Intracellulär sortering av protein Flashcards
Hur behöver vi upprätthålla cellens organisation ?
genom att protein behöver sorteras
Hur känner cellen igen vart proteinet skall ta vägen ?
- specifika aminsyrasekvenser bestämmer vart proteiner tar vägen i cellen
(rätt protein till rätt plats)
Vad händer vid dem fria och membranbundna ribosomerna ?
Vid start av translationen rekryteras ribosomala subenheter från en fri pool. Translationen kan sedan ske på fria ribosomer i cytoplasman eller på ribosomer bundna till Endoplasmatiska
nätverket
Finns två olika mekanismer för translation hur fungerar dem?
Dessa är beroende utav proteinets destination.
- men båda har en gemensam start i cytosolen
- men går sedan vidare till antigen ribosomer med ER membran
Eller
Fria i cytosolen
Vad är sekretoriska passagen ?
Det är proteiner med en signalpeptid tar denna vägen genom cellen
ER-> Golgi-> plasmamembran / sekretion/ lysosomer
Hur fungerar identifiering och lokalisering av membran protein till ER ?
- SRP binder till ER signal sekvensen och blockerar translation (svenska?)
- SRP binder till SRP receptorn;
- GTP binder till SRP receptorn och formar nytt polypeptid som rör sig “into pore”
- GTP hydrolyseras och SRP “släpps”
- Polypeptiden förlängs och flyttar sig till ER lumen
- polypeptid är färdig och klyvs av peptidas, och släpper det från membranet
Hur fungerar de endoplasmatiska nätverket ?
- Har två olika delar
- En slät och en knottrig del (rough ER och smooth ER)
Hur fungerar rough ER?
- ER membran med dockade ribosomer
- syntes av membran proteiner. (styr transport av proteiner till det korrekta membranet)
- Syntes av protein som skall utsöndras från cellen
- I ER sker modifiering av proteinet (veckning, disulfidbindningar mm)
Vad är N-länkad glykosylering ?
- > oligosackarider (14 monosackarider) sätts på asparagin när proteinet passerat ER membranet.
- > Sockret sitter först på en lipid (dolichol) i ER membranet.
- > sockret överförs från dolichol till proteinet med hjälp av enzymet “oligosaccharyl transferase”
- > underlättar veckning av proteiner i ER
Vad kommer efter det endoplasmatiska nätverket ?
Efter detta fortsätter protein ner till golgiapparaten
Hur fungerar golgi-apparaten ?
- Den andra delen av endomembransystemet.
- Här sorteras och modifieras proteiner.
- Olika delar av golgi-apparaten har olika funktion och membranegenskaper.
- Transport mellan diskarna sker främst via vesiklar– Anterograd och Retrograd transport.
Vilka funktionella rum är golgi uppdelat i?
-cis, medial och trans golgi.
Hur fungerar protein som ska sorteras?
> protein ska sorteras till lysosomer binder till N-acetylglucosamine fosfotransferase som sätter på mannose-6-fosfat på dessa proteiner
Lysosomala proteiner innehåller en komplex igenkännings-sekvens-“singal-patch” som låter dem interagera med enzymet GlcNAc fosfotransferase
Mannose-6-fosfat binder till en receptor som styr lysosomala proteiner till särskilda transport-vesiklar
Vad är Clathrin för protein?
- ett coat protein som används främst vid endocytos
- Renade clathrin molekyler består av en symmetrisk trimer av 3 tunga och 3 lätta kedjor (triskelions)
- 36 Cathrin triskelions polymeriserar och bildar en polygonal korg.
- Clathrin hjälper till att böja membranet och på det viset att knoppa av vesikeln
Vad är viktigt att vesiklarna gör ?
- Vesikeln måste känna igen sitt målmembran, den får inte komma fel.
- vesikeln måste fusionera med målmembranet och leverera sitt innehåll.
