La virologie Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’un virus?

A

C’est un agent infectieux affectant tous les organismes vivants. Les virus sont impliqués dans de nombreuses pathologies.

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2
Q

Les virus sont-ils des êtres vivants? Pourquoi? (4)

A

Non:

  • Structure inerte
  • Absence de métabolisme (ce n’est qu’un amas de protéines sans activités particulières)
  • Pas de reproduction autonome (parasites intracellulaires obligatoires, monopolisent et redirigent les activités cellulaires de l’hôte)
  • Acellulaire
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Q

Vrai ou faux. Tous les gènes de l’ensemble des virus sont commun.

A

Faux. Il n’y a aucun gène commun entre l’ensemble des virus.

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4
Q

Quel est le but ultime des virus?

A

Production de particules virales (copies) en utilisant les protéines de l’hôte.

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Q

Les virus ont une structure …

A

Acellulaire.

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6
Q

Quelle est l’unité infectieuse de base des virus?

A

Le virion.

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7
Q

Vrai ou faux. Les virus ont une bonne quantité d’espèces moléculaires.

A

Faux. Ils ont un nombre limité d’espèces moléculaires, il y a peu de diversité à l’intérieur d’un virion.

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8
Q

Quels sont les constituants de base que l’on retrouve chez tous les virions? (2)

A
  • Acide nucléique (ADN OU ARN)
  • Capside
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9
Q

Quel est le constituant de base que l’on retrouve fréquemment chez les virions mais pas chez tous.

A

L’enveloppe.

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10
Q

Quelles sont les 3 différences entre les cellules et les virions?

A
  • Virion a soit un ADN ou un ARN tandis que les cellules ont les 2
  • L’acide nucléique des virions peut être bicaténaire ou monocaténaire tandis que l’ARN des cellules ne peut être bicaténaire et que l’ADN des cellules ne peut être monocaténaire
  • La réplication des virions amène la cellule à produire des enzymes viraux
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11
Q

Quel est le rôle de l’acide nucléique chez les virus?

A

Porter l’information génétique.

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12
Q

Vrai ou faux. La taille de l’acide nucléique des virions est très diversifiée?

A

Vrai. Elle peut aller de 4 à 1200 kb.

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13
Q

Quelles sont les caractéristiques du génome des acides nucléiques des virions? (2)

A
  • Génome haploïde
  • Génome fragmenté
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14
Q

Est-ce que l’acide nucléique est présent chez tous les virus?

A

Oui.

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15
Q

Qu’est-ce que la capside?

A

Une structure protéique externe à l’acide nucléique.

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16
Q

Comment est formée la capside?

A

Par l’assemblage de capsomères.

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17
Q

Quelle structure donne la forme au virion?

A

La capside.

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18
Q

Qu’est-ce que le capsomère?

A

Des sous-unités structurales qui forme la capside.

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19
Q

Comment est formé le capsomère?

A

Par l’assemblage de protomères.

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20
Q

Quels sont les 3 types de symétrie de la capside?

A
  • Polyèdrale
  • Hélicoïdale
  • Binaire (mixte, complexe)
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21
Q

Quelle est la caractéristique de la symétrie polyèdrale de la capside?

A

Plusieurs côtés, assemblage de triangles.

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22
Q

Quelle est la caractéristique de la symétrie hélicoïdale de la capside?

A

Ressemble à un hélice.

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23
Q

Quelle est la caractéristique de la symétrie binaire de la capside?

A

Mixte, complexe.

2 types de symétrie à l’intérieur de la même particule virale

Tête polyèdrale, queue hélicoïdale

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24
Q

Quel est le type de symétrie polyèdrale le plus fréquent?

A

Icosaèdre, 20 côtés.

