Métagénomique Flashcards
Qu’est-ce que la métagénomique ?
La transposition des techniques d’études d’un génome seul à l’ensemble d’un génome d’une population bactérienne.
Quelle différence entre une population et une communauté ?
Population : ensemble d’individus de la même espèce.
Communauté : ensemble de populations.
Quelle est la première étape d’une analyse métagénomique ?
On extrait de l’ADN à partir d’un prélèvement environnemental. Peut être pénible, il faut avoir des kits d’extraction respectant les conditions physico chimiques de l’environnement. Puis, on analyse le contenu de l’environnement, poru voir ce qui risque de perturber des trucs.
Une fois l’ADN environnemental extrait, que faire ?
ON construit des banques, qu’on criblera de manière globale pour identifier des gènes d’intérêts.
Lorsqu’on fait un screening des banques, quel petit problème peut on encontrer ?
On peut ne pas prendre en compte certaines populations peu représentées dans cet environnement.
A part l’identification de gènes d’intérêts par leur séquence (screening) que peut on faire ?
Faire un screening basé sur l’activité, en produisant des banques de clones à partir de l’ADN extrait puis de les exprimer dans des hôtes.
Lorsqu’on fait de la métaprotéomique, quelle technique d’analyse est privilégiée ?
La spectro de masse en tandem. Impossible de faire des techniques qui nécessitent de fragmenter, car y’en aurait trop.
