Les virus Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’un virus?

A

*Agent qui peut être filtré

*Un parasite intracellulaire obligatoire (Dépend de la machinerie biochimique de la cellule hôte pour la réplication)

*Agent ne pouvant produire ni énergie ni protéines indépendamment de la cellule hôte

*Fait d’un génome viral d’ADN ou d’ARN

*Enveloppé ou non

*Agent infectieux dont les composantes individuelles sont assemblées, donc qui nese reproduit pas par division cellulaire

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2
Q

V/F: les virus sont vivants.

A

Faux, pas vivants,

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3
Q

V/F: Les composantes virales doivent s’assembler par elles-mêmes.

A

Vrai.

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4
Q

V/F: Tous les virus ne peuvent pas infecter toutes les cellules ou tous les hôtes.

A

Vrai.
*Le virus doit pouvoir entrer dans la cellule hôte
*Une fois le virus entré, la cellule doit posséder la machinerie cellulaire appropriée pour lui permettre de se répliquer
*Une fois répliqué, le virus doit pouvoir être libéré de la cellule pour transmettre l’infection(et pouvoir ainsi assurer “sa survie”)

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5
Q

La taille des virus se mesure en…

A

nm

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6
Q

Les virus sont visibles en microscopie optique. V/F.

A

Faux. PRESQUE!

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7
Q

V/F. En général, les plus gros virions ont un plus gros génome qui encode pour plus de protéines et sont généralement plus complexes que les petits virions.

A

Vrai.

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8
Q

Structure et composition de la particule virale.

A

-Génome d’acide nucléique compris dans
*une couche protectrice de protéines: la capside
*Génome d’acide nucléique + capside= nucléocapside

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9
Q

Formes de nucléocapside?

A

–Icosahédrique
–Hélicoïdale
–Complexe

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10
Q

Tous les virions ont une nucléocapside et une enveloppe. V/F.

A

Vrai pour nucléocapside, faux pour enveloppe.

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11
Q

Comment peut être un génome d’ADN chez un virus?

A

*Simple ou double brin
*Linéaire ou circulaire

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12
Q

Comment peut être un génome d’ARN chez un virus?

A

*Simple brin
–Polarité positive (+) comme l’ARNm
ou négative (-)
*Double brin (reovirus)
–Polarité +/–ou double sens
*Segmenté ou non

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13
Q

Qu’est-ce qui détermine la structure, la protection et le véhicule de transmission du virus?

A

Sa couche la plus externe (nucléocapside ou enveloppe).

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14
Q

Les structures présentes à la surface de la capside ou de l’enveloppe permettent…

A

…l’interaction entre le virus et la cellule hôte via une protéine d’attachement virale (PAV) ou autre structure.

–Si on détruit la couche la plus externe d’un virus (la capside ou l’enveloppe), on inactive le virus.

–Les anticorps développés contre les composantes de ces structures de surface peuvent prévenir l’infection.

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15
Q

Décrire Capside.

A

*La capside est faite de protéines
*Structure rigide capable de résister à des conditions environnementales difficiles
*Les virus nus (non enveloppés) sont généralement résistants à la sécheresse, à l’acidité, aux détergents
–Incluant l’acide et la bile du tractus digestif
*Ceci détermine leur mode de transmission
*La capside est symétrique (icosaédrique ou hélicoïdale) ou asymétrique (complexe)

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16
Q

De quoi est composées une capside icosahédrique?

A

La capside icosahédrique simple est formée de
12 capsomères. Chacun des 12 capsomères
(aux 12 sommets) interagit avec 5 autres
capsomères
*On appelle ces capsomères des pentamères
ou pentons.

Pour former la capside icosahédrique,
les sous-unitésprotéiques virales
s’unissent en protomères. Cinq protomères
s’unissent pour former des capsomères
(pentamères) qui s’assemblent en capside

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17
Q

V/F. La capside icosahédrique ressemble à une sphère et est constituée par l’assemblage de sous-unités protéiques.

A

Vrai.

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18
Q

V/F. Toutes les faces de l’icosahèdre simple sont différentes.

A

Faux. Identiques.

