Module 4 - Épigénétique

Question 1

A quels niveaux se mesure la diversité génétique?

Answer 1

Moléculaire : polymorphisme et expression

Traits quantitatifs : taille, fécondité, adaptation, etc.

Question 2

Marqueur moléculaire : ADNmt = ?

Answer 2

mitochondrial

Question 3

Marqueur moléculaire : ADNmt

Avantages?

Answer 3

• très polymorphes
• Id. + nbr mutations
• Donnée universelle entre tout organismes

Question 4

Marqueur moléculaire : ADN microsatellite = ?

Answer 4

répétitions (ex: GTGTGTGT)

Question 5

Marqueur moléculaire : ADN microsatellite

Avantages?

Answer 5

• Degré de polymorphisme variable selon loci (versatilité d’application)
• Marqueur neutre (mais parfois liés)
• Facile et robuste

Question 6

Marqueur moléculaire : ADN microsatellite

Désavantages?

Answer 6

• Standardisation difficile

- Long + coûteux d’analyser bcp loci

Question 7

Marqueur moléculaire : SNP avec développement de marqueur

Avantage/Inconvénients

Answer 7

+: Précis, données facile a gérer en informatique

-: R&D SNP p-ê longue et coûteuse, biais possibles, coûteux

Question 8

Marqueur moléculaire : SNP sans développement de marqueur

Avantage/Inconvénients

Answer 8

+: Pas besoin de connaître le génome, biais réduit, bon rapport bénéfice/coût
-: Besoin bonne base en bio-info, traitement bio-info augmente temps analyse

Question 9

Séquencage génome entier

Avantage/Inconvénients

Answer 9

+: Aucun développement ou connaissance du génome requis, Biais réduit dans la représentativité allélique réelle, Accès à toute la variation génétique
-: coût séquencage, nécessite ADN frais

Question 10

Variation structurales

Answer 10

région ADN avec changement (nbr copies, orientation, position chr)

Question 11

Gènes-candidats

Answer 11

Marqueur avec lien direct entre polymorphisme et fonction