Interaction entre microbes

Question 1

Essence de la bioloigie

Answer 1

Évolution qui s’applique dans tous les champs de la biologie

Question 2

Élément clé dans la théorie évolution

Answer 2

Charles Darwin ( et les becs d’oiseaux )
Sélection naturelle
L’homme n’est pas au centre

Question 3

Théorie synthétique de l’évolution

Answer 3

1) Mutation —> pour avoir de la diversité
2) Migration —> ce qui permet d’exporter certain génétiques/phénotypes
3) Dérive génétique —> goulot d’étranglement (antibiotique) où un petit nombre d’individu qui passe à la génération suivante par le hasard et les caractéristiques de la population change. Ce qui va décimer la diversité de la population
4) Sélection

Question 4

Diversité alpha

Answer 4

Plus la diversité alpha est élevée dans l’échantillon, plus il y a d’espèces

Question 5

Milieux les plus diversifiés/complexes

Answer 5

Sol, milieu marin et plantes

Question 6

Facteurs abiotiques

Answer 6

Lumière
Courant
Disponibilité en nutriments
pH
O2...

Question 7

Facteurs biotiques

Answer 7

Bactéries

Question 8

Interactions positives

Answer 8

Mutualisme
Coopération
Commensalisme

Question 9

Interactions négatives

Answer 9

Prédation
Compétition
Parasitisme
Amensalisme

Question 10

Catastrophe malthusienne

Answer 10

Où la population va être trop grande pour les ressources
Limitation des ressources —> espèces vont se diversifiées
Darwin s’est inspiré de l’économie

Question 11

Compétition (+/-)

Answer 11

Directe : production d’antimicrobiens

Indirecte : séquestration de ressources limitantes (Phosphore, Fer)

Question 12

Prédation (+/-)

Answer 12

Phage et bactéries

BDELLOVIBRIO : SUPER ANTIBIOTIQUE (Se servir contre des bactéries hyper résistante à plusieurs classes d’antibiotique)

Question 13

Amensalisme (-/0)

Answer 13

Bactéries absorbe composé A pour le transformer en B qui a des bénéfices négatives pour l’autre bactérie

Question 14

Coopération (+/+)

Answer 14

Coopération pour le cycle de carbone (Oxydation anaérobique au niveau du plancher océanique : presque aucune émission dans l’atmosphère)

Question 15

Mutualisme (+/+)

Answer 15

Oxydation anaérobie du méthane couplée à la réduction des sulfates
Les électrons sont échangées à travers des tubes (des transporteurs d’électrons) ainsi que des métabolites

Il y a toujours trois bactéries associés aux cyanobactéries —> coévolution

Question 16

Commensalisme (+/0)

Answer 16

Bactéries absorbe composé A pour le transformer en B qui a des bénéfices positives pour l’autre bactérie

Endosymbiose primaire et secondaire

Question 17

Biofilms

Answer 17

On trouve des biofilms partout

Très résistant à des antibiotiques…

Question 18

Élément transposable

Answer 18

Capacité à se copier et coloniser un autre endroit

Question 19

Niveau de sélection

Answer 19

Interaction à l’intérieur d’une même espèce

Mutation dans les membres de la même espèce

Question 20

Bactéries du genre Wolbachia

Answer 20

Féminisation des males
Induisent la parthénogenèse
Tuent les males
(Être femelle est plus avantageux)

Question 21

Mécanisme d’interaction

Answer 21

Nanotubes

Question 22

Transfert de gènes : conjugaison

Answer 22

Bactéries communiquent entre elles en échangeant de l’ADN volontairement (conjugaison) ou non volontairement

Plasmides sont porteurs de gènes clés pour résister à des facteurs

Très fréquents entre les bactéries d’une même espèce

Question 23

Transduction & Transformation (phages)

Answer 23

Phage trouve son génome modifié quand il utilise le génome bactérien pour se multiplier

Question 24

Quorum sensing

Answer 24

Communication intra et interespèce

Bactérie qui relâche et qui capture des molécules en continue. Si on augmente le nombre de bactéries, le nombre de molécules relâchées et capturées augmentent

Question 25

Phage est autonome?

Answer 25

Non

Question 26

Étape d’infection des phages

Answer 26

1) Absorption
2) Injection
2. 5) Voie lysogénique ou voie lytique
3) Infection (Assemblage des nouveaux bactériophages)
4) Lyse

Question 27

Virus dans l’environnement

Answer 27

Contrôle des populations de bactéries
Disponibilité de la matière organique
Augmentation de la diversité microbienne en favorisant les transfert horizontaux de gènes

Question 28

CRISPR

Answer 28

Mécanisme de lutte contre les phages
Système découvert par la recherche fondamentale
CRISPR = ciseaux moléculaire —> Désactiver un gène

Question 29

CRISPR mécanisme

Answer 29

Fragment d’ADN/plasmide du phage est enregistré dans l’ADN de la bactérie pour fabriquer des ARN
Comme ça, si cet ADN/plasmide revient, on peut le couper (mettre KO un gène)

Question 30

Phages capables de contrer CRISPR

Answer 30

Oui

Phage est capable d’acquérir une résistance contre CRISPR dans certaines conditions

Question 31

Théorie de la reine rouge

Answer 31

Système de compétition : capacité de muter d’une manière rapide

Question 32

Domestiquer un phage

Answer 32

1) Cellules épithéliales sécrètent du mucus
2) Phages s’adhèrent au mucus
3) Phages adhérents forme une couche anti-microbienne
4) Phage et bactéries sont disposés avec le mucus

Question 33

Phage sont évolutifs?

Answer 33

Oui
Phages sont évolutifs pas les antibiotiques —> Thérapie par les phages contre les bactéries multi-résistantes

Phages sont capable de transporter n’importe quoi n’importe où

Question 34

Problème avec les phages

Answer 34

Il est difficile de cultiver toutes les bactéries –> on ne peut pas cultiver tous les phages