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19
Q

V/F: L’acide nucléique est compris au centre de la capside qui le protège de l’environnement ET Des virions à plus grosse capsides ont fabriqués en insérant des capsomères (hexons) entre les pentons.

A

Vrai.

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20
Q

Définir La capside hélicoïdale.

A

Les sous-unités protéiques interagissent entre elles et avec l’acide nucléique pour former une structure qui ressemble à un bâtonnet

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21
Q

Qu’est-ce que l’enveloppe?

A

-Membrane composée de lipides, de protéines et de glycoprotéines.

-a une structure similaire aux membranes cellulaires.

-Des glycoprotéines virales sont ancrées sur l’enveloppe et se projettent hors de la surface du virion, comme des spicules «spikes».

(Certaines agissent comme protéines d’attachement virales (PAV), capables de se lier à des cellules cibles; Sont des antigènes majeurs pouvant éliciter une immunité protectrice; Autres fonctions possibles)

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22
Q

Virus enveloppés sont facilement inactivés. V/F.

A

Vrai. inactivés par la sécheresse, l’acidité, les détergents et les solvants. La plupart de ces virus ne peuvent survivre dans le tractus digestif.

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23
Q

La structure de l’enveloppe peut être maintenue uniquement dans…

A

…une solution aqueuse (doivent rester mouillés). Ces virus sont généralement transmis parles fluides tels que le sang, les gouttelettes respiratoires et les tissus.

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24
Q

Les virus sont classifiés principalement selon 2 choses.

A
  1. la nature de leur génome et
  2. leur structure (morphologie)
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25
Q

Déclinaisons possibles du génome pour un virus.

A

Acide nucléique: ADN ou ARN
*Simple brin ou double brin (Pour les génomes d’ARN: polarité(+/-))
*Segmenté ou non segmenté
*Linéaire ou circulaire

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26
Q

Déclinaisons possibles de la structure pour un virus.

A

Structure du virion
*Symétrie de la nucléocapside (icosahédrique, hélicoïdale, complexe)
*Enveloppé ou non enveloppé
*Nombre de capsomères
*autres

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27
Q

Convention de terminaison selon la hiérarchie taxonomique.
-Viridiae

A

Famille

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28
Q

Convention de terminaison selon la hiérarchie taxonomique.
-Virales

A

Ordre

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29
Q

Convention de terminaison selon la hiérarchie taxonomique.
-Virinae

A

Sous-famille

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30
Q

Convention de terminaison selon la hiérarchie taxonomique.
-aucun

A

espèce

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31
Q

Convention de terminaison selon la hiérarchie taxonomique.
-Virus

A

genre

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32
Q

Convention de terminaison selon la hiérarchie taxonomique.
ALL IN

A

Ordre: virales
Famille: viridae
Sous-famille: virinae
Genre: virus
Espère: aucun

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33
Q

Tous les virus à
ARN simple brin négatif (-) sont enveloppés. V/F.

A

Vrai.

34
Q

Réplication virale: généralités.

A

*Les principales étapes de la réplication virale sont les mêmes d’un virus à un autre

*La cellule hôte agit comme une usine en fournissant les substrats, l’énergie et la machinerie nécessaires à la synthèse des protéines virales et à la réplication du génome

*Ce qui n’est pas fourni par la cellule hôte doit être encodé dans le génome du virus

35
Q

Les étapes de la réplication virale?

A

1.Reconnaissance de la cellule cible

2.Attachement

3.Entrée dans la cellule à travers la membrane plasmatique

4.Décapsidation

5.Synthèse des constituants viraux (multiplication virale).

6.Assemblage du virus

7.Bourgeonnement des virus enveloppés

8.Relâchement du virus hors de la cellule hôte

36
Q

Décrire Reconnaissance et attachement à la cellule cible.

A

*Les protéines d’attachement virales (PAV) ou d’autres structures à la surface du virus se lient à des récepteurs sur la cellule hôte.

Les virus peuvent se lier à des récepteurs présents sur certaines cellules seulement (spécifiques au type de cellule), parfois présents chez certains hôtes seulement (spécifiques à l’hôte).

