Module 7 - Structure Génétique des Populations Flashcards
effet de la dérive génétique sur la structure génétique des POP (intraPOP)
réduit la diversité, augmente consanguinité
effet de la dérive génétique sur la structure génétique des POP (extraPOP)
augmente la différenciation
effet de la mutation sur la structure génétique des POP (intraPOP)
augmente la diversité, réduit consanguinité
effet de la migration sur la structure génétique des POP (extraPOP)
homogénéise les fréquences alléliques (maintient diversité)
Dans le modèle de migration en îles, comment se font les échanges d’allèles?
De façon identique et stable
Dans le modèle de migration pas-a-pas, comment se font les échanges d’allèles? Comment varie le degré de divergence?
Entre POP adjacentes seulement, l’isolement par la distance fait augmenter le degré de divergence avec l’éloignement géographique
Dans l’équation: Fst=1/(4Nem+4Neu+1)
A quoi correspond Fst?
Fst = degré de divergence entre POP
Dans l’équation: Fst=1/(4Nem+4Neu+1)
A quoi correspond Nem?
nbr migrant/gen
Dans l’équation: Fst=1/(4Nem+4Neu+1)
A quoi correspond Neu?
Neu= taille efficace et taux de migration
Dans l’équation: Fst=1/(4Nem+4Neu+1)
A quoi correspond Ne?
Ne= taille efficace
Dans l’équation: Fst=1/(4Nem+4Neu+1)
A quoi correspond m?
m= taux de migration
Quelles sont les étapes pour évaluer la structure génétique d’une POP?
1- diversité génétique intraPOP
2- hypothèses non-nulle de différenciation
3-ampleur de la différenciation
Comment peut-on tester l’hypothèse non-nulle de différenciation?
Test de Fisher (analyse de chi-carré)
Comment peut-on évaluer lampleur de la différenciation?
Statistiques de Wright
Dans l’équation:
F=1-(Ho/He)
A quoi correspond F?
F= indice de fixation
Dans l’équation:
F=1-(Ho/He)
A quoi correspond Ho?
Ho= hétérozygotie observée
Dans l’équation:
F=1-(Ho/He)
A quoi correspond He?
He = hétérozygotie attendue
équilibre de hardy-weinberg
He=2pq
A quoi correspond 2pq?
fréquence de l’allèle hétérozygote Aa
statistique de Wright
comment est partitionnée la POP?
I-individus
S-sous-POP
T-POP totale
statistique de Wright
Fis=?
consanguinité des individus relativement a leur sous-POP
statistique de Wright
Fst=?
consanguinité des sous-POP relativement a la POP totale
statistique de Wright
Fit=?
consanguinité des individus relativement a la POP totale
statistique de Wright
si on obtient un Fis non-nul qu’est-ce que cela peut vouloir dire?
plusieurs causes possibles:
- auto-fécondation
- repro. entre individus apparenté + ou - qu’attendu avec le hasard
- effet Walhund
qu’est-ce que l’effet Walhund?
échantillonnage est un mélange d’individus appartenant a des POP génétiquement distinctes, résulte en un déficit apparent d’hétérozygotes
en génétique du paysage, quelle est la matrice?
la patch qui domine les autres
qu’est-ce que l’isolement par la résistance?
modèle ou certains éléments du paysage produisent un plus grande résistance au flux génique que l’isolement par la distance
la structure de POP résulte de la balance entre quoi?
mutation, dérive, migration, sélection
