Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Biokjemi > Kapittel 25 > Flashcards

Kapittel 25 Flashcards

1
Q

Hvilke tre regler er grunnleggende for replikasjon?

A
  • replikasjon er semikonservativt
  • replikasjon begynner ved et opprinnelsespunkt og fortsetter vanligvis toveis
  • syntese av nytt DNA skjer i 5´–>3`-retning og er semidiskontinuerlig
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Hva betyr det at DNA-replikasjon er semikonservativt?

A

hver DNA-tråd fungerer som en mal for syntese av ny tråd. Det produseres to nye DNA-molekyler, hver med én ny tråd og én gammel tråd.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Hva er en replikasjonsgaffel?

A

dynamiske punkter der foreldre-DNA blir avviklet og separert, og tråder replikert.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Hva heter de korte sekvensene som lages på sinketråden ved DNA-replikasjon?

A

Okazaki-fragmenter.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Hva er nukleaser?

A

enzymer som bryter ned nukleinsyrer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Hvor bryter eksonukleaser ned nukleinsyrer?

A

ved enden av molekylet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Hvor bryter endonukleaser ned nukleinsyrer?

A

ved spesifikke punkter inni molekylet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Hva er DNA-polymerase?

A

komplekse enzymer som kan syntetisere DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

DNA-polymeraser krever en primer, hva er det?

A

et strengsegment med en fri 3`-OH-gruppe som et nukleotid kan tilsettes. Må være komplementær til malen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Hva er en primerterminus?

A

den frie 3`-enden av primeren

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Det aktive DNA-polymerasesetet har to deler, hva er de og hva gjør de?

A
  • Innsetningssted, den delen av det aktive setet hvor innkommende nukleotid binder seg.
  • Postinnsetningssted, den delen av det aktive setet hvor det nye baseparet ligger når polymerasen glir fremover.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Hva er prosessivitet?

A

gjennomsnittlig antall nukleotider lagt til før en polymerase dissosierer.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Hvordan gjør DNA-polymerase I feilretting?

A

Translokasjon av enzymet er hemmet når et feil nukleotid tilsettes. Mange DNA-polymeraser har en indre 3-->5eksonuklease korrekturlesing, som lar enzymet fjerne et nylig tilsatt nukleotid.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Hvor mange feil er det gjennomsnittlig etter basevalg og korrekturlesing?

A

1 feil per 106-108 baser.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hvorfor er det høyere nøyaktighet av E-coli-replikasjon?

A

pga. mismatch reparasjon.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Hvilke 3 underenheter har DNA-polymerase III* i E-coli?

A

α, ε og θ.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Hva gjør underenheten α?

A

polymerisasjonsaktivitet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Hva gjør underenheten ε?

A

korrekturlesning

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Hva gjør underenheten θ av DNA-polymerase III* i E-coli?

A

assosieres med både α og ε, for å danne kjernepolymerase.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Hva kan konvertere DNA-polymerase III* til DNA-polymerase III Holoenzym?

A

β-underenheter, som gir en økning i prosessivitet ved å forhindre dissosiasjon av DNA-polymerase III fra DNA.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Hva er et replisom?

A

et DNA-replikasjonssystem som er hele komplekset av enzymer og proteiner som kreves for replikasjon.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Hva er hovedklassene av replikasjonsenzymer?

A
  • Helikaser
  • topoisomeraser
  • SSB (DNA-bindende proteiner)
  • primaser
  • DNA-polymerase I
  • RNase H1
  • DNA-ligaser.
23
Q

Hva er helikaser?

A

enzymer som beveger seg langs DNA og skiller trådene. Krever ATP

24
Q

Hva gjør topoisomeraser i replikasjon?

A

Splitting av DNA-trådene (fra hverandre) fører til at resten av DNAet blir mer kveilet og under stress. Topoisomerase lindrer stresset skapt av trådseparasjon før og etter stedet det skjer replikasjon.

25
Q

Hva gjør SSB (DNA-bindende proteiner)?

A

stabiliserer separerte tråder.

26
Q

Hva gjør DNA-polymerase I?

A

fjerner og erstatter RNA-primere

27
Q

Hva gjør RNase H1?

A

bryter ned RNA i RNA-DNA-hybrider, og kan fjerne RNA-primere.

28
Q

Hva gjør DNA-ligaser?

