LES VIRUS Flashcards
Qu’est-ce qu’un virus? (6)
1) Agent qui peut être filtré
2) Un parasite intracellulaire obligatoire
– Dépend de la machinerie biochimique de la cellule hôte pour la réplication
3) Agent ne pouvant produire ni énergie ni protéines indépendamment de la cellule hôte
4) Fait d’un génome viral d’ADN ou d’ARN
5) Enveloppé ou non
6) Agent infectieux dont les composantes individuelles sont assemblées, donc qui ne se reproduit pas par division cellulaire
Pour quoi sont conçus les filtres des virus?
Pour retenir les bactéries
Pourquoi dit-on que les virus sont filtrables?
Parce que quand on utilise des filtres conçus pour retenir des bactéries, les virus sont capables de passer au travers (plus petits que les bactéries)
Nommer quelques faits par rapport aux virus (5)
1) Les virus ne sont pas vivants
2) Les virus doivent infecter les cellules pour assurer leur survie
3) Les virus doivent être capables d’utiliser la machinerie cellulaire de l’hôte pour produire leurs propres composantes
4) Les virus doivent encoder tous les processus requis qui ne sont pas “fournis” par la cellule hôte
5) Les composantes virales doivent s’assembler par elles-mêmes
Pourquoi est-ce que tous les virus ne peuvent pas infecter toutes les cellules ou tous les hôtes?
Parce que:
1) Le virus doit pouvoir entrer dans la cellule hôte
2) Une fois le virus entré, la cellule doit posséder la machinerie cellulaire appropriée pour lui permettre de se répliquer
3) Une fois répliqué, le virus doit pouvoir être libéré de la cellule pour transmettre l’infection (et pouvoir ainsi assurer sa survie)
Décrire la taille des virus
- Se mesure en nanomètres
- Plus petits: 18 nm (parvovirus)
- Plus gros: 300 nm (poxvirus)
Est-ce que les virus sont visibles en microscopie optique?
Non
Décrire la structure d’un virus
- Génome (d’acide nucléique) recouvert d’une capside
Qu’est-ce que la capside?
C’est une couche protectrice de protéines
Qu’est-ce que la nucléocapside?
Le terme utilisé pour désigner l’ensemble du génome et de la capside
Vrai ou faux. Ce ne sont pas tous les virions qui ont une nucléocapside
Faux. Ils en ont tous une
Quelles sont les différentes formes que la capside peut prendre?
– Icosahédrique
– Hélicoïdale
– Complexe
Vrai ou faux. Tous les virus ont des enveloppes
Faux. Ils ne sont pas obligés d’en avoir une
Quelle est la différence entre une virus nu et un virus enveloppé?
Nu: pas d’enveloppe
Enveloppé: nucléocapside + enveloppe
Est-ce que les virus peuvent posséder de l’ADN et de l’ARN
Non. Un ou l’autre
Définir les différences entre l’ADN et l’ARN
ADN
- Simple ou double brin
- Linéaire ou circulaire
ARN
- Simple brin (on les désigne selon le sens de l’ARN: polarité positive ou négative)
- Double brin (polarité positive ou négative)
- Segmenté ou non
Qu’est-ce que constituent la capside et/ou l’enveloppe du virus (dépendamment de quelle couche est la plus externe)
Elles constituent la structure, la protection et le véhicule de transmission du virus
Qu’est-ce que permet la couche la plus externe du virus (soit la capside ou l’enveloppe)?
Les structures à la surface de cette couche externe permet l’interaction entre le virus et la cellule hôte via une protéine d’attachement virale (PAV) ou autre structure
Qu’est-ce qui arrive si on détruit la couche la plus externe d’un virus?
Le virus est inactivé (puisque c’est la couche externe lui permet d’interagir avec son environnement)
Comment est-ce que l’infection peut être prévenue (en relation avec la capside/enveloppe)?
