Maladies pédiatriques rares Flashcards
une maladie rare touche combien de personne?
1 personne sur 2000
environ combien de maladies rare sont répertoriées ?
7000
quelle proportion de maladie rare touchent les enfants?
3/4
vrai ou faux: tout les maladies rares sont génétiques
faux, 80% sont génétiques
quel maladie a été la première maladie héréditaire importante pour laquelle nous avons trouver le gène causal?
la fibrose kystique
pourquoi est-ce que les compagnies pharmaceutiques ne veulent pas faire de recherche pour développer des médicaments pour des maladies rares?
parce que le marché est trop restreint pour justifier les couts et avoir un retour sur leurs investissements
quel est l’objectif principal de PRISMES?
améliorer les connaissances sur les dysfunctions moléculaires associés à certaines maladies rares
une analyse du caryotype permet quoi? Il évalue quoi?
l’examen de l’ensemble des chromosomes d’une cellule du patient à partir d’une vue microscopique, il évalue le nombre et la structure des chromosomes
combien de paire de chromosome est-ce qu’un humain a ?
23
quel est une analyse CGH?
cette analyse compare le génome du patient à un génome de référence, identifie les différences entre les deux génomes, et donc localise les régions de déséquilibre génomique chez le patient
quel est une mutation ponctuelle silencieuse? Faux-sens? non-sens?
silencieuse: mutation dans laquelle un nucléotide est changé mais l’acide aminé ne change pas
Faux-sens: un nucléotide est changé et induit le changement de l’Acide aminé
Non-sens: un nucléotide est change et induit le changement de l’acide aminé en codon stop
quel sont les deux niveau de vérification de la longeure d’une protéine?
- ARNm avec codon stop pre-mature sont dégradés
- si la protéine tronquée est synthétisée, elle sera la plupart du temps dégrader dans le reticulum endoblastique avant d’être livrer à la membrane
vrai ou faux: les insertions/déletions peuvent seulement arriver avec décalage de cadre de lecture
faux ils peuvent aussi arriver sans décalage de cadre de lecture
une mutation ponctuelle splicing qui créer un nouveau site de splicing a quel effet sur l’ARN? une abolition d’un site?
création: perd un bout de l’ADN qui est supposer être coder
abolition: garde une region d’un intron qui n’est pas supposer être présent dans l’ARN
quel est l’Effet d’une mutation ponctuelle régulatrice?
augmentation ou diminution de l’expression d’un certain gène
une mutation d’expansion répétitive instable serait causer par quoi?
un mécanisme appelé le slippage durant la réplication et/ou réparation de l’ADN
Les expansions répétitives instables causent la plupart du temp quel sorte de maladie?
maladie neurodégénérative
quels sont les 5 façons que les mutations peuvent être sur un allele ?
- wild type: pas de mut
- heterozygote: une mutation sur un allele
- homozygote: une meme mutation sur les deux alleles
- compound heterozygote (in trans): 2 différentes mutations sur les deux allèles du meme gene
- compound heterozygote (in cis): 2 différentes mutations mais sur le meme allele
quel est le risque le l’enfant soit malade si on a une mutation autosomique dominante?
50%
quel est le risque que l’enfant soit malade si on a une mutation autosomique récessive ?
25% MAIS les deux parents doivent avoir une mutation du meme gene
Si le père a une mutation dominante liée à l’allele X, Quelles sont les chances que son gars ou sa fille soit malade?
gars: 0%
Fille: 1005
si la mère a une mutation récessive liée à l’X, quels sont les chances que sont gars ou sa fille soit malade?
Gars: 50%
Fille: 0% MAIS elle a 50% d’être conductrice
pourquoi est-ce qu’une fille a 100% de chance d’être conductrice d’une mutation récessive lié à l’X venant de son père?
Parce-que son père a seulement un X a lui donner
quel est une mutation de novo?
une mutation récente qui s’est produit dans une cellules sexuelle d’un des deux parents
vrai ou faux: lors d’une mutation de novo le parent est toujours affecté par la mutation
Faux le parent est jamais affecté puisque c’Est une maladie produite dans les cellules sexuelles du parent
pourquoi est-ce que toutes les mitochondries d’un individu lui bien de sa mere?
parce-qu’il n’y a pas de cytoplasme dans un spermatozoide donc ils ne peuvent pas être transmise à l’enfant
la sévérité d’une maladie transmis par les mitochondries dépend de quoi?
la proportion de mitochondrion d’un individu dans lesquelles le gène impliqué est muté
quels sont les 7 étapes de la méthodologie du projet prismes?
