La génétique biochimique - Celui avec la PCU et tout le tralala Flashcards

1
Q

Les maladies lysosomales (endocytose et autophagie) sont synonymes de maladies de…

A

surcharge

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2
Q

(1) Que penses-tu que tu vas faire dans le cours de génétique biochimique?

(2) Si t’as des types de molécules en tête, on code pour environ combien d’entre elles avec notre génome? (2 types)

Avant-propos 1

A

(1) Voir des réactions biochimiques et comprendre comment le dysfonctionnement de certaines molécules détruisent certains pathway métaboliques et mènent à la maladie.

(2)
Enzymes : ~2000
Transporteurs: ~2000

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3
Q

Il y aura 6 maladies au menu, lesquelles?

A
  1. Phécylcétonurie (PCU)
  2. Tyrosinémie de type 1
  3. Leucinose
  4. MCADD (acide gras)
  5. LHON (mito)
  6. Gaucher (surcharge)
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4
Q

(1) Quel enzyme fait défaut dans PCU
(2) Ça fait quoi comme pathologie?
(3) Transmission?

A

(1) Phénylalanine hydroxylase (PAH)

(2) Une augmentation de l’aa phénylalanine sans aucune capacité d’ajuster la dégradation selon les quantités disponibles, une incapacité à la transformer en tyrosine
—> problèmes neurologiques chez l’être en plein développement

(3) Autosomique récessive

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5
Q

L’expression de PAH est à prédominance…

—> Avec la PAH, la phénylalalalalanine devient quel aa?

A

Hépatique…
LE FOIE!

—> Tyrosine

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6
Q

Le PAH est une (1) à fonction mixte

A

(1) oxidoréductase

(Catalyse un transfert d’électron)

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7
Q

La tyrosine est primordiale pour générer: (1), (2) et (3)
[Hint, précurseur de]

—> Quelles sont les conséquences physiologiques du manque?

A

(1) Les catécholamines
—> Neurodégénerescence

(2) Mélanine
—> Albinisme

(3) Hormone thyroïdienne (TSH)
—> Hypothyroïdie + goitre

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8
Q

Quel est le symptôme le plus important de la PCU non-traitée?

A

La déficience intellectuelle.

Première cause de déf. intel. génétique à étiologie connue

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9
Q

Le dépistage est maintenant fait en (1) le bÉbÉ au talon et en imbibant un (2) buvard de (3).

A

(1) piquant
(2) papier buvard
(3) sang de bÉbÉ

Idéalement avant 3 jours

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10
Q

(1) Comment mesurait-on les résultats avant pour la PCU?

(2) Et maintenant?

A

(1) Test de Guthrie
—> La « pelouse » :
regarder la concentration sur pastille échantillon vs contrôle

(2) Spectroscopie de masse en tandem
—> Envoye dans machine

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11
Q

On remarque qu’après la naissance, les taux de phénylalalanine grimpe en flèche durant les premiers jours?

Pourquoi? (2)

A
  1. La mère qui n’a pas la déficience n’est plus là pour métaboliser la concentration en post-natal. Plus de placenta, de villosités ChRoSIAlES et autres…
  2. L’enfant boit maintenant le lait maternel.
    Ce dernier est riche, onctueux, et empli de doux acides aminés.
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12
Q

(1) Comment se fait le dépistage de PCU?

(2) Que verra-t-on d’anormal?

A

(1) De nos jours, avec le spectroscope de masse en tandem.

(2) Il y aura un haut pic d’absorbance correspondant à la Phé

Si pelouse de Guthrie : un gros spot

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13
Q

(1) Quel est le meilleur traitement pour la PCU?

(2) Qu’existe-t-il pour aider les parents et les individus atteints?

(3) Que faire avec l’onctueux lait pour éviter les carences?

A

(1) La diète :
lui donner assez pour avoir des taux acceptables

(2) Des produits spéciaux contenant pas/moins de phénylalanine

(3) Mélanger le lait maternel, food for the gods, riche en aa (dont Phé), avec le lait dépourvu de Phé.
—> Apport équilibré ajustée selon la tolérance de l’enfant

Fun fact : La Banque des Aliments du Qc distribue les produits graTIS

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14
Q

Faut-il baisser la consommation de Phé si :

(1) L’enfant est en pleine croissance?
(2) L’enfant attrape un rhume?

