Métabolisme microbien Flashcards
Les types nutritionnels dépendent de quoi?
Source d’énergie et source de carbones.
Quels sont les sources d’énergie possibles?
Phototrophe (lumière)
Chimiotrophe (composé chimique)
Quels sont les sources de carbones possibles?
Autotrophe (CO2)
Hétérotrophe (composé organiques)
Rétro-inhibition?
Produit final de la voie métabolique va inhiber l’enzyme précédente.
Cool car non-compétitive et pas énergivore comparativement à une régulation génique
Voies métaboliques
Suite de réactions biochimiques composées d’étapes successives
et interdépendantes (catabolique ou anabolique).
Enzyme
Protéine augmentant la vitesse des réactions biochimiques en diminuant l’énergie d’activation nécessaires aux réactions (= catalyseur biologique).
Apoenzyme
Inactive, nécessite un cofacteur ou une coenzyme
Coenzyme
Molécule organique
Cofacteur
Ion métallique
Holoenzyme
Enzyme activée liée à son cofacteur/coenzyme
Endoenzyme
Enzyme intracellulaire
Exoenzyme
Enzyme extracellulaire
La régulation de l’activité enzymatique se fait sur deux volets. Lesquels sont-ils?
Activité de l’enzyme (interaction substrat-produit)
Synthèse de l’enzyme (agit au niveau de la transcription et de la traduction)
Inhibition compétitive
Régulation de l’activité de l’enzyme
Compétition entre un inhibiteur compétitif et un substrat. Néanmoins, si on augmente la [substrat], la réaction sera favorisée.
Inhibition non compétitive
Régulation de l’activité de l’enzyme
L’inhibiteur non compétitif va se lier sur un site allostérique et va entraîner la déformation du site actif… donc [substrat] ne va avoir aucun impact.
Qu’est-ce qui est utilisé pour agir sur la synthèse de l’enzyme?
Activateurs ou inhibiteurs de transcriptions
Enzyme inductible
Transcrite et traduite au besoin afin de conserver de l’énergie et économiser de l’espace
À l’opposée d’une enzyme constitutive
Quand la régulation d’une enzyme inductive à lieu
Avant la transcription
Quels sont les deux modes de régulation prétranscriptionnelle
Répression et induction
Répression
Diminution de la synthèse enzymatique par l’utilisation de répresseurs au niveau de l’ARN polymérase bloquant la transcription.
Induction
Stimulation de la synthèse enzymatique par l’utilisation d’inducteurs
Opéron?
Gènes adjacents dont l’expression est régulée simultanément par le(s) même(s) gène(s) régulateur(s)… soit le même promoteur et le même opérateur
C’est quoi l’avantage d’un opéron?
Le fait de rassembler plusieurs gènes permet un contrôle plus rapide et mieux contrôler les régulateurs eux-
mêmes.
Promoteur
Lieu de liaison de l’ARN polymérase
Opérateur
Lieu de la liaison du répresseur
LacI
Protéine régulatrice constitutive qui se lie à l’opérateur (O)…
Elle joue un rôle de répresseur
Lac Z, lac Y, lac A
Enzymes impliqués dans la digestion du lactose
- lacZ : Beta-Galactosidase (transforme le lactose en glucose et en galactose)
- lacY : Perméase (transporte le lactose à travers la membrane cytoplasmique)
- lacA : Transacétylase (transforme les galactosides)
L’opéron lac est inductible ou répressif? Pourquoi?
L’opéron lac est inductible (le répresseur s’inactive en présence d’un inducteur, soit l’allolactose)
Répression catabolique
Répression où une dégradation domine l’autre (soit celle du glucose sur celle du lactose)
À quoi correspond la période de latence dans la courbe biphasique glucose-lactose
Au moment où l’AMPc s’accumule et qu’on commence tranquillement à réaliser la transcription, puis la traduction.
Évidemment, il n’y a pas de croissance cellulaire ni d’utilisation du lactose.
Qu’est-ce qu’un opéron répressible? Donne un exemple
Diminution de la synthèse enzymatique par l’utilisation de répresseurs au niveau de l’ARN polymérase bloquant la transcription.
Opéron trp
