komplexa sjukdomar ✓ Flashcards
Komplexa sjukdomar, vad är dess karakteristika (påverkas mer av) vilka finns det t.ex?
påverkas mer av miljö och yttre faktorer än vad monogena sjukdomar är.
Många gener samverkar till de komplexa sjukdomar
ex. metabola sjukdomar (diabetes typ 2, obesitas) autoimmuna sjukdomar (HIV, reumatism) cancer, neurologiska och osykiska sjukdomar (autism, schizofreni)
Monogena sjukdomar
.påverkas mer av genetik än vad komplexa sjukdomar gör
Man ska inte behandla patienterna som en stor grupp utan försöka individualisera patienterna så de får den bästa möjliga hjälp
statement
förklara genetiken bakom komplexa sjukdomar
genetik bakom komplexa sjukdomar är ärftlig, men även miljö och livsstil bidrar. Kan ha direkta och indirekta genetiska effekter.
Det är ärftligt men de följer inte dessa mönster utan orsakat av många genetiska varianter - kan
variera från endast varianter med liten effekt till en blandning av ovanliga varianter med stor effekt och vanliga varianter med liten effekt
Riskvarianter finns ofta i normalpopulationen. eftersom det är så liten risk ökning med varje risk variant så spridningen…
Autism
vad tyder på att det finns en stark genetisk faktor i denna komplexa sjukdom?
tyder på att det finns en stark genetisk faktor, stor heratibilitet eftersom
- det skiljer mycket mellan enäggs och tvåäggstvillingar.
- adoptionsstudier visar högre sjukdomsrisk i biologiska släktningar och
- familjär aggregering tyder på genetisk kompetens.
genome associations studies (GWAS) vad kollar man på och vad bör man tänka på?
man utgår från en common variant commmon disease -hypotes
man måste ha en katalog av miljontals genetiska variationer (SNPs).
Man kollar på vilka positioner som är polymorfa, var finns de i genomet och hur de är distribuerade i olika populationer.
hittar man nått som en associerad med en sjukdom ska man inte tänka att det är direkt orsaks sammanband utan bara en association.
Ett biologiskt hypotesfritt test av hela genomet. Risken för vanliga sjukdomar utgörs av kombinationer av vanliga varianter (alleler), som var och en har en liten effekt.
rekombination och genetik
kromosom utbyter variant med varandra och bildar nya varianter. Efter många generationer kommer vi ha en stor variation men..
Ju närmare varianten ligger på kromosomen desto större chans att de inte kommer delas utan följer med till nästa generation.
vilka sekvenser på kromosom vill man undersöka för att spara på resurser?
Vad kan användas som markör?
sekvens på kromosom på olika individer, olika varianter
Vi kan inte testa alla så vilka är bästa varianter o tensta för att se ….
De som har samma informationsvärde är dumma att kolla så vi kollar bara de mest relevanta varianter för att få så mkt information om arvsmassan som möjligt.
En så kallad “tag SNP” kan användas som markör för andra SNPs.
(vi kollar sekvens på kromosom på olika individer, olika varianter)
alla genetiska sjukdomar ritas upp
varför?
detta för att lättare kunna se
- hur vanliga är varianterna i populatinen?
- hur stor risk har du om du bär på denna varianten?
vad gör GWAS ?
visar en region inom arvsmassan som är relevant och associerad med en viss sjukdom.
Den säkerställer att sjukdomen är den enda skillnaden mellan patient och kontrolllgruppen då den letar efter varianter som var och en ger en liten ökning av risk för sjukdom. Men detta kräver stora kohorter av patienter och kontroller för att statisktiskt kunna säkerställa en skillnas i frekvens. Kräver även att ett stort antal markörer testas.
för att statistisk kunna särställa variationen i guppen behövs en stor stor patient och kontorllgrupp som visar att det finns en stor skillnad.
väldigt viktigt att säkerställa att sjukdomen är den enda skillnaden mellan patient och kontrollgrupperna.
fakta
varje färgad prick är säkerställning att det finns en association mellan ..
slide 23
240 olika regioner i arvsmassan som är associerade med schizofreni, men vissa komplexa sjukdomar är för komplexa för att kunna använda sig av dem för diagnostik och åtgärder.
fakta
Vilka strategier finns det för att studera komplexa sjukdomar?
GWAS (genomvida associationsstudier)
CNVs (rare variants och kopietalsvariation)
vad menas med heritabilitet?
Heritabilitet är proportionen av den fenotypiska variansen som kan förklaras av genetik. Vi kan mäta heratibilitet mha. MZ och DZ tvillingar.