Pourquoi?
(Concept de tolérance (pas celle des hippies))

A

(1) Non! More protein synthesis, less free Phé

(2) Oui! More protein breakdown, more free Phé

Parce que la tolérance, ou quantité max de phé diététique qui permet le taux sang acceptable, est augmentée ou diminuée selon la situation.

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15
Q

L’apport diététique est (1), mais ce n’est pas le seul facteur. Les gènes autres que le PAH exercent une (2) sur la tolérance, tout comme (3) (ex: infections).

—> Corollaire sur la diversité

A

(1) critique, (ou extrêmement importante)
(2) influence majeure
(3) l’environnement

—> Différents patients, différentes tolérances
Spectre phénotypique peut être large

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16
Q

Suivi des patients PCU (4)

(Le 3e est la concentration [phé] sanguine)

A

(1) Visites rapprochés initialement
—> taux sanguin

(2) Étroit suivi de la croissance + param nutritionnels

(3) Visons [phé] 100-300 (100-400 µmol/L)

(4) Impact sur le développement psychomoteur pendant 2 premières années de vie

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17
Q

Quels sont les 3 variantes cliniques de la PCU?

A

(1) Hyperphénylalaninémie
(2) PCU atypique (« maligne »)
(3) PCU maternelle

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18
Q

Hyperphénylalalalalaninémie…

  • Le pathway de phénylpyruvate, voie alternative au destin de phénylalanine autre que tyrosine?
  • Pourquoi c’est différent que dire PCU?
  • Différence entre les taux?
A
  • phénylalanine + α-cétoglutarate ⇌ phénylpyruvate + glutamate
    Si PAH est éronnée, cette voie est favorisée
    —> ↑ phénylpyruvate, un phénylcétone
    —> phénylpyruvate dans l’urine
  • La PCU est pour les formes sévères (déficience quasi-complète en PAH), avec Taux très haut de phénylalanine
    —> Hyperphénylalanémie : activité enzymatique avec PAH
    —> Moins d’activation de la voie de transamination alternative
  • Taux de phénylalanine + phénylpyruvate plus bas

Fun Fact : Urine devient verdâtre si ajout de FeCl₃
—> ancienne méthode de diagnostic

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19
Q

Autosomique dominant ou récessif, l’hyperphénylalanémie non-PCU?

A

Récessif

Si tu comprends pas le diagramme, dis-toi juste que les taux de concentration [phé] est très bas même avec seulement 1 allèle mutée, mais deux et rien ne va plus, les jeux sont faits.

50% muté ≠ 50% de diminution

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20
Q

La PCU atypique est due à une erreur innée de la biosynthèse de la (1), un co(2) de la (3).

—> Donne des anomalies (4) dues à la déficience des (5).

A

(1) tétrahydrobioptérine (BH4)
(2) cofacteur
(3) phénylalanine hydroxylase (PAH)

—> (4) neurologiques, (5) neurotransmetteurs.

Tout enfant dépisté PCU est évalué pour concentration des précurseurs de BH4

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21
Q

La PCU maternelle n’est pas drôle, car la PCU non-contrôlée de la mére causera un (1) chez le foetus même si celui-ci est (2) pour l’allèle mûtée.

Les concentrations [phé] des deux sont en (3), le placenta (4) la phé du côté foetal et le (5) embryonnaire a peu de capacité à dégrader la phé.

A

(1) retard mental sévère
(2) hétérozygote

(3) équilibre
(4) concentre
(5) foie

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22
Q

À quels moments devrait-on s’assurer absolument de contrôler la [phé] chez la mère en PCU maternelle? (2)

A

(1) AVANT la conception
(2) pendant toute la grossesse,
SURTOUT au 1er Trimestre

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23
Q

La tyrosinémie est une maladie génétique (1), donc bien de chez (2)

C’est même une mutation qu’on appellerait (3)

A

(1) québeCOISE
(2) nOuS
(3) fondatrice

24
Q

Quel gène est muté pour la tyrosinémie?

—> allèle mutée?