37
Q

Qu’est-ce qui définit le tropisme cellulaire?

A

Les cellules susceptibles ciblées le définissent.

38
Q

Un virus peut-il avoir plus d’un tropisme?

A

oui!

39
Q

Exemples de Virus pneumotropes.

A

Influenza, adénovirus, rhinovirus et virus respiratoire syncytial(RSV)

40
Q

Exemples de Virus dermotropes.

A

Variole, rougeole, rubéole, varicelle et zona

41
Q

Exemple de virus viscérotropes.

A

Hépatite, fièvre jaune, gastro-entérite

42
Q

Exemple de virus neurotropes.

A

Rage, encéphalite et poliomyélite

43
Q

Qu’est-ce que gp120?

A

Protéine d’attachement virale du VIH qui se lie aux CD4 et co-récepteu rchemokine sur les lymphocytes T «helperT-cell» pour le VIH.

44
Q

Qu’est-ce que HA gp?

A

hémagglutinine du virus
Influenza A (Protéine d’attachement virale) qui se lie aux Acide sialique des cellules épithéliales pour Influenza A.

45
Q

Comment le virus non enveloppé entre dans la cellule?

A

–Principalement: Endocytose médiée par un récepteur

46
Q

Comment le virus enveloppé entre dans la cellule?

A

–Fusion des membranes du virus et de la cellule cible (précédée ou non d’endocytose)
–La nucléocapside ou le génome viral est ensuite relâché dans le cytoplasme

47
Q

Que se passe-t-il après l’entrée dans la cellule?

A

Décapsidation (Après internalisation, la nucléocapside doit arriver au site de réplication et se rompre).

48
Q

Lors de la décapsidation, où va le génome d’ADN?

A

est habituellement transporté au noyau (exception: poxvirus)

49
Q

Lors de la décapsidation, où va le génome d’ARN?

A

reste habituellement dans le cytoplasme (exceptions: orthomyxovirus et retrovirus)

50
Q

Décrit la synthèse des constituants viraux,

A

1.Transcription du génome en ARNm pour traduction en protéines non-structurales (produits précoces)
2.Réplication du génome
3.Transcription du génome en ARNm pour traduction en protéines structurales (produits tardifs)
4.Modification post-traduction de la protéine

51
Q

La machinerie cellulaire nécessaire pour la transcription de l’ARNm se trouve où dans la cellule?

A

Dans le noyau.

52
Q

La plupart des virus à ADN utilisent ________ de la cellule hôte pour synthétiser l’ARNm dans le noyau.

A

les polymérases

53
Q

La plupart des virus à ARN se répliquent dans le cytoplasme, donc…

A

… doivent eux-mêmes encoder les enzymes nécessaires à la transcription et à la réplication (la cellule hôte n’a pas ce qu’il faut pour répliquer de l’ARN, et les virus ne peuvent pas utiliser la polymérase ded l’hôte, qui est dans le noyau!)

54
Q

Il y a beaucoup d’erreurs qui sont faites par les ARN polymérases (virales). V/F.

A

Vrai!

55
Q

Où a lieu l’assemblage du virus?

A

dépend d’où la réplication a eu lieu et si la structure finale est celle d’un virus nu ou d’un virus enveloppé:
–La plupart des virus à ADN sont assemblés dans le noyau
–La plupart des virus à ARN sont assemblés dans le cytoplasme

56
Q

Comment fonctionne l’assemblage des capsides?

A

Les capsides virales peuvent être assemblées et ensuite remplies du génome ou peuvent être assemblées autour du génome.

57
Q

Comment est acquise l’enveloppe du virus?

A

est acquise lors du bourgeonnement du virus!

–La plupart des virus à ARN bourgeonnent de la membrane plasmatique sans tuer la cellule.

–D’autres virus acquièrent leur enveloppe du réticulum endoplasmique et de l’appareil de Golgi

58
Q

V/F. Des erreurs sont faites durant l’assemblage et résultent en la formation de virions vides ou contenant un génome défectueux.

A

Vrai.

59
Q

Comment sont relâchés les virus hors de la cellule hôte?