Les anticorps développés contre les composantes des structures de surface peuvent prévenir l’infection
Décrire la capside (4)
1) La capside est faite de protéines
2) Structure rigide capable de résister à des
conditions environnementales difficiles
3) Les virus nus (non enveloppés) sont généralement résistants à la sécheresse, à l’acidité, aux détergents
– Incluant l’acide et la bile du tractus digestif
• Ceci détermine leur mode de transmission
4) La capside est symétrique (icosaédrique ou hélicoïdale) ou asymétrique (complexe)
Vrai ou faux. Les virus qui possèdent, en plus de la capside, une enveloppe, sont plus résistants
Faux. C’est le contraire parce que lorsque nus, c’est la capside qui leurs permet de résister aux “attaques”
Décrire comment se forme la capside icosahédrique
1) Les sous-unités protéiques virales s’unissent en protomère
2) Cinq protomères s’unissent pour former des capsomères (pentamères) qui s’assemblent en capside
La capside icosahédrique simple est formée de 12 capsomères. Chacun des 12 capsomères (aux 12 sommets) interagit avec 5 autres capsomères
Nommer quelques caractéristiques de la capside icosahédrique (4)
1) La capside icosahédrique ressemble à une sphère et est constituée par l’assemblage de sous-unités protéiques
2) Toutes les faces de l’icosahèdre simple sont identiques
3) L’acide nucléique est compris au centre de la capside qui le protège de l’environnement
4) Des virions à plus grosse capside sont fabriqués en insérant des capsomères (hexons) entre les pentons
Décrire la capside hélicoïdale
Les sous-unités protéiques interagissent entre elles et avec l’acide nucléique pour former une structure qui ressemble à un bâtonnet
Nommer quelques caractéristiques de l’enveloppe
1) L’enveloppe est une membrane composée de lipides, de protéines et de glycoprotéines
2) L’enveloppe a une structure similaire aux membranes cellulaires
3) Des glycoprotéines virales sont ancrées sur l’enveloppe et se projettent hors de la surface du virion, comme des spicules « spikes »
– Certaines agissent comme protéines d’attachement virales (PAV), capables de se lier à des cellules cibles
– Ces protéines sont des antigènes majeurs pouvant éliciter une immunité protectrice
– Autres fonctions possibles
Quelle est la majeure différence entre un virus enveloppé et un virus nu?
Contrairement aux virus non enveloppés, les virus enveloppés sont facilement inactivés par la sécheresse, l’acidité, les détergents et les solvants
– La plupart de ces virus ne peuvent survivre dans le tractus digestif
Dans quel milieu est-ce que la structure de l’enveloppe peut uniquement être maintenue?
Dans une solution aqueuse (doivent rester mouillés)
Comment est-ce que les virus enveloppés vont généralement être transmis?
Par les fluides (sang, gouttelettes respiratoires, tissus)
Comment est-ce que les virus sont classifiés?
Selon
1) La nature de leur génome
- ADN ou ARN
- Simple ou double brin
- Segmenté ou non segmenté
- Linéaire ou circulaire
2) Leur structure (morphologie)
- Symétrie de la nucléocapside
- Enveloppé ou non enveloppé
- Nombre de capsomères
- Autres
Décrire la convention pour l’attribution des noms des virus
Ordre: virales Famille: viridae Sous-famille: virinae Genre: virus Espèce: aucun
Décrire les généralités de la réplication virale (3)
1) Les principales étapes de la réplication virale sont les mêmes d’un virus à un autre
2) La cellule hôte agit comme une usine en fournissant les substrats, l’énergie et la machinerie nécessaires à la synthèse des protéines virales et à la réplication du génome
3) Ce qui n’est pas fourni par la cellule hôte doit être encodé dans le génome du virus
Nommer les étapes de la réplication virale (8)
- Reconnaissance de la cellule cible
- Attachement
- Entrée dans la cellule à travers la membrane plasmatique
- Décapsidation
- Synthèse des constituants viraux (multiplication virale)
- Synthèse de l’ARNm précoce et des protéines non-structurales
- Réplication du génome
- Synthèse de l’ARNm tardif et des protéines structurales
- Modification post-traduction de la protéine
- Assemblage du virus
- Bourgeonnement des virus enveloppés
- Relâchement du virus hors de la cellule hôte
Décrire la reconnaissance et l’attachement du virus à la cellule cible
Les protéines d’attachement virales (PAV) ou d’autres structures à la surface du virus se lient à des récepteurs sur la cellule hôte
– Les virus peuvent se lier à des récepteurs présents sur certaines cellules seulement (spécifiques au type de cellule), parfois présents chez certains hôtes seulement (spécifiques à l’hôte)
– Les cellules susceptibles ciblées définissent le tropisme tissulaire
• ex: le virus de l’hépatite C est hépatotrope
• ex: le virus EBV est lymphotrope
Qu’est-ce que le tropisme tissulaire?