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25
Q

Quels sont les avantages de la symétrie polyèdrale de la capside? (2)

A
  • Le rapport surface/volume augmente
  • Les virus peuvent avoir des tailles variées
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26
Q

Quels sont les virus ayant une symétrie de capside hélicoïdale? (6)

A
  • Virus de la mosaïque du tabac
  • La rage
  • Les oreillons
  • La rougeole
  • SARS-COV2
  • Bactériophage M13
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27
Q

Quelles sont les caractéristiques de la symétrie hélicoïdale de la capside? (3)

A
  • 1 type de capsomère
  • Assemblage hélicoïdal autour de l’acide nucléique
  • Bâtonnets creux
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28
Q

Quelles sont les caractéristiques de la symétrie binaire de la capside?

A
  • Inclus les 2 types de symétries
  • Tête polyèdrale et queue hélicoïdale
  • Assemblage complexe
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29
Q

Vrai ou faux. Les capsides à symétrie binaire sont exclusives aux bactériophages.

A

Vrai.

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30
Q

Quel sont les rôles de la capside? (3)

A
  • Protection de l’acide nucléique contre les conditions environnementales
  • Attachement à la cellule cible
  • Forme de la cellule
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31
Q

La capside est-elle présente chez tous les virus?

A

Oui.

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32
Q

De quoi est composée l’enveloppe des virus?

A

De tout ce qu’on trouve dans la membrane → phospholipides, protéines cellulaires, glycoprotéines virales.

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33
Q

D’où provient l’enveloppe des virus?

A

De la membrane cytoplasmique ou de la membrane nucléaires de la cellule infectée.

liée au mécanisme de sortie

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34
Q

À quel endroit trouve-t-on l’enveloppe?

A

À l’extérieur de la capside.

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35
Q

Quel est le rôle de l’hémagglutinine?

A

Agglutine les hématies (globule rouge) permet au virus d’être camouflé et de se protéger du système immunitaire

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36
Q

Quel est le rôle de la neuraminidase?

A

Digère l’acide neuraminique, facilite l’entre du virus dans la cellule lors de l’infection.

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37
Q

Comment peut-on identifier les virus de l’influenza (grippe)?

A

Selon leur type de H+N.

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38
Q

Quels sont rôles de l’enveloppe? (3)

A
  • Protection (hémagglutinine)
  • Reconnaissance des récepteurs spécifiques sur la cellule hôte.
  • Pénétration/sortie de la cellule hôte (neuraminidase)
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39
Q

Quelles sont les protéines internes de la capside?

Présentes chez plusieurs virus

A

Les nucléoprotéines.

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40
Q

Quels sont les rôles des nucléoprotéines? (3)

A
  • Empaquetage de l’acide nucléique viral
  • Réplication de l’acide nucléique viral
  • Lecture de l’acide nucléique viral
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41
Q

Vrai ou faux. La réplication des virus est un processus de reproduction.

A

Faux. Il n’y a pas de croissance, c’est un processus permettant la production de répliques.

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42
Q

Quelles sont les 5 étapes du cycle viral?

A
  1. L’adsorption à la surface de la cellule
  2. La pénétration de la cellule infectée
  3. La réplication des constituants viraux
  4. L’assemblage des constituants viraux
  5. La sortie des constituants viraux
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43
Q

Quelle est l’étape cruciale du cycle viral?

A

La réplication des constituants viraux.

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44
Q

À quel condition l’adsorption à la surface de la cellule est réversible?

A

Tant qu’il n’y a pas de complémentarité, que cela reste des collisions au hasard avec des surfaces en raison des forces électrostatiques.

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45
Q

À quel moment l’adsorption à la surface de la cellule devient irréversible?

A

Lorsqu’il y a attachement donc complémentarité virus-récepteurs (récepteurs sont spécifiques).

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46
Q

Quel est l’exception qui ne possède pas 5 étapes du cycle vital? Quel est la différence avec les 5 étapes?

A

Les virus des plantes. Il y a absence de récepteurs, donc il y a fusion des 2 premières étapes.

