La génétique quantitative Flashcards
Qu’est-ce que la génétique quantitative étudie?
Les caractères phénotypiques à variation continue
Pourquoi utilise-t-on la génétique quantitative? (2)
- Afin de distinguer la composante héréditaire de la composante environnemenntale de la variation du phénotype
- Afin d’établir les mécanismes génétiques régissant la composante héréditaire
Vrai ou Faux?
Les caractères étudiés en génétique quantitative résultent de l’action conjointe de nombreux facteurs
Vrai, “caractères multifactoriels” ou “caractères complexes”
Nommez des exemples de caractères qui peuvent être traités comme des caractères complexes. (5)
- Taille et forme des structures
- Cinétique enzymatique
- Niveaux d’ARNm
- Rythmes circadiens
- Chant des oiseaux
Entre l’écart-type et la variance, qu’est-ce qui possède une plus grande signification biologique?
L’écart-type, car il s’exprime en unités similaire à la moyenne
Quelle est la différence entre un caractère inné et un caractère acquis?
Inné (“Nature”): Contrôle génétique
Acquis (“Nurture”): Contrôle environnemental
Ensembles, qu’est-ce que les caractères innés et acquis déterminent?
Le phénotype
La variance phénotypique pour un caractère donné peut dépendre que quels facteurs? (2)
- Facteurs génétiques (héréditaires)
- Facteurs environnementaux
Quelle est l’équation de la variance phénotypique totale?
Vx = Vg + Ve
- Vx : Variance phénotypique totale
- Vg : Variance génétique
- Ve : Variance environnementale
Comment sait-on si les différences phénotypiques entre individus s’expliquent pas des différences génétiques?
En évaluant l’héritabilité
Qu’est-ce qu’est l’héritabilité au sens large?
Contribution de la variance génétique à la variance phénotypique totale
Comment calcule-t-on l’héritabilité au sens large?
H2 = Vg / (Vg + Ve)
- H2: Héritabilité
- Vg: Variance génétique
- Ve: Variance environnementale
Que veut dire H2 (héritabilité au sens large) si c’est égal à 0? à 1?
0: Aucune contribution génétique
1: l’entièreté du trait est causé par la génétique
Quel genre d’individus utilise-t-on pour mesurer l’héritabilité chez les plantes?(1) Chez les animaux et les plantes?(2) Chez les humains?(1)
Plantes:
- Individus obtenus par reproduction végétative (“clones”)
Animaux et plantes:
- Individus obtenus ^pas croisement de lignées pures
- Individus issus de plusieurs générations de croisements consanguins
Humains:
- Jumeaux
Nommez des méthodes pour mesurer l’héritabilité au sens large (3)
- Observer les phénotypes d’individus non-identiques dans un environnement constant
- Sélectionner pour la reproduction des individus nettement au-dessus ou en dessous de la moyenne de la distribution phénotypique
- Observer les phénotypes chez la descendance se développant dans des environnements identiques
Vrai ou faux?
L’hériitabilité au sens large est plus haute dans les environnements extrêmes.
Faux, plus basse
Les différences phénotypiques s’expliquent ici surtout par des différences environnementales
Quel est le nombre d’allèles en commun entre jumeaux monozygotes? entre frère et soeur (et jumeaux dizygotes)? entre cousins?
- Jumeaux monozygotes: 100%
- Frère et soeur (et jumeaux dizygotes): 50%
- Cousins: 25%
Comment varie les variances génétique et environnementale des jumeaux monozygotes s’ils sont élevés ensemble? séparément?
Ensemble:
Vg = 0
Ve très petite
Séparément:
Vg = 0
Ve dépend du phénotype étudié
Comment varie les variances génétique et environnementale des jumeaux Dizygotes de même sexe s’ils sont élevés ensemble? séparément?
Ensemble:
Vg > 0
Ve petite
Séparément:
Vg > 0
Ve dépend du phénotype étudié
Est-ce que l’héritabilité au sens large est applicaple entre plusieurs populations?
Non! Seulement à l’intérieur d’une même population
Vrai ou faux?
L’héritabilité nulle ne veux pas dire que le caractère n’est pas sous contrôle génétique.
Vrai
Vrai ou faux?
L’héritabilité élevée veut dire que le caractère n’est pas influencé par l’environnement.
Faux
La variance génétique peut être décortiquée en quels deux types de variation?
- Effet additif
- Effet de dominance
Qu’est-ce qu’est l’effet additif?
Effet provoqué par la substitution de B1 par B2
Comment calcule-t-on l’effet additif?
Pas besoin de savoir par coeur, juste comprendre
A = X(B2/B2) - X(B1/B1) / 2
Qu’est-ce qu’est l’effet de dominance?
Déviation de l’hétérozygote de la moyenne entre les deux homozygotes
Comment calcule-t-on la variance génétique en fonction des effets additif et de dominance?
Vg = Va + Vd
Va : Variance génétique additive
Vd : Variance génétique due à la dominance
Qu’est-ce que l’héritabilité au sens strict?
C’est la proportion de la variance génétique additive sur la variance phénotypique totale
Qu’est-ce que l’héritabilité au sens strict permet de prédire?
Permet de prédire si un programme de sélection artificielle permettra d’obtenir des changements phénotypiques dans la population
Comment calcule-t-on l’héritabilité au sens strict? (avec les valeurs de Va et Vx)
h2 = Va / Vx
Va: variance génotypique additive
Vx: variance phénotypique totale
Comment calcule-t-on l’héritabilité au sens strict à l’aide d’un graphique?
h2 = Y/X
Y : Réponse à la sélection
X: Écart de sélection
Qu’est-ce qu’est l’hérédité polygénique?
Phénotype caractérisé par plusieurs gènes
Qu’est-ce que sont les polygènes?
Gènes ayant des effets similaires et cumulatifs sur un phénotype
À quoi est attribuée la composante génétique impliquée dans une variation phénotypique continue?
Aux polygènes
Vrai ou faux?
La variation continue observée pour un caractère ne signifie pas nécessairement qu’il est contrôlé par plusieurs gènes.
Vrai
Un caractère contrôlé par un seul gène avec deux allèles peut démontrer une variation continue si le phénotype est soumis à des facteurs environnementaux
Vrai ou faux? L’exposition des organismes à un environnement contrôlé réduit la variance phénotypique.
Vrai
Dans certains cas, la variation continue peut ainsi se transformer en variation discontinue
Qu’est-ce qu’est l’hérédité transgressive?
Croisement entre individus aux phénotypes extrêmes
À quoi sert l’hérédité transgressive? (méthode pour…)
Méthode pour estimer le nombre de polygènes qui influencent un caractère
Qu’est-ce qu’un QTL?
Quantitative trait locus (“locus déterminant un caractère quantitatif”)
Région du génome contrôlant un caractère quantitatif
Un caractère quantitatif est habituellement contrôlé pas plusieurs QTLs qui contribuent à son élaboration pour une part plus ou moins importante
Vrai ou faux?
Pour la détection d’un QTL, les lignées choisies doivent présenter un polymorphisme seulement pour le QTL
Faux, pour le marqueur moléculaire aussi
Quelles sont les étapes (3) pour identifier un gène déterminant un caractère quantitatif?
- Créer des lignées congéniques
- Analyser les polymorphismes SNPs chez ces lignées pour déterminer les points de recombinaison
- Mesurer le phénotype de chaque lignée