Ce vers quoi le virus est attiré
Nommer des exemples de tropisme et de maladies virales
• Virus pneumotropes
– Influenza, adénovirus, rhinovirus et virus
respiratoire syncytial
• Virus dermotropes
– Variole, rougeole, rubéole, varicelle et zona
• Virus viscérotropes
– Hépatite, fièvre jaune, gastro-entérite, VIH et mononucléose
• Virus neurotropes
– Rage, encéphalite et polyomyélite
Donner des exemples de protéines d’attachement virales (PAVs)
– gp120 (glycoprotéine 120) du VIH
– HA gp (hémagglutinine) du virus Influenza A
Donner des exemples de récepteurs sur la cellule hôte
– CD4 et co-récepteur chemokine sur les lymphocytes T « helper T-cell » pour le VIH
– Acide sialique des cellules épithéliales pour Influenza A
Décrire l’entrée dans la cellule (virus enveloppés vs non enveloppés)
Les virus enveloppés vont généralement entrer en fusionnant leurs membranes , puis la nucléocapside ou le génome viral sera relâché dans le cytoplasme
Les virus non enveloppés vont entrer par endocytose (médiée par un récepteur)
Décrire la décapsidation (ADN vs ARN)
Après internalisation, la nucléocapside doit arriver au site de réplication et se rompre
Les virus à ADN nous ressemblent donc vont devoir être transportés jusqu’au noyau pour ensuite être décapsidé au noyau
Le génome d’ARN reste habituellement dans le cytoplasme puisque nos noyaux n’ont pas ce qu’il faut pour les virus à ARN
***ARN reste dans le cytoplasme, ADN va au noyau
Décrire la synthèse des constituants viraux (multiplication virale)
- Transcription du génome en ARNm pour traduction en protéines non-structurales (produits précoces)
- Réplication du génome
- Transcription du génome en ARNm pour traduction en protéines structurales (produits tardifs)
- Modification post-traduction de la protéine (pcq parfois une grande protéine est produite et les enzymes doivent aller la cliver pour faire des plus petites protéines)
Qu’est-ce que les virus à ADN utilisent pour synthétiser l’ARNm dans le noyau?
Les polymérases de la cellule hôte
Comment les virus à ARN font pour se répliquer dans le cytoplasme?
Ils doivent eux-mêmes encoder les enzymes nécessaires à la transcription et à la réplication, pusique la cellule hôte n’a pas ce qu’il faut pour répliquer de l’ARN
Quelle sont les différences entre les polymérases de la cellule hôte et les ARN polymérases ?
