Kapittel 26 Flashcards
Hva er transkripsjon?
prosess hvor et enzymsystem konverterer den genetiske informasjonen i dsDNA (double stranded DNA) til en RNAtråd med en komplementær basesekvens.
Hva gjør Messenger RNA (mRNA)?
koder for aminosyresekvenser av polypeptider
Hva gjør Transfer RNA (tRNA)?
leser mRNA og overføre passende aminosyre til en voksende polypeptidkjede under proteinsyntese
Hva er Ribosomalt RNA (rRNA)?
bestanddeler av ribosomer, de cellulære maskinene som syntetiserer proteiner.
Hva gjør Ikke-kodende RNA (ncRNA)?
har en rekke katalytiske, strukturelle og regulatoriske funksjoner.
Hva er mest selektvit for hva som kopieres, replikasjon eller transkripsjon?
transkripsjon der kun ca. 76% av genomet blir transkribert til RNA.
Hva er det vanligste produktet av transkripsjon?
ncRNA (non-coding RNA)
Hva brukes for å syntetisere RNA?
RNA-polymeraser, DNA-mal og ribonukleosid 5´-trifosfater.
Hva initierer transkripsjon?
når RNA-polymerase binder seg til en promotorsekvens
Hva skjer under elongeringen ved transkripsjon?
den voksende RNA-tråden danner midlertidig basepar med DNA-malen for å danne et kort hybrid RNA-DNA dobbel helix.
Hva skjer når dsDNA er relaxed?
En transkripsjons”boble” dannes når dsDNA slapper av. RNA-polymerase genererer positivt supercoiler foran “boble” og negativ supercoiler bak.
Hva er en malstreng?
DNA-streng som fungerer som mal for RNA-syntese
Hva er ikke-template-streng?
DNA-tråd som er identisk i basesekvens med det transkriberte RNA, med U i stedet for T i DNA. Også kalt coding strand.
Hvor mange underneheter har RNA polymerase holoenzym?
6
Hva gjør σ-underenheten i RNA polymerase holoenzym?
σ-underenheten styrer enzymet til spesifikke DNA-bindingssteder.
Hva gjør at RNA-polymerase har høyere feilprosent enn DNA-polymerase?
RNA-polymerase mangler en separat korrekturlesing 3->5
Hva er en promotør?
en spesifikk sekvens i DNA som RNA-polymerase binder seg til
Hva er en konsensussekvens?
Korte strekninger med DNA som viser tilsynelatende liten variasjon i mange forskjellige gener.
Hva er UP (oppstrøms promotør) element?
et tredje AT-rikt gjenkjenningselement som oppstår mellom posisjoner -40 og -60 i promotorer til visse høyt uttrykte gener
Hva er et lukket kompleks?
bundet DNA forblir dobbelttrådet
Hva er et åpent kompleks?
bundet DNA er delvis avviklet
Hva er ρ (rho)?
proteinfaktor som har en ATP-avhengig RNA-DNA-helikaseaktivitet
Hva er ρ-avhengige terminatorer?
klasse av terminatorer som avhenger av proteinfaktoren ρ (rho).
Hvilken type RNA blir syntetisert fra RNA-polymerase I?
Pre-ribosomalt RNA
Hvilke typer RNA blir syntetisert fra RNA-polymerase II?
mRNA og ncRNA
Hvilke typer RNA blir syntetisert fra RNA-polymerase III?
- tRNA
- 5S rRNA
- ncRNA
Hva er en transkripsjonsfaktor?
en rekke proteiner som fungerer med Pol II og danner det aktive transkripsjonskomplekset.
Hva skjer ved RNA-prosessering?
- addisjon og sletting av nukleotidsekvenser
- kjemisk modifisering av RNA-nukleotider
- degradering.
Hva er et ribozym?
katalytisk RNA som katalyserer posttranskripsjonelle prosesseringsreaksjoner.
Hva er Primær- eller forløpertranskripsjon?
et nylig syntetisert RNA molekyl
Hva er introner?
ikke-kodende kanaler som bryter opp kodeområdet av mRNA-transkriptet
Hva er eksoner?
kodende segmenter av mRNA-transkriptet
Hva er RNA-spleising?
prosessen der introner fjernes fra pre-mRNA og eksoner spleises sammen for å danne en kontinuerlig sekvens som spesifiserer et funksjonelt polypeptid.
Hvordan modifiseres 5`-enden på eukaryot mRNA?
det blir lagt til en 5`-hette
Hvordan modifiseres 3`-enden på eukaryot mRNA?
det skjer spalting og 80-250 A-rester blir lagt til og danner en poly(A)-hale.
Hva er en 5`-hette?
en rest av 7-metylguanosin knyttet til 5-terminalrest av mRNA gjennom en uvanlig 5,5`-trifosfatbinding.
Hva er funksjonen til en 5`-hette?
beskytte mRNA fra ribonukleaser, binde seg til spesifikke hette-bindende komplekser av proteiner og delta i binding av mRNA til ribosomet.
Hvilke 4 grupper introner finnes?
:: Gruppe I og II (selvspleisende), spleisosomer (fjernes av RNP) og proteinkatalyserte introner (fjernes av enzymer).
Hva er Alternativ spleising?
prosess der et bestemt ekson kan eller kan ikke være inkorporert i det modne mRNA transkripsjon.
Omvendt transkriptase produserer hva?
DNA fra viralt RNA.
Hvilke tre gener og LTP-sekvenser har retrovirus?
gag, pol, env og LTP (long terminal repetation)
Hva gjør gag?
koder for proteinene i den indre virale kjernen
Hva gjør pol?
koder for:
- proteasen som spalter den lange polypeptidkjeden
- en integrase
- revers transkriptase.
Hva gjør env?
koder for proteinene i den virale konvolutten
Hva gjør LTR?
sekvenser som letter integrasjon inn i verts-DNA.
Hvilke 3 reaksjoner er katalysert av revers/omvendt transkriptase?
- RNA-avhengig DNA-syntese
- RNA-nedbrytning
- DNA-avhengig DNA-syntese.
