.
Co to są telomery?
Końcówki wszystkich chromosomów posiadające identyczne, powtarzające się sekwencje nukleotydowe, działają jak “czapeczki” ochronne podczas procesu replikacji DNA. Najważniejszą funkcją telomerów jest utrzymanie integralności i stabilności chromosomów. Struktura telomerów zabezpiecza końce chromosomów przed ewentualnymi uszkodzeniami, które mogą zachodzić podczas ich replikacji.
Co to jest problem replikacji końca?
Zjawisko skracania normalnego chromosomu podczas duplikacji. Zjawisko to zaobserwował James Watson.
Jak działa telomeraza, opisz przebieg działania?
- Telomeraza łączy się z końcem 3’ telomeru, który zawiera sekwencję komplementarną do telomerazy RNA
- Zasady są dodawane używając dołączonej telomerazy RNA jako matrycy.
- Telomeraza przesuwa się do przodu dodając się do nowododanego powtórzenia
- proces powtarza się
Jaką rolę mają telomery?
- umożliwiają komórkom normalne i prawidłowe dzielenie się
- dzięki nim komórki nie zlepiają się ze sobą
- może wywołać starzenie się organizmu oraz pojawienie się chorób związanych z wiekiem
Jaką długość mają telomery?
w momencie narodzin ok 11 kilobaz, w okresie starości do 4 kilobaz
Dlaczego telomeraza jest niebezpieczna w czasie nowotworu?
aktywność telomerazy w komórkach nowotworowych jest 10-20 większa niż w zdrowych komórkach, komórki nowotworowe nie starzeją się, ponad to ulegają gwałtownym podziałom, telomeraza sprzyja prawidłowości tego podziału a więc w rezultacie dalszemu rozwojowi nowotworu
Jakie zachowania mogą negatywnie wpływać na długość telomerów?
- cyniczna wrogość
- pesymizm
- błądzenie myślami
- ruminacja
Czy to sama sytuacja stresowa powoduje skracanie telomerów?
nie sama sytuacja a nasz odbiór stresu
Jakie konsekwencje ma zbyt mocne skrócenie telomerów w komórkach?
- Zbyt krótkie telomery uniemożliwiają dalszy podział komórki?
- Zbyt mocne skracanie telomerów prowadzi do utraty białka powierzchniowego CD28 i tym samym do osłabionej odpowiedzi na patogen