Interaction entre microbes Flashcards

1
Q

Essence de la bioloigie

A

Évolution qui s’applique dans tous les champs de la biologie

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Q

Élément clé dans la théorie évolution

A

Charles Darwin ( et les becs d’oiseaux )
Sélection naturelle
L’homme n’est pas au centre

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3
Q

Théorie synthétique de l’évolution

A

1) Mutation —> pour avoir de la diversité
2) Migration —> ce qui permet d’exporter certain génétiques/phénotypes
3) Dérive génétique —> goulot d’étranglement (antibiotique) où un petit nombre d’individu qui passe à la génération suivante par le hasard et les caractéristiques de la population change. Ce qui va décimer la diversité de la population
4) Sélection

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4
Q

Diversité alpha

A

Plus la diversité alpha est élevée dans l’échantillon, plus il y a d’espèces

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5
Q

Milieux les plus diversifiés/complexes

A

Sol, milieu marin et plantes

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6
Q

Facteurs abiotiques

A
Lumière
Courant
Disponibilité en nutriments
pH
O2...
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7
Q

Facteurs biotiques

A

Bactéries

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8
Q

Interactions positives

A

Mutualisme
Coopération
Commensalisme

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9
Q

Interactions négatives

A

Prédation
Compétition
Parasitisme
Amensalisme

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10
Q

Catastrophe malthusienne

A

Où la population va être trop grande pour les ressources
Limitation des ressources —> espèces vont se diversifiées
Darwin s’est inspiré de l’économie

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11
Q

Compétition (+/-)

A

Directe : production d’antimicrobiens

Indirecte : séquestration de ressources limitantes (Phosphore, Fer)

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12
Q

Prédation (+/-)

A

Phage et bactéries

BDELLOVIBRIO : SUPER ANTIBIOTIQUE (Se servir contre des bactéries hyper résistante à plusieurs classes d’antibiotique)

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13
Q

Amensalisme (-/0)

A

Bactéries absorbe composé A pour le transformer en B qui a des bénéfices négatives pour l’autre bactérie

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14
Q

Coopération (+/+)

A

Coopération pour le cycle de carbone (Oxydation anaérobique au niveau du plancher océanique : presque aucune émission dans l’atmosphère)

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15
Q

Mutualisme (+/+)

A

Oxydation anaérobie du méthane couplée à la réduction des sulfates
Les électrons sont échangées à travers des tubes (des transporteurs d’électrons) ainsi que des métabolites

Il y a toujours trois bactéries associés aux cyanobactéries —> coévolution

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16
Q

Commensalisme (+/0)

A

Bactéries absorbe composé A pour le transformer en B qui a des bénéfices positives pour l’autre bactérie

Endosymbiose primaire et secondaire

17
Q

Biofilms

A

On trouve des biofilms partout

Très résistant à des antibiotiques…

18
Q

Élément transposable

A

Capacité à se copier et coloniser un autre endroit

19
Q

Niveau de sélection

A

Interaction à l’intérieur d’une même espèce

Mutation dans les membres de la même espèce

20
Q

Bactéries du genre Wolbachia

A

Féminisation des males
Induisent la parthénogenèse
Tuent les males
(Être femelle est plus avantageux)

21
Q

Mécanisme d’interaction

22
Q

Transfert de gènes : conjugaison

A

Bactéries communiquent entre elles en échangeant de l’ADN volontairement (conjugaison) ou non volontairement

Plasmides sont porteurs de gènes clés pour résister à des facteurs

Très fréquents entre les bactéries d’une même espèce

23
Q

Transduction & Transformation (phages)

A

Phage trouve son génome modifié quand il utilise le génome bactérien pour se multiplier

24
Q

Quorum sensing

A

Communication intra et interespèce

Bactérie qui relâche et qui capture des molécules en continue. Si on augmente le nombre de bactéries, le nombre de molécules relâchées et capturées augmentent

25
Phage est autonome?
Non
26
Étape d'infection des phages
1) Absorption 2) Injection 2. 5) Voie lysogénique ou voie lytique 3) Infection (Assemblage des nouveaux bactériophages) 4) Lyse
27
Virus dans l'environnement
Contrôle des populations de bactéries Disponibilité de la matière organique Augmentation de la diversité microbienne en favorisant les transfert horizontaux de gènes
28
CRISPR
Mécanisme de lutte contre les phages Système découvert par la recherche fondamentale CRISPR = ciseaux moléculaire —> Désactiver un gène
29
CRISPR mécanisme
Fragment d’ADN/plasmide du phage est enregistré dans l’ADN de la bactérie pour fabriquer des ARN Comme ça, si cet ADN/plasmide revient, on peut le couper (mettre KO un gène)
30
Phages capables de contrer CRISPR
Oui | Phage est capable d’acquérir une résistance contre CRISPR dans certaines conditions
31
Théorie de la reine rouge
Système de compétition : capacité de muter d’une manière rapide
32
Domestiquer un phage
1) Cellules épithéliales sécrètent du mucus 2) Phages s'adhèrent au mucus 3) Phages adhérents forme une couche anti-microbienne 4) Phage et bactéries sont disposés avec le mucus
33
Phage sont évolutifs?
Oui Phages sont évolutifs pas les antibiotiques —> Thérapie par les phages contre les bactéries multi-résistantes Phages sont capable de transporter n’importe quoi n’importe où
34
Problème avec les phages
Il est difficile de cultiver toutes les bactéries --> on ne peut pas cultiver tous les phages