Morphologie fonctionelle des procaryotes Flashcards
Qui est Carl von Linné
Aide à la nomenclature des microorganismes
Comment nommer scientifiquement les organismes
Nous utiliserons le genre et l’espèce
Comment écrire les noms scientifiques des organismes
Les noms seront écrits en latin. Il sera soit en italique, soit souligné. Le genre commence par une lettre majuscule et l’espèce commence par une lettre minuscule. Les noms peuvent être descriptifs ou donnés dans un honneur scientifique
Comment écrire les noms scientifiques des organismes dans les publications.
Pour la première utilisation du nom des organismes, vous écrirez le nom complet. Tous les autres noms après vous le raccourciront en abrégeant le genre. Homo sapiens devient H. sapiens
Pourquoi les bactéries sont-elles importantes dans nos vies.
Ils sont les plus pertinents pour les maladies microbiennes. La grande majorité ne sont pas des agents pathogènes. Ils sont utilisés dans la production d’aliments, de médicaments, de traitement de l’eau et pour voir s’il y a des effets positifs sur la santé humaine. Ils ont également la plus grande diversité de métabolisme dans leur vie.
Y a-t-il des archées pathogènes
Aucun pathogène archées sont connues
Qu’est-ce que l’antibiothérapie
Ils sont principalement utilisés pour lutter contre les infections bactériennes. Cependant, nous dépensons une grande majorité d’énergie sur les agents pathogènes car ils ont un impact direct sur nos vies.
Quelle est la plus petite sous-unité des procaryotes, des mitochondries et des chloroplastes
C’est l’ARNr (ARN ribosomal) 16S
Quelle est la plus petite sous-unité des eucaryotes
C’est l’ARNr (ARN ribosomal) 18S
Pourquoi est-ce qu’on utilise ARN ribosomal pour étudier l’évolution?
ARN ribosomal sont trouvés dans tous les être vivants; ils sont tous présents dans la domaine du vivant.
Quelles sont les étapes pour créer un arbre phylogénétique
- Isoler l’ADN de chaque organisme
- Faites des copies du gène de l’ARNr par PCR
- ADN de séquence
- Analysez la séquence
- Générer l’arbre phylogénétique
Définir ce qu’est la phylogénie
C’est l’étude de la formation et de l’évolution des organismes vivants
Les archées sont-elles plus proches phylogénétiquement des eucaryotes ou des bactéries
Eucaryotes
Quels sont les macroorganismes du domaine eucaryote
Ce sont les animaux, les champignons et les plantes. Tout le reste sont des microorganismes
Qu’est-ce qu’un arbre phylogénétique
L’arbre comprend trois domaines: les bactéries, les archées et les eucaryotes
Quelle est la perspective des physiciens sur la source d’énergie et les flux d’énergie
Utilise des sources d’énergie physique. Lumière – (Photosynthétiques), procaryotes et eucaryotes
Quelle est la perspective des chimistes sur la source d’énergie et les flux d’énergie
Inorganique (Lithotrophes), Organique (Organotrophes). Bactéries sont les plus efficaces
Quelle est la perspective des biologistes sur la source d’énergie et les flux d’énergie
Prédateurs et eucaryotes.
C’est quoi qui utilise et transforme la majorité de l’énergie de notre planète.
La majorité de l’énergie solaire et géothermique est utilisée et transformée par les procaryotes sur notre planète
Est-ce que les eucaryotes ou procaryotes contrôlent-ils la majorité des aspects de la vie sur notre planète
C’est le procaryote qui contrôle les aspects de nos vies, cela comprend les cycles des nutriments, le climat et le corps humain
Quelles sont les différences externes entre les procaryotes et les eucaryotes
Les procaryotes n’ont généralement pas d’organites de même taille. Les procaryotes sont également généralement plus petits que les eucaryotes.
Les procaryotes ou les eucaryotes ont-ils une croissance cellulaire plus rapide?
Les procaryotes ont une acquisition plus rapide de la croissance cellulaire par rapport aux eucaryotes.
Quelles sont les raisons pour lesquelles les procaryotes ont une croissance cellulaire plus rapide
Il y a moins d’espace à prendre et il y a un meilleur accès aux nutriments pris grâce à une variété d’absorptions à travers la membrane cellulaire
Quelles sont les similitudes entre les procaryotes et les eucaryotes
Les similitudes sont le matériel génétique, les ribosomes, le cytoplasme et une membrane plasmique
Definir Ribosomes
Structures complexes constituées de protéines et d’ARN responsables de la synthèse des protéines cellulaires (traduction)
Definir Nucléoïde
Une région dense et de forme irrégulière dans laquelle se trouve le chromosome normalement circulaire, singulier du procaryote. Certains procaryotes ont des chromosomes linéaires et / ou multiples. Dans les bactéries en croissance active, le nucléoïde a des projections qui s’étendent dans la matrice cytoplasmique; ces projections contiennent probablement de l’ADN transcrit activement par des ARN polymérase.
Definir Plasmides
Petites molécules d’ADN circulaires fermées qui existent et se répliquent indépendamment du chromosome bactérien. Ils ne sont pas nécessaires à la croissance et à la reproduction bactériennes, mais peuvent porter des gènes qui confèrent à la bactérie un avantage sélectif.
Quelles sont les différences entre les procaryotes et les eucaryotes
Plasmides; qui sont même facultatifs chez les bactéries
Est-ce que les procaryotes ont-ils un vrai noyau
Un procaryote n’a pas un vrai noyau; mais ils ont des matériels génétiques
Quelle forme prend le matériel génétique dans des bactéries
Chez les bactéries, le matériel génétique est circulaire et ne possède qu’un seul chromosome; il y a quelques exception
Comment fait-on la distinction entre les bactéries?