- recrutement de patients
- Prélevement
- traitement des échantillons pour une bio banque
- séquencage de l’exome
- analyze des variants
- analyse complémentaires
- divulgation des résultats aux familles
quels sont les critères d’inclusion pour le recrutement de patients?
- patient vivant et membres apparentés biologiques atteint ou non
- clientele pédiatrique est priorisée mais des jeunes adultes peuvent être recrutés
- avoir obtenu un diagnostic de pathologie: neurodegenerative, neuro musculaire, syndrome polymalformatifs ou métaboliques
- ne pas avoir obtenu l’identification de la cause de la maladie
- avoir été identifié comme participant potentiel par le médecin responsable
quels sont les 4 sortes d’échantillons biologiques qui peuvent être prélever et que pouvons nous faire avec ?
- sang: extraction ADN, backup, immortalization des cellules B
- urine: Extraction proteines
- salive: extraction ADN
- biopsie: ADN-ARN-protéine
quels sont les trois échantillons crée avec l’extraction d’ADN?
un echantillon pour le NGS, un backup, et un stock
quels sont les étapes à l’immortalisation de lymphocytes B?
- isole les globules blancs
- les infecte avec le virus Epstein-barr ce qui tue toutes sauf les cellules B, eux ils sont immortalisée
- on les mets en culture
- on les congèle à l’azote liquide
pourquoi est-ce qu’on s.quence seulement l’exome? pourquoi pas le génome?
Parce que le génome est beaucoup trop grand, si on le séquence tout on pourrait manquer une mutation présent dans l’Exome qui est la partie la plus importante puisque les exons sont ceux qui sont codants
pourquoi est-ce que on reconfirme la présence du variant par séquence Sanger?
pour s’Assurer que le variant est bel et bien présent, Sanger séquence juste des petites parties il est donc plus précis
Pourquoi est-ce qu’on utilise le logiciel RedCap?
Parce que le logiciel peut contenir tout les données du projet du recrutement jusqu’au trouvailles
dans le Cas-1 l’examen clinique du petit gars de 6 ans a démontré quoi?quels étaient ces symptomes?
une atrophie musculaire généralisée, retard moteur durant sa première année de développement, a page de 6 ans il ne pouvait pas courir, sauté et avait difficulté à monter les marches
les parents du cas-1 étaient co-sanguin à quel niveau? ça laisse suspecter quelle sorte de transmission?
leurs grand-mères étaient des soeurs
transmission autosomal
Dans le cas-1 qu’est-ce qu’ils ont trouvé dans la biopsie?
présence de corps de némaline en forme de bâtonnets indicatifs de myopathie à némaline
qu’est-ce qu’il a été trouver après le séquencage de l’exome du cas-1?
une nouvelle mutation homozygote dans l’intron 144 du gène de la nébuline
des mutations dans le gène de la nébuline-NEB ont été associés à quoi?
des myopathies à némaline
la nébulise est exprimée principalement ou?
dans le muscle squelettique
quel sont les roles de la nébuline?
- réguler la longueur des filaments d’actine
- interaction actine-myosine-régulation
- contraction musculaire
vrai ou faux: la nébuline est une des plus grosses protéines des vertébrés
vrai
quels exons de la nébuline n’ont jamais été retrouvé dans le même transcrit?
143 et 144
le gène de la nébuline est retrouver sur quel chromosome?
2
la substation dans l’intron du cas-1 pourrait créer quoi?
un nouveau site d’epissage qui afffectrait l’epissage naturel
le nouveau site d’epissage dans le cas-1 a quoi comme répercussion?
la cellule a autant de probabilité de couper lui que le site original ce qui pourrait affecter le niveau des isoformes ainsi que leurs fonctions
l’ajout des 118 paire de base lors que le nouveau sit d’epissage du cas-1 est chosis cause quoi au niveau de l’ADN?
un décalage du cadre de lecture changeant ainsi la séquence d’acide aminé pour introduire un codon stop prématuré, ces ARNms sont dégradés et très peu de clones sont détectés
les deux patients vivant du cas-2 présentaient quels phenotype?
-microcéphalie
- retard du développement
- crises d’épilepsie
- myeline anormale
- etc.
la mutation retrouvée dans le cas-2 était retrouvée dans quel gène?
pyridoxal phosphate binding protein
une déficience dans la PLPBP est associé à quoi?
épilepsie précoce dépendante à la vitamine B6
les deux patients du cas-2 avaient des antécédents de quoi?
leur meres avaient pris des antécédentes de suppléments prénataux contenant de haute dose de pyridoxine
quel était la mutation observée dans le cas-2? ça donnerait une protéine comment?
une délétion des nucléotides 370-373 (GACA), une protéine tronquée de 124 AA au lieu de 285