A

FAH (15q23-25)

—> Allèle mutée majoritaire : IVS12+5A

25
Q

(1) Quels sont les symptômes de la tyrosinémie de type 1?

(2) Quel est le marqueur par excellence?

A

(1) InSuFfiSanCe, cirrhose et cancer hépatiques
(+ rachitisme hypophosphatémique)

(2) Succinylacetone

26
Q

L’autonomie cellulaire dans la tyrosynémie…

Le produit qui buildup est le FAA, ou (1). Les (2) apparaissent dans la même ¢ de (3) qui produit le métabolite.

Si comparée à la PCU, les dommages sont plus (4), tandis que la PCU prenait le chemin (5) avant d’atteindre le cerveau.

—> Quels sont 3 « -toxique » du PowerPoint

A

(1) Fumarylacétoacétate
(2) dommages
(3) foie
(4) localisés (dommages à côté)
(5) systémique (dommages plus loin)

—> Il est marqué hépatoxique, nephro et neuroxiques en bas de la slide…

27
Q

Le traitement de Tyr du type 1est une (1) en amont de la 3e réaction avec le (2) . Aussi, une restriction diététique en (3) et en (4).

A

(1) inhibition
(2) Nitisinone (NTBC)
(3) phé
(4) tyr

Il est encore marqué hépatoxique, nephro et neuroxiques en bas de la slide…

28
Q

Urgences en génétique biochimique

Plusieurs maladies métaboliques héréditaires ne sont pas (1) par (2).

—> donc…

Avant-propos

A

(1) détectées
(2) dépistage

—> Garder une vigilance clinique élevée

29
Q

Quel est le tableau clinique le plus évocateur?

A

Un enfant qui, après une grossesse
—> détériore progressivement en dépit des investigations
—> prise en charge habituelles déjà faites

30
Q

Présentations cliniques aiguës (4)
(urgence)

N
I
S
O

A

(1) Neurologies
—> diminution progressive des boâres
—> coma

(2) Insuffisance organes

(3) Systémique
—> acidose, cétose, hypoglycémie

(4) Odeur anormale caractéristique

31
Q

Évolution clinique des erreurs non-traitées

  • Profils (2) + courte description
A
  • Décompensation aiguë
    —> Multiples épisodes de sévérité variable
  • Dégénération
    —> Surcharge ou autres pathos lentement progressives
32
Q

Décompasation métabolique aigüe

Pourquoi le anion gap, ou trou anionique, est important dans un test sanguin

(1) Formule du prof
(2) (Normal vs Pathos)
(3) Acidose ou alcalose?

A

(1) Le anion gap = Na⁺ - (Cl⁻ + HCO₃⁻) = ~ 7 à 16 mmol/L

(2) Normalement, concentrations [anions] = [cations]

Les aa sont acides organiques, et il commence à y avoir une charge nette quand il y a une accumulation d’un acide organique.

(3) Acidose –> Ketoacidosis, Lactic acidos + autres types aciduries org

33
Q

Once again, what is the anion gap’s formula?

Si j’ai :
Na = 140
K = 4
Cl = 109
HCO₃ = 20

A

Anion gap = Na⁺ - (Cl⁻ + HCO₃⁻)

⇒ Anion gap = 140 + (109+20) = 11

C’est donc normal

34
Q

Prélèvement critique

Faire le prélèvement lorsque l’enfant est (1)

A

(1) sur une moto

Désolée…

(1) Symptomatique
—> On ne veut pas que les niveaux soient normaux

35
Q

Les 3 trois tests spécialisés de décompensation métaboliques aiguës

2 analyses + molécules
—> quels fluides?
+ 1 inusité

A
  • Chromatographie des aa + acylcarnithine
    —> PLASMA
  • Chromatographie des acides organiques
    —> URINE
  • ReNifLeZ
    —> composés à fragrance spécifique
    —> Exemple, leucinose & maple syrup urine disease (MSUD)
36
Q

Quel est l’étiologie liée à la leucinose?

A

Déficience BCKADH (son cofacteur est B1)

Déshydrogénase des acides organiques à chaînes ramiffiés après leur transamination

—> Ile, Leu et Val

—> S’accumulent en cétones/cétoacides

37
Q

(1) Quel traitement pour la leucinose?