Vous pouvez distinguer les bactéries entre la morphologie, la composition de la paroi cellulaire, les besoins en nutriments et l’activité biochimique et les sources d’énergie
Quelles sont toutes les différentes morphologies présentes chez les procaryotes
Ronde / Cocci, Vibrion, Hélice flexible ou spiralée, Hélice rigides ou spiralée, Filamenteuse, Bâtonnent ou Bacille, et Bourgeonnantes et pédonculées
Quelles sont les morphologies majoritaires chez les procaryotes?
Ronde / Cocci, Hélice flexible ou spiralée, Hélice rigides ou spiralée, et Bâtonnent ou Bacille
Quelles sont les bactéries contemporaines
Les bactéries contemporaines sont la majorité des bactéries, elles sont Ronde / Cocci, Hélice flexible ou spiralée, Hélice rigides ou spiralée, et Bâtonnent ou Bacille
Quels sont tous les arrangements des bactéries Cocci
Cocci, diplocoque, staphylococci, streptoccci, sarcines et tétrades
À quoi ressemble un coccus régulier?
Un cercle, il pourrait y en avoir beaucoup, mais il se présente comme un seul cercle
À quoi ressemble un diplocoque?
C’est une paire de cocci présents, il peut y avoir beaucoup de paires présentes, mais un diplocoque lui-même n’est qu’une paire
À quoi ressemble un staphylocoque
Cela ressemble à un groupe de raisins, il peut y en avoir beaucoup, mais ils se rassemblent pour former un grand groupe qui ressemble à des raisins
À quoi ressemble un streptocoque
C’est une ligne de beaucoup de cocci, il peut y en avoir beaucoup mais c’est une ligne qu’ils ne se côtoient pas que de former une ligne
À quoi ressemble des sarcines
Il s’agit d’une représentation 3-D de cocci, il y en a généralement 8, deux tétrades l’une sur l’autre.
À quoi ressemblent les tétrades
C’est un groupe de 4 cocci, qui forme un carré. Il ne prend pas une apparence 3D.
Quelles sont les différentes formes que les bacilles peuvent prendre
Coccobacilles, bacilles, diplobacilles, palisades et streptobacilles
À quoi ressemble le coccobacille?
Il ressemble à un ovale par rapport au reste des bacilles qui ressemblent plus à des bâtonnets.
À quoi ressemble un bacille
Cela ressemble à une seule bâtonnets, il peut y en avoir plusieurs mais c’est une bâtonnets à elle seule
À quoi ressemble un diplobacille
On dirait deux bâtonnets qui sont attachées du côté de la largeur, elles n’étaient que deux, elles peuvent être plusieurs diplobacilles mais il n’y en aura que deux côte à côte.
À quoi ressemble un palisades
Cela ressemble à un groupe de bâtonnets réunies sur le côté long des bacilles
À quoi ressemblent les streptobacilles
On dirait multiples bâtonnets qui sont attachées du côté de la largeur, elles peuvent être plusieurs streptobacilles.
À quoi ressemble Vibrio
Ils ressemblent à des bâtonnets courbes
À quoi ressemblent les spirochètes
Ils ressemblent à des bâtonnets ondulées. Ils sont flexibles
À quoi ressemblent l’appendice et le bourgeon
Il a l’apparence de deux cellules filles dans la cellule. L’un de ces deux a un appendice très long et mince, l’autre a un plus petit et plus épais qui est le bourgeon
Où pouvez-vous trouver Caulobacter
On le trouve dans les espaces aquatiques
Que sont les cellules Swarmer
Elles sont également connues sous le nom de cellules sœurs et se différencient entre les cellules par leur motilité
À quoi ressemble le procaryote filamenteux
C’est l’une des bactéries anciennes, elle est photosynthétique, on dirait qu’elle est composée de nombreuses fines lignes ondulées ensemble.
Qu’est-ce que la morphogenèse
Changement de forme
Qu’est-ce que monomorphe
Une seule forme; observée dans la plupart des cultures pures de bactéries
Qu’est-ce que pléomorphe
Plusieurs formes. Change pendant la croissance (Cellules deviennent plus petites avec l’âge). En réponse aux conditions environnementales (Sporulation donc peu de nutriments)
Que se passe-t-il dans une bactérie qui n’a pas de forme unique
Certaines bactéries n’ont pas de forme caractéristique unique et sont appelées pléomorphes. Ils subissent une morphogenèse à mesure que la culture vieillit.
Quelles sont les fonctions de la membrane cytoplasmique
- Perméabilité de la barrière
- Ancrage protéique
- Économies d’énergie
Pourquoi n’appelons-nous pas cela une membrane cytoplasmique chez les bactéries
Elle n’est pas appelée « membrane cytoplasmique » car cela implique la présence d’autres membranes, qui sont rares chez les procaryotes. Ils n’ont pas d’organite.
Que se passe-t-il si la membrane est compromise
Structurellement faible, si la membrane est compromise, l’intégrité de la cellule est détruite, le cytoplasme fuit dans l’environnement et la cellule meurt
Qu’est-ce qu’une membrane plasmique
La membrane plasmique de la plupart des bactéries est constituée d’une bicouche phospholipidique avec des surfaces hydrophiles sur les deux surfaces et un intérieur hydrophobe
Qu’est-ce que cela signifie quand quelque chose est organisé en mosaïque
Différentes unités qui vont être ensachée stable qui rend la molécule stable.
L’architecture générale d’une membrane plasmique est-elle la même pour tout (procaryote, archées et eucaryotes)
L’architecture générale de la membrane plasmique est la même chez tous (procaryote, archees et eucaryote), mais pas la composition, la composition est différente.
