Diversité, Écologie et évolution des microorganismes

Question 1

Visualisation des premiers microbes?

Answer 1

Van Leeuwenhoeck en 1670

Question 2

Réfutation du concept de génération spontannée

Answer 2

Lazarro Spalanzanni en 1750

Un contenant fermé (aucun contact avec l’air) n’aura pas de contamination par des bactéries

Question 3

Microbe

Answer 3

Être vivant microscopique

Question 4

3 domaines du vivant

Answer 4

Procaryote : Bactéries (& Archées)
Archées
Eucaryote : Protistes, microalgues, champignons

Question 5

Pourquoi s’interesser aux microbes?

Answer 5

Lutter contre les pathogènes
Meilleur compréhension des cycles biogéochimiques
Biotechnologies
Médecine de demain
Générer de la connaissance sur le vivant

Question 6

Ancêtre commun?

Answer 6

LUCAS : Last Universal Common Ancestor

Question 7

Unicité du vivant

Answer 7

Toutes les formes de vie sur Terre ont une composition chimique très comparable
Source d’É utilisant les gradients de protons
Stockage d’É sous forme d’ATP
Supports communs de l’information génétique

Question 8

Origine de la vie

Answer 8

Abiogenèse -> soupe prébiotique
Panspermie -> météorites

Eau = élément vital pour qu’il y a de la vie

Question 9

Avantages de la paroi

Answer 9

Protection
Régulation de la division
Régulation du transfert de gènes

Question 10

Théorie endosymbiotique

Answer 10

Lyn Margullis propose que les cellules eucaryotes sont le résultat d’une suite d’associations symbiotiques avec différents procaryotes

Question 11

Taille des génomes

Answer 11

Très variables au sein même des différentes espèces

Organismes les plus simples peuvent avoir des génome gigantesques et vice versa

Question 12

Diversité microbienne

Answer 12

1-2% qui sont cultivables

Bactéries sont les organismes les plus abondants sur la planète

Question 13

Algues

Answer 13

Plus aquatiques
Phototrophes
75% de l’oxygène sont fait par les cyanobactéries
Base de la chaîne alimentaire aquatique

Question 14

Mycètes

Answer 14

Plus terrestres

Levures unicellulaire jusqu’aux moisissures et champignon

Question 15

Protozoaires

Answer 15

Eau et sol
Protistes unicellulaires de type animal
Bactérivores et algivores
Certains pathogènes connus ( plasmodium falciparum responsable du paludisme)

Question 16

Importance des microbes et l’écosystème

Answer 16

Source de toutes formes de vie
Diversité génétique et biochimique
Représentent 50% de la biomasse des océans
Contrôlent le cycle de tous les éléments qui déterminent l’habitabilité de la Terre
Cyanobactéries ont un rôle clé dans la production d’O2
Rhizobium et cyanobactéries fixent l’azote sur les plantes
Décontamine les sols (Pseudomonas)
Production d’antibiotiques (Streptomyces)
Implication sur la santé de l’hôte (microbiome)

Question 17

Amplification ciblée des gènes

Answer 17

Amplifier des zones avec des caractères variables pour avoir une plus grande diversité

Question 18

Intérêt de la métagénomique

Answer 18

Pas besoin de passer par la méthode de cultivation ce qui permet de représenter 100% de la population

Dans la métagénomique, on a tout, mais il faut tout reconstruire les gènes après ce qui est difficile

Question 19

Comment étudier les microbes

Answer 19

16S amplicon sequecing nous dis quelle espèce de bactérie c’est.
Mais ce n’est qu’un seul gène et dans E. coli, les gènes sont extrêmement variables

Question 20

Rôle du microbiome intestinal

Answer 20

Digestion des fibres complexes
Développement du système immunitaire
Lutte contre les pathogènes
Synthèse des molécules essentielles

Question 21

Dysbiose

Answer 21

Déséquilibre du microbiote intestinal

Peut causer des maladies (obésité)

Question 22

Importance des fibres dans alimentation

Answer 22

Microbiote intestinal et hôte coexistent et il existe une couche de mucus pour protéger l’intestin, mais dans une alimentation faible en fibre, les bactéries attaquent le mucus -> maladies

Question 23

Médecine et microbiome

Answer 23

On peut utiliser le microbiome d’une personne pour le “transférer” à quelqu’un qui en a pas ou peu (capsule avec du caca)