Pharmacogénomique Flashcards

1
Q

Variabilité de la réponse thérapeutique

A
  • tous des patients avec le même diagnostic : bénéfice et toxicité, aucun bénéfice et toxicité, aucun bénéfice et aucune toxicité, bénéfice et aucune toxicité
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2
Q

Facteurs associés à la réponse variable aux médicaments

A
  • il est nécessaire d’identifier les facteurs associés à la sensibilité différentielle aux médicament afin d’améliorer les thérapies
  • le risque d’une réaction indésirable à un médicament dépend de facteurs génétiques et environnementaux
  • l’environnement comprend : médicament(s) administré(s), maladie, autres facteurs (nutrition, mode de vie, âge, sexe, interactions médicamenteuses)
  • le régime de la même posologie pour tous n’est pas idéal pour tous les patients et ne justifie pas les coûts pour les services médicaux
  • une alternative à cette approche est d’ajuster le traitement en fonction de la génétique du patient
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3
Q

Pharmacogénétique

A
  • un lien entre la constitution génétique individuelle et la réponse thérapeutique
  • relation entre les variations héréditaires et variabilités individuelles dan la réponse aux médicaments
  • relation entre génotype et phénotype
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4
Q

Histoire de la pharmacogénétique : CYP2D6

A
  • débrisoquine
  • collègues ont voulu faire une expérience pour voir s’ils réagiraient différemment à la débrisoquine
  • un seul souffrait d’un vertige intense et d’une baisse marquée et prolongée de la tension
  • chez la plupart des gens, la débrisoquine est transformé rapidement en métabolites inactifs et éliminés dans l’urine
  • dans son cas, le métabolite principal était absent dans l’urine, révélant que la sensibilité extrême au médicament est associée avec l’incapacité à former le métabolite
  • donné deux phénotypes : métabolisateurs pauvres et métabolisateurs rapides
  • déficience de CYP2D6 était responsable pour les effets secondaires observés
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5
Q

Pharmacogénétique : but

A
  • aider à maximiser l’efficacité du traitement en ciblant certains médicaments seulement à des patins qui vont en tout probabilité répondre
  • peut identifier des individus qui pourraient être à plus haut risque de subir les effets secondaires des médicaments
  • chez ces individus, il est possible de changer les modalités de traitement en utilisant un médicament différent ou une dose de médicament différente
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6
Q

Ajustement du traitement

A
  • en se basant sur les différences au niveau des gènes dont les produits agissent comme médiateur des effets des médicaments, il serait possible d’identifier les individus qui répondent bien ou non au traitement (effets secondaires et l’efficacité du traitement)
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7
Q

Traitement individualisé

A
  • approche traditionnelle : dose standard : 50% de réponse non-favorable ou favorable
  • médecine de la précision : dose diminuée, dose standard, dose élevée, ou médicament alternatif : beaucoup plus de réponses favorables
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8
Q

Nature des polymorphismes

A
  • polymorphisme d’un nucléotide (SNPs)
  • insertions ou délations de codons
  • polymorphismes de répétitions ou de longueur
  • microsatellites
  • minisatellites
  • gènes répétés
  • grosses inversions et délétions
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9
Q

Polymorphismes : fonction

A
  • variations des séquences de l’ADN, tout particulièrement celles associées à une fonction altérée (les variants fonctionnels), peuvent avoir un impact majeur sur la réponse aux :
  • médicaments
  • maladies
  • agressions environnementales, telles que les produits chimiques, les agents pathogènes;nes et les toxines
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10
Q

Polymorphismes : exemples

A
  • changement d’acides aminés peuvent changer la structure et ainsi la fonction d’une protéine
  • changement du site dépistage peut changer le taux d’ARNm produit
  • les SNPs fonctionnels peuvent modifier la quantité ou la qualité de produits du gène et peuvent ainsi affe ces directement la réponse au traitement
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11
Q

SNP

A
  • polymorphismes de répétition
  • les polymorphismes ou les variants d’ADN : ka variation génétique existant sous forme de deux ou sous forme de multiples allèles dans la population
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12
Q

2 approches en pharmacogénétique

A
  • approche des gènes candidats : nécessite des connaissances préalables sur le gène candidat, gènes qui codent pour les déterminant pharmacocinétique et pharmacodynamiques des effets des médicaments
  • dépistage génomique : utilisée pour trouver la région du génome ayant les gènes de susceptibilités sans avoir une connaissance a priori des gènes potentiellement impliqués (SNPs marqueurs)
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13
Q

Quels sont les gènes analysés dans des études pharmacogénétiques?

