Ligands Flashcards
Définir généralement un récepteur
Protéine médiatrice, transmembranaire ou autre, qui réagissent à un ligand pour donner une réponse
Définir généralement un ligand
Substance biologiquement active qui exerce une action via sa liaison avec un récepteur
Quelle est l’interaction ligand-récepteur la plus commune?
Un changement de conformation du récepteur induit par le ligand
Vrai/Faux : un récepteur a une activité constitutive, qui correspond à son activité lorsque lié à un ligand
Faux, l’activité constitutive d’un récepteur correspond à son activité lorsqu’il n’est pas lié, donc à son état basal en quelque sorte
Décrire les trois modes d’actions d’un ligand et leurs variations
Agoniste : complet ou partiel, induit (active) le récepteur lorsqu’il se lie à celui-ci
Antagoniste : aucune réponse lorsqu’il se lie au récepteur
Agoniste inverse : complet ou partiel, inhibe le récepteur lorsqu’il se lie à celui-ci
Schématiser simplement la cascade d’action d’un ligand sur un récepteur, avec un exemple
Correction diapo 15 PDF cours 7
Quelle est la méthode de discrimination des ligands marqués liés et non liés, et comment ça fonctionne?
Filtration : on fait passer le mélange de ligands et de récepteurs par un filtre, qui peut être slm perméable par exemple aux ligands marqués non liés, ce qui laisse les ligands liés sur le filtre.
Nommer les 4 critères qui définissent une liaison spécifique
1) Réversibilité
2) Affinité
3) Saturabilité
4) Stéréospécificité
Expliquer le critère de réversibilité
Il faut que les forces de liaison ligand-récepteur soient suffisamment faibles pour permettre la dissociation du ligand. Ex. Van der Waals, ioniques, hydrogènes.
Nommer les trois types de liaison ligand-récepteur
Réversible, quasi-réversible, irréversible
Vrai/Faux : pour une liaison ligand-récepteur irréversible, il est possible de changer la dynamique de la réaction en modifiant par exemple le volume de la réaction
Faux, parce que si la liaison est irréversible, le ligand ne se dissocie jamais, donc il ne peut y avoir de dynamisme dans la réaction. Ce dynamisme est uniquement pour les liaisons réversibles
Qu’est-ce que l’état d’équilibre en terme de liaison ligand-récepteur?
L’état où autant de ligands se fixent au récepteurs que s’en dissocient.
Si on augmente le volume d’une réaction, que se passe-t-il avec l’état d’équilibre?
On aura moins de complexes ligand-récepteur parce qu’un ligand libre aura moins de chance de croiser un récepteur libre.
Expliquer le critère d’affinité
L’affinité est la probabilité qu’un ligand libre lie son récepteur à un moment donné.
Vrai/Faux : l’affinité d’un ligand pour un récepteur n’a aucun effet sur l’importance de l’effet produit.
Vrai, toutefois plus l’affinité du ligand est forte, plus il y a de chances qu’il lie le récepteur, donc produise son effet.
Vrai/Faux : plus l’affinité du ligand est forte, plus sa concentration est faible dans le corps, expliquer
Vrai, parce que le ligand lie bcp le récepteur, donc il a tendance à être soit libéré de manière moins importante dans le corps (vu qu’on a besoin de concentrations plus faibles pour lier autant de récepteurs), soit simplement moins présent librement dans le sang vu que fortement enclin à se lier.
Décrire l’expérience générale sous-jacente à l’élaboration d’une courbe de compétition
On a des tubes dans lesquels on a une quantité constante de récepteurs, on rajoute la même quantité de ligand radioactif dans chaque tube, ce qui forme notre mélange de base.
1er tube : on ne rajoute rien, ceci est le contrôle
2e tube : on rajoute un ligand
“froid” (non détectable)
On peut s’arrêter ici ou utiliser un 3e tube, où on rajoute un autre ligand froid pour comparer si désiré.