A

–Par lyse cellulaire
–Par exocytose
–Par bourgeonnement à travers la membrane plasmatique

60
Q

Les virus nus sont souvent relâchés après…

A

lyse cellulaire

61
Q

les virus enveloppés sont souvent relâchés par…

A

bourgeonnement par la membrane plasmatique sans tuer la cellule

62
Q

Les virus qui bourgeonnent dans le cytoplasme sont relâchés par …

A

exocytose ou lyse cellulaire

63
Q

Mécanismes de transmission virale?

A

–Aérosols
–Ingestion de nourriture et eau contaminées (fécale-orale)
–Fomites
–Contact direct avec les sécrétions (salive, plaie) (Gouttelettes)
–Contact sexuel
–Sang contaminé ou transplantation d’organe
–Zoonoses (animaux, insectes)
–De la mère à l’enfant: transmission verticale

64
Q

V/F. Le mode de transmission ne dépend pas la source du virus et de la capacité du virus à endurer les conditions de l’environnement et du corps jusqu’à sa cellule cible.

A

Faux. Il en dépend.

65
Q

Quel est le principal déterminant structural du mode de transmission virale?

A

La présence ou non d’une enveloppe.

Les virus non-enveloppés sont résistants à la sécheresse, les détergents, les extrêmes de température et de pH contrairement aux virus enveloppés

66
Q

Que peut-on en déduire pour la transmission des virus non enveloppés?

A

Peuvent donc survivre à l’acidité de l’estomac et à l’effet détergent des acides biliaires de l’intestin.

–Souvent transmis par voie fécale-orale

–Source fréquente: objets contaminés (fomites)

*Ex: virus de l’hépatite A (picornaviridaeARN+ NE), adénovirus(adenovoridaeADN NE), calicivirus(caliciviridaeARN+ NE), etc.

67
Q

Pour les virus enveloppés?

A

Ils sont plus fragiles: ils ont besoin d’une enveloppe intacte pour rester infectieux et doivent rester mouillés

–Souvent transmis par gouttelettes respiratoires, mucus, salive et sperme, sang, organe transplanté

*Ex: VIH (retroviridaeARN+/E), virus de l’hépatite B (hepadnaviridaeADN/E), virus Influenza (orthomyxoviridaeARN-/E), etc.

68
Q

Comparons globalement les virus non enveloppés…

A

–La capside est faite de protéines

–Plus stables aux conditions de l’environnement

–Peuvent être transmis plus facilement
*Fomites, main à main, poussières, petites gouttelettes
*Peuvent rester infectieux malgré la sécheresse
*Peuvent résister l’acide de l’estomac

–Relâchés en lysant la cellule hôte

69
Q

Aux virus enveloppés.

A

–La membranes est faite de lipides, protéines et gp

–Labiles face aux conditions environnementales

–Doivent rester mouillés
*Ne survivent pas au milieu GI
*Transmis par grosses gouttelettes, sécrétions, tissus, sang contaminé

–Relâchés par bourgeonnement +/-lyse cellulaire

–N’ont pas besoin de tuer la cellule hôte pour se transmettre

70
Q

Zoonoses définition?

A

Les maladies virales qui peuvent atteindre les animaux (ou les insectes) et les humains sont appelées zoonoses.
*ex: rage

71
Q

Arbovirose définition?

A

Lorsque les arthropodes (moustiques, tiques, mouches..) sont le vecteur d’une infection virale, l’infection est une arbovirose.
*ex: flavivirus(virus de la Dengue dont le vecteur est le moustique du genre Aedes)

72
Q

Comment dx ou détecter virus et infections virales? (4)

A

*Culture virale sur des cellules dérivées de tissus humains en couche monocellulaire
–On peut observer l’apparition d’effets cytopathiquescaractéristiques
–Était encore utilisé pour certains spécimens avant la pandémie: on ne l’utilise plus en laboratoires médicaux

*Détection d’anticorps spécifiques chez l’hôte infecté
–Sérologie [sérum précoce, sérum tardif (phase aiguë ou latente/chronique)] (Utilisée pour certaines infections virales)

*Détection du matériel génétique viral (PCR)
–Devenu la méthode de choix

*Observation en microscopie électronique
–En laboratoire de recherche seulement

73
Q

Comment contrôler infections virales?

