Manipulación de genes y PCR Flashcards
importancia de la extracción de DNA
Primer paso para todos los estudios de biología molecular, med forense, bioinformática, nanotecnología de DNA, historia y antropología
la elección del método de extracción de adn depende de
- tipo de ac nucleico que se va a extraer
- organismo origen
- fuente del ácido nucleico (cultivo, sangre, tejido, lcr)
- técnica en que se utilizará el ácido nucleico extraído
qué se requiere para la pcr
- secuencia de dna
- enzima dna polimeraa
- desoxirribonucleótidos (dNTP)
- primers
función de la DNA polimerasa en PCR
polimeriza una cadena de DNA tomando como molde una preexistente.
se utiliza Taq (proviene de hongos)
esquema de la PCR (pasos)
- desnaturalización
(95°C) de 20 a 30 segs - amplificación= hibridación
- primers se alinean al extremo 3’
- tm 50°C a 60°C - extensión o elongación
- taq polimerasa pone nucleótidos sobre el complejo templado de primers, agrega dNTP complementarios para crear cadenas completas
- 72°C
características y aplicaciones de PCR estándar
Amplificación de un segmento de ADN utilizando dos partidores. Gel de agarosa
Aplicaciones: detección cualitativa de un segmento de ADN (está o no está)
punto final (realizada en nuestro lab)
características y aplicaciones de PCR múltiple
amplificación de 2 o más segmentos en una sola reacción de amplificación. gel de agarosa
Aplicación: detección cualitativa de varios segmentos en una sola pcr
varientes covid, diferentes bacterias
características y aplicaciones de PCR RFLP
(restriction fragment lenght polymorphisms)
pcr estándar con paso agregado de digestión con enzimas de restricción
aplicación: detección de polimorfismos genéticos (SNPs)
características y aplicaciones de PCR RT (reverse transcriptase)
Síntesis de cADN a partir de ARN mediante transcripción reversa seguido de una pcr
aplicación: expresión de genes, detección de virus ARN (covid-19)
características y aplicaciones de PCR TR (tiempo real) o PCR-qPCR
se utilizan tinciones o sondas con fluoros para la detección de los fragmentos amplificados, puede ser tipo mútliplex
aplicación: cuantificación o sea carga viral
se realiza a través de una compu, no necesita electroforesis
es mucho más específica y sensible
análisis de ácidos nucleícos
sistema reportero fluoresncencia (específicos sondas fluorescentes / no específicos SYBER Green)
Cuantificación
- absoluta: número exacto de copias amplificadas, mide carga viral, concentración de ácidos nucleicos
- relativa: evalúa cambios en la expresión de genes utilizando un gen de referenia que no cambia y el gen blanco