Module 12 Flashcards
Que découvrit Friedrich Miescher en 1869?
Il découvrit dans le noyau des cellules une substance inconnue riche en azote et en phosphore qu’il baptisa « nucléine » qui n’était ni d’origine protéique ni d’origine lipidique.
La substance découverte par M. Miescher a été identifiée plus tard. De quoi s’agit-il?
Au XXe siècle, cette substance sera identifiée et nommée acide désoxyribonucléique (ADN)
À quoi réfère le terme «acide nucléique»?
Le terme « acide nucléique » réfère généralement aux 2 types de polymères linéaires constitués de nucléotides : l’acide désoxyribonucléique (ADN) et l’acide ribonucléique (ARN).
Nommez les fonctions qu’assurent les acides nucléiques.
- Médiateur chimique
o Nucléosides (adénosine) et nucléotides (AMPc)
-Source d’énergie
o Nucléotides
- Cofacteur dans les réactions enzymatiques
o Nucléotides et dinucléotides
- Rôle catalytique à la manière d’enzymes
o Ribozymes (exemple : une des espèces d’ARN dans le ribosome)
- Gardienne des caractères héréditaires o ADN
- Expression des caractères héréditaires o ARN
Quels sont les deux groupes de monomères d’acide nucléique?
Les nucléosides et nucléotides
De quoi sont formés les nucléosides?
Les nucléosides sont formés d’une base azotée et d’un ose reliés par un lien β-N-glycosidique.
De quoi sont formés les nucléotides?
Les nucléotides sont des esters phosphoriques de nucléosides
Comment apple-t-on les nucléotides?
Nucléosides phosphate puisqu’ils sont des esters phosphoriques de nucéosides.
Quels sont les 2 ou 3 constituants de monomères d’acide nucléique?
-base azotée
-monosaccharide
(-1 à 3 groupements phosphoryle)
La base azotée d’un monomère d’acide nucléique est dérivée de quoi?
Dérivée d’une purine ou d’une pyrimidine
- Pyrimidines (cytosine (ADN, ARN), uracile (ARN) et thymine (ADN))
- Purines (adénine (ADN, ARN) et guanine (ADN, ARN))
Quel est le monosaccharide dans un monomère d’acide nucléique?
Ribose ou désoxyribose
V/F On retrouve des groupements phosphoryle dans les nucléosides.
Faux, seulement dans les nucléotides
Pourquoi le préfixe « désoxy » n’est généralement pas utilisé pour la thymine dans la nomenclature des bases dans le cas d’un désoxyribonucléoside?
Puisque la thymidine est presque toujours un désoxyribonucléoside,
Quel est le ribonucléoside correspondant à chaque base ici: adénine, guanine, uracile, thymine, cytosine
adénosine, guanosine, uridine, thymidine, citidine
Quels sont les ribonucléotides correspondant à l’adénine?
AMP adénosine monophosphate
ADP adénosine diphosphate
ATP adénosine triphosphate
Quels sont les ribonucléotides correspondant à la thymine?
TMP thymidine monophosphate
TDP thymidine diphosphate
TTP thymidine triphosphate
V/F Les nucléotides peuvent former des polymères de différentes longueurs via la formation de liens phosphodiester.
VRAI
Nommez le nom de différents polymères pouvant être formés selon le nombre de résidus de nucléotides.
- Dinucléotide: 2 résidus de nucléotides
- Trinucléotide: 3 résidus de nucléotides
- Décanucléotide): 10 résidus de nucléotides
- Oligonucléotide: Entre 10 et 50 nucléotides
- Polynucléotides (ARN ou ADN) : Plus de 50
Quel lien rencontre-t-on fréquemment dans les dinucléotides?
Dans les dinucléotides, on rencontre fréquemment un lien entre la position 5’ de l’ose d’un des nucléotides et la position 5’ de l’autre.
Les dinucléotides agissent comment dans la cellule?
Ils agissent comme coenzyme
Quel terme est utilisé pour décrire les polymères dont les résidus sont réunis par des liaisons phosphodiester 3’ - 5’?
Polynucléotides
En quoi résulte la formation de liens phosphodiester successifs entre plusieurs résidus de nucléotides?
Ça résulte en un polymère linéaire
Comment sont appelés les polynucléotides constitués de désoxyribonucléotides?
acides désoxyribonucléiques (ADN)
Comment sont appelés les polynucléotides constitués de ribonucléotides?
acides ribonucléiques (ARN).
Quelles sont les fonctions des nucléosides, des nucléotides à l’état libre et des dinucléotides?
coenzyme, médiateur chimique, source d’E
Que caractérise les nucléotides cyclique (médiateur chimique)?
Un même groupement phosphate relie 2 carbones d’un même ose.
Donnez un exemple de nucléotide cyclique et la fonction qu’il remplit.
L’AMP cyclique (AMPc) qui joue le rôle de messager intracellulaire (second messager) dans certaines voies de transduction du signal.
Nommez un second médiateur chimique et son rôle à part l’AMPc.
Adénosine : hormone dans la régulation du sommeil. Lorsque le niveau d’adénosine augmente, la sensation de fatigue apparaît.
Comment le café intérragit-il avec l’adénosine?
La caféine combat la somnolence en bloquant les récepteurs neuronaux de l’adénosine.
Quelle est la source d’E par excellence de la cellule?
Les nucléosides triphosphates (NTPs), en particulier l’ATP.