Décrire une protéine périphérique
Ne traverse pas la bicouche, il va avoir une extrémité qui est à la partie hydrophile de la protéine. Elle peut être en interaction avec quelques choses qui sont transmembranaires
Décrivez les protéines hydrophiles
Des protéines hydrophiles et d’autres substances chargées, telles que des ions métalliques, peuvent être fixées aux surfaces hydrophiles.
Quelles molécules peuvent détecter et répondre à l’environnement
Les glycolipides, les oligosaccharides et les protéines intégrales peuvent également jouer un rôle en tant que molécules réceptrices pour détecter et répondre aux produits chimiques dans leur environnement
Comment agit la membrane
La membrane est hautement organisée, asymétrique, flexible et dynamique
Comment l’acide carboxylique se lie-t-il à la membrane cellulaire pour les bacteries et les eucaryotes?
L’acide carboxylique des acides gras est lié par une liaison ester dans les membranes cellulaires bactériennes pour former des lipides de phosphate de glycérol
Comment liez-vous le glycérol et les acides gras dans une archée
Liaison éther (éther un composé dans lequel un atome d’oxygène est lié par liaison simples à deux groupes organiques différentes) et beaucoup plus stables
Quelles sont les lipides majoritaires présents chez les Archées
Diéthers et les tétraéthers de glycérol
Qu’est que c’est le Biphytanyl
Les chaines latérales de phytanyl de chaque molécule de glycérol sont liées par des liaisons covalentes ceci crée une monocouche de lipides au lieu d’une bicouche
Les archées ont-elles une monocouche ou une bicouche
Les archées ont à la fois des membranes monocouches et bicouches
Les bactéries ont-elles une monocouche ou une bicouche
Les bactéries n’ont que la bicouche lipidique.
Quel est l’homologue du cholestérol observé chez les bactéries
Hopanoïdes
Est-ce les archées ont-elles un homologue avec le cholestérol
Les Archées n’ont même pas les homologues de cholestérol; hypothèse qu’il y a des régulateurs, mais ils ne sont pas trouvés.
Quel est le rôle des stérols et de ses dérivés de molécules
Les stérols et les molécules dérivées sont rigides et plans alors que les acides gras sont flexibles. Ceci fait que la présence des stérols stabilise une membrane et la rend moins flexible
Quels sont les hopanoïdes
Sont des composés plats de type stérol qui confèrent une plus grande rigidité à la membrane. Ils se trouvent dans les bactéries (mais pas dans les archées) contrairement au stérol et au cholestérol trouvés dans eucaryote.
Quelle est la composition d’un stérol
Tous les stérols contiennent les mêmes quatre anneaux, étiquetés 1, 2, 3 et 4. La structure du cholestérol. La structure du diplotène humanoïde dans les membranes de certains procaryotes. Pas de stérols chez les procaryotes sauf chez les bactéries méthanotrophes et les mycoplasmes.
Que fait la partie hydrophobe de la membrane
La partie hydrophobe de la membrane constitue une barrière étanche à la diffusion de ces substances. Bien que certaines petites molécules ne diffusent pas mais doivent plutôt être transportées.
Comment est-ce que les molécules de charge se diffusent à travers une membrane
Les molécules chargées diffuses très faiblement; ils utilisent les autres mécanismes
Décrire la diffusion simple
La diffusion simple ne montre pas de saturation, mais pas avec ce mode, il est difficile pour solutés d’atteindre pour réaliser les réactions biochimiques
Pourquoi les transporteurs sont-ils nécessaires
Transporteurs nécessaires pour permettre aux microorganismes de capter des solutés à dues taux supérieurs à ceux trouver dans la nature
Décrire le diffusion passif
La diffusion passive (osmose pour l’eau) ne nécessite pas d’énergie, est le simple passage d’une molécule d’une zone de concentration supérieure à une zone de concentration inferieure. Les membranes sont les plus perméables à l’eau.
Décrire la diffusion facilitée
La diffusion facilitée est également passive, mais nécessite la liaison de la molécule à une protéine de transport. La protéine subit un changement de conformation pour laisser la molécule se diffuser à travers la membrane.
Décrire le transport actif
Le transport actif nécessite de l’énergie pour amener des produits chimiques dans la cellule contre son gradient de concentration; c’est-à-dire que la molécule peut passer d’une zone de concentration inferieure (à l’extérieur de la cellule) à une zone de concentration plus élevée (à l’intérieur de la cellule)
Décrire un uniporteur
Uniporteur déplace une seule substance de l’extérieur vers l’intérieur
Décrire un antiporteur
Antiporteur « échange » une substance avec des propriétés similaires contre une autre
Quelles sont les transporteurs chez les procaryotes
Chez les procaryotes, les transporteurs couvrant la membrane contiennent généralement 12 hélices alpha qui s’alignent les unes avec les autres dans un cercle pour former un canal à travers la membrane
Decrire un symporteur
Symporteur implique un anion et un cation
C’est quoi Force proton motrice en ATP
Transport actif qui est utiliser par la bactérie. Transport à travers la membrane pour alimenter le métabolisme et soutenir la croissance, importer des nutriments, exporter des déchets de manière continue.
Quels sont les types de mécanismes présents dans Force proton motrice en ATP
Transport simple, Translocation de group et Transporteur ABC
C’est quoi le Transport simple de Force proton motrice en ATP
Se compose uniquement d’une protéine de transport couvrant la membrane
C’est quoi le Translocation de groupe de Force proton motrice en ATP
Utilise une série de protéines pour le transport. La translocation modifie la molécule transportée.
