Daño y reparación del DNA

Question 1

cuando hay una lesión en DNA

Answer 1

DNA pol d y e se detienen
Polimerasas de síntesis a través de lesión, no corrige, lo brinca para que D y E puedan seguir.
Las polimerasas de TLS realizan la síntesis del DNA en la región dañada.

Si el daño persiste => apoptosis o muerte celular programada

Question 2

tipos de daño endógenos

lista (5)

Answer 2

1. error replicativo
2. desaminación de espontánea de base
3. pérpida de bases
4. daño oxidativo
5. metilación

Question 3

tipos de daño exógenos

lista (4)

Answer 3

1. radiazión ionizante
2. radiación ultravioleta
3. agentes alquilantes
4. agentes aromáticos

Question 4

mecanismos de reparación del DNA

Answer 4

1. escisión de base (BER)
2. escisión de nucleótidos (NER)
3. mismatch (MMR)
4. recombinación homóloga (HR)
5. unión de extremos no homóloga (NHEJ)

Question 5

Error replicativo, tipos

Answer 5

a. ADN polimerasa: incorpora nucleotido erróneo
“mutaciones espontáneas”
b. Topoisomerasa: cuando cortan 2 hebras y se alinean mal

Question 6

Desaminación espontánea de base

Answer 6

a. Alteración de bases N, perdida de amino exociclico
i. Citosina a uracilo
ii. Adenina a hipoxantina
iii. Guanina a xantina
iv. 5-metil citosina a timina

Question 7

Pérdida de bases

Answer 7

a. Hidrolizacion o ADN glicosilasa:
rompe enlace N-glucosidicos
(perdemos purinas y queda
espacio (sitio AP)

Question 8

función de la Tirosil ADN fosfodiesterasa y endonucleasa

error replicativo

Answer 8

Quita topos extras y evita el exceso de topoisomerasas

Question 9

Daño oxidativo

Answer 9

a. Especies reactivas de oxigeno
i. O2 (superoxido)
ii. H2O2 (peroxido de H)
iii. OH (radical hidroxilo)
b. Exceso de radicales de O causa:
i. Genera dobles enlaces covalentes entre bases
ii. Fragmenta purinas y pirimidinas (quita bases)
iii. Rotura de una sola hebra de ADN
iv. Forma 8-oxoguanina

Question 10

Metilacion del ADN

Answer 10

a. Marca hebra original para señalizar en grupos metilo (-CH3) en una base N
i. Metilacion de citosina (normal) en el ADN
b. Las mutaciones inhiben la sintesis de ADN
i. Metilguanina, metiltimina, metiladenina

Question 11

Radiación ionizante, cuáles son, qué causan y cómo se repara?

Answer 11

Alfa, beta, gamma, neutrones y rayos x
Que causa?
i. ruptura de 1 o 2 cadenas de ADN
c. Como se repara?
i. Endonucleasa: quita nucleotidos para dejar el corte
parejo
ii. Tirosil ADN fosfodiesterasa 1: repara
iii. Reparacion homologa

Question 12

Radiación ultravioleta

Answer 12

a. Tipos:
i. UV-C 190-290 nm (daña ADN, rompe 2 hebras)
ii. UV-B 290-320nm
iii. UV-A 320-400 nm
b. ADN absorbe longitud de onda de 260nm
c. Forma enlaces covalentes entre pirimidinas y
fotoproductos de pirimidinas

Question 13

Agentes alquilantes

Answer 13

a. Funcion: adhiere grupos alquilos al ADN
i. Metil, etil
b. Ejemplos: tabaco, agentes mostaza nitrogenadas.
cisplatino y ciclofosfamida (fármacos)
c. Que causa?
i. Forma puentes cruzados
ii. Fragmenta el ADN

Question 14

Agentes aromáticos

Answer 14

a. Que hacen?
i. Sustitución de bases
ii. Altera geometría del ADN
b. Necesitan: activación metabolica por citocromos P450
c. Ejemplos: tabaco, carbon, pesticidas
o Puede ocasionar enfermedades (cancer, envejecer)

Question 15

reparación por escisión de bases

error en una sóla hebra

Answer 15

a. Que hace?
Elimina nucleotidos alterados
b. Que repara?
i. Desaminaciones, alquilaciones y especies reactivas de O
c. Pasos:
1. Identificar la base nitrogenada que está alterada (N glucosídico= base y pentosa)
2. DNA glucosilasas Tiene que quitar fosfato y pentosa unido para poder poner un nucleótido.
3. Endonucleasa AP rompe el enlace en sitio a-pirimidínico.
4. Ya hay hueco
5. DNA Pol B pone el nucleótido
Ligasa pone los enlaces fosfodiéster que faltan.

solo falta una base, no tienen que cortar pedazos ni codones

Question 16

Reparación por escisión NUCLEÓTIDOS (NER)

error en una sóla hebra

Answer 16

Dímeros Uniones
Uniones de pirimidinas forman dímeros. Distorsión de la hebra. Vía genómica global que corrige las cadenas de DNA en el resto del genoma.
Cómo repara?
1. XPC reconoce el sitio de error
2. rompe helicasa
3. RPA es la proteína de cadena simple
4. Endonucleasa (XPF y XPG) hidroliza enlaces fosfodiéster hacia los lados, de modo que se lleva un gran pedazo .
DNA Pol D y E es la que rellena

quitan todo un pedazo y luego lo van rellenando

Question 17

Reparación por mismatch (MMR)

Answer 17

Bases mal apareadas, adenina con citosina, guanina con adenina
Una base es muy susceptible de oxidación por especies reactivas

Se diferencia de la de escisión de bases porque esta reparación se realiza en el momento de replicación.
Pasos:
i. ADN OGG1: reconoce a adenina unida a GO
ii. Metil-directed mismatch repair: elimina adenina y sustituye por citosina
iii. Reparación de bases mal apareadas
iv. MSH:reconoce bases mal apareadas
v. MLH: permite formación de complejo de reparación
vi. Exonucleasas: en los extremos quita
vii. DNA alfa empieza luego, delta o epsilon: corrige y rellena hueco
viii. Ligasa: une

Question 18

Reparación por recombinación homóloga

Se usan cuando hay rupturas de las dos cadenas

Answer 18

Cada vez que tengamos una hebra sola, llega RPA, llega el sistema RAD (complejo MRN)
Atm identifica cuando hay un error él es el encargado llamar al complejo MRN (RAD 50: proteína, MRE11, NBS1)
1. MRE11 y NBS1 (agarran extremos, se unen
y activan) y RAD 50 (llama otros RPA)
iii. RPA se une a cadena sencilla
iv. RAD 51, 52 y 54 movilizan hebras para su
recombinacion homologa
v. ADN polimerasa
vi. Moviliza
vii. ADN polimerasa

Question 19

Reparación NO Homóloga

Answer 19

DNA-PKcs: reconocimiento de los cortes de DNA, mantienen los extremos cerca para su procesamiento.
Exonucleasa Artemisa empareja los bordes, quita los nucleótidos para dejarlos lisos,
MRE11, NBS1 y RAD50: actividad nucleasa
XRCC4 ligasa