Enzym och enzymkinetik Flashcards
Vad är enzymer?
Livets katalysatorer. Behövs för att styra och möjliggöra, mycket specifika.
Varför behövs enzymkatalyserade reaktioner i cellen?
- Öka hastigheten för reaktioner
- Hög selektivitet erfodras och kräver hög specificitet mellan enzym och substrat.
Ge exempel på proteaser ?
Trypsin och Thrombin som katalyserar hydrolys av peptidbindningar
Varför används enzym kinetik inom biomedicin?
- Känsligt sätt att påvisa ett enzym
- Hitta inhibitorer
- Påverkar mutationer kinetiken?
- Hur regleras enzymet?
Vad menar man med att det finns två koncept för att förstå enzymer ?
- Bindning till protein.
- en ligand binder reversibelt till bindningsfickan i ett protein.
- Hastigheten sker med bestämt Ka och Kd
Protein har ett viss hastighet att binda in, jämnvikts konstanten beror på dessas affinitet till varandra.
- Jämnviktskoncentrationen anges med jämnviktskonstanterna Ka eller Kd - Hur sker reaktioner i allmänhet.
Vad skulle vara en bra inbindning?
1 nanomolar; är bra bindning ex. en drog /lkm.
Nu har vi LKM som liknar 1 nm om vi ska blockera ett enzym som har 2 nm i kroppen har vi nu slagit ut hälften av dem.
Varför får inte enzym och substrat binda för hårt?
För att det inte blir en reaktion då.
- De får inte binda in för bra, ska helt enkelt inte passa perfekt.
(bindning-katalys-reaktion-släppa)
Hur fungerar hastighet och temperatur ?
En reaktion går mycket snabbare om det är lägre aktiveringsenergi, om temperaturen ökar, blir även K större.
- Feber är alltså bra då enzym börjar jobba snabbare.
Vad menar vi när det inte får passa för bra?
“Brytningen” kräver energi.
Enzymet ska brytas (katalyseras) men om enzymet skulle binda för bra med substratet skulle man inte kunna bryta staven därmed fungerar inte enzymet som de ska.
Vad har vi för vanliga bindningar?
- Vätebindning
- Jon interaktioner
- Hydrofob växelverkan
Detta är exempel på bindningar som sker i reaktionen.
Vad är Km?
- > Det är michaelis-konstanten. Km skrivs med molar (mol/L)
- > Motsvarar koncentrationen substrat när hälften av enzympopulationen har sina katalytiska säten ockuperade.
- > Om Km är litet= hög affinitet mellan enzym och substrat (de är ett mått på dissociationen; alltså affiniteten)
Vad innebär kompetetiv inhibering ?
> > Kompetetiv inhibering: enzym och substrat måste ha väldigt lika former då den binder in till samma ställe. Tävlar nästan.
V-max ändras INTE när vi har en inhibitor insatt
Km ser ut att öka eftersom mer substrat krävs för att enzymet ska utföra samma arbete.
Vad innebär icke-kompetetiv inhibering ?
- Vmax minskas
- Km ändras inte
- Km och Vmax presenteras ofta i ett Lineweaver-burk diagram.
Vad innebär Unkompetetiv ?
- > inhibitor binder enbart in till ES komplex-
- > Vmax blir lägre
- > det uppmätta värdet på Km blir lägre
Hur fungerar irreversibel inhibering ?
Binds till enzymets aktiva yta så starkt att det i princip inte lossnar alls. Kallas enzymgifter.
Detta är till exempel när man vill reagerar med en viss molekyl.