C’est quoi le Transporteur ABC
Se compose de 3 composants : une protéine de liaison au substrat (1), un transporteur intégré à la membrane (2) et une protéine (3) hydrolysant l’ATP. Tous ces éléments entrainent le transport en utilisant l’énergie de la force motrice du proton ou de l’ATP ou d’un autre composé organique riche en énergie.
Chez les bactéries, les systèmes de transport nécessitent-ils de l’énergie
Chez les bactéries, tous les systèmes de transport nécessitent de l’énergie, sous forme de proton-motrice, d’ATP ou d’autres composes riches en énergie
Comment le lactose est-il transporté?
Le lactose est transporté par grâce a un symporteur appelé perméase Lac
Que fait Enzyme 2C
Phosphoryle et transporte le sucre (protéine transmembranaire)
Que fait Enzyme 1 et 2A
Cytosoliques
Que fait Enzyme 2B
Lié à la surface interne de la membrane
Pourquoi n’y a-t-il pas de Transport ABC dans les bactéries à Gram positif
Les Gram (+) ont des protéines de transport homologues mais liées à la membrane
Comment le maltose est-il transporté?
Le transport de maltose est un Transport ABC
Comment le glucose est-il transporté?
Le transport de glucose est un Translocation de groupes
Quel est la paroi bactérienne
La paroi cellulaire est une structure rigide qui donne les formes caractéristiques des différents procaryotes et les protège de l’éclatement sous la pression osmotique
La paroi bactérienne est-elle nécessaire?
Un peu facultatif, mais la majorité des bactéries ont une paroi bactérienne
Quels sont les rôles de la paroi bactérienne
Rigidité, forme, intégrité, préserver les bactéries de l’éclatement (ils sont à risque de l’éclatement à cause de pression osmotique) sont tous important pour les rôles de la paroi bactérienne
Quels sont les deux types de parois bactériennes
Les bactéries à Gram positif et les bactéries à Gram négatif
Quelle est une description de base des bactéries à Gram positif
Les bactéries à Gram positif ont des parois cellulaires constituées d’une épaisse couche d’un peptidoglycane avec très peu d’espace entre la membrane cellulaire et la paroi cellulaire. Elles sont capables d’aspirer la colorant. 2 niveaux : couche peptidoglycane et membrane cytoplasmique
Quelle est une description de base des bactéries à Gram négatif
Les bactéries à Gram négatif ont une très fine couche peptidoglycane dans un grand espace périplasmique entre la membrane cellulaire et la membrane externe. La membrane externe des bactéries à Gram négatif est ainsi appelée car elle contient des composants lipidiques membranaires. Elles ne sont pas capables d’aspirer la colorant.
Qu’est-ce qu’un peptidoglycane
Monomères de peptidoglycane (muréine) chez les bactéries
Ce qui comprend un peptidoglycane
Peptido = Acides aminés (4). Glycane = Disaccharide NAM + NAG avec une liaison glycosidique (B 1,4)
Quels sont les acides aminés présents dans le peptidoglycane présent dans les bactéries à Gram négatif
L-alanine, D-Glutamic acid, Diaminopimelic acid et D-alanine
Quels sont les acides aminés présents dans le peptidoglycane présent dans les bactéries à Gram positif
L-alanine, D-alanine, D-Glutamine, et L-Lysine
Quels sont les acides aminés constants dans le peptidoglycane, qu’il soit Gram positif ou négatif
L-alanine et D-alanine sont constant
Ce qui rend les parois bactériennes rigides
La paroi bactérienne est rigide grâce au peptidoglycane
Où le peptide interbridge est-il présent
Bactéries à Gram positives
Puisque les bactéries à Gram négatif n’ont pas d’interbridge peptidique, qu’est-ce qu’elles ont à la place
Pas de liaison entre les chaines
Qu’est-ce qu’un pont interpeptidique composé de
Présence d’un pont interpeptidique impliquant une répétition de glycine : le nombre d’unité de glycine participe aussi à la diversité des bactéries a Gram +
Quels sont les autres acides aminés moins courants qui peuvent être présents dans le pont interpeptide
Les acides aminés (aa) tels que la théonine, l’acide aspartique et la serine peuvent faire partie a l’élaboration du pont interpeptidique.
Quelles sont certaines choses qui ne feront jamais partie d’un pont interpeptide
Cependant ils ne participent jamais dans le pont interpeptidique un noyau aromatique et l’histidine
Quelles sont les acides téichoïques
Molécules qui comprennent du glycérophosphate ou des résidus phosphate. Ces molécules étant chargées négativement sont en partie responsable de la charge négative de la surface bactérienne
Où sont les acides téichoïques trouvés
Acide téichoïque prend son insertion dans la couche de peptidoglycane alors qu’un autre acide du même group (acide lipotéichoïque) est relie aux lipides membranaires (point d’insertion des lipides)
Ce qui donne de la fluidité aux parois bactériennes
Les acides téichoïques
Chez les bactéries à Gram positif, quelle est la distance entre la couche de peptidoglycane et la membrane cytoplasmique
Couche épaisse des peptidoglycane (plusieurs couches) et repose directement sur la membrane cytoplasmique
Quelles sont les inhibiteurs de la synthèse de la paroi
- Le lysozyme hydrolyse la liaison glycosidique entre le NAM et le NAG
- La pénicilline bloque l’enzyme transpeptidase qui connecte deux tétrapeptides voisins
Que détruisent les antibiotiques qui font partie des peptidoglycanes
Antibiotiques détruit la liaison B (1,4);
Que sont le lysozyme
Une enzyme qui hydrolyse la liaison glycosidique entre NAG et NAM. Cette enzyme est présente dans les yeux des mammifères et constitue un mécanisme de protection naturel contre Staphylococcus aureus, une bactérie indigène de la peau humaine et un pathogène potentiel.