Pourquoi les nucléosides triphosphate NTPs fournissent plus d’E?
Ils ont 2 liens anhydrides phosphoriques qui sont hautement énergétiques, donc ils stockent une quantité appréciable d’énergie sous forme de liaison covalente.
Comment l’énergie des NTPs est-elle libérée?
L’hydrolyse de ces liens permet de libérer l’énergie au moment approprié.
V/F L’acide désoxyribonucléique est le support de l’information génétique chez TOUTES les cellules.
Vrai
Dans quel type d’organisme est-ce que l’ARN joue le rôle de l’ARN?
Chez certains virus
V/F On retrouve de l’ADN seulement dans le noyau.
Faux, dans les cellules eucaryotes, l’ADN est principalement situé dans le noyau, mais on retrouve aussi de l’ADN dans des organites comme les mitochondries et les chloroplastes (ADN mitochondrial et ADN chloroplastique).
Quel terme réfère à l’ensemble du matériel génétique d’un organisme vivant ou d’un virus?
génome
Chez quel type d’organisme le génome peut-il être contenu dans une seule molécule d’ADN?
C’est le cas pour la majorité des bactéries
Par convention, le génome d’un eucaryote comprend-il l’ADN mitochondrial et l’ADN chloroplastique?
Non
Qu’est-ce qui constitue le génome chez les eucaryotes?
Le jeu complet des différentes molécules d’ADN qui sont présentes dans le noyau (autrement dit, l’ADN correspondant au jeu haploïde des chromosomes chez les organismes diploïdes)
V/F La composition en bases de l’ADN varie selon l’espèce
Vrai
Résumez la structure double hélice de l’ADN.
- L’ADN est constitué de 2 chaînes polynucléotidiques qui sont enroulées l’une sur l’autre pour former une hélice régulière. Cette structure hélicoïdale présente un petit et un grand sillon à sa surface.
- A-T via 2 liens H, G-C via 3 liens H.
- Les paires de bases sont empilées les unes sur les autres à l’intérieur de la double hélice, et le squelette ose-phosphate est à l’extérieur.
- Les 2 brins de l’hélice d’ADN sont antiparallèles et complémentaires.
V/F Les deux brins de l’hélice de l’ADN sont parallèles.
Faux, antiparallèles.
Quel est le contenu G+c du génome humain?
39,8%
Comment est exprimée la taille des molécules d’ADN double brin?
en bp ou en kilopaires de bases (kb, 1 kb = 103 pb), mégapaires de bases (Mb, 1 Mb = 106 pb), ou gigapaires de bases (Gb, 1Gb = 109 pb)
Quelle est la taille du génome en bp chez les virus?
Quelques kb
Quelle est la taille du génome en bp chez les eucaryotes?
Plusieurs centaines de milliers de Mb
Quelle est la taille du génome humain en bp?
3,200 Mb (ou 3,2 Gb).
Quelle est la taille du génôme de la bactérie Escherichia coli?
4,6 Mb
V/F La taille du génome est nécessairement proportionnelle à la complexité d’un organisme. Donnez un exemple.
Faux, par exemple, la plante herbacée Paris japonica a un génome qui est près de 50 fois celui du génome humain.
Qu’est-ce que la dénaturation de l’ADN?
Le processus par lequel les 2 brins d’ADN se séparent complètement suite aux bris des liaisons hydrogène et des interactions hydrophobes.
V/F La dénaturation de l’ADN se passe dans les cellules.
Faux. Elle peut être provoquée in vitro.
Qu’est-ce qui est utilisé pour dénaturer l’ADN?
Les agents utilisés pour séparer les brins d’ADN sont la chaleur, un pH élevé, ou un agent chaotropique comme l’urée.
Qu’est-ce que l’effet hyperchrome ou l’hyperchromicité?
Lorsque la température de la solution d’ADN est augmentée jusqu’au point d’ébullition de l’eau, l’absorbance augmente fortement.
Pourquoi les bases dans l’ADN double brin (ou bicaténaire) absorbent environ 40 % moins de lumière UV que les bases dans l’ADN simple brin (monocaténaire)? (effet hyperchrome)
L’empilement des bases à l’intérieur de la double hélice diminue leur capacité à absorber les rayons UV.
Qu’est-ce que la courbe de fusion?
une courbe sigmoïde obtenue lorsqu’on reporte les valeurs d’absorbance de l’ADN en fonction de la température
Que démontre la forme sigmoïde de la courbe de fusion?e
La forme sigmoïde démontre que la dénaturation est un processus hautement coopératif.
Pourquoi les liens H à l’intérieur de la double hélice sont plus stables que les liens H en milieu aqueux
Parce qu’ils sont à l’intérieur de la zone hydrophobe.
Pourquoi dit-on que la dénaturation est coopérative?
parce qu’à partir du moment où le processus de dénaturation est amorcé, la vitesse de bris des liaisons s’accélère.
Le bris des premières liaisons H entre les 2 brins demande plus d’énergie, puisque la structure de la double hélice est stable. Lorsque les premières liaisons H sont brisées, l’intérieur de l’hélice devient plus accessible aux molécules d’eau, ce qui facilite la rupture des liens adjacents.
Qu’est-ce que la température de fusion Tm pour l’ADN?
La température correspondant à la moitié de l’augmentation d’absorbance observée, ou autrement dit à la température pour laquelle 50 % de l’ADN est dénaturé
Complétez la phrase. La Tm est directement proportionnelle au ….
au contenu G+C