A
  • les gènes contrôlant des enzymes qui métabolisent des médicaments et leurs produits
  • le transport des médicaments est un autre processus qui est d’une importance évidente dans l’effet du médicament
  • l’ensemble des enzymes métabolisant et des transporteurs pourraient aussi être nommés comme les gènes influençant l’absorption, la distribution, le métabolisme et l’excrétion
  • les médicaments doivent se lier à leurs cibles (les récepteurs ou les enzymes) afin de moduler leurs fonctions
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14
Q

Méthodologie : études d’association

A
  • comparer la fréquence génotypique allylique d’un SNP chez:
  • sujets répondant vs. non-répondants
  • patient avec toxicité vs. patients sans toxicité
  • paramètres pharmacocinétiques, la dose de médicament
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15
Q

Effet de polymorphisme

A
  • enzyme pour métaboliser un médicament n’est plus efficace à cause du polymorphisme
  • réduction de l’activité enzymatique
  • augmentation de la concentration du médicament dans le sang
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16
Q

Combien d’allèles a un SNP?

A
  • 2
17
Q

Combien de génotypes d’un SNP on retrouve dans la population?

A
  • 3
18
Q

Un SNP (l’allèle mineur) diminue l’activité de l’enzyme métabolisant. Cette enzyme est importante pour l’inactivation d’un médicament. Si un individu a 2 copies d’allèle mineur, quel changement dans la concentration du médicament on s’attend à voir?

A
  • augmentation
19
Q

On a comparé la fréquence génotypique d’un SNP dans le gène codant pour le transporteur d’un médicament entre patients qui ont bien répondu au médicament et non-répondeurs. Le résultat indique que la fréquence génotypique est similaire entre deux groupes. Est-ce que ce SNp joue un rôle dans l’efficacité du traitement?

A
  • non
20
Q

Warfarine et les variants génétiques du CYP2C9

A
  • la warfarin est largement proscrite pour prévenir et contrôler la thromboembolie
  • l’inhibition de la réductase de l’époxyde de la vitamine K pour la warfarin limite la quantité de la vitamine K réduite disponible comme le cofacteur pour la synthèse des protéines essentielles impliquées dans la cascade de la coagulation
  • l’efficacité de l’anticoagulothérapie est d’habitude mesurée par le rapport international normalisé (RIN) : rapport entre le temps de coagulation due sang du patient et le temps standardisé de coagulation
  • la dose de warfarin nécessaire afin d’atteindre un RIN thérapeutique varie beaucoup entre les individus
  • efficacité plus faible ou toxicité (saignements)
  • changement d’acide aminé dans l’allèles 2 et 3 du CYP2C9 diminue l’activité enzymatique
21
Q

Influence des allèles CYP2C9 sur la posologie requise pour la warfarine

A
  • parmi les patients stabilisés lors d’une thérapie de warfarine de faible dose : les porteurs de variant de CYP2C9 étaient plus nombreux que dans la population générale
  • les porteurs de l’allèle CYP2C9*2 ont besoin de doses de warfarine réduites pour atteindre le RIN thérapeutique
  • ils ont une probabilité plus élevée de développer de complications majeures (saignements), si traités avec les doses standards (trop grande concentration du médicament donc toxicité)
22
Q

Warfarine : VKORC1

A
  • site de liaison pour un facteur de transcription, réduction du taux d’ARNm
23
Q

Par rapport aux individus sans allèles *2 ou *3, la concentration de warfarine chez un individu ayant deux copies d’allèles *2 ou *3 de CYP2C9 est…?

A
  • plus grande
24
Q

Polymorphismes CYP2D6

A
  • gène CYP2D6 est hautement polymorphe
  • le rapport entre la récupération urinaire du composé d’origine (débrisoquine) et celle de son métabolite après avoir utilisé une dose orale unique du médicament (rapport métabolique) en tant que mesure de l’activité du CYP2D6
  • métabolisateurs pauvre (MP) : allèles non fonctionnels causés par :
    • sites d’épissages modifiés (4,11)
    • mutation du cadre de lecture (*3, *6, *13, *15)
    • délétion du gène (*5)
    • codon d’arrêt prématuré (*8)
  • métabolisateurs extensifs (ME) : individus ayant l’allèle 1*
  • métabolisatuers intermédiaires (MI) : réduction d’activité enzymatique causée par la substitution de la séquence d’acides aminés
  • métabolisateurs ultra rapides (MU) : duplication génique
25
Q

Bêta-bloquants

A
  • souvent utilisés dans la thérapie pour les maladies cardio-vasculaires
  • ils sont efficaces pour la réduction de morbidité et de mortalité à la suite de l’hypertension, de coronaropathie ou d’insuffisance cardiaque chronique
  • le métoprolol est une bêta-bloquant efface qui agit contre les récepteurs bêta 1 adrénergique
  • il est métabolisé via le cytochrome P450 2D6 (CYP2D6) hépatique
26
Q

