NUKLEINSKE KISELINE Flashcards
KAKO MOŽEMO PODJELITI NUKLEINSKE KISELINE?
-deoksiribonukleinska kiselina (DNA)
-ribonukleinska kiselina (mRNA, tRNA, rRNA)
RAZLIKA IZMEĐU PURINA I PIRIMIDINA?
-purini se sastoje od dva prstena
-pirimidini se sastoje od jednog prstena
TREBA NACRTATI PURINE I PIRIMIDINE!!!
-purini: adenin i gvanin
-pirimidni: citozin i timin/ uracil
CHARGAFFOVO PRAVILO
-Chargaffovo pravilo je pravilo koje opisuje način na koji se vežu dušićne baze unutar molekule DNA to jest koliko ima gvanina toliko mora biti i citozina, a koliko ima adeninia toliko mora biti i timina
U KOJME SU OBLIKU DUŠIĆNE BAZE UNUTAR DNA MOLEKULE?
-dušićne baze mogu općenito biit u keto obliku i u enolnom obliku
-unutar molekule DNA su u keto obliku
NACRTAJ PURINE
NACRTAJ PIRIMIDINE
KOJA JE RAZLIKA IZMEĐU NUKLEOZIDA I NUKLEOTIDA
NUKLEOZID= šećer + baza
NUKLEOTID= šećer + baza +fosfat
NOMENKLATURA DUŠIĆNIH BAZA I NUKLEOZIDA
adenin - (deoksi)adenozin
gvanin - (deoksi)gvanozin
citozin - (deoksi)citidin
uracil - uridin MOŽE BITI SAMO NA RNA!
timin - deoksitimidin MOŽE BITI SAMO NA DNA!
ŠTO JE OKOSNICA POLINUKLEOTIDNOG LANCA I NACRTAJTE JU.
-okosnicu polinukleotidnog lanca čine deoksiriboze ili riboze tj.l šećeri povezani fosfodiesterskim vezama u ponavljajućem nizu
ŠTO JE OLIGONUKLEOTID?
- više nukleotida povezanih fosfodiesterskom vezom
OBJASNI ZAŠTO JE DNA TOLIKO STABILNIJA OD RNA?
-deoksiriboza za razliku od riboze u svojoj strukturi nema jednu OH skupinu
-ta OH skupina u alkilnim uvjetima može djelovati kao nukleofil te napasti fosfatnu skupinu i razoriti fosfodiestersku vezu te samim time i cijelu molekulu RNA
ZAŠTO JE U DNA URACIL ZAMIJENJEN TIMINOM?
-zato što zna doći do reakcije u kojoj se deaminira citozin i u toj reakciji je produkt uracil
-VAŽNO JE DA DNA PREPOZNA TU GREŠKU I DA SE POPRAVI!!!
-kada bi uracil bio standardni dio DNA možda ga DNA nebi prepoznala kao grešku pa bi došlo do raznih problema
KAKO SU POVEZANA DVA POLINUKLEOTIDNA LANCA?
- susjedne dušićne baze polinukleotidnih lanca se povezuju vodikovim vezama
-dodatnu stabilnost donosi nešto što se zove BASE STACKING (hidrofobne reakcije između susjednih parova baza)
OPŠIŠITE MOLEKULU DNA
-molekula DNA je građena od dva antiparalelna polinukleotidna lanca
-nukleotidi unutar lanca su povezani fosfodiesterskim vezama
-dva lanca se međusobno povezuju vodikovim vezama
-BASE STACKING je pojava hidrofobnih reakcija između susjednih baza koja također pridonosi stabilnosti same molekule
-uzvojnica DNA JE desna i promjer joj je oko 2 nm
-razmak među susjednim bazama je 0,34 nm
-dušićne baze su gotovo okomite na okosnicu polinukleotidnog lanca
-parovi baza su međusobno zakrenuti za 36 stupnjeva što znači da je potrebno 10 parova baza za jedan puni okret
-adenin se uvijek spaja s timinom, a citozin uvijke s gvaninom
-DNA unutar sebe ima utore (mogu biti veliki i mali) oni služe kako bi se za njih vezali proteini
KAKO BAZE MOGU STERIČKI BITI OKRENUTE UNUTAR NUKLEOTIDA?
-mogu biti u anti i syn položaju
-syn je točno iznad šećera
-anti nije točno iznad šećera (POVOLJNIJE!!!)