C’est quoi la pénicilline
Un antibiotique qui agit principalement sur les bactéries. Gram positives en raison a) de leur couche de peptidoglycane étendue, b) du manque d’absorption de la pénicilline par les bactéries Gram négatives et c) de l’extrusion d’enzymes bêtalactamases dans les bactéries Gram positives en dehors de la cellule. Le médicament se lie aux enzymes (transpeptidases) qui forment la liaison peptidique entre D-ala et DAP en Gram négatif, et L-lys et l’acide aminé inter-ponts dans les bactéries Gram positives, empêchant ainsi la polymérisation des unités peptidoglycanes.
C’est quoi les protoplastes
Si les cellules sont placées dans une solution de lysozyme et de sucrose, on obtient des protoplastes (bactéries dépourvues de paroi)
Comment sont fabriqués les protoplastes
Les protoplastes peuvent être fabriques en digérant les parois cellulaires avec du lysozyme en présence d’une solution de saccharose. Si elles sont placées dans des solutions diluées, les cellules se lyseront.
Qu’arrive-t-il aux protoplastes dans une solution diluée
En solution diluée, la décomposition de la paroi cellulaire libère la protoplaste, mais il se lyse immédiatement car la membrane cytoplasmique est très faible.
Qu’arrive-t-il aux protoplastes dans une solution isotonique
Dans une solution contenant une concentration isotonique d’un soluté tel que le saccharose, l’eau n’entre pas dans le protoplaste et reste stable. Le lysozyme rompt les liaisons glycosidiques b-1,4 dans le peptidoglycane.
Quels sont les rôles des protoplastes
Fusion cellulaire, modification cellulaire
C’est quoi les acides (lipo)téichoïques
Dépassent de la surface de la paroi. Confère une charge négative. Confère une certaine flexibilité à la paroi qui, sinon, serait très rigide
Ces acide (lipo)téichoïques sont-ils présents dans les bactéries à Gram négatif
Les acides (lipo)téichoïques Ils ne sont pas présents dans les bactéries à Gram négatif
L’architecture est-elle différente pour les bactéries Gram positives et Gram négatives
L’architecture est différente entre eux
Quels sont les 3 niveaux distincts de bactéries à Gram négatif
Membrane externe, périplasme et membrane cytoplasmique
Quels sont les Lipopolysaccharide (LPS)
Barriere important contre les défenses de l’hôte
C’est quoi le lipide A
Le lipide A est une endotoxine pour les animaux, donc une cause de pathogénicité; apporte la virulence
Quel polysaccharide varie d’une espèce à l’autre
Le polysaccharide O varie d’une espèce à l’autre
C’est quoi l’ordre dans le LPS
Lipide A; pas attaché au glycérol
Ketodeoxyoctonate
Polysaccharide Central (core)
Polysaccharide O
C’est quoi KDO
Cétodésoxyoctonate
C’est quoi Hep
Heptose
C’est quoi Glu
Glucose
C’est quoi Gal
Galactose
C’est quoi GluNac
N-acétylglucosamine
C’est quoi GlcN
Glucosamine
C’est quoi P
Phosphate
Quelle partie du LPS peut être toxique
La partie lipide A du LPS peut être toxique pour les animaux et comprend le complexe d’endotoxine
C’est quoi l’espace périplasmique
L’écart ou l’espace entre les membranes cytoplasmique et les couches externe dans les bactéries à Gram négatif
Les bactéries à Gram positif ont-elles un espace périplasmique
Les bactéries à Gram positif ont les différents mécanismes
Qu’est-ce qu’il y a à l’intérieur d’un espace périplasmique
Contient des enzymes participent à l’acquisition des nutriments et au métabolisme cellulaire
Definir Chimiolithotrophes
Grande variété de protéines de transport d’électrons atteigne la membrane externe pour l’assimilation et le métabolisme d’ions inorganique
Puisque les bactéries à Gram positif n’ont pas d’espace périplasmique, qu’est-ce qu’elles ont à la place
Des exoenzymes secrétées par la cellule pour aider à transporter les nutriments (ex. des amylases excrétées par Bacillus aident pour mobiliser les sucres)
C’est quoi les Porines
Canaux pour l’entrée et la sortie de petites substances hydrophiles. Dans la membrane externe; permettre le de l’extérieur à l’intérieur. 3 protéines entourent les ouvertures. Molécules <600 Daltons peuvent travers ces canaux
Quelles sont les étapes Coloration de la Gram
- Coloration uniforme des cellules avec le complexe insoluble d’iodine-cristal violet
- Cellules « décolorées » à l’alcool
a. Le peptidoglycane des Gram (+) est alors déshydraté
b. Fermeture des pores empêchant le colorant de s’échapper
c. Cellules colorées en violet - Bactéries à Gram (-) sont colorées à la safranine et deviennent roses
Pourquoi les bactéries Gram positives deviennent violettes
Le peptidoglycane agit comme une barrière pour le complexe cristal violet-iode. Le polymère peptidoglycane se déshydraté et rétrécit lorsque la tâche est lavée avec de l’éthanol, emprisonnant ainsi le colorant à l’intérieur de la cellule
Pourquoi les bactéries à Gram négatif deviennent roses
La membrane externe bicouche lipidique de la paroi cellulaire bactérienne Gram négative est dissoute et le colorant est éliminé par lavage de la cellule avec de l’éthanol. Les bactéries à Gram négatif peuvent ensuite contre-colorées avec de la safranine, ce qui rend les cellules roses.
Les bactéries Gram positives ou Gram négatives sont-elles plus sensibles aux antibiotiques?