Dessiner une courbe de compétition pour deux ligands, l’un doit avoir une plus grande affinité que l’autre, l’identifier
Correction diapo 40 PDF cours 7
Faire l’exercice de la diapo 80
Correction diapo 41 PDF cours 7
Interpréter la courbe de compétition de la diapo 81
Correction diapo 43 PDF cours 7
Expliquer le critère de saturabilité
Il faut que les sites de liaison du récepteur soient saturables, autrement dit qu’il en y ait un nombre fini.
Comment calculer la proportion de liaison spécifique?
Liaison totale - liaison non spécifique
Comment peut-on mesurer la liaison totale et la liaison non spécifique? Expliquer
Totale : augmentation croissante de ligand radioactif dans le tube, pour avoir de la liaison du ligand chaud à tous les sites, spécifiques ou non
Non spécifique : même concentrations croissantes de ligand radioactif, mais beaucoup plus de ligand froid, qui le déplace et le force à se lier sur les sites non spécifiques
Définir et représenter sur un graphique site de liaison-concentration de ligand Bmax et Kd
Bmax : nombre total de récepteurs
Kd : concentration de radioligands requise pour occuper 50% du nombre total de récepteurs
Vrai/Faux : plus Kd est grand, plus l’affinité du ligand pour le récepteur est élevée
IMPORTANT
Faux, si Kd est grand, ça signifie qu’il faut une concentration de ligand plus importante pour occuper 50% des récepteurs, donc l’affinité est plus petite, et inversement si Kd est petit.
Expliquer le critère de stéréospécificité
La plupart des médicaments ont un énantiomère (molécule miroir) plus actif que l’autre, ou ayant plus d’affinité que l’autre pour un certain récepteur.
Donner les formules pour calculer Bmax, Kd et le taux d’occupation
Bmax = [L*R] + [R]
Kd = [L][R] / [L*R]
BONUS : on a qu’à l’état d’équilibre, Kd = [L], donc :
[LR] = Bmax / 2
Y (taux d’occupation) = [LR] / Bmax ou [L] / Kd + [L*}
Où [L*] = concentration de ligand chaud
[R] = concentration de récepteurs
Bmax = nombre total de récepteurs
Décrire les 4 types d’antagonistes
1) Chimique : association covalente avec le site de liaison du récepteur, liaison irréversible
2) Compétitif : association réversible avec le même site de liaison que l’agoniste, compétition pour le site
3) Non compétitif : association réversible avec un site de liaison différent de celui de l’agoniste, pas de compétition
4) Fonctionnel : interaction entre deux ou plus agonistes ou agonistes inverses ayant des effets inverses sur la cellule
Définir antagonisme surmontable et insurmontable
Surmontable : la concentration d’agoniste nécessaire pour obtenir l’effet maximal est plus grande, mais l’importance de l’effet ne change pas.
On peut surmonter l’effet de l’antagoniste
Insurmontable : même chose, mais l’importance de l’effet maximal est diminué
On ne peut pas surmonter l’effet de l’antagoniste
Classer en ordre croissant d’affinité et d’efficacité les ligands représentés par les courbes de compétition de la diapo 82
Correction diapo 60 PDF cours 7
Comment fonctionne un agoniste inverse?
Il change la conformation du récepteur vers une forme inactive dite Ri.
Schématiser en un graphique activité-log[ligand] l’effet d’un agoniste complet, partiel ; inverse complet, partiel ; et antagoniste
Correction diapo 64 PDF cours 7
deux autres sous-formes d’agonistes :
Protéans :
Biaisé :
Protéans :
activent ou inhibent un récepteur selon l’activité constitutive de celui-ci. Autrement dit, si le récepteur est constitutivement actif, l’agoniste protéan diminuera son activité, et inversement s’il est constitutivement inactif.
Biaisé
mène à l’activation d’une voie de signalisation spécifique (ou plusieurs avec des forces variables) parmi toutes celles liées au récepteur activé.
Expliquer la notion de récepteur de réserve
C’est la fraction de la population totale de récepteur qui n’est pas nécessaire à la réponse maximale. Parce que lors d’une réponse maximale, tous les récepteurs ne sont pas occupés.
