Caractérisation des microorganismes Flashcards
Sur quoi est basée la hiérarchie des taxons?
Sur une proportion de caractères communs
Pourquoi dit-on que la hiérarchie des taxons est non chevauchante?
Parce qu’un organisme fait partie d’un seul taxon à un niveau donné de la hiérarchie (ne peut pas faire partie de plus d’un taxon en meme temps) et que les traits sont de plus en plus restrictifs
Quel est le taxon de base?
Espèce
Groupe homogène diffèrent des autres
Quels sont les 7 taxons (en ordre)?
- Espèce
- Genre
- Famille
- Ordre
- Classe
- *sous-embranchement
- Phylum (embranchement*)
- Domaine
** absents chez les procaryotes
Quel est le groupe le plus homogène des taxons?
Espèce
Qu’est-ce qu’une culture pure?
Culture (population) de microorganismes où tous les individus ont les mêmes caractéristiques
ex. culture pure de L. pneumophila provenant d’un cas à Québec 2013
Qu’est-ce qu’une souche?
Tous les descendants (sous-culture/isolat) d’une culture pure
Dans le contexte des cultures pures, à quoi correspond l’espèce?
Groupe de souches dont les caractéristiques sont presque identiques
(Escherichia coli de différents individus)
Qu’est-ce qu’une souche type?
Souche (fréquemment la 1ère), possédant toutes les caractéristiques représentatives de l’espèce
Quels sont les centres de références des souches?
- ATCC (American Type and Culture Collection)
- NTCC (National Type Culture Collection)
Vrai ou faux. Dans une espèce de souches, tous les membres du groupes sont identiques.
Faux, 75-85% est identique, mais le reste est différent
Quel est le préalable pour procéder à l’identification d’un organisme?
Avoir une culture pure
Selon quels critères morphologiques peut-on identifier un organisme?
- Taille, forme, arrangement
- Structure cellulaire/endospore
- Réaction aux colorants
- Couleur
- Cils/flagelles
- Mobilité
- Inclusions cellulaires
Selon quels critères liés à la composition chimique peut-on identifier un organisme?
- Membrane
- Paroi cellulaire
Qu’est-ce qui peut différer dans la membrane des organismes?
Types de lipides et d’alcools (Ex: archae vs eubactérie)
Qu’est-ce qui peut différer dans la paroi cellulaire des organismes (composants)?
- Polysaccharides
- Protéines
De quoi peut être faite la paroi cellulaire des organismes?
- Peptidoglycane (eubactéries)
- Pseudomuréine (archaea)
- Cellulose (mycètes/algues)
Selon quels critères physiologiques peut-on identifier un organisme?
- Exigences en nutrition (Éléments nutritifs essentiels)
- Conditions d’incubation
À quoi correspondent les différentes conditions d’incubations?
- Température
- O2
- Lumière
Selon quels critères métaboliques peut-on identifier un organisme?
- Produits finaux de fermentation
- Enzymes extracellulaires
Quelles peuvent être les enzymes extracellulaires d’un organisme?
- Protéases
- Exotoxines
- Hémolysines
Selon quels critères génétiques peut-on identifier un organisme?
- Composition en bases G+C
- Nombre de chromosomes (eucaryotes)
- Plasmides (petits fragments d’ADN circulaire présents dans la cellule bactérienne et indépendants du génome bactérien.)
Avec quel instrument peut-on identifier la composition en bases G+C?
Un spectrophotomètre UV
À quoi correspond la composition en bases G+C%?
Au ratio (G+C)/(A+T)
Quelle est la longueur d’onde d’absorption des acides nucléiques?
260 nm
Vrai ou faux. L’absorbance diminue lors de la séparation des brins d’ADN.
Faux, elle augmente
Comment est la densité optique selon les 2 formes d’ADN?
Densité optique monocaténaire est 2x plus élevée que bicaténaire
Qu’est-ce que la température de fusion de l’ADN?
Température lorsque la moitié des brins sont séparés (donc monocaténaire)
Quel est le lien entre la composition en bases G+C et la température de fusion?
Plus la composition en bases G+C est élevée, plus la température de fusion sera élevée
Pourquoi un grand nombre de bases G+C augmente la température de fusion?
Car ils sont reliés avec 3 liens hydrogènes, comparés à 2 pour les bases A+T
Vrai ou faux. La composition en bases G+C est exclusive à une espèce.
Faux, elle est typique, mais pas exclusive (plusieurs espèces peuvent avoir la même composition)
Comment est la valeur intragenre de la composition en bases G+C?
Très similaire
Selon quels critères peut-on identifier les plasmides chez un microorganismes?
Tailles, nombre, gènes plasmidiques
Selon quels critères interactionnels peut-on identifier un microorganisme?
- Pathogénicité
- Symbiose
Qu’est-ce que la pathogénicité?
Capacité de provoquer une maladie chez différents hôtes
Qu’est-ce que la spécificité d’hôte?
Un humain ne peut pas attraper le sida de son chat (l’humain n’est pas un bon hôte pour le virus d’immunodéficience félin)