Bactéries à Gram + sont susceptibles aux antibiotiques de la famille B-lactames (comme la pénicilline)
Les bactéries Gram positives ou Gram négatives forment-elles une spore plus résistante?
Bactéries à Gram + ayant forme une spore sont plus résistantes à la chaleur et au stress mécanique
Pourquoi les bactéries Gram positives sont-elles plus sensibles à la pénicilline et à d’autres antibiotiques?
Les bactéries à Gram positif sont plus sensibles à la pénicilline et aux autres antibiotiques B-lactamines en partie en raison de leur grande couche de peptidoglycane. Parce qu’elles peuvent former des spores, les bactéries Gram positives sont plus résistantes au stress mécanique et à la chaleur.
De quoi sont composées certaines parois cellulaires des archées?
Sont composées de « pseudopeptidoglycanes » qui a une liaison B (1-3) entre NAG et NAT qui est incassable par le lysozyme.
Pourquoi les archées sont-elles résistantes à la pénicilline?
Elles ont des transpeptidases qui ne lient pas la pénicilline. Elles ne prennent pas la pénicilline. La plupart des archées n’ont pas de pseudopeptidoglycane, mais plutôt des parois cellulaires faites d’un autre matériau comme polysaccharides, glycoprotéines ou couches S protéinacées
Les archées ont-elles des parois cellulaires?
Dépourvus de paroi ou paroi inhabituelle composée de polysaccharide et de protéines, mais pas de peptidoglycane
Que sont les parois cellulaires
Quand elle existe renferme une substance semblable au peptidoglycane appelé pseudomuréine.
Qu’est ce que c’est pseudomuréine
Composée de plusieurs monomères de NAG et NAT
Les inhibiteurs rendent-ils les bactéries plus sensibles?
Même si, il représente le composant majoritaire de la paroi, la présence de grandes quantités de peptidoglycane semble rendre les bactéries plus sensibles à l’action des inhibiteurs de la paroi.
Y a-t-il des parois cellulaires avec des peptidoglycanes chez l’homme
Pas de paroi avec peptidoglycane chez les cellules humaines
C’est quoi la matrice de polysaccharides ou le glycocalyx
Important pour la survie, l’attachement et la virulence des certains procaryotes
Quel est le rôle de la capsule ou du glycocalyx
Impliquer dans beaucoup, s’attacher au cellule hôtes, virulence, régulation de pression osmotique. Difficile à être coloré
C’est quoi les capsules et couches visqueses
Couches de polysaccharides situées à l’extérieur de la paroi cellulaire qui protègent les bactéries de la phagocytose, des infections virales, des fluctuations du pH, du stress osmotique, des enzymes hydrolytiques : facteurs de virulence. Important pour la fixation à la surface et la formation de biofilms.
C’est quoi Slime
Structure de capsule mal organisée et déformée. Les couches de slime sont diffuses et non organisées, donc plus difficiles à visualiser.
Quelles sont les inclusions cellulaires
- Stockage du carbone
- Stockage du soufre
- Magnétosomes
- Vésicules de gaz
Quel est le rôle du stockage du carbone
Biosynthèse ou synthèse dATP
Pourquoi les vésicules de gaz sont-elles importantes
Important pour les microorganismes aquatiques; leur permet de flotter en de larges amas la surface de l’eau.
Qu’est-ce que le stockage de carbone
La matrice cytoplasmique est la substance encapsulée par la membrane cytoplasmique. Elle est sans structure dans les micrographies électroniques, mais est souvent rempli de ribosomes et de corps d’inclusion, et est très organisé en ce qui concerne la localisation des protéines.
Quel est le corps d’inclusion du stockage de carbone
Granules de matière organique ou inorganique stockés par la cellule pour une utilisation future, le stockage sous forme insoluble est avantageux car il réduit le stress osmotique qui se produirait si la même quantité de substance était dissoute dans le cytoplasme. La plupart ne sont pas délimités par une membrane, mais ont généralement une monocouche lipidique ou une enveloppe protéique.
C’est quoi magnétosome
Inclusions d’oxyde de fer, entourée d’invaginations de la membrane plasmique. Surtout retrouve chez les Gram négatif
C’est quoi stockage inorganique
Granules de soufre et magnétosomes. Oxydation du sulfure liée à la nécessité pour les électrons de conduire soit des réactions de métabolisme énergétique soit de fixation du CO2. Accumulation de soufre élémentaire oxydé en sulfate SO4 2- si nécessaire. Ces granules sont en fait dans le périplasme étendu vers l’extérieur pour accumuler les corps en croissance. Les magnétosomes sont ce qui se rapproche le plus d’un véritable « organite » en ce que la membrane cytoplasmique entoure les particules de magnétite lorsqu’elles se forment.
C’est quoi les vacuoles de gaz
Encore appelée vacuole gazeuse, ce sont des vésicules retrouvées chez les procaryotes aquatiques dont les cyanobactéries. Ce sont des organes de flottaison qui permettent aux procaryotes de se maintenir dans l’eau à une profondeur appropriée ou elles peuvent capter suffisamment de dioxygène des nutriments et de la lumière.
Definir les vacuoles à gaz
Les cyanobactéries (phototrophes) et certaines autres bactéries aquatiques (planctoniques); ils procurent de la flottabilité à ces organismes et les maintiennent à la surface ou près de la surface de leur habitat aqueux où il y a plus de soleil.
C’est quoi les endospores des Gram (+)
Se forme lorsque la bactérie se trouve dans des conditions de manque de nutriments. Ne se forme pas en réponse à un stress environnemental
Quelles bactéries forment des spores
Avec quelques exceptions, toutes les bactéries formant des spores sont des Gram +
Comment la sporulation est-elle contrôlée
La sporulation est contrôlée par différents facteurs sigma de la phase végétative à la spore complète. Les facteurs Sigma dirigent l’ARN polymérase ce qui conduit à l’expression des enzymes impliquées dans chaque processus.