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47
Q

Comment les bactériophages pénètrent-ils dans la cellule infectée?

A

Ils font entrer leur acide nucléique, la capside reste à l’extérieur.

48
Q

Comment les virus animaux pénètrent-ils la cellule infectée? (2)

A
  • Par fusion directe (virus enveloppés): fusion enveloppe-membrane
  • Par endocytose: formation d’une vésicule pour l’entrée (semblable aux pseudopodes)
49
Q

Quels évènements ont lieu lors de l’étape de la pénétration?

A
  • La libération de la nucléocapside
  • La décapsidation (Libération de l’acide nucléique)
  • Le début de la phase d’éclipse
50
Q

Qu’est-ce que la phase d’éclipse?

A

Le moment à lequel le virus est absent lorsqu’on l’observe en microscopie électronique.

51
Q

Quelles sont les 2 étapes de la réplication des constituants viraux?

A
  • Les évènements précoces
  • Les évènement tardifs
52
Q

Que se passe-t-il lors des évènements précoces de la réplication?

A
  • Production d’enzymes de réplication
  • Production d’une grande quantité d’acide nucléique viral
53
Q

Que se passe-t-il lors des évènements tardifs de la réplication?

A

Production de protéines de structure virales (capsomères, glycoprotéines d’enveloppe, protéines de queue, enzymes de lyse).

54
Q

Que se passe-t-il lors de l’étape de l’assemblage?

A
  • L’encapsidation
  • La fin de la phase d’éclipse
55
Q

Comment se fait l’encapsidation?

A

Grâce aux interactions capsomères-acides nucléiques.

56
Q

Comment se forme les capsides polyèdrales?

A

Grâce à la fermeture de la capside.

57
Q

Comment se frome les capsides hélicoïdales?

A

Par empilement hélicoïdal.

58
Q

Comment se forme les capsides binaires?

A

Par l’assemblage indépendant d’une tête polyèdrale et d’une queue hélicoïdale.

59
Q

Comment les virus sortent-ils des cellules? (3)

A
  • Par lyse cellulaire
  • Par bourgeonnement
  • Par les canaux cellulaires
60
Q

Chez quels virus il y a sortie par lyse des cellules?

A

Chez les virus nus, pas enveloppés.

61
Q

Chez quels virus il y a sortie par bourgeonnement?

A

Chez les virus enveloppés.

62
Q

Chez quels virus il y a sortie par les canaux cellulaires?

A

Chez les virus à réplication nucléaire.

63
Q

Quel mode de sortie tue les cellules?

A

La sortie par lyse des cellules.

64
Q

Quels mode de sortie permet la survie des cellules?

A
  • La sortie par bourgeonnement
  • La sortie par les canaux cellulaires
65
Q

Quels caractères permettent la classification des virus? (8)

A
  • Le type d’acide nucléique
  • La présence d’enveloppe
  • Le processus de réplication des acides nucléiques
  • La taille
  • Le nombre de capsomères
  • Les propriétés immunologiques
  • Le nombre de gènes / la carte génomique
  • Le site de réplication chez l’hôte
66
Q

Quelle nomenclature est utilisée pour les virus?

A

La nomenclature linéenne. Un seul mot comprenant l’ordre (caractéristiques) suivi de la famille (virus).

–Tobacco mosaic virus

Tobamovirus = Tobacco mosaic virus

67
Q

Comment peut-on isoler et identifier des bactériophages?

A

On peut les isoler dans les cultures de cellules bactériennes vivantes (la souche/l’espèce sensible) (métabolisme actif). On peut identifier les bactériophages par la présence de plages de lyse.

68
Q

Comment peut-on isoler des virus animaux?

A
  • Dans des culture de cellules vivantes, comme les œufs embryonnés de poulets.
  • Dans des cultures de tissus in vitro, comme les cellules de rein de singes.
69
Q

La technique des œufs embryonnés de poulet est utilisée pour la production de quel vaccin?