—> donc donner le (?) de l’enzyme

(2) Est-ce assez? Quoi faire en cas aigu?

A

(1) Vitaminothérapie
Thiamine/B1
—> cofacteur

(2) Non, il faut épurer
—> leucinose décompensée
—> hémodialyse chez le nouveau-né

38
Q

MCADD

1.Qu’est-ce que ça veut dire?

  1. Quelle enzyme?
  2. Signes apparents d’un cas aigu (5)
A

(1) Medium chain acyl-CoA dehydrogenase deficiency

(2) Relie le nom

(3) coma, convulsions, hypoglycémie sévère, diarrhée + vomissements

39
Q

Quelles sont les étapes du métabolisme des acides gras AG (4)

Et…

  • Quel processus est important ici et qu’est-ce qu’on produit/utilise en état de jeûne? (Pense à ton petit gras)
  • Pourquoi c’est pertinent chez l’enfant?
A

(1) Acide gras
—> entrent avec -CoA
(2) Carnitine
—> navette nécessaire qui fait entrer AG-CoA dans mito
(3) β-oxydation
—> coupe pour donner acétyl-CoA
(4) Cétogénèse (foie)
Krebs avec ça —>STONKS

  • De la β-oxydation (après Lipolyse) pour avoir des corps cétoniques pour notre cerveau, entre autres
    Ketone body —> travels in bloodstream—> (cytoplasm of other ¢) Acétyl-CoA —> Krebsy, Baby
  • Les 5 phases métaboliques se succèdent vite, donc jeûne arrive vite
    —> hypoglycémieee
40
Q

β-oxydation

(1) Combien de réactions, donc combien d’enzymes?

(2) Le produit qui nous intéresse ici pour Krebs?

(3) Quel organe consomment les AG à chaînes longues + moyennes

(4) Quels organes sont surtout touchés par les AG à chaînes longues seulement?

A

(1) 4, 4

(2) Acétyl-CoA

(3) Foie
MCADD —> Stéatose hépatique, hypoglycémie, hypocétogène
Toutes les maladies du genre peuvent toucher le foie

(4) Coeur, Muscles

41
Q

Donc, avec MCADD, on pourrait dire que l’enfant est en hypo(1) sans (2)

En plus, il y a accumulation d’un composé neurotoxique, l’(3)

A

(1) hypoglycémie
(2) cétose
(3) acide octanoïque

42
Q

Quelle est la prise en charge long terme de la MCADD?

(1) Régime normal? Faire attention à quoi?
(2) Récidives? Si oui quoi faire?

A

(1) Oui, mais faire attention aux MCT = TG à chaîne moyenne

(2) Si jeûne + vomissement
—> Soluté glucosé rapidement
—> une vraie PANACÉE, prévient toute crise

43
Q

Maladies mitochondriales

(1) Avec ces maladies, fait-on toute l’énergie dont nous avons besoin?

(2) Quels sont les deux types génétiques des maladies mitochondriales héréditaires?

A

(1) Non…

(2)

  • Gènes nucléaires
    (autosomique ou lié à l’X)
  • Gènes à transmission mitochondriale (maternelle)
44
Q

Mitochondrial protein entry

(1) et (2) à partir d’un gène nucléaire. Protéine a une séquence de tête en (3).

La séquence est reconnue par des récepteurs sur la membrane des (4) par lesquels il gagne la (5) mitochondriale, où la séquence est (6).

Avec les TIM & TOM… LES QUOI?

A

(1) Transcription
(2) traduction
(3) N-terminal
(4) mitochondries
(5) matrice
(6) clivée

(TIM & TOM)
translocase of inner/outer membrane

45
Q

ADN mitochondrial

  • Combien de sous-unités pour coder pour des protéinZ?

—> Quelles autres molécules sont codées avec l’ADN mito? (2)

—> Quelle est la seule sous-unité de chaîne respiratoire qui n’est pas seulement d’origine mitochondriale?

A
  • 13

—> rRNA + tRNA

—> Sous-unité 2

46
Q

(1) LHON, ou l’atrophie optique de Leber, apparaît chez les patients avec quel type de population de mitochondrie, quel type de transmission?