Les ARN polymérases vont très vite mais font beaucoup d’erreurs
Décrire l’assemblage et le bourgeonnement du virus
• Le site et le mécanisme d’assemblage du virus dépend d’où la réplication a eu lieu et si la structure finale est celle d’un virus nu ou d’un virus enveloppé
– Les virus à ADN sont assemblés dans le noyau (sauf poxvirus)
– Les virus à ARN et les poxvirus sont assemblés dans le cytoplasme
• Les capsides virales peuvent être assemblées et ensuite remplies du génome ou peuvent être assemblées autour du génome
• L’enveloppe est acquise lors du bourgeonnement du virus
– La plupart des virus à ARN bourgeonnent de la membrane plasmatique sans tuer la cellule
– D’autres virus acquièrent leur enveloppe du réticulum endoplasmique et de l’appareil de Golgi
• Des erreurs sont faites durant l’assemblage et résultent en la formation de virions vides ou contenant un génome défectueux
Décrire le relâchement hors de la cellule hôte
• Les virus sont relâchés de la cellule
– Par lyse cellulaire
– Par exocytose
– Par bourgeonnement à travers la membrane plasmatique
- Les virus nus sont souvent relâchés après lyse cellulaire et les virus enveloppés le sont souvent par bourgeonnement par la membrane plasmatique sans tuer la cellule
• Les virus qui bourgeonnent dans le cytoplasme sont relâchés par exocytose ou lyse cellulaire
Comment est-ce que les virus sont relâchés de la cellule? (3)
– Par lyse cellulaire
– Par exocytose
– Par bourgeonnement à travers la membrane plasmatique
Pourquoi est-ce que les virus nus ne vont pas bourgeonner?
Car ils ne vont pas chercher d’enveloppe
Quels sont les modes de transmission des virus? (8)
1) Aérosols
2) Ingestion de nourriture et eau contaminées
• fécale-orale
3) Fomites (objets contaminés par le virus)
4) Contact direct avec les sécrétions (salive, plaie)
• Gouttelettes
5) Contact sexuel
6) Sang contaminé ou transplantation d’organe
7) Zoonoses (animaux, insectes)
8) De la mère à l’enfant: transmission verticale
De quoi est-ce que le mode de transmission dépend-t-il?
De
1) quelle est la source du virus
2) la capacité du virus à endurer les conditions de l’environnement et du corps jusqu’à sa cellule cible
Quel est le principal déterminant structural du mode de transmission viral?
La présence ou non d’une enveloppe
À quoi peuvent survivre les virus non enveloppés?
1) la sécheresse,
2) les détergents,
3) les extrêmes de température et de pH
4) l’acidité de l’estomac
5) l’effet détergent des acides biliaires de l’intestin
Comment est-ce que les virus non enveloppés sont le plus fréquemment transmis? (2)
1) Par voie fécale-orale (survivent dans l’estomac)
2) Par fomites (puisqu’ils résistent bien à la sécheresse et aux détergents)
Est-ce que les virus de l’hépatite A et C sont enveloppés ou non?
Ils sont enveloppés (doivent être maintenus dans qqch d’humide, ils sont plus fragiles)
Comment est-ce que les virus enveloppés sont le plus fréquemment transmis? (6)
1) gouttelettes respiratoires,
2) mucus,
3) salive,
4) sperme,
5) sang,
6) organe transplanté
Comparer la capside des virus nus et la membrane des virus enveloppés
Virus non-enveloppés: La capside est faite de
protéines
Virus enveloppés: La membranes est faite de lipides, protéines et gp
Quels virus tuent la cellule hôte lorsqu’ils sont relâchés?
Les virus non enveloppés
Décrire le rôle des animaux dans la transmission des virus
Ils peuvent être des vecteurs, ie qu’ils transmettent l’infection à d’autres animaux ou à des humains
ls peuvent aussi agir comme réservoir: maintiennent et amplifient le virus dans l’environnement
Comment est-ce qu’on appelle les maladies virales qui peuvent atteindre les animaux (ou insectes) et les humains?
Les zoonoses
Quand est-ce que l’infection est une arbovirose?