A

Le vaccin de l’influenza (de la grippe).

70
Q

La technique d’isolement par les cellules de rein de singes est utilisée pour la production de quel vaccin?

A

Le vaccin Salk (polio).

71
Q

Que permet la culture de cellules vivantes dans l’isolement des virus?

A

La production d’une grande quantité de virions.

72
Q

Que permet la culture de tissus dans l’isolement des virus? (2)

A
  • La propagation des virions
  • Un changement de la forme cellulaire (effets cytopathiques caractéristique : arrondies, ⇓ ou ⇑ de volume, agrégation, corps d’inclusion, lyse, formation de syncitia : Une cellule à plusieurs noyaux, formée par la fusion de plusieurs cellules ensemble.)
73
Q

Comment peut-on identifier des virus (les distinguer)? (4)

A
  • Par l’observation de structures au microscope électronique
  • Par la réaction avec des anticorps spécifiques
  • Par des infections expérimentales
  • Par la séquence de l’acide nucléique
74
Q

Quels sont les inconvénients des méthodes d’identification des virus?

A

Ça prend du temps et coûte cher.

75
Q

Qu’est-ce qu’un ADN égoïste spécialisé?

A

Un ADN s’autopropageant (égoïste) et faisant l’acquisition de gènes (spécialisés).

76
Q

Vrai ou faux. Il y a un nombre faible d’erreurs de polymérases chez les ADN égoïstes spécialisés donc ils évoluent lentement?

A

Faux. Il y a un nombre élevé d’erreurs de polymérases chez les ADN égoïstes spécialisés donc ils évoluent rapidement.

77
Q

Quelle est l’origine des virus?

A

Les virus ont des origines multiples.

78
Q

Quelles sont les fonctions environnementales des virus? (4)

A
  • Permettent les cycles de carbone et d’azote
  • Sont des sources de nutriments
  • Contrôle des populations
  • Disponibilité de la matière organique (court-circuit des cycles de la matière organique)
79
Q

Vrai ou faux. Les virus sont les entités biologiques ayant le plus grand nombre dans la biosphère?

A

Vrai. Ils sont très petits mais très nombreux (petit pourcentage de la biomasse mais diversité vraiment plus élevée).

80
Q

Quelle est l’unité infectieuse de base?

A

Le virion

81
Q

Vrai ou faux. Il est facile de déterminer l’origine évolutive des virus.

A

Faux, ils n’ont aucun gène commun

82
Q

Quels 4 types d’acides nucléiques peut-on retrouver dans les virus?

A
  • ADN:1
  • ADN:2
  • ARN:1
  • ARN:2
83
Q

Quelles molécules d’acides nucléiques sont toujours absentes de la cellule infectée?

A

ADN:1 et ARN:2

84
Q

Comment une cellule hôte peut-elle répliquer de l’ADN:1 ou de l’ARN:2?

A

En faisant intervenir les enzymes viraux

85
Q

Vrai ou faux. Tous les virus sont haploïdes.

A

Faux, la plupart le sont, mais il existe quelques diploïdes

86
Q

Pourquoi dit-on que le génome des virus est fragmenté?

A

Car il y a des gènes différents pour chaque partie du virus

87
Q

Quel est ce type de capside?

A

Hélicoïdal

88
Q

Quel est ce type de capside?

A

Polyédrale (isocaèdre)

89
Q

Quel est ce type de capside?

A

Binaire/mixte

90
Q

Nommer 2 types de glycoprotéines virales de l’enveloppe.

A

Hémaglutinine et neuraminidase

91
Q

Quelle partie de l’enveloppe peut être utilisée pour créer un vaccin?

A

Les glycoprotéines

92
Q

Quelle forme de capside possède le SARS-COV-2?

A

Hélicoïdale

93
Q

Est-ce que le SARS-COV-2 est un virus enveloppé?

