Brainscape's Knowledge GenomeTM


Top Flashcards (Certified)
All Flashcards

Temelji biokemije > Nukleinske kisline > Flashcards

Nukleinske kisline Flashcards

1
Q

iz česa so nukleotidi?

A

*dušikove baze *sladkorne enote *ene ali več fosfatnih skupin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

nukleozidi

A

(deoksi)riboza(C1’) + baza (N9 ali N1), povezani z glikozidno vezjo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

nukleotidi

A

nukleozid + ena ali več fosfatnih skupin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

AMP

A

najpogostejši mononukleotid v celici

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

nukleinske kisline

A

polimeri nukleotidov, povezanih s 3’,5’ fosfodiestrsko vezjo
od prostega 5’-konca proti prostem 3’-koncu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

nivoji strukture DNA, lastnosti vijačnice

A

*primarna struktura (zaporedje nukleotidov)
*sekundarna struktura (ponavljajoče se ureditev polinukleotidnih verig)
*terciarna struktura (dodatno zvitje)
desna vijačnica
antiparalelni verigi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

stabilizacija vijačnice

A

H-vezi, pi-interakcije med naloženimi bazami

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

taljenje DNA

A

DNA se stali v ozkem temperaturnem intervalu (5-10 oC) *prevoju talilne temperature pravimo temperatura tališča Tm *proces je reverzibilen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Nukleosom

A

enota, sestavljena iz histona (8) in okoli navite DNA (147 bp) imenujemo nukleosom

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

dodatno zvijanje DNA

A

*kompaktnost *odpornost na cepitev *vpliv na uravnavanje podvojevanja in prepisovanja
*topoizomeraze so encimi, ki katalizirajo pretvorbo

manj stabilna oblika

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

tridimenzionalne strukture RNA

A

notranje zanke izbokline/lasnične zanke

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

tRNA

A

*najmanjše molekule izmed RNA (74-93 nukleotidov)
*oblika L (2D deteljica), tri lasnične zanke
*segmenti z dvojno vijačnico *stabilizacija preko H-vezi
*CCA konec za vezavo ak *antikodonska zanka

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

nukleaze

A

*prisotne v vseh celicah, katalizirajo hidrolizo fosfodiesterskih vezi
*razgrajujejo poškodovane nukleinske kisline
*tip a cepijo vez s 3’ -OH skupino
*tip b cepijo vez s 5’ -OH skupino

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

restrikcijske endonukleaze

A

*so najbolj specifične endonukleaze (več 100)
*so bakterijski encimi, ščitijo pred bakteriofagi (lastna DNA zaščitena z metilacijo)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

eksperimentalna potrditev semikonzervativne replikacije

A

*gojili E. coli v mediju z NH4Cl, označen z 15Ntežkim izotopom dušika (DNA je težja) *prenesli v medij z 14NNH4Clin spremljali dogajanje skozi generacije

*’težko’ DNA, ki vsebuje dve verigi 15N-DNA
*‘lahko’ DNA, ki vsebuje dve verigi 14N-DNA
*hibridno« DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

podvojevanje linearne DNA pri evkariontih

A

*podvojevanje vsakega kromosoma začne hkrati na več izhodiščih (∼30.000 mest ori, ∼100/kromosom)
*enako, kot pri prokariontih poteka v obesmeri *posamezna izhodišča tvorijo replikacijske mehurčke (replikon) *replikacijski mehurčki se na koncu združijo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Dna polimeraze

A

*encimi, ki katalizirajo sintezo DNA
*za delovanje potrebujejo matrico(starševsko DNA) *potrebujejo Mg2+ione (2 v akt. mestu encima)
*za začetek delovanja potrebujejo predhodno začetni oligonukleod
*podaljševanje nastajajoče verige začne vedno v smeri 5’à3’ *matrična veriga se bere3’à5’ *energijo za reakcijo daje sprostitev molekule pirofosfata in njegova hidroliza do ortofosfata
*lahko imajo eksonukleazno akvnost (sposobnost odcepljanja napačno sparjenih baz)

18
Q

vrste DNA polimeraz (baktrijske)

A

*DNA polimeraza III je glavni podvojevalni encim
kompleksna struktura, 10 podenot (900 kDa), večja hitrost *DNA polimerazi I in II pa sodelujeta pri kontrolnem branju in popravljanju napak
delujeta dodatno kot nukleazi (cepita fosfodiestersko vez)

19
Q

helikaza

A

*protein za razpiranje DNA *veže se na izhodišče replikacije *prekine H-vezi *reakcija je sklopljena s hidrolizo ATP

20
Q

DNA –giraza

A

*pomaga pri odvijanju verig DNA (zmanjša napetost) *oblikujejo se replikacijske vilice *po vezavi DNA deluje encim v treh korakih
*cepi eno izmed verig DNA (nukleof. napad Tyr)
*se prestavi preko te cepitve
*ponovno poveže DNA

21
Q

proteini SSB

A

*vežejo se na enoverižno DNA *stabilizirajo izpostavljene verige (zaščita pred nukleazami)

22
Q

primaza

A

je RNA polimeraza, ki najprej sintetizira kratko zaporedja RNA (RNA primer, 4-10 nt)

