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Biochimie > Introduction à la biochimie > Flashcards

Introduction à la biochimie Flashcards

1
Q

Quel est le principal composant de l’organisme?

A

L’eau

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Q

Pourquoi l’eau forme-t-elle un bon solvant dans l’organisme?

A

À cause de sa nature polaire et de son pouvoir de former des liaisons hydrogènes

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Q

En excluant l’eau, de quelle molécule sommes-nous principalement constitués?

A

D’oxygène

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Q

Quelle est l’origine des biomolécules?

A

Eau (H2O)
Méthane (CH4)
Ammoniac (NH3)

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Q

Quelle est l’unité de base de l’ADN?

A

Les désoxynucléotides

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6
Q

Quelle est la principale fonction de l’ADN?

A

Matériel génétique

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7
Q

Quelle est l’unité de base de l’ARN?

A

Les ribonucléotides

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8
Q

Quelles sont les principales fonctions de l’ARN?

A
  • Intermédiaire pour synthèse des protéines
  • Matériel génétique (certains virus ex: COVID)
  • Molécules qui exécutent le travail
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9
Q

Quelle est l’unité de base des protéines?

A

Acides aminés

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10
Q

Quelles sont les principales fonctions des polysaccharides?

A
  • Emmagasinage d’énergie

- Constituants membranaires

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11
Q

Quelle est l’unité de base des lipides (les seuls qui peuvent s’assembler sans être des polymères)?

A
  • Acides gras

- Triglycérides

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12
Q

Quelles sont les structures de l’ADN?

A
  • Phosphate
  • Désoxyribose
  • Base
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13
Q

Qu’est-ce qui change d’un désoxynucléotide à un autre?

A

La base (Thymine (T), Adénine (A), Guanine (G), Cytosine (C))

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14
Q

À quoi peut-on comparer un désoxynucléotide?

A

À un « building bloc » d’ADN

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15
Q

Quelle est la différence entre l’ADN et l’ARN?

A
  • ADN: double hélice

- ARN: simple brin

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16
Q

Combien de combinaisons de séquences différentes peut-on avoir avec 100 paires de bases?

A

4 à la puissance 100

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17
Q

Quelles bases des chaînes de nucléotides s’associent ensemble dans l’ADN?

A
  • C avec G

- A avec T

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18
Q

Quelle partie de l’acide gras est hydrophile et quelle partie est hydrophobe?

A
  • Tête: hydrophile

- Queue: hydrophobe

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19
Q

Décris les membranes

A
  • Bicouche lipidique
  • Les acides gras s’assemblent et forment les
    membranes de façon à ce que les têtes hydrophiles
    soient aux bords et les queues hydrophobes soient
    au centre
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20
Q

Quelles sont les 2 étapes de la formation des biomolécules?

A
  1. La synthèse des « building blocs »
  2. L’assemblée des polymères (ou membranes)
    - Le métabolisme des «building blocs » et des
    polymères est différent
    - Ces étapes se font à différents endroits dans la
    cellule
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21
Q

À quoi consiste l’expérience de Miller et Urey?

A

À reproduire les conditions originellement sur la terre (essayer d’expliquer l’origine de la vie)

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22
Q

Décrire les étapes de l’expérience de Miller et Urey

A
  • Mettre molécules (Hydrogène, Ammoniac, Méthane)
  • Injecter énergie
  • Attendre
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23
Q

Quels sont les résultats de l’expérience de Miller et Urey?

A

À partir de molécules organiques (Hydrogène ou cyanide d’hydrogène, Ammoniac, Méthane), des molécules inorganiques sont synthétisés (Acides aminés, Nucléotides (avec cyanide d’hydrogène))

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24
Q

Quelles sont les organites retrouvés dans les cellules procaryotes?

A
  • Membrane externe
  • Paroi cellulaire
  • Membrane plasmique
  • Cytosol
  • Ribosomes
  • Plasmide
  • Pilis
  • Flagelle
  • Nucléoide
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25
Q

Quelles sont les organites retrouvés dans les cellules eucaryotes?

A
  • Membrane plasmique
  • Microtubules
  • Noyau (contient et protège le matériel génétique
    (ADN))
  • Nucléole (synthèse d’ARN ribosomaux)
  • Centrosome
  • Réticulum endoplasmique rugueux (RER) (synthèse et
    modification des protéines)
  • Microfilaments
  • Mitochondrie (production d’énergie)
  • Appareil de Golgi (synthèse et modification des
    protéines)
  • Vacuole
  • Ribosome
  • Cytosol
  • Réticulum endoplasmique lisse (REL)
  • Lysosome
  • Desmosome
  • Filaments intermédiaires
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26
Q

Nomme les 3 approches expérimentales pour étudier la biochimie des cellules

A
  • Microscopie
  • Rupture « douce » des cellules
  • Isolement des constituants cellulaires
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27
Q

Quelles sont les composantes du squelette cellulaire qui sert à ce que la cellule ait une certaine forme et rigidité?

A
  • Filaments d’actine
  • Microtubules
  • Filaments intermédiaires
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28
Q

Quel est le rôle du noyau?