A

Oui

94
Q

Est-ce que la phase d’éclipse est plus longue chez les virus animaux ou chez les phages?

A

Chez les virus animaux (1-10h), chez les phages c’est plutôt 15-20 min

95
Q

Combien de virus sont produits en moyenne par une cellule?

A

103 à 106

96
Q

De quoi sont composés les viroïdes?

A

D’ARN simple brin circulaire

97
Q

Quels types de pathogènes sont les viroïdes?

A

Phytopathogènes

pathogènes des plantes.

98
Q

Nommer un exemple de viroïde phytopathogène.

A

Le tubercule en fuseau de la pomme de terre

99
Q

Quelle est la taille du génome des viroïdes comparés aux virus?

A

10x plus petit que le plus petit virus

100
Q

Est-ce que les viroïdes possèdent une capside?

A

Non

101
Q

Vrai ou faux. Il existe des intermédiaires d’ADN des viroïdes

A

Faux. pas de gène qui codent pour un viroïde dans le génome ou dans l’agent infectieux. C’est une molécule ARN qui est infectieuse point final

102
Q

Avec quoi interfèrent les viroïdes?

A

Avec la régulation génique: Vont se répliquer dans le noyau en parasitant les enzymes de l’hôte : forcer à produire des copies de cet ARN qui vont s’accumuler dans le cytoplasme jusqu’à des quantités très élevés : organisme ne fonctionne plus

103
Q

Comment se propage les viroïdes?

A

via des contacts cellule-cellule de végétaux, via des pollens qui vont emmener le viroïde à d’autres plantes (presque toujours de ces 2 façons), abrasion de l’intégrité de l’hôte.

104
Q

Pourquoi dit-on que les virusoïdes sont des ARN satellites?

A

Car ils dépendent de virus auxiliaires va fournir la capside et des protéines de l’enveloppe

105
Q

Quel est le virusoïde le plus connu et quel virus agit comme son auxiliaire?

A

Le virusoïde de l’hépatite D, auxiliaire est le virus de l’hépatite B

106
Q

De quoi est formé un virusoïde?

A

ARN simple brin circulaire jusqu’à 1700 nucléotides

107
Q

Vrai ou faux. Les viroïdes et les virusoïdes codent pour des protéines.

A

Faux, les virusoïdes codent pour des protéines, mais pas les viroïdes

108
Q

Qu’est-ce qu’un virophage?

A

Un virus infectant d’autres virus

109
Q

Quelle est la fonction évolutive des virophages?

A

ils vont s’exciser du génome et s’intégrer dans le génome d’autres mégavirus en transportant des gènes.
- Efficacité de réplication du mégavirus diminue parce qu’une portion de l’énergie est dirigée vers la réplication du virophage

110
Q

De quoi sont composés les prions?

A

De protéines

111
Q

Est-ce que les prions ont une capside et des acides nucléiques?

A

Non

112
Q

Quelle est la taille d’un prion comparé à un virus?

A

100 x plus petit qu’un virus

113
Q

Comment se fait la réplication d’un prion?

A

Par modification d’une protéine cellulaire (Prpc)

114
Q

Est-ce que les prions sont très résistants?

A

Oui, la forme infectieuse résiste à l’autoclave et aux protéases

115
Q

Vrai ou faux

Pour chacune des pathologies on à affaire à des protéines différentes

A

Vrai

116
Q

Comment se transmettent les maladies à prions?

A
  • Transmises par ingestion (exemple rite funéraires, consommation des cerveaux)
  • Transmission génétique (verticale)
  • Mutation spontanée
117
Q

Pourquoi les Traitement/thérapie des maladie à prions sont très complexe?

A

prophylaxie : très difficile étant donné que chaque individu porte la cellule pré-prion. Ne peut pas faire un
vaccin pour une protéine qu’on a déjà, PrPc n’est pas immunogène, elle appartient déjà au soi.