(2) À pénétrance…

(3) Pénétrance plus grande chez…

A

(1) Transmission mitochondriale homoplasmique (mutée)

(2) Incomplète

(3) Les garçons, 5 à 10 fois

Leber hereditary optic neuropathy en anglAS

47
Q

LHON

(1) Le symptome majeur et ce qui suit

(2) Dans la plupart du temps, un seul est atteint?

A

(1) Perte de la vision centrale

  • un oeil ou les deux
  • L’autre oeil suit le deuxième après quelques jours, mois, (années (rare))
  • dilution des couleurs (dyschromatopsie)

(2) Non

48
Q

Diagnostique

(1) La région de la mitochondrie qui est mutée dans l’Atrophie optique de Leber code pour?

(2) Atrophie (?), + diagnostic différentiel

(3) Des métabolites anormaux?

(4) Effet fondateur? De qui ça vient ça?

A

(1) La sous-unité 1

(2)

  • Atrophie optique
  • Rarement, matière blanche toucheé
    —> diagnostic différentiel de la sclérose en plaques

(3) Nope

(4) D’une fille du Roy, suggèrent les investigations

Osti de Roy...
49
Q

Et maintenant les maladies de surcharge? Pas comme celle que tu vies avec MMD1045 là ma/mon jeune…

Et si le (1) ne pouvait pas sortir de la (2)..?

(3) On parle de quel organite?

A

(1) substrat
(2) cellule
(3) Lysosome

50
Q

Résumé du lysososomes

4 et 5 sont ses 2 fonctions qu’on aime ici, mais aussi la molécule faite en 1

A
51
Q

Maladies de surcharge

(1) Quelle maladie est au menu

(2) The culprit, AKA les molécules fautives + problème
(indice : Cérébrosides pimpés…)

(3) Grossièrement parlant, ces molécules sont une combinaison de (A), d’un aa (B) et d’un (C).

A

(1) La maladie de Gaucher

(2) Les sphingolipides gangliosides et leur dégradation
—> Gaucher n’est pas la seule maladie avec
—> Traitement en fonction de l’erreur inné

(3)
* (A) 2 queues hydrophobes
* (B) Sérine
* (C) sucre

52
Q

Avec la maladie de Gaucher…

(1) Quelle est l’enzyme défectueuse

(2) Quel organes sont atteints? (A,B,C)

(3) Est-ce que tous les cas se ressemblent?

A

(1) Glucocérébrosidase

(2)

  • (A) Rate
    —> Splénomégalie
  • (B) Muscles
    —> Fonte musculaire
  • (C) Infiltration osseuse
    —> Fracture

(3) NON!
—> Allant d’asymptomatique à neurologique à décès foetal prénatal avec hydrops

53
Q

(1) Comment on diagnostique la maladie de Gaucher? (A,B)

(2) Comment la traite-t-on?
—> Deux méthodes, un même but… (A,B)

  • Qui a-t-il de spécial avec l’organite et le traitement?
A

(1)

  • (A) Dosage de glucocérébrosidase
  • (B) Analyse du gène GBA
    —> Si homozygotie : ↑ splénomégalie, Ø atteintes neuro

(2)

  • —> (A) Greffe de moelle d’un donneur sain: ¢ qui font l’enzyme
  • —> (B) Remplacement enzymatique
  • L’enzyme entre dans la ¢ par vésicule et va dans le lysosome
    —> STONKS
54
Q

Le cas de l’urgence métabolique adulte…

Les erreurs innées peuvent se présenter à tout (1).

Le Dx à l’étude est celui l’(2).
Le frère de la dame présentait un signe caractéristique de la pathologie, la luxation des (3), et la dame avait une (4) temporale.

A

(1) âge
(2) homocystinurie
(3) crystallins
(4) thromboembolie

55
Q

L’homocystinurie vient en 2 formes…

(1) Lesquelles?
(ou plutôt, quel aa est en cause et quels cofacteurs)

(2) Et quant au Tx?

A

(1)

  • Troubles de la reméthylation
    —> méthionine normale ou basse
    (cofacteur B12)
  • Déficience en cystathionine β-synthase
    —> méthionine haute
    (cofacteur B6)

(2) Diète + les vitamines/cofacteurs appropriées