À quelle température les endospores résistent-elles?
Endospore résiste jusqu’à 150 degrés. Cependant, un autoclave fonctionne à 121 degrés pendant 20 minutes tue la plupart des endospores et les autres espèces
Comment commence normalement la formation de spores
La formation de spores (sporulation) commence normalement lorsque la croissance cesse en raison d’un manque de nutriments, PAS à cause de conditions stressantes.
Quand a lieu la sporulation
La sporulation se produit dans les anciennes cultures au début de la phase de croissance stationnaire, PAS pendant la division cellulaire active. La sporulation peut être considérée comme une forme aberrante de division cellulaire dans laquelle l’une des cellules filles dépérit.
Quelles sont les spores libres
Les spores libres sont des spores matures
Quelles bactéries produisent le plus d’endospores
Plus les bactéries sont âgées le plus ils produisent les endospores
C’est quoi la tyndallisation
Le processus par lequel les cultures en bouillon sont stérilisés en plusieurs étapes pour tuer les spores-formateurs. Les jeunes cellules actives seront détruites lors de la première ébullition, tandis que les spores des cultures plus anciennes survivront à l’ébullition. Ainsi, après ébullition et culture ancienne, le bouillon est refroidi et les spores germent et se développent pendant la nuit. Faire bouillir à nouveau le bouillon le lendemain attrape toutes les cellules au stade végétatif et elles sont toutes tuées.
Que se passe-t-il lorsque les endospores sont exposées à des colorants
Les endospores sont imperméables à la plupart des colorants, à l’exception des procédures de coloration spécifiques comme le colorant vert malachite infusé dans la spore avec de la vapeur
Quelles sont les couches d’endospores qui sont absentes dans les cellules végétales
Exosporium et Cortex
C’est quoi l’exosporium des endospore
Couche la plus externe, fine couche de protéines.
C’est quoi le cortex des endospores
Peptidoglycane faiblement réticulé.
C’est quoi le noyau des endospores
Contenant la paroi centrale, la membrane cellulaire, le cytoplasme, le nucléoïde, les ribosomes et d’autres éléments essentiels.
C’est quoi l’acide dipicolinque est spécifique des spores bactériennes
Représente plus de 10% de poids sec des endospores. Concentration élevée en calcium qui sert de lien entre les molécules d’acide dipicolonique
Quelle est la différence chimique entre une spore et une cellule végétale
L’acide dipicolinique, qui ne se trouve que dans les spores
Quelle sont les types des endospores
Les endospores peuvent être centrales, subterminales ou terminales
Quelles sont les étapes pour revenir à l’état végétatif
- Activation
- Placement dans un bouillon nutritif
- Germination
- Développement
Qu’est-ce qu’une activation dans le retour à l’état végétatif
Chauffage de l’endospore à des températures sublétals
Qu’est-ce qu’une germination au retour à l’état végétatif
Très rapide; synthétise l’ARN, les protéines et l’ADN, brise et élimine l’enveloppe de la spore
Qu’est-ce que le développement dans le retour à l’état végétatif
Gonflement grâce à l’entrée d’eau
Que sont les appendices de surface
Facultatif. Formes des points de conjugaison entre des cellules bactériennes
C’est quoi pili dans les appendices de surface
Permet aux bactéries de se fixer les unes aux autres pour l’échange d’ADN. Certains pili sont également impliqués dans la motilité des contractions ou l’attachement à la surface. Fabrique à partir de protéines pilines.
C’est quoi fimbriae dans les appendices de surface
Nombreux et courts (présents chez les espèces de Salmonelle, Neisseria gonorrhoea et Bordetella pertussis (coqueluche). Pili plus longs et un ou quelques-uns par cible (cible des bactériophages)
C’est quoi la distinction entre pili et fimbriae
Pili plus long et un ou quelques-uns par cellule
Les flagelles sont-ils nécessaires aux bactéries à Gram négatif
Ils sont facultatif
Quels sont les composants des flagelles dans les bactéries à Gram négatif
Filament : flagelline. Crochet : Protéines du crochet. Corps basal : 3 anneaux
Que sont les flagelles dans les bactéries à Gram négatif
Moteur alimente par la force proton motrice, pas l’ATP. Capable de reconnaitre des flagelles des bactéries a Gram – et Gram +
Quelles sont les protéines Mot
Moteur flagelleaire
Quelles sont les protéines Fli
Interrupteur moteur. Le moteur flagellaire fait tourner le filament pour propulser à travers le milieu
C’est quoi les flagelles
Les flagelles sont des appendices locomoteurs filiformes s’étendant vers l’extérieur de la membrane plasmique et de la paroi cellulaire et sont composés de unités
D’où vient l’énergie du mouvement des flagelles
L’énergie pour le mouvement flagellaire provient de la force motrice du proton et implique un moteur protéinique, similaire à un moteur électrique. La rotation du moteur implique des interactions électrostatiques entre les protons qui sont détournés à travers un canal et les charges sur les acides aminés proches
C’est quoi l’anneau L et l’anneau P dans LPS
L’anneau L est intégré dans le LPS et l’anneau P dans le peptidoglycane
C’est quoi l’anneau MS
L’anneau MS est intégré dans membrane cytoplasmique
C’est quoi la rotation du moteur grâce aux protons
La rotation du flagelle est expliquée par un modèle type turbine à protons. Les protons traversant les protéines Mot exercent une force électrochimique sur les charges des anneaux C et MS entrainant la mise en mouvement du rotor
Expliquer les attractions positives et négatives dans la rotation du moteur
Les attractions entre les charges positives et négatives entrainant la rotation du corps basal lorsque le flux de protons traverse le stator.
