Module 10 -Phylogéographie + unité de conservation

Question 1

phylogéographie =?

Answer 1

Domaine d’étude traitant des principes et des processus qui gouvernent la distribution géographique de lignées évolutives distinctes, particulièrement au niveau intra-spécifique ou entre espèces très apparentées.

Question 2

qu’est-ce qui caractérise l’historique des généalogies de gènes en phylogéographie?

Answer 2

temps et espace

Question 3

approche phylogéographique vise a ?

Answer 3

1. De définir le nombre de lignées évolutives composant une espèce donnée.
2. Établir la répartition géographique de ces différentes lignées évolutives.
3. D’établir le temps de divergence approximatif de ces lignées
4. De reconstituer l’historique démographique et de dispersion
   de ces populations anciennes.
5. De comprendre le rôle des événements historiques
   (géologiques, climatiques, démographiques, etc) sur la
   structure et la diversité génétique des populations actuelles.

Question 4

Comment définir le nombre de lignées évolutives composant une espèce donnée?

Answer 4

• écht. (plusieurs sites sur l’aire de répartition de sp.)
• séquencer un/des gènes ciblés (ADNmt ou ADNcp)
• établir relation phylogénétiques entre haplotypes

Question 5

2 approches pr établir relation phylogénétiques entre haplotypes?

Answer 5

• par caractères

- par distance

Question 6

établir le temps de divergence approximatif de ces lignées : principe de l’horloge moléculaire =?

Answer 6

mutation s’accumulent a vitesse proportionnelle au temps géologique (Th évolution moléculaire: majorité mutation accumulée et conservée sont neutre)

• diff. régions du génome ‘‘tic’’ a vit. diff.
• niveau divergence génétique informe sur temps absolu ssi calibration

Question 7

pk variation génétique intra-sp. est importante?

Answer 7

Protection de plusieurs populations maximise le potentiel évolutif
et minimise le risque d’extinction

Question 8

unité de conservation: critère de Waples

Answer 8

-entités isolés reproductivement d’autres semblables

Question 9

unité de conservation: critère de Moritz

Answer 9

• réciprocité monophylétique (divergence de ADNmt)

- démontrer diff. marqueés de fréq. allélique

Question 10

unité de conservation: critère de Fraser et Bernatchez

Answer 10

-ESU varie d’un contexte a autre

Question 11

unité désignable=?

Answer 11

loi sur espèces en péril: unité (inférieure a sp.) évaluée pour être conservée par le COSEPAC

Question 12

caractères pour désigner UD?

Answer 12

-Preuves de la distinction génétique, comme, sans toutefois s’y limiter,
des traits hérités (morphologie, cycle vital, comportement) et/ou des
marqueurs génétiques neutres (alloenzymes, microsatellites, séquences d’ADN)
-Disjonction naturelle entre des portions importantes de l’aire de répartition
d’une espèce ayant grandement limité les mouvements des individus entre
les régions pendant une période prolongée, rendant les mouvements
peu probables dans un avenir proche et favorisant les adaptations locales
-Occupation de différentes régions écogéographiques qui sont pertinentes
pour l’espèce et qui reflètent une différence historique ou génétique, qui peut être
décrite sur une carte appropriée d’écozones ou de zones biogéographiques.
Il y peut y avoir une certaine dispersion entre les régions, mais elle n’est pas
suffisante pour empêcher les adaptations locales.

Question 13

caractères pour mesurer importance UD?

Answer 13

1. Preuves que ces UD diffèrent de façon marquée des autres en raison de caractéristiques
   génétiques témoignant d’une divergence phylogénétique intraspécifique relativement grande.
   (ex. différences fixes dans les séquences d’ADNmt ou nucléaire). Les différences de
   fréquence des allèles communs (microsatellites), ne sont généralement pas suffisantes.
2. Persistance d’une UD dans un contexte écologique inhabituel ou unique à l’espèce
   ayant donné lieu à des adaptations locales connues.
3. Preuves que la perte d’une UD créerait un énorme trou dans l’aire de répartition
   de l’espèce au Canada.