Variations dans le message génétique Flashcards
Qu’est-ce qu’un transposon?
Élément génétique mobile
Que désigne la transposition?
Le déplacement d’une séquence d’ADN en un nouveau site dans le génome sans qu’il n’y ait aucun lien de séquence avec le locus cible
Comment sont appelés les éléments génétiques capables de déplacements (transposition)?
Transposons ou éléments mobiles
Qu’est-ce que la transposition réplicative?
“Copier-coller”
L’élément transposable est dupliqué et c’st une copie qui est insérée dans l’ADN cible. Le nombre de copies/génome du transposon peut ainsi augmenter
Qu’est-ce que la transposition conservative?
“Couper-coller”
L’élément transposable se déplace d’un site à l’autre
Quels sont les deux types de transposons procaryotes?
- Transposon composite
- Transposon simple
Le transposon composite fait partie de quel type de transposition?
Transposition conservative
Le transposon simple fait partie de quel type de transposition?
Transposition réplicative
Qu’est-ce que le transposon composite?
Flanqué par deux Longues séquences répétées inversées (séquences insertionnelles = IS qui incluent un gène de transposage)
Qu’est-ce que le transposon simple?
Possède son propre gène de transposage ainsi qu’une résolvase; flanqué par deux courtes séquences répétées Inversées (IR)
Qu’est-ce que la transposase?
Enzyme créant des coupures dans l’ADN au site d’insertion
Qu’est-ce que la résolvase?
Enzyme agissant lors de la transposition réplicative; “sépare” les copies “ancienne” et “nouvelle” du transposon
Les éléments mobiles chez les bactéries sont un facteur important de quoi?
De dissémination de gène de résistance aux antibiotiques
Que sont les îlots de pathogénicité?
Certains éléments mobiles de grande taille qui peuvent véhiculer des ensembles de gènes essentiels pour la fonction pathogène ou parasitaire (bactéries et archées)
Quels sont les gènes viraux impliqués dans le cycle de vie d’un rétrovirus? (3) Et que font-ils?
- pol: transcriptase inverse
- gag: gène impliqué dans la maturation de l’ARN viral
- env: gène codant pour la protéine de l’enveloppe virale
Que fait partie de la Classe I des éléments mobiles de eucaryotes?
Éléments mobiles à transposition réplicative impliquant un intermédiaire d’ARN (“rétrotransposons”); dont certains sont apparentés aux rétrovirus
Que fait partie de la Classe II des éléments mobiles de eucaryotes?
Transposons d’ADN: éléments mobiles similaires aux transposons des bactéries (conservatifs ou réplicatifs)
Quelle est l’utilité des transposons en biotechnologie? (2)
- Agent “mutagène” (outil pour créer des mutations aléatoires)
- Vecteur de génie génétique (dans le but d’introduire des gènes étrangers dans un organisme
Dans les génomes eucaryotes les séquences hautement répétitives sont constituées de quoi?
Éléments génétiques mobiles
Les éléments génétiques mobiles des séquences hautement répétitives du génome eucaryote son responsable de quoi?
L’accroissement de la taille des génomes eucaryotes
Qu’est-ce qu’une mutation?
Un changement transmissible dans le matériel génétique
Qu’est-ce qu’une mutation génique?
Mutation qui se produit à l’intérieur de gènes individuels
Qu’est-ce qu’une mutation chromosomique?
Changement qui affecte des chromosomes entiers ou des grandes parties de ceux-ci
Qu’est-ce qu’une substitution?
Remplacement d’une paire de nucléotides par une autre
Qu’est-ce qu’une transition (type de substitution)?
Purine remplacée par une autre purine; pyrimidine remplacée par une autre pyrimidine)
Qu’est-ce qu’une transversion (type de substitution)?
Purine remplacée par pyrimidine et vice-versa
Que sont les additions ou délétions?
Une ou plusieurs paires de nucléotides qui sont ajoutées ou enlevées à la séquence originale
Que sont les purines?
A & G
Que sont les pyrimidines?
T, U & C
Qu’est-ce qu’une mutation silencieuse?
Le triplet muté code pour le même acide aminé
Qu’est-ce qu’une mutation faux-sens?
Le triplet muté code pour un acide aminé différent
Qu’est-ce qu’une mutation faux-sens, conservatrice (neutre)?
Le nouveau codon spécifie un acide aminé similaire à l’ancien
Qu’est-ce qu’une mutation faux-sens, non conservatrice?
Le nouveau codon spécifie un acide aminé dissemblable
Qu’est-ce qu’une mutation non-sens?
Le triplet muté est un codon stop
Qu’est-ce que la réversion?
Mutation inverse qui se produit au même site (même codon) que la mutation directe
Qu’est-ce que la réversion vraie?
Mutation inverse qui restaure le codon original
Qu’est-ce que la réversion équivalente?
Mutation inverse qui restaure un codon différent pour le même acide aminé ou un codon pour un acide aminé synonyme
Qu’est-ce que la suppression?
Mutation inverse qui touche un site différent dans un même gène (suppression intragénique) ou un site dans un gène tout à fait différent (suppressiion extragénique)
Qu’est-ce que la tautomérisation des bases?
Source de mutations spontanées lors de la réplication de l’ADN (Changement de forme chimique à l’équilibre, ce qui change l’appariment avec l’autre base (A,T,C,G))
Quelle est la conséquence directe d’une addition ou d’une délétion?
Changment du cadre de lecture
Quelles sont les sources de mutation venant du dommage à l’ADN?
- Formation de sites apuriniques (incorporation d’une base erronée, souvent A)
- Lésions oxydatives (Arrêt de la réplication d’ADN, transversion G/C → T/A)
- Déamination de la cytosine (Transition C/G → T/A)
Quels sont les types de mutations induites? Expliquez ce qu’elles font.
- Analogue des bases azotées (transition A/T → G/C)
- Agents alkylants (transition G/C → A/T ou T/A → C/G)
- Agents intercalants (déforme la structure de l’ADN, provoquant l’insertion ou la délétion d’un nucléotide lors de la répllication)
- Les rayons UV (provoquent la formation d’abondantes formes actives d’oxygène (ROS: reactive oxygen species) dans la cellule
→ dommages oxydatifs
(induisent la formation de photoproduits)
Quels sont les agents alkylants populaires en recherche? (3)
- EMS (ethyl methane sulphonate)
- MMS (methyl methane sulphonate)
- NG (nitrosoguanidine)
Quels sont les agents intercalants? (3)
- Proflavin
- Acridine orange
- ICR-191