A

Contient et protège le matériel génétique (ADN)

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29
Q

Quel est le rôle du nucléole?

A

Synthèse d’ARN ribosomaux

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30
Q

Quel est le rôle du RER?

A

Synthèse et modification des protéines

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31
Q

Quel est le rôle des mitochondries?

A

Production d’énergie

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32
Q

Quel est le rôle de l’Appareil de Golgi?

A

Synthèse et modification des protéines

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33
Q

Qu’est-ce que la microscopie électronique permet de voir?

A

Elle permet de voir certaines protéines qui se trouvent spécifiquement dans certains des sous-compartiments cellulaires

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34
Q

À quoi sert la rupture « douce » des cellules?

A

À isoler les constituants pour ensuite pouvoir les étudier

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35
Q

Comment fonctionne la rupture « douce » des cellules?

A
  1. Prends des œufs de grenouilles
  2. Fait éclater les œufs
  3. Centrifuge lentement
  4. Les composés se séparent
  5. Prends l’extrait et centrifuge rapidement
  6. Les composés se séparent (protéines, ARN, membranes, etc.)
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36
Q

De quoi sont formés les microtubules dans la cellule?

A

De tubuline

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37
Q

Quels types de tubuline existent?

A

Alpha et beta

38
Q

Comment sont formés les microtubules?

A
  • Des dimères de tubulines s’assemblent entre eux
  • Forme des polymères
  • Forme un brin de polymère de tubuline = microtubule
39
Q

Qu’est-ce qu’un groupe R?

A

C’est ce qui est attaché au carbone qui porte le groupement fonctionnel

40
Q

Pourquoi les groupements fonctionnels sont importants?

A
  • Ils confèrent des caractéristiques bien définies et
    dictent les réactions typiques d’une biomolécule
  • La plupart des biomolécules ont plusieurs
    groupements fonctionnels
  • Généralement, les groupes fonctionnels sont modifiés
    enzymatiquement un à la fois. On peut focaliser sur un
    groupement fonctionnel spécifique et comment il
    change au cours de la réaction
  • Alors, si on reconnaît et comprend bien les
    groupements fonctionnels, on peut comprendre les
    réactions des biomolécules complexes
  • En chimie, les réactions des groupes fonctionnels sont
    faites par d’autres molécules chimiques (ex: oxydation
    des alcools par le permanganate). En biochimie, les
    réactions des groupes fonctionnels se font par des
    enzymes (protéines)
41
Q

Quelles sont les caractéristiques des hétéroatomes?

A
  • Ils ne sont pas le carbone ou l’hydrogène
  • Principalement Oxygène (O), Azote (N) et Soufre (S)
  • Contiennent plus ou 1 doublets non-liant (doublet
    d’électrons de valence qui n’est pas impliqué dans
    une liaison covalente. Donne un champ électrique
    négatif)
  • Ces doublets peuvent former des liens covalents
    (partage d’électrons entre atomes) avec le carbone
42
Q

Donne des exemples de groupes fonctionnels dans lesquels les hétéroatomes sont présents

A
  • Amino -NH2
  • Carboxyle -COOH
  • Hydroxyle -OH
43
Q

Nomme la formule du groupe hydroxyle / alcool

A

-OH

44
Q

Quelles sont les caractéristiques du groupe hydroxyle / alcool?

A
  • Soluble dans l’eau

- Forme des ponts hydrogène

45
Q

Donne un exemple de molécule contenant le groupe hydroxyle / alcool

A

Éthanol

46
Q

Nomme la formule du groupe carboxyle

A

-COOH

47
Q

Quelles sont les caractéristiques du groupe carboxyle?

A
  • Chargé négativement à pH physiologique

- Bon accepteur de ponts hydrogène

48
Q

Donne un exemple de molécule contenant le groupe carboxyle

A

Acide acétique

49
Q

Nomme la formule du groupe amino

A

-NH2

50
Q

Quelles sont les caractéristiques du groupe amino?

A
  • Habituellement chargé, zwetterionique à pH
    physiologique
  • Forme des ponts hydrogène
51
Q

Donne un exemple de molécule contenant le groupe amino

A

Glycine

52
Q

Quelles sont les caractéristiques du groupe phosphate?

A
  • Toujours chargé négativement (`cause de ses liens)
  • Forme des ponts hydrogène avec l’eau
  • Très soluble dans l’eau
53
Q

Donne un exemple de molécule contenant le groupe phosphate

A

Glycéraldéhyde 3-phosphate

54
Q

Quelles sont les caractéristiques des groupes carbonyle, aldéhyde et cétone?

A

Forme des ponts hydrogène avec l’eau

55
Q

Donne un exemple de molécule contenant le groupe carbonyle

A

Acétaldéhyde

56
Q

Donne un exemple de molécule contenant le groupe cétone

A

Pyruvate

57
Q

Quelles sont les caractéristiques du groupe amide?

