Module 9 - Assignation populationnelle et parentale

Question 1

Assignation populationnelle = ?

Answer 1

Id. origine d’individus

Question 2

Assignation parentale = ?

Answer 2

Id. parents biologiques

Question 3

méthodes d’assignation populationnelle utilise quelles informations génétique?

Answer 3

• marqueurs polymorphes
• génotype multilocus de l’individu
• fréquence allélique des POP candidates

Question 4

quels marqueurs sont utilisés en assignation populationnelle?

Answer 4

• microsatellites
• SNP
• AFLP

Question 5

Comment assigner un individus a sa population selon la méthode classique?

Answer 5

1. génotyper un individus pour tout les loci
2. génotype un échantillon représentatif de toutes les populations candidates et calculer les fréquences alléliques
3. calculer la probabilité d’occurence et tranformation logarithmique
4. calcul de vraisemblance, assignation

Question 6

applications de l’assignation populationnelle

Answer 6

• Id. pop d’originie
• criminalistique (Id. captures illégales)
• mesure du taux de dispersion en temps réel
• mesure du patron de dispersion 9(m vs f, jeunes vs vieux, etc.)

Question 7

Si on ne connait pas la structure génétique des espèces, comment assigner un individus a sa POP?

Answer 7

méthode de groupement (clustering)

Question 8

quel marqueur est utilisé en assignation parentale? pourquoi?

Answer 8

-microsatellite

très polymorphes

Question 9

méthodes d’assignation parentale utilise quelles informations génétique?

Answer 9

• marqueurs (très polymorphes)
• génotype multilocus du rejeton
• génotypes multilocus des parents candidats

Question 10

assignation parentale : méthode d’exclusion =?

Answer 10

on élimine les parents qui ne partagent pas un allèle pour chaque locus, il faut connaître un des parents (généralement la mère)

Question 11

avantage/inconvénients de la méthode d’exclusion?

Answer 11

+ simple

• difficile d’exclure complétement dans de grosses population (bcp de parents et de progénitures)
• si mutation germinale, fausse exclusion

Question 12

assignation parentale : méthode d’allocation catégorique =?

Answer 12

choisir le seul parent, le plus probable

Question 13

assignation parentale : méthode d’allocation fractionnelle =?

Answer 13

calculer la probabilité de chaque parents

Question 14

avantage/inconvénients de la méthode d’allocation catégorique?

Answer 14

+ prend en compte erreurs de génotypage et les mutations

• calculs très diff. (ordi)
• moins intuitif

Question 15

avantage/inconvénients de la méthode d’allocation fractionnelle?

Answer 15

+ erreurs génotypes et mutations prises en compte
+ nécessite moins d’iinfo.
- pas d’assignation définitive

Question 16

applications de l’assignation parentale

Answer 16

• Id. paternité/maternité
• étude structure sociale
• étude strat. repro. (mono/polygamie, sélection sexuelle)
• variance du succès reproducteur