Nukleotider Flashcards
Nämn 4 användningsområden för nukleotider i kroppen.
- Ingår i nukleinsyror (RNA och DNA)
- Energibärare, i te.x. ATP
- Reglering i t.ex. metabolism
- Ingår i coenzym (ofta nukleotid + B-vit)
Nukleotidens 3 beståndsdelar?
Socker (ribos/deoxyribos)
Kvävebas (A, C, G, U, T)
Fosfatgrupper/er
Puriner - struktur och namn?
Består av 2 ringar.
Adenin, Guanin och Hypoxantin
Pyrimidiner - struktur och namn?
Består av en ringstruktur.
Cytosin & Tymin/Uracil
Tymin/Uracil - vad förekommer i DNA resp RNA?
Tymin i DNA
Uracil i RNA
Hur namnges puriner som nukleosid?
+ ändelsen ”osin”
Adenin -> adenosin (Ado)
Guanin -> guanosin (guo)
Hypoxantin -> Inosin (ino)
Hur namnges pyrimidiner som nukleosid?
Får ändelsen ”idin”
Cytosin -> cytidin (Cyd)
Uracil -> uridin (Urd)
Tymin -> tymidin (dThd)
Vad är PRPP?
Används vid syntes av nuklotider och har 2 fosfater där kvävebasen sedan kommer sitta.
Bildas av ribos-5-fosfat i pentosfosfatshunten.
Vad heter Hypoxantin och Tymin som nukleotider?
Hypoxantin -> Inosin -> IMP
Tymin -> tymindin -> dTMP, dTDP, dTTP
Alltid i deoxyform
Tymin = DNA
Vad är De Novo syntes och när behövd den?
När nya nukleotider behöver byggas upp vid t.ex. celldelning eller för att ersätta nukleotider vid t.ex uttjänta mitokondrier, skadat DNA eller celldöd.
Hur går De Novo-syntesen till för puriner?
- PRPP används som ribosdel
- NH2 fästes och purinskelett byggs atom per atom
- Blir till IMP som sedan kan bilda både GMP och AMP (GMP och AMP kan vid behov göras om till varandra via IMP)
Hur går De-Novo-syntesen till för pyrimidiner?
Från en grund av PRPP byggs pyrimidinskelettet upp atom för atom.
- bildar UMP ->UDP ->UTP ->CTP
Vad är dNDP och hur bildas de?
dNTP är deoxynukleinsyra som finns i DNA.
De-Novo syntes av dNDP bildas av NDP
Salvage syntes av dNMP sker av en bas -> som bildar en deoxynukleosid -> dNMP
Vad är dTTP och hur bildas det?
Deoxy tymintrifosfat, bildas på speciell väg av dUMP -> dTMP
Sedan kan dTMP - > dTDP -> dTTP
Vad är salvage syntes och hur går den till?
Återanvändning av nukleosider och baser från föda eller nedbrytning.
Kan antingen bilas från kvävelbaser + PRPP mha PRtase
Eller bilas av (deoxy)nuklesid där (deoxy)nukleosidkinas sätter på fosfatgrupper från ATP
Vad bildas vid nedbrytning av nukleotider bildade av pyrimidiner?
Nukleotid -> nukleosid
Både d(cyd) och dThy blir till —> dUrd
(d) Uridin —> Uracil —> Beta-alanin, som går in i metabolismen
* nedbryten deoxytymidin får en extra metylgrupp som slutprod.
Vad bildas av nedbrutna nukleotider bildade av puriner?
Nukleotid —> Nukleosid
d(ado) blir till d(Ino)
d(Ino) + d(guo) —> motsvarande baser
Båda bildar Xantin
Xantin —> urinsyra som kissas ut
Varför får man gikt och hur kan det behandlas?
Orsakas av höga halter av urinsyra som kristalliseras och orsakar svullna och inflammerade leder.
Behandlas med inflammationsdämpande eller hämmare av xantinoxidas (XOD).
Xantinoxidas omvandlar vanligtvis hypoxantin —> xantin och xantin —> Urinsyra
(hypoxantin —> xantin —> urinsyra)
(Guanin —> xantin —> urinsyra)
Både guanin och hypoxantin kan kissas ut som de är och behöver egentligen inte omvandlas till urinsyra.
Vad är Lesch-Nyhan syndrom och vad orsakar det?
Mental redardation, dålig muskelkontroll, ”self mutilation” och gikt.
Orsakas av avsaknad av ett PRtase
HGPRtase (hypoxantin-guanin)
Detta gör att salvage-syntesen från hypoxantin och guanin inte kan ske - vilket driver på De-Novo syntes.
Mindre Salvege-syntes bildar till mer urinsyra vilket ger gikt.
Vad är SCID (severe combined immunodeficiency) och vad orsakar det?
En typ av SCID är ADA - adenosindeaminas-brist
När adenosin (puriner) inte kan deamineras och brytas ner accumuleras de i cellerna.
Detta är giftigt för T-celler och B-celler (lymfocyter) som behövs för immunförsvaret.
Var i cellen sker nukleotidmetabolism?
Mestadels i cytosolen