Lorsque les arthropodes (moustiques, tiques, mouches..) sont le vecteur d’une infection virale
Nommer les autres sources associées à la transmission d’un virus (6)
1) Attention aux infections asymptomatiques qui peuvent contribuer à la transmission (ITSS)
2) Conditions de vie: promiscuité (saison hivernale : gens plus proches)
3) Travail/loisirs
4) Styles de vie (surtout en voyage)
5) Fréquentation des garderies
6) Voyages
Nommer les façons de détecter les virus/ de diagnostiquer des infections virales
1) Culture virale sur des cellules dérivées de tissus humains en couche monocellulaire
– On peut observer l’apparition d’effets cytopathogènes (changements observables au microscope) caractéristiques
– Était encore utilisé pour certains spécimens avant la pandémie
*Il faut entretenir une lignée cellulaire (infecter des cellules afin de voir/faire croître des virus)
2) Détection d’anticorps spécifiques chez l’hôte infecté
– Sérologie [sérum précoce, sérum tardif (phase aiguë ou
latente/chronique)]
• Très souvent utilisé
3) Détection du matériel génétique viral (PCR)
– Devenu la méthode de choix
- Méthode directe
4) Observation en microscopie électronique
– En laboratoire de recherche
Pourquoi est-ce que la culture virale n’est plus une méthode disponible/accessible?
Parce que la contamination des cellules mettait à risque le personnel de la santé
Comment contrôler les infections virales?
• Hygiène (lavage des mains, équipement de protection individuelle, distanciation, etc.)
• Vaccination (la façon la plus efficace)
o Différents types de vaccins (Inactivés, vivants atténués, autres)
• Traitement antiviral (on ne traite pas toutes les infections virales)
Est-ce qu’on traite toutes les infections virales?
Non. La plupart du temps, notre système immunitaire se débarasse de l’infection
Nommer les différentes cibles thérapeutiques pour le traitement antiviral (6)
1) Inhibition de l’attachement du virus à la cellule
2) Inhibition de l’entrée dans la cellule et 3) de la
décapsidation
4) Inhibiteurs de la réplication du génome
5) Assemblage du virus et 6) relâchement hors de la cellule
Vrai ou faux.
L’inhibition de la synthèse de l’ARNm est une bonne cible en général. Expliquer
Faux.
L’Inhibition de la synthèse de l’ARNm: pas une bonne cible en général car il est difficile d’inhiber l’ARNm du virus sans inhiber l’ARNm de la cellule hôte
Expliquer l’inhibition de l’attachement du virus à la cellule
a) Donner des anticorps qui vont neutraliser les différents virus
b) Antagonistes de récepteurs spécifiques
- Développement d’analogues des récepteurs cellulaires ou de la pAV qui bloquent l’interaction entre le virus et la cellule
Expliquer l’inhibition de l’entrée dans la cellule et de la
décapsidation
Si ce processus est bloqué, le génome du virus ne peut pas être relâché dans la cellule pour se répliquer
Expliquer les inhibiteurs de la réplication du génome
– La plupart des antiviraux sont des analogues des nucléosides (nucléosides modifiés)
– Il existe aussi des analogues non nucléosidiques de la polymérase qui se lient de façon non compétitive à l’enzyme à des sites autres que celui du substrat pour inhiber la polymérase
Nommer des exemples de bonnes cibles thérapeutiques pour les inhibiteurs de la réplication du génome (analogues nucléosides)
L’ADN polymérase virale du HSV et la transcriptase inverse du VIH sont de bons exemples puisqu’elles sont essentielles à la réplication virale et elles sont différentes des enzymes de l’hôte (donc on n’affecte pas l’hôte)
Les analogues nucléosidiques se lient facilement à la polymérase virale (qui est moins précise que les enzymes de l’hôte) et inhibent la réplication virale le plus souvent par arrêt de l’élongation de la chaîne d’ADN ou d’ARN
Expliquer l’inhibition de l’assemblage du virus et du relâchement du virus hors de la cellule
On veut inhiber des enzymes responsables de ces étapes
Donner deux exemples d’enzymes que l’on peut inhiber pour empêcher l’assemblage et le relâchement hors de la cellule du virus
a) Inhibiteurs de la protéase du VIH, enzyme essentielle à l’assemblage du virus et à la production de virions infectieux
b) Inhibiteurs de la neuraminidase de l’Influenza A et B (la neuraminidase permet au virus d’être libéré hors de la cellule)