Différences interindividuelles dans la réponse au métoprolol

A
  • la thérapie pourrait être plus efficace chez les MP grâce à des concentration plasmiques plus élevées
  • la thérapie pourrait être plus toxique
  • l’élévation des concentrations de métoprolol pourrait contribuer à l’apparition d’effets secondaires (bradycardie, aggravation de l’insuffisance cardiaque)
27
Q

Concentration plasmique du métoprolol par rapport aux génotypes CYP2D6

A
  • si 2 allèles non fonctionnels, augmentation de la concentration de métoprolol dans le sang
28
Q

Inhibiteurs sélectifs de la recapture de la sérotonine (ISRS)

A
  • ISRS sont efficaces dans le traitement de la dépression
  • le neurotransmetteur sérotonine (5-HT) est impliqué dans la modulation de l’humeur et des émotions
  • le transporteur de la sérotonine (5-HTT) joue un rôle crucial dans la terminaison de la neurotransmission de la 5-HT, et donc représente une cible pour les ISRS
  • inactivation
  • métabolisateurs ultra rapides : grand métabolisme, donc peu de concentration : échec de traitement donc médicament alternatif
  • métabolisateurs pauvres : métabolisme fiable donc hautes concentrations : effets secondaires donc médicament alternatif
29
Q

Codéine

A
  • chez un métabolisateur rapide pour le cytochrome 2D6, la proportion de moprhine produite équivaut en moyenne à 10% de la dose de codéine
  • chez un métabolisateur lent, la morphine est absente donc échec de traitement
  • chez un métabolisateur ultrarapide, la production de morphine augmente, donc effets secondaires
30
Q

CYP2D6 et le tamoxifène

A
  • le tamoxifène est un anti-estrogène qui agit en inhibant la liaison d’estrogène aux récepteurs d’estrogène
  • le tamoxifène inhibe l’expressions gènes controlées par les estrogènes, y compris les facteurs de croissance et d’angiogenèse impliqués dans la prolifération de la tumeur
  • approuvé pour le traitement du cancer du sein avancé et pour le traitement adjuvant du sein primaire (cancer du sein positif pour le récepteur d’estrogène)
  • le métabolite actif du tamoxifène est responsable de l’efficacité clinique
31
Q

Résumé CYP2D6 : inactivation

A
  • ISRS et metoprolol
  • PM : augmentation de la concentration donc risque de toxicité
  • UM : concentrations moindres donc thérapie moins efficaces
32
Q

Résumée CYP2D6 : activation

A
  • codéine et tamoxifène
  • PM : baisse concentration de morphine ou endoxifène donc thérapie moins efficace
  • UM : augmentation concentration donc risque de toxicité
33
Q

Par rapport aux autres groupes métaboliques du CYP2D6, la concentration e morphne chez un individu étant MP et traité par codéine est :

A
  • plus petite
34
Q

Par rapport aux autres groupes métaboliques du CYP2D6, la concentration de ISRS chez une individu étant UM est :

A
  • plus petite
35
Q

Leucémie lymphoblastique aiguë (LLA) chez l’enfant

A
  • amélioration remarquable du taux de survie
  • les cas résistants de la LLA représentent encore la cause principale de décès liés au cancer pédiatrique
  • toxicité et morbidité de longue durée
  • la 6-mercaptopurine (6-MP) est le composant important de la thérapie de la LLA
36
Q

Importance des génotypes de la TPMT

A
  • génotype peut aider le traitement
  • les patients avec deux allèles variants ont un risque plus élevé de développé une toxicité hématopoïtique sévère
  • ces personnes ont besoin e seulement 6-10% de la dose standard du médicament, et, si traités avec la dose pleine, développement une myélosuppréssion sévère
  • environ 10% des gens sont hétérozygotes et produisent une quantité réduite d’enzyme fonctionne (30% de réduction)
  • ces individus ont un risque plus élevé de souffrir d’effets secondaires, mais dans une moindre mesure que les individus avec deux allèles variants
37
Q

Mécanisme d’action du méthotrexate (MTX)

A
  • antagoniste du folate
  • application thérapeutique étendue
  • associé à la rechute et à la toxicité chez certains individus
38
Q

Inhibition du thymidylate synthase (TS)

A
  • une enzyme nécessaire aux cellules proliférantes
  • catalyse la conversion de dUMP en dTMP
  • une cible importante pour une variété d’agents utilisés en chimiothérapie
  • diminution de dTMP, augmentant de l’Incorporation de l’gracile dans l’ADN, altération chromosomique et la mort cellulaire par apoptose