Intracellulär sortering av protein Flashcards
Hur behöver vi upprätthålla cellens organisation ?
genom att protein behöver sorteras
Hur känner cellen igen vart proteinet skall ta vägen ?
- specifika aminsyrasekvenser bestämmer vart proteiner tar vägen i cellen
(rätt protein till rätt plats)
Vad händer vid dem fria och membranbundna ribosomerna ?
Vid start av translationen rekryteras ribosomala subenheter från en fri pool. Translationen kan sedan ske på fria ribosomer i cytoplasman eller på ribosomer bundna till Endoplasmatiska
nätverket
Finns två olika mekanismer för translation hur fungerar dem?
Dessa är beroende utav proteinets destination.
- men båda har en gemensam start i cytosolen
- men går sedan vidare till antigen ribosomer med ER membran
Eller
Fria i cytosolen
Vad är sekretoriska passagen ?
Det är proteiner med en signalpeptid tar denna vägen genom cellen
ER-> Golgi-> plasmamembran / sekretion/ lysosomer
Hur fungerar identifiering och lokalisering av membran protein till ER ?
- SRP binder till ER signal sekvensen och blockerar translation (svenska?)
- SRP binder till SRP receptorn;
- GTP binder till SRP receptorn och formar nytt polypeptid som rör sig “into pore”
- GTP hydrolyseras och SRP “släpps”
- Polypeptiden förlängs och flyttar sig till ER lumen
- polypeptid är färdig och klyvs av peptidas, och släpper det från membranet
Hur fungerar de endoplasmatiska nätverket ?
- Har två olika delar
- En slät och en knottrig del (rough ER och smooth ER)
Hur fungerar rough ER?
- ER membran med dockade ribosomer
- syntes av membran proteiner. (styr transport av proteiner till det korrekta membranet)
- Syntes av protein som skall utsöndras från cellen
- I ER sker modifiering av proteinet (veckning, disulfidbindningar mm)
Vad är N-länkad glykosylering ?
- > oligosackarider (14 monosackarider) sätts på asparagin när proteinet passerat ER membranet.
- > Sockret sitter först på en lipid (dolichol) i ER membranet.
- > sockret överförs från dolichol till proteinet med hjälp av enzymet “oligosaccharyl transferase”
- > underlättar veckning av proteiner i ER
Vad kommer efter det endoplasmatiska nätverket ?
Efter detta fortsätter protein ner till golgiapparaten
Hur fungerar golgi-apparaten ?
- Den andra delen av endomembransystemet.
- Här sorteras och modifieras proteiner.
- Olika delar av golgi-apparaten har olika funktion och membranegenskaper.
- Transport mellan diskarna sker främst via vesiklar– Anterograd och Retrograd transport.
Vilka funktionella rum är golgi uppdelat i?
-cis, medial och trans golgi.
Hur fungerar protein som ska sorteras?
> protein ska sorteras till lysosomer binder till N-acetylglucosamine fosfotransferase som sätter på mannose-6-fosfat på dessa proteiner
Lysosomala proteiner innehåller en komplex igenkännings-sekvens-“singal-patch” som låter dem interagera med enzymet GlcNAc fosfotransferase
Mannose-6-fosfat binder till en receptor som styr lysosomala proteiner till särskilda transport-vesiklar
Vad är Clathrin för protein?
- ett coat protein som används främst vid endocytos
- Renade clathrin molekyler består av en symmetrisk trimer av 3 tunga och 3 lätta kedjor (triskelions)
- 36 Cathrin triskelions polymeriserar och bildar en polygonal korg.
- Clathrin hjälper till att böja membranet och på det viset att knoppa av vesikeln
Vad är viktigt att vesiklarna gör ?
- Vesikeln måste känna igen sitt målmembran, den får inte komma fel.
- vesikeln måste fusionera med målmembranet och leverera sitt innehåll.
Vad är SNARE protein?
specifika interaktioner sker mellan SNARE molekyler på vesikeln (v-SNARE) och målmembranet (t-SNARE) detta ger specificitet
Detta protein används även vid utsöndring av neurotransmittorer
Hur fungerar mitokondrien och hur importeras protein dit?
> > mitokondreins speciella egenskaper
Innehåller eget DNA och translationsmaskineri och kan tillverka vissa protein
Andra proteiner importeras från cytosolen där de bildats av fria ribosomer
Har dubbla memrabn system
Hur fungerar import av protein till kärnan?
- kärnan har ett dubbelt membransystem, som är kontinuerligt med det endoplasmatiska nätverket
- Det är många ämnen som behöver exporteras från eller till kärnan
- Exempel på protein som importeras.
-> RNA och DNA polymeraser
-> ribosomala proteiner (sätts ihop med rRNA i kärnan) och exponeras igen som ribosomala subenheter
Generellt GÄLLER “PROTEIN IN OCH RNA UT”
Hur sker transport mellan kärna och cytoplasma ?
Sker genom nuclear pore complexes
Vad är Nukleära lokalisations signaler NLS?
- detta kan finnas vart som på ett protein.
- NLS består av 4-8 aminosyror, där flera är basiska och binder till import.
- För proteinexport används nukleära export signaler och Ran-GTP kompelx
- NLS fungerar som en “signalpeptid” för kärnan men klyvs aldrig av.