A

*Hygiène (lavage des mains, équipement de protection individuelle, distanciation, etc.)

*Vaccination (prévention)
–Inactivés, vivants atténués, autres

*Traitement antiviral
–Pour certains infections virales seulement

74
Q

Quelles sont les cibles des traitements antiviraux?

A

Les cibles thérapeutiques sont principalement les étapes du cycle de réplication virale.

1) Inhibition de l’attachement du virus à la cellule

2) Inhibition de l’entrée dans la cellule et 3) de la décapsidation

4) Inhibiteurs de la réplication du génome

5) Assemblage du virus et 6) relâchement hors de la cellule: On veut inhiber des enzymes responsables de ces étapes

75
Q

L’Inhibition de la synthèse de l’ARNm: est-elle une bonne cible des traitements antiviraux?

A

L’ARNm n’est pas une bonne cible puisqu’il est difficile d’inhiber l’ARNm du virus sans inhiber l’ARNm de la cellule hôte.

76
Q

Cible 1: Inhibition de l’attachement du virus à la cellule.
Se fait via…

A

*Anticorps neutralisants
–ex: immunisation passive de l’hépatite B (immunoglobulines)

*Antagonistes de récepteurs spécifiques
–Analogues des récepteurs cellulaires ou de la PAV

77
Q

Cible 2 et 3: Inhibition de l’entrée dans la cellule et de la décapsidation

A

Si ce processus est bloqué, le génome du virus ne peut pas être relâché dans la cellule pour se répliquer

*Pour les virus qui entrent pas des vésicules endocytiques, certains antiviraux vont neutraliser le pH de ces compartiments pour empêcher la fusion ou le bris de la membrane, empêchant la décapsidation

78
Q

Cible 4: Inhibiteurs de la réplication du génome

A

La plupart des antiviraux sont des analogues des nucléosides (nucléosides modifiés)
*L’ADN polymérase virale du HSV et la transcriptase inverse du VIH sont de bons exemples
–Cibles thérapeutiques idéales puisqu’elles sont essentielles à la réplication virale et elles sont différentes des enzymes de l’hôte
*Les analogues nucléosidiquesse lient facilement à la polymérase virale (qui est moins précise que les enzymes de l’hôte) et inhibent la réplication virale le plus souvent par arrêt de l’élongation de la chaîne d’ADN ou d’ARN

79
Q

Qu’est-ce que l’analogue triphosphorylé?

A

Il permet l’arrêt de l’élongation de la chaîne d’ADN! (cible 4)

80
Q

Qu’est-ce que la lamivudine?

A

Analogue nucléosidique de la polymérase du VIH.

*Mécanisme d’action:
–Analogue de la cytosine: compétition avec le substrat naturel
–Tri-phosphorylation par des kinases des cellules de l’hôte
–Incorporation de l’analogue nucléosidiquetriphosphorylédans la chaîne d’ADN virale qui résulte en la terminaison de l’élongation de la chaîne

81
Q

Cible 5-6: Assemblage du virus et6) relâchement hors de la cellule
–On veut inhiber des enzymes responsables de ces étapes! Comment?

A

*Inhibiteurs de la protéase du VIH, enzyme essentielle à l’assemblage du virus et à la production de virions infectieux

*Inhibiteurs de la neuraminidasede l’Influenza A et B (la neuraminidasepermet au virus d’être libéré hors de la cellule)

82
Q

À retenir les virus?

A

*Un virus est un parasite obligatoire intracellulaire

*Composé d’un génome d’acide nucléique (ARN ou ADN) entassé dans une capside +/-enveloppé

*Classification principalement selon
la nature du génome (ARN ouADN) et sa structure +/-enveloppe

*Le mode de réplication virale est spécifique au virus (ARN vs ADN)

*Le mode de transmission dépend beaucoup de la présence ou non d’une enveloppe

*Les traitements antiviraux disponibles ciblent le plus souvent une étape du cycle de réplication virale