Classification en taxonomie Flashcards
Nomme les 4 rôles de la classification des organismes
- Regrouper les organismes similaires
- Identifier des organismes déjà classés
- Établir des critères d’identification de nouvelles espèces + les nommer
- Obtenir de l’information sur la proximité évolutive des organismes
Quels sont les règnes de Linné?
Plante, Animal
Quels sont les règnes chez Haeckel
Microorganisme, animal, plante, protiste
Quels sont les règnes chez Whittaker
Microorganisme, animal, plante, protiste, champignon
Qu’est-ce que le système de Woese conclut?
Eucaryote sont évolutivement éloigné des procaryotes et que les archés sont plus près des eucaryotes (3 grands domaines du vivant, soit les eucaryotes, les archées et les procaryotes après l’étude des sous-unité ribosomale)
ARNr ?
Fonction structurale pour le ribosome. La séquence est très conservée (16S chez bactérie et archée et 18S chez eucaryotes)
Qu’est-ce qui distingue la paroi cellulaire des procaryotes de celle des archées/eucaryote
Celle des bactéries contient du peptidoglycane
Qu’est-ce qu’un espèce virale?
Population de virus présentant des caractéristiques similaires (morphologie, gènes et enzymes visées) et ayant une niche écologique spécifique.
Nomme des arguments qui appuie la théorie de l’évolution par endosymbiose (il y en a 7 au total)
Pour les mitochondries/chloroplastes:
1) Même taille que les bactéries
2) ADN circulaire
3) ARNr 16s
4) Ribosome 70S
5) Synthèse protéique inhibée par streptomycine (antibiotique)
6) Fission binaire
7) Double membrane (comme Gram négatif)
Défini l’espèce eucaryote
Ensemble d’organisme étroitement apparentés et pouvant produire des descendants fertiles
Défini l’espèce procaryote
Population de cellules bactériennes ayant des caractéristiques semblables
Souche bactérienne?
Groupes distincts à même une espèce
Manuel de référence en classification des bactéries?
Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology
Classification en 2024 basée sur quoi?
Séquence ARNr 16S ou génome complet
Quelle est la différence entre la classification et l’identification?
En identification on va vouloir aller rapidement alors qu’en classification on va prendre le temps de caractériser le plus possible la bactérie (source/habitat, composition de la paroi, besoin en O2, épreuve biochimique…)
Classification et identification:
Méthode traditionnelle par caractère morphologique?
Étude individuelle d’une culture pure en utilisant la microscopie (forme, taille, groupement, structures visibles)
Pas suffisant pour une identification formelle
Classification et identification:
Méthode traditionnelle par caractère tinctoriaux?
Colorants pour faire ressortir particularités (ex: coloration différentielles)
Résultat en fonction de la composition chimique de la paroi
Classification et identification:
Méthode traditionnelle par épreuve biochimique
Pour ressortir la présence d’enzymes spécifiques chez les bactéries
▪ Test de fermentation des sucres
▪ Test de l’oxydase
▪ Test de la catalase (protection contre prod. réactifs de l’oxygène)
Possibilité de faire +sieurs tests en simultané (miniaturisation)
Classification et identification:
Méthode traditionnelle par épreuve sérologique
Sérologie : étudie le sérum sanguin et les réponses immunitaires
(présence d’anticorps)
▪ Met en évidence les antigènes bactériens
▪ Permet de différencier des souches (ex : streptocoques)
Classification et identification:
Méthode traditionnelle par lysotypie
Analyse des bactériophages (spécifiques parfois jusqu’à la souche) capables d’infecter une bactérie.
Utile pour identifier la souche.
Classification et identification:
Méthode moléculaire par la composition des bases de l’ADN
Évaluation de la teneur en G+C dans l’ADN (proximité évolutive selon la différence entre les pourcentages.
Permet de savoir si une portion du génome a été acquis de façon horizontale
Donnée non-utile seule
Classification et identification:
Méthode moléculaire de l’ARNr
Analyse possible sans faire croître les microorganismes
Présent dans toutes les cellules
Peu de variation temporelle