A

Forme des ponts hydrogène

58
Q

Donne un exemple de molécule contenant le groupe amide

A

Asparagine

59
Q

Nomme la formule du groupe sulfhydryle

A

-SH

60
Q

Quelles sont les caractéristiques du groupe sulfhydryle?

A
  • Deux groupes SH s’oxydent facilement pour donner
    des ponts disulfures (S-S)
  • Peut former des thioesters
  • Liaison très importante en biochimie
  • Les groupes SH forment de faibles ponts hydrogène
61
Q

Donne un exemple de molécule contenant le groupe sulfhydryle

A

Cystéine

62
Q

Quel est le lien entre l’Oxygène (O) et le Soufre (S)?

A

Ils sont dans la même famille du tableau périodique et donc forment plusieurs composés semblables

63
Q

Dans les alcools, le groupe hydroxyle donne un caractère…

A

Polaire

64
Q

Dans les alcools, le groupe alkyle donne un caractère…

A

Non-polaire

65
Q

Les alcools sont solubles dans l’eau mais plus la chaîne carbonée est longue, plus la solubilité…

A

Décroît

66
Q

Nombre d’oxydations possibles des alcools primaires

A

2

67
Q

Nombre d’oxydations possibles des alcools secondaires

A

1

68
Q

Qu’est-ce qui est spécial des alcools tertiaires

A

Ils ne peuvent pas être oxygénés / déshydrogénés sans couper la liaison C-C

69
Q

Quelles sont les réactions biochimiques possibles des alcools?

A

L’estérification et la formation d’éthers

70
Q

Donne la formule de l’estérification des alcools primaires

A

Acide + Alcool —> Ester + Eau

71
Q

Comment forme-t-on un éther à partir d’un alcool secondaire?

A

Les éthers sont dérivés d’alcools dans lesquels l’hydrogène du groupement R-OH est remplacé par un groupement alkyle (R’)

72
Q

Les disulfures (S-S) et les peroxydes jouent des rôles importants. Nommez le rôle de chacun

A
  • Disulfures (S-S): Structure des protéines

- Peroxydes (O-O): Biosynthèse des prostaglandines

73
Q

Dire la différence de nombre de groupements alkyle entre les aldéhydes et les cétones vu qu’ils possèdent tous les deux un groupement carbonyle?

A
  • Aldéhydes: 1 groupement alkyle (R)

- Cétones: 2 groupements alkyle (R et R’)

74
Q

Nommez les réactions des aldéhydes et des cétones

A
  • Oxydation

- Réduction

75
Q

L’oxydation d’un aldéhyde donne…

A

Acide carboxylique correspondant

76
Q

Qu’ont en commun les cétones et les alcools tertiaires?

A

Les cétones ne sont pas facilement oxydées puisque, tout comme les alcools tertiaires, elles ne peuvent pas perdre un hydrogène sans coupure de la liaison C-C

77
Q

La réduction d’un aldéhyde donne…

A

Alcool primaire correspondant (le -OH (hydroxyle) remplace le C=O (carboxyle))

78
Q

La réduction d’un cétone donne…

A

Alcool secondaire correspondant (le -OH (hydroxyle) remplace le C=O (carboxyle))

79
Q

La réduction des aldéhydes et des cétones est l’inverse de…

A

L’oxydation des alcools

80
Q

La formation d’hémiacétal et d’acétal se fait en milieu…

A

Acide

81
Q

Comment se forment un hémiacétal et un acétal?

A
  • Hémiacétal: un aldéhyde se combine avec un
    groupement hydroxyle d’un alcool
  • Acétal: un aldéhyde se combine avec deux
    groupements hydroxyles d’un alcool
82
Q

Qu’est-ce qu’un thioalcool, thioester et thioéther?

A

C’est la même chose qu’avec un groupement -OH mais cette fois-ci avec un groupement -SH

83
Q

Comment se forment un thiohémiacétal et un thioacétal?

A
  • Thiohémiacétal: un aldéhyde se combine avec un groupement -SH d’un thioalcool
  • Thioacétal: un aldéhyde se combine avec deux groupements -SH d’un thioalcool
84
Q

La condensation aldolique se fait en milieu…

A

Alcalin (basique)

85
Q

Comment se forme les aldols et les cétones B-hydroxylés?

A
  • Aldols: Les aldéhydes se condensent
  • Cétones B-hydroxylés: À un degré moindre, les
    cétones se condensent
86
Q

Quelle molécule deviennent souvent des cétones B-hydroxylés?

A

Les acides gras

87
Q

Qu’est-ce qui caractérise les groupement carboxyliques?

A
  • Groupement carbonyle (>C=O) et groupement
    hydroxyle (-OH) sur le même atome de carbone
  • Acides faibles
88
Q

Comment se dissocient les acides carboxyliques dans l’eau?

A

Ils se dissocient seulement en partie pour former un ion hydrogène (H+) et un anions carboxylate (R-COO-)

89
Q

La réduction complète d’un acide carboxylique donne…

A

L’alcool primaire correspondant (cette réaction nécessite 4 hydrogènes)

90
Q

L’oxydation complète des alcools primaires donne…

A

Un acide

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