Quelles sont les étapes de l’assemblage du flagelle
- Assemblage de l’anneau MS dans la membrane cytoplasmique
- Formation de l’anneau P dans le periplasme
- Formation de l’anneau L dans le LPS
- Formation du crochet et de la capsule
- Flagelline traverse le crochet pour former le filament
Où sont assemblés les flagelles
Les flagelles sont assemblés à partir de la membrane cytoplasmique
À quoi ressemblent les flagelles des bactéries à Gram positif
Les flagelles bactériens à Gram positif n’ont que 2 anneaux : Un ancré à la membrane cytoplasmique et un à la base de la paroi cellulaire
Pourquoi selon vous, les flagelles des bactéries ont Gram + n’ont que deux anneaux?
Absence de membrane externe (pas de LPS)
Comment s’appelle-t-il quand il y a un flagelle attaché à une extrémité
Monotriche
Comment s’appelle-t-il quand il y a un flagelle attaché à deux extrémités
Amphitriche
Comment s’appelle-t-il quand il y a un groupe de flagelles attachés à une extrémité
Lophotriche
Comment s’appelle-t-il quand il y a un groupe de flagelles attachés tout autour de la cellule
Peritriche
Quels sont les flagelles
Les flagelles sont des appendices locomoteurs filiformes s’étendant vers l’extérieur de la membrane plasmique et de la paroi cellulaire
C’est quoi le mouvement péritriche
Tous les flagelles tournent dans le sens anti-horaire et s’entrelacent
C’est quoi le vitesse de rotation de mouvement péritriche
Vitesse de rotation n’est pas constante, elle est dépendante de l’intensité de la force proton motrice
Quelle est la mobilité des bactéries dans le mouvement péritriche
La mobilité des bactéries polaires et lophotriches et microscopiquement différente des péritriches
Definir mouvement péritriche
Déplacement lent et majestueux
C’est quoi les flagelles péritriche
Les flagelles péritriches se regroupent et se déplacement dans le sens inverse des aiguilles d’une montre pour déplacer les bactéries
C’est quoi les flagelles polaires
En revanche, les flagelles polaires changent la direction du mouvement cellulaire en changeant le sens de rotation ou arrêtent la cellule pour une réorientation.
C’est quoi la rotation dans les flagelles polaires
La rotation dans le sens des aiguilles d’une montre fait basculer la cellule, puis un retour à la rotation dans le sens anti-horaire entraîne la cellule dans une nouvelle direction.
C’est quoi le mouvement polaire
Changement de direction en inversant le sens de direction
Comment est-ce que les cellules changent direction en mouvement polaire
Les cellules changent de direction en inversant la rotation flagellaire (donc en tirant au lieu de pousser la cellule), dans les flagelles unidirectionnels, en s’arrêtant périodiquement pour se réorienter, puis en avançant par rotation horaire de ses flagelles.
C’est quoi le motilité fluide
« Gliding proteins » dans les membranes cytoplasmiques et externe. Réseau de peptidoglycanes qui connectent ces protéines. Alimente par une force proton motrice
Qu’arrive-t-il aux bactéries qui n’ont pas de flagelles
Il existe des bactéries qui n’ont pas de flagelles, mais qui se déplacent quand même (déplacement par glissement) sur un support solide
C’est quoi la motilité de glissement
Un mécanisme utilisé par certains procaryotes par lequel ils côtoient des surfaces solides. Aucune structure visible n’est associée à cette forme de motilité, mais on pense que les protéines dans les membranes cytoplasmiques et externes se déplacement le long d’une piste située dans le périplasme sous l’effet de la force motrice des protons.
C’est quoi les filaments axiaux
Les filaments axiaux sont utilisés pour les mouvements « vis-bouchons » des spirochètes. Les filaments sont internes et sont également appelés « endoflagelle »
C’est quoi le chimiotactisme
Déplacement aléatoire en absence de molécules attractive
Quelles sont les molécules attractives dans le chimiotactisme
Molécules attractives entrainent un déplacement dirigé vers la source du gradient de ces molécules
Que se passe-t-il dans le chimiotactisme en l’absence d’attractivité chimique
La cellule se déplace au hasard, changeant de direction pendant les culbutes.
Que se passe-t-il dans le chimiotactisme lorsqu’il y a présence d’attractivité chimique
En présence d’un attractif, le déplacement est orienté et progresse vers le gradient de concentration élevé
Que détectent les bactéries photosynthétiques
Bactéries photosynthétiques détectent les longueurs d’ondes absorbées par les pigments. L’ensemble de la colonie de bactéries se déplace vers la source lumineuse
C’est quoi phototaxie ou phototactisme
Mouvement dirige des bactéries photosynthétiques vers longueurs d’onde de la lumière que leurs pigments peuvent absorber.
C’est quoi le mesure de chimiotaxie capillaire
Insertion d’un capillaire dans un suspension bactérienne. Le mouvement dirige vers un attractif peut être mesure par dosage capillaire. Un capillaire contenant un attractif provoquera un essaimage de bactéries dans un milieu liquide vers et vers le haut du tube. Un capillaire contenant un répulsif provoquera la dispersion des bactéries loin du tube.
C’est quoi le bleu couleur dans le mesure de chimiotaxie cellulaire
Contrôle
C’est quoi le vert couleur dans le mesure de chimiotaxie capillaire
Substance attractive
C’est quoi le rouge couleur dans le mesure de chimiotaxie capillaire
Substance répulsive