23
Q

DNA polimeraza III in I med replikacijo

A

*podaljševanje vodilne verige gre v smeri napredujočih replikacijskih vilic
*podaljševanje zaostajajoče verige gre v obratni smeri , dokler ne doseže RNA-primerja
*RNA-primer se z eksonukleazno aktivnostjo DNA polimeraze I v smeri 5’à3’ odstrani
*DNA polimeraza I sintetizira predel RNA primerjev -zapolni vrzel
*sintetizira se nov RNA primer za nov Okazakijev fragment

24
Q

DNA ligaza

A

katalizira nastanek fosfodiestrske vezi

25
replikacija pri prokariontih
izhodišča replikacije so pri nižjih evkariontih bolje karakterizirana hitrost replikcijskih vilic je 10 x počasnejša kot pri prokariontih več vrst DNA polimeraz in drugih encimov ter proteinov pomembna lastnost po katerih se evkariontska DNA razlikuje od prokariontske je linearnost –prosti konci (telomeri)
26
telomere
*vzdržujejo stabilnost genoma *nekodirajoče dvojnovijačne regije meja dolžine telomere (Hayflick limit)povzročijo staranje telomerazeso aktivne le v embrionalnih in rakavih celicah
27
kaj delajo telomeraze?
rešujejo težavo tako, da podaljšajo 3’-konec z zaporedjem TTAGGG podaljšan del je sedaj matrica za DNA polimerazo, da dokonča manjkajoče zaporedje
28
spontane mutacije
ob upoštevanju popravljalnih mehanizmov je napak 10-10 spontana hidroliza (odstrani se purinski obroč) deaminacija tavtomerija baz
29
splošni popravljalni sistem
*z endonukleazami katalizirana cepitev ene od fosfoestrskih vezi, ki povezujejo napačen nukleotid v verigo DNA *odstranitev napačnega nukleotida z eksonukleazo *vključitev pravilnega nukleotida s pomočjo DNA-polimeraze I ali III *zapolnitev vrzeli z nastankom fosfoesterske vezi s pomočjo DNA-ligaze
30
UV sevanje kot mutageni dejavnik
*izpostavitev DNA UV-svetlobi povzroči kovalentno povezavo med sosednjimi pirimidinskimi bazami (T ali C) *nastali dimer prisili DNA v upogib, napačna vezava nukleotida pri podvojevanju (zamenjava C s T)
31
kemijski mutageni
alkilirajoča sredstva *modificirajo baze in povzročijo nastanek napačnih parov pri naslednjem podvojevanju interkalatorji *hidrofobne aromatske spojine *vrinejo se med naložene bp v DNA, strukturne spremembe *povzročajo insercije ali delecije *v raziskovalnih laboratorijih *kot barvilo za zaznavanje DNA
32
prokariontska RNA polimeraza (transkripcija)
RNApol apoencim (α2ββ’ω) + σ podenota-->RNApol holoencim *α podenoti stabilizirata kompleks, interagirata z DNA in vežeta regulatorne elemente *β podenoti tvorita aktivno mesto *σ podenota –omogoči vezavo na promotor, kasneje oddisocira s kompleksa *ω podenota stabilizira kompleks
33
potek transkripcije
polimeraza izvaja in nadzoruje vse korake prepisovanja RNA polimeraza poišče specifično mesto vezave (promotor) del DNA se razpre matrična veriga se prepiše v RNA
34
RNA polimeraze lastnosti
isto kot DNA nukleaze nepotrebujejo predhodno začetnega oligonukleotida
35
potek transkripcije
*vezava na promotorsko regijo upočasni potovanje DNA polimeraze *sproži razprtje dvojne vijačnice (12 -15 bp) –prepisovalni mehurček *sinteza se začne z vstopom prvega ribonukleotida *na mestu +1 prepisovanje de novo, brez začetnega oligonukleotida *podaljševanje verige RNA poteka v smeri 5’-->3’ *konec sinteze RNA nadzorujejo posebna zaporedja DNA *Pri E. coli so odkrili dva načina terminacije, ki sta del novonastale mRNA: (s proteinom ρ (rho), preko tvorbe lasnične zanke)
36
oblike polimeraz
DNA polimeraza -->od DNA odvisna DNA polimeraza RNA polimeraza -->od DNA odvisna RNA polimeraza RNA replikaza --> od RNA odvisna RNA polimeraza reverzna transkriptaza --> od RNA odvisna DNA polimeraza
37
operon
zaporedje genov pod kontrolo skupnega promotorja mRNA, ki kodira več proteinov hkrati, pravimo policistronska
38
zorjenje evkariontske tRNA
*krajšanje 5‘-koncev s cepitvijo fosfoestrskih vezi *zamenjava UU z CCA *izrezovanje introna *modifikacija heterocikličnih baz, običajno metiliranje
39
inhibitorji transkripcije
aktinomicin D (antibiotik pri kemoterapiji), alfa-amanitin (inhibira RNA polimerazo II)
40
KOMPLEKS KI KATALIZIRA IZREZOVANJE INTRONOV
Spliceosom (samll nuclear ribonucleic particle)

Temelji biokemije (10 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2025 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions