Kollagen Flashcards
kollagen, 2 vanliga saker, en konstig?
kollagen är protein → har drf vanlig proteinsyntes, dock har den posttranslationella modifieringar som ger just kollagenet dess utseende och funktion.
- är stark
transkription
initiering:
- en gen i dna måste vara aktiv för att transkription av kollagen ska ske
- hats ändrar form på histoner för att dna ska vara tillgänglig.
- rna-polymeras 2 binder till en promotor i dna vid en plats med mycket a och t (tata box).
- transpkriptionfaktorer kommer att hjälpa stabilisera bidnningen mellan dna och rna-polymeras.
- rna polymeras bildar en transkriptionsbubbla.
Elongering:
- ena strängen fungerar som en mallsträng
- rna polymeras lägger fria ribonukleotider (A, U, C, G) som är korrespondernade til dnat och bygger pre- mrna från 5 till 3 prim men läser från 3 till 5.
- de strängen som läses av kallas antisense och den andra kallas sense strängen.
- rna- polymeras når termineringssekvensen och pre- mrona (hn-rna) släpps.
- pre-mrna skapar mrna genom slitsing där introner tas bort och exoner sammanfogas.
translation
- mrna 5 prim ände sätter sig vid ribosomen.
- ribosomen läser startkondonet AUG på mrna.
- trna med korresponerdande antikodon till kodonet bär korresponderande aminosyran och gör en kedja av det.
olika platser i ribosomen:
- a plats där kommer trna in med korrespondernade antikodon och bär en aminosyra
- p plts där bildas peptidbindningar mellan aminssyror
- e platsen där trna går ut för den har lämnat aminosyran
- när ribosomen når stoppkodon, UAA, UAG, UGA finns binder en relase factor vilket frigör polypeptiden från ribsoomen.
- det har bildats nu pro a kedja
hydroxylering, brist?
- i er sker hydroxylering då prolin och lysin i pro a kedjan kommer hydroxyleras mha prolin hydroxyleas och lysin hydroxylas.
- detta bildar då hydroxylysin och hydroxyprolin.
- dessa enzymer behöver fe2+ i sitt aktiva site för att hydroxyleringen ska ske, den då oxideras till fe3+ och för att reduceras och bli aktiv igen behöver den c vitamin tex askorbat.
- detta ger upphov till vätebindningar.
brist på c- vitamin kan leda till instabil kollagen och därmed tandfall.
- syre krävs med för att sätte ett o i oh
glykosylering
- sker i er eller golgi
- en glukos sätts på
glycin, mutation?
- glycinen i pro a kedjan är liten och prolin är bulklig så detta skapar helixformen
- de ger upphov till vätebindningar mellan olika dlear av kedjan vilket stabiliserar den
- mutationer på glycin leder till osteogenes imperfecta där benen är sköra.
trippelhelix
- tre pro a kedjor sätts ihop genom disulfid bryggor (kovalenta bindingar).
- det finns oh grupper från kedjorna som ger upphov till vätebindningar vilket leder till en stabil trippehelix som kallas prokollagen.
fortsättning på kollagensyntes sker extracellulärt
- Kollagen går ut från cellen via vesikeltransport. Ändarna av prokollagen klipps av mha prokollagen peptidas → tropokollagen
- När ändarna är klippta, kmr flera tropokollagen gå samman och bilda fibriller.
- self assembly- lysoxidas omvandlar hydroxylerade lysin till allysin som skapar starka kovalenta bindongar mellan tropokollage, kollagen fibriller blir kollagnefibrer.
- bindningarna ökar med åldern och man blir stelare
vesikeltransport
- i golgi eller er när celler ska transporteras ut använder kollagen vesikeltransport
- kollagent är i en vesikel och på vesikeln finns proteinet v-snare, vesikeln transporteras via mikrotubuli och når sltdestinationeren, t- snare som står på membranet av målet. vesikeln smälter in och sprids ut.
denna process behöver ca2+
ehlers danlos syndrom
- mutation på enzym lysoxidas led lysin blir ej till allysin led ej kovalneta bindingar led töjbar hy.
komma in till er för post tanslationella modifieringen
- aminosyra sekvensen (pro a kedjan) kommer in genom att den bär en signalpeptid som kommer kännas igen av srp och translationen stamnar av och sen kommer den in i er och den forstätter med translationen.