A
  • forsegler hakk i DNA-ryggraden etter fjerning og erstatning av en RNA-primer.
  • katalyserer dannelsen av en fosfodiesterbinding mellom en 3-OH på slutten av en DNA-tråd og et 5-fosfat på slutten av en annen tråd. Fosfat må aktiveres ved adenylylering ved å bruke ATP.
29
Q

Hvilke 3 faser kan replikasjon deles inn i?

A

initiering, elongering og avslutning.

30
Q

Hva skjer i initieringsfasen?

A

binding av initieringsproteiner og helikase til replikasjonsorigo

31
Q

Hva skjer i elongerinsfasen?

A

det tilføres nye nukleotider til de to maltrådene (ledetråd og sinketråd). Det skjer ved at primase syntetiserer en kort RNA-primer ved replikasjonsorigo. Helikase beveger seg i motsatte retninger, og DNA-polymerase III legger til nukleotider til 3`av primeren (og er knyttet til helikasen bundet til den motsatte DNA-tråden).

32
Q

Hva skjer i avslutningsfasen?

A

replikasjonsskjemaet når Ter-sekvensen som får den til å stoppe. DNA-polymerase I eller RNase H1 fjerner RNA-primer og erstatter den med DNA-ligase.

33
Q

Hvilken retning syntetiseres nye DNA-tråder?

A

5-->3

34
Q

Hvilken retning leses maltråden i?

A

3-->5

35
Q

Hvilke typer mutasjoner finnes?

A

substitusjonsmutasjon, innsettingsmutasjon og delesjonsmutasjon.

36
Q

Hva skjer ved substitusjonsmutasjon?

A

ett basepar erstattes med et annet (trenger ikke ha noen påvirkning på resultatet)

37
Q

Hva skjer ved innsettingsmutasjon?

A

tillegg av 1+ basepar

38
Q

Hva skjer ved delesjonsmutasjon?

A

Delesjon av 1+ basepar

39
Q

Hva gjør en mismatchreperasjon?

A

feil korrigeres for å reflektere maltrådinformasjon. Skilles fra den nylig syntetiserte tråden av tilstedeværelse av metylgruppemerker på mal-DNA.

40
Q

Hva gjør DNA-glykosylaser?

A

fjerner spesifikt uracil fra DNA som et resultat av spontan deaminering av cytosin.

41
Q

Hva gjør AP-endonuklease?

A

kutter DNA-tråden som inneholder AP.

42
Q

Hva gjør DNA polymerase I i reparasjon på AP-steder i bakterier?

A

erstatter DNA

43
Q

Hva gjør DNA-ligase i reparasjon på AP-steder i bakterier?

A

forsegler det gjenværende hakket.

44
Q

Hva gjør nukleotid-eksisjonssystemet?

A

reparerer DNA-lesjoner som forårsaker store forvrengninger i DNA-spiralstrukturen (i alle frittlevende organismer).

45
Q

Hva gjør Excinuclease ved nukleotid-eksisjonsreparasjon?

A

hydrolyserer to fosfodiesterbindinger, en på hver side av forvregningen.

46
Q

Hva gjør DNA-polymerase I (bakterier) eller DNA-polymerase ε (mennesker) ved nukleotid-eksisjonsreparasjon?

A

fyller gapet

47
Q

Hva gjør DNA-ligase ved nukleotid-eksisjonsreparasjon?

A

forsegler hakket

48
Q

Hva gjør DNA-fotolyaser ved direkte reparasjon?

A

fremmer direkte fotoreaktivering av cyklobutan-pyrimidin-dimerer.

49
Q

Hvilke 3 klasser av genetiske rekombinasjonshendelser finnes?

A
  • Homolog genetisk rekombinasjon
  • stedsspesifikk rekombinasjon
  • DNA-transposisjon.
50
Q

Hva skjer ved homolog genetisk rekombinasjon?

A

involverer genetisk utveksling mellom to DNA-er som deler en utvidet region med nesten identisk sekvens.

51
Q

Hva skjer ved stedsspesifikk rekombinasjon?

A

involverer genetisk utveksling bare ved en bestemt DNA-sekvens.

52
Q

Hva skjer ved DNA-transposisjon?

A

involverer et kort DNA-segment med kapasitet til å flytte fra ett sted i et kromosom til et annet («hoppende gener»).

53
Q

Hva er ikke-homolog endesammenføying?

A

en alternativ prosess for reparasjon av dobbelttrådbrudd (innebærer ikke rekombinasjon).

54
Q

Når kollapser en replikasjonsgaffel

A

når den møter et skadet sted på malstrengen

Biokjemi (19 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions