Immunologie Flashcards
Les fonctions du systeme immunitaire
- reconnaissance et elimination de :
- pathogenes (virus, bact, champignons, parasite) -> variete sans fin
- toxines
- prevention de reinfection = memoire
- surveillance contre les tumeurs
- inflammation
Le combat contre les pathogenes est diff
- enomre diversite moleculaire
- diversite en taille
- vers 1-1000 mm
- bact 0.1 < 10µm
- virus 0.1 < 1µm
- diversite du site d entree et de la propagation
- presence extracell (bact et vers) ou intracellulaire (virus et bact) n importe ou dans le corps
- strategies de survie et d evasion : haute frq de mutation (pendant l infection) suppresssion de l immunite
- transmissible (maladies infectieuses)
reponse immunitaire contre le cancer
- le systeme immunitaire tolere le soi et attq le non soi
- le cancer vient de l une de nos cellules donc notre coprs le tolere -> plus diff de combattre un cancer qu un virus
danger du systm immunitaire
- Huperreactivite/Reactivite contre des agents inoffensifs
- allergie
- asthme
- choc septique/anaphylactq (allergie)
- inflammation chronq (inclus : destruction de tissus (immun pathologie))
- Reactivite contre le soi :
- auto immunite (inclu : destruction de tissus (immun pathologie)) Le corps interprete mal les signaux de notre corps et detruit une partie de nos cellulaires
- Reactivite contre le non soi
- rejet de transplants
- Immunodeficiences :
- raison : mutation genetq ou infection (VIH/sida)
La fonction du systeme immunitaire
- protection de l organisme (mais pas a tous prix) :
- eliminer rapidement les dangers
- eviter la reaction contre :
- le soi
- les agents/microbes inoffensif
- Distinguer le soi du non soi
- Distinguer entre dangereux et inoffensifs
La reponse immunitaire (1er apercu)
- 1% des cellules du corps sont dediees a la defense :
- le corps est pret a se defendre contre 1 500 pathogenes et cellules cancereuses
- 10**12 leucocytes mobiles nous defendent
- 10**9 recepteurs d antigenes diff -> enorme diversite de recpt fait par le systm immunitaire pour diff le soi du non soi
- des centraines d organe (ganglion, ratte…)
- plus de 500 ganglions sont la pour nous defendre
- les ganglions sont positionnes de facon strategique
- Defense immunitaire :
- immunite innee est bcp plus rapide que l immunite acquise
- les GB (leucocytes)
- immunite innee :
- monocytes- macrophages
- cell natural killet (NK)
- granulocytes :
- eosinophiles
- basophiles
- neutrophiles
- mastocytes
- immunite acquise :
- LB
- LT
- immunite innee :
- Etapes d une rep immunitaire :
- detection de l infection :
- site
- type de pathogene
- Inflammation et limitation de l infection (reponse programmee et rapide, innee)
- determination et dvlpmt de la meilleure reponse (reponse variable et lente, acquise)
- elimination du pathogene/danger
- prevention contre une infection dans le futur (memoire)
- detection de l infection :
- Reponse immunitaire acquise contre un virus :
- les LT sont induits apres qq jours
- on a une reponse immunitaire apres les L cytotoxiques au bout de 6/7 jours
- le systeme inne n est pas suffisant, on a besoin du systeme acquis
- Vaccins contre les maladies infectieuses : un succes
- l incidence de maladies infectieuses a bcp diminuee grace aux prog de vaccinations (surtout generation d anticorps)
- la rougeole nous fait perdre la moitie de nos cellules memoires

Les barrieres physiques
- Avant la reponse immunitaire ;
- les barrieres physiques diminuent efficacement l entreee des pathogenes
- une ou plusieurs couches de cellules epitheliales : peau, intestin (une seule couche), poumon (une seule couche)
- cependant il y des couches muqueuses secreteees par l epitheme pour nous protegere encore mieux
- des signaux antimicrobiens sont tjrs secretes
- intestin = 300 m**2 de surface de cellules a proteger.
- poumon = 70-80 m**2
- Barrieres physique, chimiques
- peau, pH
- muqueuses
- salive, lysozymes
- mucus, pH, proteases
- poils
- cils
- larmes, urines
- eternuer, tousser
- temperature
- secretions vaginales
- secretions de substances antimicrobiennes : defensines, IgA
- flore nat
- Detecteurs d infections proches des surfaces et a l interieur
- 400m**2 de surface a detendre et 10**14 cellules a l interieur a surveiller
- 10**12 cellules immunes et mobiles a disposition (et a reguler)
- le systeme immunitaire est unique : les cellules sont mobiles et ne sont pas limitees a un tissus, elles peuvent aller partout dans le corps

La reponse innee et acquise
- trois niveaux de defense :
- les 3 systm de defense interagissent et communiquent
- les cellules du systm innee alertent le systeme acquis (l immunite acquise est induite par l immunite innee)
- Immunite innee :
- detection
- inflammation
- reponse programmee et rapide (seondes. min. H)
- Immmunite acquise :
- devlpm de la meilleure reponse (variable, adapte)
- reponse lente (4-12 j)
- memoire
- L immunite innee et acquise sont complementaires en fonction et dans le temps
- Systeme innee : reponse homogene
- chq type cellulaire du systeme inne :
- porte le meme set de recpteurs contre les pathogenes
- repond de la meme facon
- existe en grd nombre avant que le pathogene arrv = reponse rapide (min/heures) et homogene
- chq type cellulaire du systeme inne :
- Systeme acquis : reponse heterogene
- chq LT ou LB :
- porte un recepteur unique contre les pathogenes, reponse heterogene (99.99% de L ne reagissent pas)
- la cellule specfq est rare et doit etre amplifiee = reponse lente (jour)
- chq LT ou LB :
- Differences entre les rep innee et acquise :
- Innee :
- evolution : toute organisme multicell
- temps de reaction : immediate
- memoire : non
- tolerance du soi : oui
- reco d antigene : peu de recepteurs (100) reco toutes les pathog (TLR, RLR, NLR, FcR, lectines, CR)
- ligands : motifs moleculaires des pahtog, danger
- Acquise :
- evolution : vertebres
- temps de reaction : tardives (la 1er fois, vite la 2emem fois)
- memoire : oui
- tolerance du soi : doit l apprendre
- reco d antigene : grande variete de recpeteurs spe et clonales (>10**9) (TCR, BCR/immunoglobine)
- ligands : antigenes
- Innee :
- Definitions :
- antigene : toute struct reco par le systeme immunitaire acquis (recepteurs T ou B, antibody generator) chimiquement tres divers (peptides, sucres, lipides…)
- exemples :
- microbes/tumeurs => elimination
- pollen => allergies
- auto antigenes => maladies auto immunitaires
- allon antigene (antigene du non soi) => rejet de greffes d organes
- exemples :
- immunogene : antigene qui elicite une reponse immunitaire acquise
- haptene : groupement chimique qui est un antigene mais n agit pas comme immunogene (sauf si lie a une prot immunogene)
- epitope :partie de l antigene reconnu par un recepteur
- antigene : toute struct reco par le systeme immunitaire acquis (recepteurs T ou B, antibody generator) chimiquement tres divers (peptides, sucres, lipides…)
- Orchestration des systemes immunitaires :
- le systemme acquis a besoin des ganglions pour generer cette reponse, a l inverse du systeme inne

Les cellules du syteme immunitaire
- frq de cell dans le sang
- orgn cell sys immun
- tissus lymph
- fonction cell sys immunitaire
- nomenclature CD
- def rep acquise

- cellules du systeme immunitaires :
- on trouve presq tous les types cellulaires dans le sang (circulent)
- lentree dans les tisssus lymphoides et non lymphoides est restreinte. Il faut avoir signaux specifiques pour attirer les cellules
- on trouve presq tous les types cellulaires dans le sang (circulent)
- frq de cellules dans le sang :
- dans le sang, il n y a presq que des erythrocytes et seulement qq leucocytes
- les plqtt sont aussi assez frq dans le sang.
- cf image
- orignie des cell du systeme immunitaire ;
- tous les types cellulaires du sys immun viennent de cellules souches et de precurseurs qui se trouvent dans la moelle ossuese
- differenciation vers un type cellulaire spe regulee par des recepteurs et cytokines
- trois lignees de precurseurs :
- lymphoides
- myeloide
- erythroide
- globules blancs : cellules lymphoides et myeloides
- tous les types cellulaires du sys immun viennent de cellules souches et de precurseurs qui se trouvent dans la moelle ossuese
- les tissus lymphatiques :
- site de devlp de toutes les cellules du sysym inne et acquis
- site dactivation du systeme acquis (LT et B mature)
- fonction des cellules du systeme immunitaire :
- macrophage : phagocytose
- cell dendritique immature : devient mature et migre dans le ganglion, se lie a la lymphe -> declenche l immunite acquise
- les granulocytes :
- granulocytes = leucocytes polynucleaires (forme irreg du noyau)
- 3 types morpho diff (coloration de leurs granules)
- neutrophiles = font la phagocytose, sont tres presents, migrent aux sites d inflammation
- eosinophiles = secretent granules toxique s
- basophiles
- les mastocytes :
- redisent dans la peau (participent dasn les reaction sallergiques)
- macrophafes et cellules dendritiques :
- macrophaages : phagocytose, peut absorber bcp d antigene, mais est moins fort pour presenter l antigene a sa surface
- cellules dendritiques : ont une forme qui leur premet de capter facilement les antigenes
- cellules du systeme immunitaire inne : myeloides
- macrophages, cellules dendritiques : resident dans les tissus en cas de danger secretent des moleucles pro inflammatoires pour attirer les granulocytes qui amplifient cette inflammation
- macrophage, cellules dendritiques et neutrophiles : phagocytes qui reconnaissent, ingerent et degradent des pathogenes
- cellules dendritiques : migrent aux tissus lymphatiques secondaires, presentent des fragments de pathogenes, declenchent l immunite acquise
- les cellules dendritiques :
- sont des cellules presentatrices d antigenes qui activent le systm acquis
- la molecule CMH presente un frgmt du pathogene au LT -> se passe dans le ganglion
- a la fin de la reponse T : mort des cellules dendritiques
- Cellules de l immunite acquise
- Lymphocytes B :
- reconnaissent une grande diversite d antigenes natifs = antigenes entier, non digeres
- recepteur : recepteur B (BCR) = anticorps de surface (Ig)
- apres activation : produisent des recpet secretes (anticorps protecteurs)
- Lymphocytes T :
- reco une grd diversite d antgene frgmentes (seulement de ptypes prot : peptides)
- recpt : recepteur T (TCR)
- aident les LB (cellule TH = helper, CD4+)
- tuent des cellules infectees ou cancereuses (Tc = killer, CD8+)
- 2 systm assez diff de protection pour avoir une protection globale
- Lymphocytes B :
- La nomenclature CD
- CD = cluster of diff
- nomenclature pour les molecules de surface des leucocytes
- reco par un groupe d anticorps monoclonaux
- a present : CD1- CD350
- utls pour indiq la lignee et l etape de maturation ou activation d une cellule (marqueur de surface)
- ex :
- CD4+ : L’T aide
- CD4+ CD62L : L’T aide naif
- CD4+ CD62L : L’T aide active ou memoire
- Definitions poru la reponse acquise
- le recepteur typiquement garde la meme specificite
- Les cellules NK (natural killers)
- grand L avec granules cytotoxiques
- fonction cytotoxique similaire aux cellules T CD8+
- n expriment pas de BCR ni de TCR, mais des recpt du type NK en cours de caracterisation
- important dans le controle de certaines infection (virales, bact ou parasitaires) et de cancers
- premiere ligne de defense innee pour l elimination de cellules infectees ou tumorales

Les cytokines (permier apercu)
- cytokines ? (nomenclature, effets, prop)
- inflammation
- recepteurs
- chimiokines
- cytokines :
- les messagers entre cellules
- communications des cellules immunes avec leur environnement
- role pour leur dvlp ou comportement
- C est quoi des cytokines :
- pett prot secretees -> communication entre cellules (certains sont/peuvent etre membranaire)
- agissent surtout localement (rarement a distance0 (diff des hormones)
- production souvent strictement regulees (diff des fact de croissance qui sont constamment produit)
- reconnues par des recpt specifiques avec haute affinite (Kd = 10^-6 - 10^-12)
- La nomenclature des cytokines :
- interleukines (IL-1 a Il-38)
- interferons (å, ß, gamma, IL-28, Il-29) ex : IFN gamma
- famille tumor necrosis factor (TNF) : TNFå, BAFF…
- chimiokines (CCL1 a CCL28, CXCL1 a CXCL17,)
- dautres facteurs de croissance (ex : GM-CSF, EGF)
- Les effets des cytokines
- activation, division cellulaire (ex : IL-2)
- differenciation cellulaire (ex : IL-4)
- survie, mort cellulaire (ex : TNFa)
- attraction/migration (ex : chimiokines : peuvent attirer seulement certaines cellules)
- inflammation (ex : IL-1)
- la reponse ou non reponse envers des cellules ou des autres cytokines
- induisent ou inhibent la production d autres cytokines (Cascade)
- Proprietes des cytokines
- Pleiotropisme :
- une cytokine peut avoir des effets multiples sur des cellules diff
- Redondance :
- plusieurs cytokines peuvent avoir des actions similaires et redondantes
- ex : knockout d un gene codant pour une cytokine sans effet
- Cascades et autres :
- synergie :
- deux ou plusieurs cytokines ont un effet qui est plus grd que la somme de leurs actions
- antagonisme :
- une ou plusieurs cytokines peuvent inhiber l effet d une autre cytokines
- cascades :
- une cytokine ppeut induire l expresssion d une autre ou d un recepteur
- synergie :
- action locale :
- la plupart des cytokines agissent a l endroit ou sont elles sont produites
- action autocrine : effet sur la cellule productrice (ex : IL-2 et cellules T CD4+)
- action paracrine : effet sur les cellules en proximite, la majorite des cytokines
- action endocrine : nv bas dans la circulation (<10 pg/ml, ex : IL-1, IL-6)
- Pleiotropisme :
- Inflammation : cytokines pro inflammatoires
- l immunite inee : production en grande quntt, detectable dans le serumm -> effet local et systemq
- les macrophages secretent les mediateurs dans les minutes/heures qui suivent
- mediateurs augmentent le volume du capillaire pour permettre d avoir plus de mediateurs qui arrivent
- Recepteurs pour cytokines :
- diff familles : plus que 50 recepteurs et diff signalisation intracellulaire
- recepteurs pour cytokines IL-2, 3,4,6,12 et autres
- recepteurs a 2-3 chaines
- dimer ou trimer necssr
- Kinases JAK (phosphorylation)
- facteurs de transcription : STAT s associent au complexe suelment qd le complexe est phospho des deux cotes des JAK (Act par JAK)
- une fois phospho les STAT vont dans le noyau et commencent un signal cle
- CHimiokines :
- 45 membres prot basq d environ 10kD, 100 aa
- facteurs chimiotactq
- les helices transmbm sont typiq de ces recpteurs
- chimiokines inflammatoires : recrutement des cellules dans les sites inflammatoires (ex : CXCR2/ CXCL8, CCR2/ MCP1)
- chimiokines homeostatiques : expresssion constitutive pour permettre la recirculation des L ( CCR7, CCL21)
- Les chimiokines sont essentielles pour guide la migration
- 10**12 cellules immunes : la plupart sont mobiles, il faut pouvoir les localiser ou il y a unpb
- Migration guidee par :
- chimiokines
- integrines
- selectines
- autre
- Necessaire pour :
- surveiller le corps en sante (homeostasie0
- guider les cellules vers leur cible pendant une rep immunitaire

les 7 points a savoir sur la reponse innee acquise, migration cell :
- le syst immun surveille continuellement toutes les parties du coprs en recirculant (orga, tissus, sang)
- le sys immun est divise dans la rep innee et acquise et les deux reponses collaborent continuellement
- Les cellules du systm inne reco toutes les microbes avec peu de recepteurs partages tandis que le systm acquis porte un recepteur specifique et unique (clonal) par cellule
- Le sys acquis mais pas le systeme inne garde en memoire les pathogenes deka rencontres en produisant les cellules memoires
- le sytsm inne est tolerant aux molecules du soi et le non soi
- l inflammation et la reco des pathgn par la reponse innee sont importantes pour la decision si une reponse adapttv est initiee
- la reponse innee est initiee au site d entree du pathogene tandis que la reponse acquise est initiee dans des organes lymphoides secondaires
Inflammation :
- Les signes cliniques :
- rongeur
- douleur
- chaleur, fievre
- enflure
- perte de fonction (si grande inflammation)
- mediateurs :
- TNFå, IL-6, chimiokines (IL-8, CXCL8), leucotrienes, prostaglandines, neuropeptides, initialement par les cellules locales (immunes et non immunes)
- plus tard amplifie par les cellules immunes attirees
- il y a dabord une invasion de pathogenes qui entraine le relachement de bcp de mediateurs
- d abord les cellules locales relachent ces facteurs c est comme ca que les signaux arrv jusq endothele
- puis les chimiokines les attirent au site prob
- il y a une difference de cinetq de nombre et de vitesse entre monocytes et neutrophiles
- conseq de l inflammation :
- augmentation de la permablt vasculaire et de signaux pour l attraction de cellules
- immigration de leucocytes : neutrophiles (minutes) apres les monocytes (heures) et finalement les lymphocytes (jours)
- fievre, migration augmentee, liberation de cellules de la moelle osseuse
- immigration de cellules dendritiq, actv de la reponse acquise (dependante de l inflammation)
- elimination du danger, regulation de l inflammation
- si l inflammation devient chrmq : cercle vicieux
- ex de maladies chrnq : arthrite rhumatoide
- il existe pleins de medicaments contre les cytokines pro inflammatoires

phagocytose
- la phagocytose fait partie de la reponse innee
- les neutrophiles et les macrophages
- phagocytose, kyse et secretion
- phagocytose typiquement grace a des recepteurs
- macropinocytose : n a pas besoin de recepteurs pour phagocyter
- les neutrophiles et les macrophages
- les cellules dendritq :
- phagocytose, lyse et presentation d antigene aux LT

la compartimentation
- compartimentation
- les L naifs
- 2 grd circulations
- organes initiant l immunite acquise
- le desordre diminue l efficacite et la possibilite de regulation
- Compartimentation :
- organes lymphoides primaires (jaunes) : pour la diff des leucocytes
- organes lymphoides secondaires (bleus) : pour l initiation des repondes immunitaires acquises
- organes lymphoides tertiaures : organes lymphoides primitives formes lors d une inflammation chrnq : role dans l amplification de la reponse
- Les L naifs circulent constamment :
- une fois ne dans le thymus les L rejoignent la circulation sanguine puis passent par la rate
- ils y passent 5h puis retournent dans la circulation
- les L passent la maj de leur tmeps dans la rate (5h) ou les ganglions (12h)
- pour sortir des ganglioins ils sortent par la lymphe efferente :
- surveillance des organes lymphoides secondaires (LT et B naifs)
- melange constt des spe de recepteurs : aug de la proba de reactvit (LT et B)
- surveillance des tissus non lymphoides (cellules dendritiq, macrophage)
- Les deux grandes circulations :
- circulation sanguine :
- transport d oxygene, de nutriments, hormones
- recirculation de cellules
- passe regulierement par la rte et le foi (= filtre)
- circulation lymphatiq :
- ramene les liqd tissulaires et les cellules dans la circulation sanguine
- transpo des lipides et dechets
- passe par des ganglions (=filtres)
- circulation sanguine :
- Raison d etre des organes lymphoides secondaires :
- organs qui :
- fitrent les fluides (souvent locaux) : filtres pour antigenes et cellules dnedritiques qui vont specifiquement dans les ganglions (pathogenes passent obligatoirement)
- sont les sites de recirculation continuelle des LT et B naifs (via le sang et la lymphe)
- organs qui :
- Site de rencontre de l antigene avec les rares L spe (naifs ou memoires) : activation proliferation, differenciation en cellules effectrices
- Organes pour initier l immunite acquise
- 2 ccompartiments :
- une pour LT (zone T) et cellules dendritq
- une pour LB (zone B, follicule)
- rate et ganglion un peu moins actv que plq de peyer
- 2 ccompartiments :
- Compartiments separer pour T et B :
- la rate :
- pulpe rouge (toutes les cellules peuvent y aller : il y a bcp de BR d ou son nom)
- pulpe blanche : bcp de GB d ou son nom
- zone B (pour LB : vers l extremite) et T ( pour LT : vers l interieur)
- fibroblastes de la zone B et T comme source constt de chimiokines : comparitements
- les fibroblastes forment des filets de chimiokines diff
- la rate :

La migration cellulaire

- des chiffres :
- 5 * 10**11 leucocytes migrent entre les tissus par jour
- seulement 2-3% sont dans le sang a chq moment
- les lymphocytes restent 30 min dans le sang suivi de 5-12 heures dans les orga lymphoides secondaires (c est la ou ils cherchent l antigene)
- MAIS
- les granulocytes (neutrophiles) circulent dans le sang jusq ce quils meurent ou soient attires dans des foyers inflammatoires (efflux massif)
- migration homeostatique des LT et B naifs :
- recirculation continuelle (sans inflammation)
- les veines postcapillaires :
- les leucocytes quittent les vaisseaux dans les veinules postcapillaires par transmigration a travers l endotheliym (sil est actv)
- le flux ralenti dans ces capillaires veineux permet l adhesion aux parois suivi de la sortie par extravasation
- entree des L naifs au ganglion comme paradigme
- acces au ganglion : seulement pour L naifs et cellules dendritiques
- granulocytes/monocytes : restent dans le sang (sauf si inflammation)
- ce sont des signaux tres spe qui permettent de sortir
- (3) sortie des L naifs ou actf (vert)
- (2) migration continuele (cherchent l antigene) (noir)
- (1) entree des L naifs via les veinules postcapillaires specialisees (sont activees en permanence : HEV) (rouge)
- veinules a endothelium epais
- veinules postcapillaires : HEV (high endothelial venule)
- presence : consttv dans les ganglions et plaq de Peyer
- transmigration : consttv (L)
- presence : tous les autres tissus
- transmigration : tres peu (bcp augmentee apres inflammation)
- mecanismes : moecules exprimees a la surface des cellules endotheliales qui permettent l adhesion (une colle)
- veinules postcapillaires : HEV (high endothelial venule)
- les 4 etapes de l extravation (ganglion)
- plusieurs familles de molecules implq sequentiellement
-
roulement realise par molecules appartenant a famille des selectines : liaison sucre avec endothele via L-selectine
- etape qui ralentit de 100 fois la vitesse initiale
- ralentissement, adhesion faible/transitoire, grace aux selectines qui lient des sucres
- activation due aux chimiokines immobilisees sur paroi endotheliale
- les chimiokines activent le systeme d adhesion
- finalement la cellule s aplatie ete cherche un endroit ou aller : diapedese
- les selectines ont une cinetq rapide de liaison :
- K(on) e K(off) rapide permet le roulement (adhesion rapide et transitoire)
- le leucocyte freine peut maintenant reconnaitre les chimiokines
- ligands glycolyses et avec souffre : Glycam-1, CD34, ensemble PNAd ou addressines
- la chaine laterale correp a des polyssaccharides
- deux fonctions disctintes pour les chimiokines :
- chimiotaxie/ haptotaxie (etape 4)
- chimiotaxie : gradient soluble
- haptotaxie : gradient insoluble (lie a la matrice ou aux GAG)
- activation d integrine (etape 2)
- recpet pour chimiokine : couple aux prot G -> signal intracellulaire
- chimiotaxie/ haptotaxie (etape 4)
- Les integrines : les couteuax suisses de l adhesion
- heterodimeres (chaines å et ß) : 2 diff paires (18å et 8ß)
- prot de surfaces
- fonction pour adhesion et/ou migration
- actv par chimiokines, TCR, BCR,… (inside-out)
- chanement de conformation (en ms) : basse affinite –> haute affinite
- Signaux bidirectionnels :
- le recpet aux chimiokines reconnait la prot G, et seulement a ce moment il y a une liaison tres forte avec le ligant
- Signalisation intracellulaire :
- apres liaison auligant : outside-in signal = signalisation intracellulaire (inclus la liaison au cytosq/actine via talin) :
- regulation de la transcription
- survie de la cellule
- proliferation cellulaire
- changement de frome de la cellule, migration
- reorganisation du cytosq
- apres liaison auligant : outside-in signal = signalisation intracellulaire (inclus la liaison au cytosq/actine via talin) :
- diapedese/migration transendotheliale :
- passe entre ou a travesr les cellules endotheliales
- role pour JAM-1-3, CD31, CD99; integrine, chimiokine (mieux caract pour monocytes que L)
- la pression du flux sanguin aide a la diapedese. Presq pas de fuite de sang (sorte d eclair)
- apres la diapedese les cellules doivent migrer dans les tissus (reco pour chimiokines, metalloproteases)
- Code d entre au ganglion (via HEV)
- etapes sequentielles, toutes les 4 etapes sont ncssr
- combinaison des 3-4 signaux decide sur l entree : haute selectv : seulement les L naifs peuvent entrer les ganglions via les HEV
- Autre ex de migration : les neutrophiles (cf image)
- migration des cellules innees au site d inflammation:
- leur extravasation est fortement aug apres inflamation locale (neutrophiles, monocytes)
- elles entrent via les veinules post capillaires
- les neutrophiles ont des recepteurs pour capter ces signaux
- les chimiokines sont exprimes grace a l inflammation

Resume sur la reponse innee-acquise et migration cellulaire
- La migration des LT et B
- La recirculation via les organes lymphoïdes secondaires est constitutive (homéostatique)
- L’entrée dans els ganglions et plaques de Peyer : un mécanisme actif de transmigration à travers des veinules postcapillaires, processus sélectif pour lymphocytes naïfs (peu de cellules innées pendant une inflammation)
- L’entrée dans la rate ; passive (pas de transmigration)
- L’émigration suit des mécanismes différents de l’immigration (est activement régulée dans les ganglions, plaques de Peyer et rate). Rôle des sphingosine-phosphates (lipides)
- Migration des cellules innées au site d’inflammation
- Leur extravasation est fortement augmentée après inflammation locale (ex : neutrophiles, monocytes)
- Elles entrent via les veinules postcapillaires
- Grandes variations de signaux de migration
- Probablement aussi 4 étapes pour la transmigration : roulement, activation par chimiokine, adhésion via l’intégrine, diapédèse
- Elles n’entrent pas souvent dans les ganglions lymphatiques par ces mécanismes. Plutôt via les tissus et les vaisseaux lymphatiques afférentes.
- Transmigration à travers l’endothèle
- Migration homéostatique et inflammatoire. Les LB et T migrent continuellement entre les organes lymphoïdes secondaires, la lymphe et le sang. Les cellules inflammatoires et les T et B mémoire/effectrices migrent dans les foyers inflammatoires
- Les cellules sont freinées par le roulement : interaction entre les lectines nommés sélectines et les molécules portant des sucres complexes, les adressines (ralentissement de 100x)
- Reconnaissance de chimiokines, activation des intégrines par protéine G, arrêt des cellules par adhésion
- Diapédèse
- Lectines : migration homéostatique pour les cellules T et B : L-selectine se lie aux sucres complexes sur les adressines
- Intégrines : migration homéostatique pour les cellules T et B : LFA-1 = αLβ2. Se lie aux ICAM
- Chimiokines : migration homéostatique pour les cellules T : CCL19 et CCI21 se lie à CCR7. Pour les LB : CXCL13 se lie à CXCR5
- Sortie des vaisseaux par les veinules postcapillaires et rentrée dans la circulation sanguine par la lymphe. Rôle des sphingosine-phosphates (lipides) pour la sortie.

Les strategies de reco des pathogenes par le systeme inne et acquis :
- Localisation des recepteurs
- Pq mettre des recpt dans la memb, cyto ou soluble ?
- 2 stratg
- soluble (secretes dans l espace cellulaire exterieur) : neutralisation, destruction, opsonisation des pathogenes
- antiB, lectines, complement…
- Opsonisation : marquage d un pathogene avec des antiB, du complement ou d autres prot pour pouvoir le phagocyter plus efficacement avec des recepteurs spe
- memb :
- a la surface des cellules ou dans les endosomes
- reco des pathogenes extracellulaire
- signalisation intracell, internalisation (lie a l opsonisation)
- antiB, recpt T, Toll like receptors (TLR), lectines…
- Intracellulaire, cytoplasmique :
- detectent des pathognes intracellulaires
- dectent du stress cellulaire
- NOD-like recept (NLR), RIG-I-like recpt (RLR)
- Pq mettre des recepteurs dans la membrane, le cyto ou sou sforme soluble (serique)?
- les formes soubles permettent de neutraliser des pathog et toxines et les complexes peuvent etre internalisees apres reco par les recepteurs Fc, les lectines et les recepteurs au complement
- les formes membranaires permettent d internaliser (et detruire) les antg (voir opsonisation)
- les formes membranaires et cyto permettent de signaler a l intereiur de la cellule > induire une rep : secretion, differenciation, lyse, activation, expresssion genq
- les formes cyto : detection de stress cellulaire (danger) et de pathogenes intracellulaires
- Deux stratg extremes :
- il y a qq recepteurs (<100) et chq reco bcp de pathg. Ils sont exprimes sur bcp de cellules
- stratg innee
- un microbe commensal est a l ext des epitheliaux ≠ un pathogene qui penetre dans nos tissus et produisent un site de replication
- il y a 1500 diff eseces de pathg. Ces organismes sont consideres comme des pathog chez un indv sain
- immunosupprimes : ex :
- VIH, leucemies, gens qui ont recus une greffe …
- il y a un type de recp par cellule, des millions de recepteurs diff, des millions de cell diff. Un recept pour chq antiG
- stratg acquise
- il y a qq recepteurs (<100) et chq reco bcp de pathg. Ils sont exprimes sur bcp de cellules
- Avantages d avoir peu de recept :
- chq recpt reco bcp de pathog. Une cellule peut reco tous les pathg
- Desavantages d avoir peu de recept :
- un pathogene qui echappe a la reco ne peut plus etre reco. Le syst, ne peut pas s ameliorer pendant une reponse. Souvent affinite assez basse cad que les recept ne sont pas tres specifiques
Les strategies de reco des pathogenes par le systeme inne et acquis :
- Les structures reco par le systm inne :
- le syst inne reco des motf
- PAMP : pathogn associated molecular pattern sont des struct conserv, reptt et essentielles exp par des microbes
- Les avantages de reco des motifs :
- le systm immunitaire reco des structures qui ne peuvent que diff etre changees par les microbes (paroi cell, ADN)
- un recpt peut reco bcp de pathg de diff familles
- peu de recpt peremettent la reco de presq tous les pathg
- Le syst inne reco le dang ou les degats :
- DAMPP : danger/ damage associated molecular parttern sont des struct du soi induisant une rep innee. C est une mesure indirecte d une infection (mort cellulaire). Les DAMP peuvent declencher une reponse dans l abs d une infection (il y a qq chose d etranger mais pas d infectieux : ex : maladie auto immunes, rhumatisme…)
- sturctu nromales des cellules
- present au mv endroit (ex : ATP devients un DAMP sil se trouve dans l espace extracellulaire)
- relache des cellules necrotiq (type particulier de mort cellulaire) ou exprime par les cellules stressees
Les strategies de reco des pathogenes par le systeme inne et acquis :
- Les recepteurs du systeme inne
*TLR
- PAMP et DAMP sont reco par des PRR (pattern recognt recept)
- Recepturs Toll like (TLR) :
- les recpt ont ete decouvert chez les droso
- notre systm de reco est ressemblant a celui de la droso
- chez nous : TLR ≠ chez drolo : toll
- Le flagelle bact est essentiel pour la mobilite de certaines cellules bact
- notre ADN est methyle. L ADN bact/ viral ne lest pas donc une reco +/- spe de l ADN methyle est possible par les TLR
- l ARN est normalement simple brin. Certains ARN viraux ont des doubles brins. Ceux avec un simple brin ont generalement plus de GU que notre ARN simple brin c est comme ca qu on pourra les reco
- TLR : struc et fonction
- dans TLR : repetiontion 19-25 fois de leucine rich repeat et il y a 24 aa dans une leucine riche
- TIR : Toll/ Interleukin receptor
- TLRs et leurs ligands
- TLR homodimeres
- TLR heterodimeres (ex : TLR2 et TLR1 ou TLR6 avec une spe de ligant diff
- une partie des recpt sont spe a la reco des aa et sont present dans l endosome
- les TLRs peuvent reco plusq ligands diff (TLR2)
- TLR : dimerisation et signalisation
- besoin d une struct repetitv pour former des dimeres
- Signalisation TLR :
- pro inflammatoire : peut induire une reaction inflammatoire
- les chimiokines sont utls pour recruter des cellules additionneles au site infecte
- IRF peut induire des genes utiles a la rep induite
- Les consq de l actv TLR
- cytokines inflammatoires (pro IL 1ß, TNFå)
- chimiokines (CXCL8)
- interferons et autres cytokines
- produits antimicrobiens
- phagocytose
- activation
- Expression des TLR :
- cellules du syst inne
- granulocytes
- monocytes / macrophages
- cellules dendritq
- autres :
- cellules epitheliales (intestinales)
- cellules B
- cellules du syst inne
- Conseq de l actv TLR
- detectent la presence des PAMPs extracellulaires
- ne discriminant pas :
- entre microbe vivant ou mort
- entre microbe commensales (non dangereux, utls pour la production de metabo et pathg (produisant des degats tissulaires direct ou indirect)
- ne detectent pas des pathogenes caches (cellules infectees)

Les strategies de reco des pathogenes par le systeme inne et acquis :
- Les recepteurs du systeme inne
*RLR
- Les recepteurs RIG-1-like (RLR)
- prot cyto :
- detecteurs intracellualires de virus (PAMP) : detectent si les celllules sont infectees ou non
- prot multi domaines :
- domaine : unite structurales d une prot. Se plie independamment des autres domaines de la molecule
- helicase : reco des acides nucleiques
- CARD : caspace recruitment domaine (interaction CARD-CARD)
- autres :
- DAI (DNA dependant actvi of interferon regulatory factors)
- stings/ cGAS
- prot cyto :
- Specificite des RLR
- reco d ARN et ADN cyto
- reco d ADN triphosphate avec phosphate a leur extrimite
- reco d ARN/ ADN
- extracellualire :
- TLR3, 7, 9 : endosome
- interferon de type 1, inflammation
- intracellulaire
- RIGI, MDAS, DAI
- sting : cGAS reco l ADN, le produit cycliq AMP et GMP
- interferons de type 1
- AIM
- interferon de type 1, inflammation
- extracellualire :

Les strategies de reco des pathogenes par le systeme inne et acquis :
- Les recepteurs du systeme inne
*NLR
- les recpt NOD like (NLR)
- prot NOD (nucelotide binding oligomerization) (NOD1 et NOD2)
- prot cytoplasmq : detecteurs intracellulaires de bact (PAMP)
- les prot sont reco une fois quelles sont a linterieur
- prot cyto multi domaines :
- LPR : leucin rich repeat
- CARD : caspase recruitment domain (interaction CARD-CARD) : utile au recrutiement des adapteurs
- NACHT : NTPases domaine
- NAD : nocotimamide adenin dinucleotide
- prot NLRP (ou NALP) : reco les degats cellulaires, reco les PA<
- NLRP (nucleotide binding oligomerization domain, leucine riche repeat and pyrin domaine containing)
- NLRP1-14
- prot cyto : detecteur du stress/ degats cellulaire (DAMP)
- prot cyto multi domaines :
- LPR : leucines rich repeat
- NAD : nicotinamide adenine dinucleotide
- NACHT : NTPase domain
- PYD : pyrin domain (interaction PYD PYD)
- Les ligands de NOD :
- peptidoglycane
- composant majeur des parois bact gram +
- en moindre qntt dans l espace periplasmq des gram -
- NOD1 : diaminopimelic acid (DAP) -> parois bact gram -
- NOD2 : muramyl dipeptide (MDP) -> la majorite des bact
- Activateurs de NLRP3
- NALP3 (NLR) : detecteurs du stress/ degats cellulaires / tissulaires (DAMP)
- acide urique excrete par les reins. Si trop d acide urique, possble de formation de cristaux
-
Diminution de la concentration intracellulaire de K+ :
- production excessive d especes reactives de l oxygene (reactive oxygene species: ROS)
- ruptures des lysosomes (relachement des cathepsines)
- tout ca induit un changement de conf du NALP3
-
Changement de confo de NALP3 :
- __formation d un inflammasome : formation d un complexe proteq oligomerique
- L inflammasome :
- conseq de l activation de l inflammasome
- maturation de cytokines inflammatoires par clivage (IL 1ß et IL- 18)
- la partie effectrice de l inflammasome est le recrutement de la molecule caspase 1
- TLR et l inflammasome
- le systeme inne repond toujours aux bact commensales
- les bact commensales jouent un role important dans le sys immunitaire
- deux signaux pour repondre aux pathg
- 2 eme signal genere qui produit cytochrome inflammatoire qui induit une rep complete
- Expresssion de NALP3
- cellules du syst inne
- granulocytes
- macrophages, monocytes (faibles)
- cellules dendrtiq
- cellules du syst acquis
- cellules B et T
- autres :
- cellules epitheliales (voies orales et genitales)
- cellules du syst inne

Les strategies de reco des pathogenes par le systeme inne et acquis :
- Les recepteurs du systeme inne
*Lectines
- reco des pathogenes par des lectines de type C
- lectine : glycoprot qui se lient a certains glucides
- lectines de type C : laision dependante du calcium
- lectines : prot qui reco du sucre
- mannose : concentration elevee a la surface des cellules
- les repct lectine de type C se lient aux pathogenes

Les strategies de reco des pathogenes par le systeme inne et acquis :
- Les recepteurs du systeme inne
*systeme du complement
- aide a l elimination des pathg
- >20 prot solubles (present dans le serum sanguin)
- produit par le foie
- la plupart inactives
- clivage les actives pour devenir des serines prot (fragment b large, fragment a pett)
- cascade damplification
- activation du systme du complement
- 3 vois diff pour induire cette cascade
- cf image
- activation du sysmt du complement : voie classiq
- une fois lie, recrutement de la prot C
- cf image
- C1q lie a l antiB. Apres le recrutement, activation de C4, C2, et finalement le C3 est clive et egalement lie a la surface des cellules
- Activation du systeme du complement : opsonisation
- C3b peut etre reco par les recept CR1 -> opsonisation
- les microbes sont marques : ca facilite la reoc et la phagocyotse
- l activation de la cascade continue : C3-> C5-> C9
- C( est important car il fait la polymerisation dans la membr du microb
- une fois polymerise, C9 = MAC (= complexe d attq memb)
- Bact, virus, produit microbiens :
- cf image
- controle du systm du complement :
- a le potentiel d endommager des tissus du soi. Son activation doit etre controle
- inhb au C1 : empehce l actv de C1
- CD55* (DAF : Decay acceleratiing factor) : empeche la liaison de Bb a C3b (necsss pour l activ de la convertase C5)
- CD59* : empeche la liaison de C9 -> formation du MAC
- * : exprime par les cellules du soi mais pas par les microbes
- le systeme inne est base sur diff celluels, sur les outils des composants solubles qui aident a la reco, et sur des recpt utls a la reco des motifs directement ou indirectment
- une fois les cell reco, induction d une reponse inflammatoire qui se fait via la production de cytokines et de chimiokines
- reco des patho par les cellules du syst inne : cf image

Les strategies de reco des pathogenes par le systeme inne et acquis :
-resume
- RESUME :
- Récepteurs :
- Membranaires (TLR (surface ou endosome), lectines, récepteurs pour le complément, récepteurs pour cellules apoptotiques (Annexine V) ou nécrotiques (CLEC9A))
- Solubles (complément, lectine (MBP))
- Cytoplasmiques (NLR, RLR) pour les pathogènes et le stress cellulaire
- TLR : onze récepteurs avec spécificité des motifs des microbes : LPS, LTA, flagelles, ADN hypométhylé, ss et dsARN etc. déclenchent la voie inflammatoire et anti-virale (production de cytokines et chimiokines comme IL-1, TNFα, CXCL8=IL-8, interféron de type I)
- Lectines : reconnaissent des sucres microbiens et induisent l’inflammation et la phagocytose
- NLR :
- Reconnaissance de pathogènes intracellulaires
- Reocnnaissance de danger (diminution de K+, nucléotides, cristaux d’urée, nanoparticules)
- Activation des gènes inflammatoires, clivage d’IL-1 et d’IL-18
- RLR : Reconnaissance d’ADN et ARN cytoplasmique. Induction d’interféron de type I et de gènes inflammatoires
- Complément :
- Trois facteurs déclencheurs : anticorps liés aux pathogènes, lectines liées aux pathogènes, liaison directe de composants du complément sur les pathogènes
- Phagocytose (opsonisation), lyse de pathogènes, induction d’inflammation
- Réponse innée avec peu de récepteurs (< 100) spécifiques aux structures qui ne peuvent pas changer.
- Réponse acquise avec des millions de récepteurs : peut reconnaître n’importe quelle structure.
Les strategies de reco des pathogenes par le systeme inne et acquis :
- comment produire tous ces recpt ?
- def : antigene, immunogene, haptene, epitope
- chq cellule exprime un recepteur different
- il y a tres peu de cellules qui sont specifique pour un antigene :
- comment trouver l antiG ?
- comment avoir assez de cellules specifiques ?
- Def :
- AntiG :
- toutes structures reconnaissable par le systeme immunitaire acquis (Ig ou recept T) chimiquement tres divers (peptides, sucres, lipides…)
- Immunogene :
- antiG qui elicite une rep immun acquise
- Haptene :
- groupement chimq qui est un antiG (reconnu par systeme inne) mais n agit pas comme immunogene (sauf si lie a une prot immunogene)
- Epitope :
- partie de l antiG qui est fixe par un recepteur
- AntiG :

Les recepteurs du systeme acquis
- Ig et receptu T : compo
- AntiB : struct, caract, struct 3D (def : isotype, allotype, idiotyp)
- caract des domainse Ig
- la superfamille des Ig
- fonction des antiB
- Les immunoglobulines (Ig) (=antiB) et les recept T (TCR)
- AntiB :
- 4 chaines (2 chaines legenes et 2 lourdes)
- Recept T :
- 2 chaines (å et ß)
- Deux types d AntiB :
- antiB de surface
- antiB secretes
- AntiB : structure, caract, struct 3D
- Struct
- 2 chaines lourdes (IgH) et 2 chaines legeres (IgL)
- chaines liees par des ponts disulfures (S-S) inter chaine (noire; cf image)
- chq chaine a une partie variable V (diff entre chq antiB) = 2 sites identq de liaison avec l antiG
- Caract :
- 5 types de chaines lourdes qui chaangent la fonction de l antiB (IgA, IgG, IgM, IgE, IgD)
- 2 types de chaines legeres : lambda et K
- La struct 3D des domaines IG :
- un domaine se plie indeendamment des autres domaines de la molecule : cf image
- isotype :
- classes d antiB selon la struct des domaines constants des chaines lourdes : 5 classes (IgM, IgD, IgG, IgA, IgE)
- Allotype :
- variantes d antiB entre indv d une meme espece, polymorphismes dans la partie constantes des antiB
- Idiotype :
- struct unq forme par l antiB au nv de la partie variable (qui peut reco antiG et de nouveau former un antiG qui peut induire une reco par une deuxieme antiB)
- Struct
- Caract des domaines Ig :
- 100-130 aa
- 7 (domaines C) ou 9 (domaine V) feuillets ß antipara
- la partie variable qui interagit avec l antiG correspond a l interaction des feuillets ß
- sur 2 plans lies par des poonts disulfures (S-S) intra domaine (noir cf image0
- forme compacte et globulaire avec des CDR : complementarity determining regions (liaison d antiG)
- La superfamille des Ig :
- bcp de molecules de surface (ou soluble) (765) ont des sutrct pareilles au immuno
- c est essentiel pour la reco, la liaison ou l adhesion entre cellules
- CMH : complexe majeur d histocompatibilite
- le CMH reco les peptides viraux et les presentes au recepteur T (le ligand du recpt T est le CMH)
- bcp de molecules de surface (ou soluble) (765) ont des sutrct pareilles au immuno
- Fonctions des antiB secretes :
- Neutralisation :
- de pathogenes pour eviter l entree dans les cellules (isotype IgA)
- Opsonisation :
- decorer les pathogene pour faciliter la phagocytose
- Liaison du complement :
- activation classique du complement (antiB du type IgM et IgG)
- ADCC (antiB dependent celllular cytotoxicity) : induction de la lyse par les cellules NK
- Activation de la degranulation des mastocytes (allergie) (depend du type d antB IgE)
- Les sequences hypervariables (CDR1-3 / HVI1-3) et framework (FR1-4)
- il y a 3 portions dans les domaines variables qui sont hypervaribles (=3 regions d hypervariabilite)
- cette region hypervarible est coudee du aux liaison des feuillets ß
- ces reigions sont utiles pour interagir avec l antiG
- il y a 4 regions de Framework
- Neutralisation :

Les recepteurs du systeme acquis
- Complexe antiG- antiB
*interaction
*calcul, mesure de l affinite
- Une sous partie du lysozyme se lie avec une partie de l epitope
- complementarite des surfaces antiB - antiG : systeme de “lock and key” (=clef serrure)
- Interaction antiG- antiB :
- antiegenes reconnus ;
- tous (prot, sucres, lipides, haptenes, artificielle DDT)
- epitopes reco :
- ont une structures 3D ou lineaires (haute complementarite)
- Interactions
- anticorps antiG basees sur plusieurs liaisons non covalentes de faible energie
- liaisons ionq
- liaisons de vander waals
- interaction hydorphobes
- liaisos hydrogene
- anticorps antiG basees sur plusieurs liaisons non covalentes de faible energie
- specificite entre antiG et antiB est tres haute
- antiegenes reconnus ;
- Def :
- affinite. :
- force de liaison entre un bras dun antiB et un antiG (=entre deux composants)
- avidite :
- force de liaison entre un antiB multivalent et un antiG multivalent (= entre plusieurs composants)
- l avidite n est pas le douvle de l affinite, il y a une augmentation de la force d interaction
- Kd :
- constante de dissociation, mesure de stabilite
- affinite. :
- Calcul de l affinite :
- cf image
- Methodes de mesure :
- dialyse a leq/ suface plasmon resonance (Biacore)
- Determination de l affinite : dialyse a leq
- 2 compartiments sont separers par une membrane qui est impermeable pour une moelcule comme un antiB
- on peut donc mesurer la concnetration dantiG libre a la fin, si on ajoute une concentration fixe d antiB
- on genere une courbe de saturation avec laquelle on peut determiner laffinite de l antiB avec l antiG
- Affinite de l interaction : moyenne a haute, varie bcp
- une faible valeur de Kd signifie qu un ligand a une forte affinite pour le recepteur
- moins de molecules du ligand sont necessaire pour occuper 50% des recpeteurs
- Kd : concentrations de molecules du ligand necessaire pour occuper 50% ddes recepteurs

Les recepteurs du systeme acquis
- antiB polyclonaux et monoclonaux
- les antoB monoclonaux sont des antiB avec une specificite perdeterminee et cherchee
- ils ont tous le meme site de liaison
- Pour les antiB polyclonaux :
- l antiG est lie avec des antiB qui ont des specificites diff amenant a une agregation des antiB et des antiG

Les recepteurs du systeme acquis
- cross reactivite (ou reactions croisees)
- cross reactivite = la capacite d une antiB a reagir avec plus d un epitope
- Epitope partage :
- une molecule B peut exprimer un epitope A qui reco l antiG A
- Epitope pareil :
- une moelcule C avec un epitopoe C peut reco l antiG A car il y a une similarite entre les epitopes A et C mais il y aune moins forte interaction.affinite pour AgC et antiG A que pour AgA et antiG A

La diversite des antiB
- comment produite des millions d antiB ? (intro)
- La diversite enorme des antiB (et des TCR) est generee par des meca de rearrangement de l ADN et par l introduction aleatoire de seqc nucleotiq dans les endroits de jonction des degments pendant le rearrangement
- Pb :
- on peut produire des antiB contre tous les antiG imaginables mais le nombre de genes est linite
- on a 25 000 genes dans le genome
- d ou vinet la diversite des antiB ?
La diversite des antiB
- organisation genomq des Ig
- generation de la diversite
- antiB : nombre de segments des genes
- Organisation genomq Ig :
- les genes des antiB sont formes a partie de multiples segments genq
- il y a autour de 30 segments varaibles
- il faut recombiner 3 elements genomq : D, J et V
- Generation de la diversite :
- chaine lourde (IgH)
- precurseurs des cellules B (fait partie de leur maturation)
- presnt dans le moelle osseuse
- 1er etape : choix aleatoire d un segement J et d une segment D et realisation dune recombinaison
- 2eme etape : choix aleatoire d une segment V avec le segemnt recombine JD et realisation dune nouvelle recombinaison
- chaine legere (IgL)
- seulement les elements V et J sont a disposition
- chaine lourde (IgH)
- VJ et VDJ rearrangement des Ig genes :
- au nv de l ADN, la formation de VJ sur la chaine legere et la formation de VDJ sur la chaine lourde sont les seules reocmbinaisons
- ensuite il y a la transcription de l ADN pius le splicing
- il n y a pas de recombinaisons avec la partie C
- AntiB : nombre de segments des genes
- cf image

La diversite des antiB
- meca de recombinaison V(D)J
- il ya des signaux de recombinaison (RSS : recombination siganl sequence) autour des segments.
- RSS correspond toujours a une region heptamere
- Le rearrangement est seuleemnt possible entre RSS- 23 et RSS012 (cad qu on peut recombiner un RSS avec un espaceur de 23 paires de base et un RSS avec un espaceur de 12 paires de bases)
- regles des 12/23
- Ce meca evite la recombinaison entre les segments du meme type et entre V et J (pour IgH) et donc force la recombinaison entre D ou DJ avec V
- Rag-1/ Rag-2 : (recombination activating gene) (specifq pour lt et B)
- se lient aux signaux de recombinaison
- formation d un hairpin
- coupe l ADN
- Enzyme de reparation d ADN :
- existe dans toutes les cellules pour reparer coupure de brins accidentelles et reparent et rejoignent les brins coupes
- apres la reparation, une partie de l adn va etre perdue car elle contenue dans un plasmide qui va etre perdu
- La reparation de l ADN augmente la diversite :
- il y aun eformation d un brin inegal avec des nucleotides non lies
- ces nucleotq sont completes par leur correspondant
- ensuite la 2eme enzyme (= enzyme TdT) ajoute de facon aleatoire 1 a 10 nucleotides
- la sequence generee par hasard donne l hypervariabilite
- il y aun eformation d un brin inegal avec des nucleotides non lies
- VDJ et N nucleotides forment les regions HV1-3
- rearrangement sequentiel : d abord chaines H apres L
- regions constrantes (C) restent separees

La diversite des antiB
- repertoire d antiB
0 enzymes impliques dans le rearrangement
- immuno deficiences
- Repertoire :
- diversite des jonctions (estimations tres conservatrice) :
- cf image
- combinaison de diff seg VDJ :
- cf image
- on ne possede pas tous les recepteurs a tout moment, mais on en a une qntt suffisante
- diversite des jonctions (estimations tres conservatrice) :
- Enzymes implq dans le rearrangement :
- RAG : 2 recombinaisons activating genes se lient aux motifs heptamene/ nonamere et coupent
- TdT : introduit des nucleotides dans des jonctions
- Immunodef :
- deficience dans une de ces enzymes
- RAG-1 ou 2
- recombinase
- DNA PK
- Ku 80
- Artemis
- RAG-1 ou 2
- si abs totale de LT et B :
- SCID = severe combined immunodeifciency (=ne peuvent pas prodiure une rep)
- la formation des Ig ou TCR est essentielles pour le developpement des LT et B
- deficience dans une de ces enzymes

Forme mebraniares (clonales) et secretees
- l activation induit la secretion des antib
- IgM transmemb : polyadenylation et epissage
- Les Ig peuvent etre membranaires ou secretees. Les Igs secretees (antiB) agissent de maniere systemique. Elles exercent diff fonction qui dependent de leur region constante (isotype)
- L activation induit la secretion des antiB :
- un LB, une fois sorti de la moelle osseuse, exprime un Ig membranaire a sa surface
- l antiB a le meme isotype sous forme mebranaire ou secretee
- IgM transmembranaire : polyadenylation et epissage
- la partie C encode constt, elle est suivie par la partie orange (=SC)
- le site de polyadenylation (pAs) est suivi de l exon TM (transmembranaire) + IC (intracytoplasmq)
- production d un ARNm primaire qui va par un meca d epissage permeettre de former un Ig membranaire a la surface de la cellule
- le meme ADN est rearrange diff sur la deuxieme photo

- IgM et IgD coexprimes a la surface
- Les cellules B matures naives coexpriment IgM et IgD
- Les cellules B matures naives coexpriment IgM et IgD :
- la cellule B immature va toujours exprimer de l IgM. Au cours de sa maturation elle va commencer a coexprimer de l IgM et de l IgD.
- C est toujours le meme isotype mais les deux Ig auront une partie constt diff
- Co expression d IgM et IgD a la surface : site de polyadenylation alternatif, epissage alternatif
- Au debut la partie variable est recombinee puis les segments qui encodent la partie constt sont recombines suivi de la partie de polyadenylation
- ensuite le locus pour l IgD est aussi recombine suivi par son propre site de polyadenylation
- L ARNm primaire produit au cours de la maturation de la cellule B est forme de la partie variable identq a l IgM mais avec une partie constt diff
- l IgM et IgD peuvent etre produits en meme temps
- L aco expression d IgM et d IgD est possible grace a la localisation avoisinante des genes Cu et Cdelta
- la cellule B immature va toujours exprimer de l IgM. Au cours de sa maturation elle va commencer a coexprimer de l IgM et de l IgD.

- Switch (communication) isotypique
- le locus humain des chaines Ig lourdes (IgH)
- La commutation de la classe d isotype
- Le locus humain des chaines Ig lourdes (IgH) :
- la cellule B fait la commutation isotype qui est irreversible (phenomene qui a lieu dans l ADN)
- il y a obligatoirement un chantement important au nv de l ADN ce qui permet de former les autres isotypes, car l ARNm ne peut pas etre trop long
- La commutation de la classe d isotype :
- precedent chq region constt, on trouve une partie switch.
- la formation de la boucle d ADN est du au fait que lees parties switch peuvent se rencontrer.
- il y a donc une possble de former l IgG3 qu lieu de IgM, IgD ou autre.

- Switch (communication) isotypique
- les principales classes d antiB (isotypes)
- L IgG existe sous 4 isotypes
- Les principales classes d antib (isotypes) :
- 5 isotypes principaux : IgM, IgD, IgG, IgE, IgA, qui different dans la partie constt de la chaine lourde
- chq isotype a ses fonctions spe
- monomere (IgG, IgE) dimere (IgA secrete : important dans la defense immunitaire des muqueuses), pentamere (IgM secrete)
- IgD : recepteur membranaire mais tres peu present
- L IgM et l IgA forment des multimeres
- IgM : pentamere secrete au debut de la reponse
- IgA : dimere present dans les secretions muqueuses
- La chaine J (≠ chaine J de la partie variable) peut stabiliser les multimeres)
- Les antiB IgM reco souvent des epitotpes repetitifs
- L IgG existe sous 4 isotypes
- les 4 isotypes d IgG se differencient orincipalement par la structure de leur region charniere (= hinge region)
- l IgG est secrete plus tard dans la reponse immunitaire
- l affinite augmente durant la maturation
- chez la souris, par d IgG4, mais l IgG2b chez la souris correspond a notre IgG4

- Switch (communication) isotypique
- Prop fonctionnelles des isotypes d Ig
- Pq le systm immunitaire fait un switch isotypq ?
- Prop fonctionnelles des isotypes d Ig :
- IgM : fonction principale :
- activation du systm du complement (neutralisation de pathogenes)
- IgD : existe sous peu de dose et n a pas de fonction spe
- sous sa forme membranaire il peut reco l antiG mais sous sa forme secretee il est inutile
- IgG : fonction principale :
- opsonisation du pathogene, neutralisation, activation du systeme complementaire.
- il a facilement acces au site extravasculaire et est transporte a travers le palcenta, donc il peut etre donne au foetus
- IgA : fonctionn principale de transport, sous forme domerique dans l epithelium
- sous forme monomerique il peut diffuser vers les sites extracellulaires
- IgE : fonction principale :
- sensibilisation des mastocytes
- IgM : fonction principale :
- Prop des isotypes d Ig :
- l IgM est un pentamere donc son poids moleculaire est plus important ≠ tous les autres qui sont monomeres et qui sont donc autour de 150 kDa.
- Les Ig ont une 1/2 vie limitee donc tiennent qq jours a plusieurs semaines
- Prop fonctionnelles des isotypes d Ig :
- IgM : complement activation; antigen receptor of naive B cells
- IgG : complement activationm phagotosis ADCC, transfer of adaptive immunity to offspring (via placenta and milk)
- IgA : mucosal immunity, phagocytosis
- IgE : activation of mast cells, basophils, eosinophils (parasites, allergies)
- IgD : antigen receptor on naive B cells
- Pq le systm immunitaire fait un switch isotypq ?
- (1) Le switch d IgM (de faible affinite mais haute avidite, ideal pour reco des epitopes repetitifs) a IgG permet la production d antiB de tres haute affinite par hypermutation somatiq
- (2) Acces aux liqd extra sanguins (IgG, IgE, plus pett masse)
- (3) Gain de nouvelles fonctions de l antiB : opsonisation et liaison aux recepteurs Fc (phagocytose, activationn de cellules NK et de mastocytes) neutralisation amelioree (de toxines ou de virus)
- (4) Secretion dans les muqueuses (IgA) transfert placentaire (IgG1)

- Switch (communication) isotypique
- Les recepteurs Fc
- Les recepteurs Fc sont des recepteurs cellulaires qui se trouvent a la surface de la membrane cellulaire et qui lient la partie constante (Fc) des IgG, IgE ou IgA soluble
- Il y a diff recepteurs Fc pour diff classes d antiB :
- les recepteurs des IgG ont une faible affinite ≠ recepteur de l IgE qui a une plus forte affinite
- Expression : surtout sur les cellules du systeme innes
- (a) Internalisation :
- les recepteurs Fc ont un role dans l internalisation et la destruction des pathogenes par les macrophages
- Il y aune liaison de la bacterie a travers l IgG qui declenche la phagocytose
- joue un role important dans l impermeabilisation
- (b) NK cytotoxicite :
- Cellules NK : la liasion d IgG au FcgammaRIII induit la cytotoxicitie
- une cellule infectee exprime a sa surface des epitopes qui peuvent etre reconnues
- (c) Degranulation :
- mastocytes : le FcepsilonRI lie l IgE soluble induisant la degranulation apres liaison d un parasite ou allergene
- les mastocytes ont un recepteur a haute affinite
- la presence de l IgE va armeer les mastocytes et ceux ci sont prets pour l arrv de pathogenes
- degranulation de vesicules contenant des histamines et des cytokines pro inflamatoires. Cette degranulation est utile dans la reaction immunitaire mais a un role nefaste dans les allergies

Maturation de l affinite :
- Pq l affinite des Ig changent ?
*activation induced deaminsase AID
*BCR
- les antiB peuvent muter pendant la reponse immunitaire et ainsi augmenter leur affinite
- L immunisation repetitive augmente l affinite des IgG
- L affinite IgM ne change pas enormement durant la maturation, mais l affinite des IgG change bcp grace a l immunisation repetitive
- Pq l affinite des Ig changent ?
- Durant la maturation de l affinite il ya une accumulation de mutations qui permettent une meilleure affinite
- si une mutation rend l antiB non fonctionnel, Ig n est plus consommee donc l antiB meurt
- Activation induced deaminase AID
- mutation d AID de souris ou humaine (= mutation dans l enzyme AID)
- pas de maturation d affinite
- pas de switch isotypique seulement IgM
- AID transforme la cytosine en uracil
- mutation d AID de souris ou humaine (= mutation dans l enzyme AID)
- Evenements reversible et irreversibles controlant la diversite et expression des immunoglobines
- tous ce qui se passe dans l ADN est irreversible alors q un nv de l ARN c est reversible
- Immunoglobines membranaires = BCR
- celle ci suite a la reco d un antiG transmet des signaux vers l interieur de la cellule.
- Le recept lui meme ne peut transmettre l info donc il est associe a une pett partie.
- Les tyrosines phosphorylees peuvent recuperer d autres molecules pour la transmission des signaux

Maturation de l affinite :
- Application des immunoglobulines
- Diagnostique et recherche :
- ELISA, RIA, ELISPOT
- FACS (cytometrie de flux)
- western blot
- immunofluorescence
- immunoprecipitation
- immunofixation
- Immunotherapie (Ig monoclonaux)
- Vaccination passive et incompatibilite rhesus (Ig polyclonaux)
Maturation de l affinite :
- Cytometrie de flux
- AntiB therapeutiques et immuno pathologie
- Cytometrie de flux :
- la cytometrie de flux est une methode qui permet de diff les diff types de cellules dans un melange de cellules
- en faisant la coloration des antiB monoclonaux il y aura une possbl de diff les types de cellules (jusq 16 diff en meme temps)
- Ensuite la solution passe par une buse mise sous vibration une cellule par goutellette
- Enfin sur un ecran on peut analyser les pop
- AntiB therapeutq et immuno pathologie :
- Natalizumab : reconnait specifiquement certains integrines
- il empeche la migration et l acces des L a certains tissus
- le risque potentiel est une grave infection du cerveau mais c est rare
- Rituximab : antiB qui reconnait CDbant (= marqueur present chez presq tous les LB)
- declanche une cytotoxicite : induit l apoptose, ADCC et CDC
- Natalizumab : reconnait specifiquement certains integrines

Recepteur des LT
- Comparaison de la structure de l Ig et du TCR
- Nombre de segment s de genes pour les TCR
- Organisation des genes du TCR åß
- La composition du complexe TCR/CD3
- Comparaison de la structure de l Ig et du TCR
- diff majeures :
- TCR :
- monovalent (= un seul site de liaison)
- jamais secrete (toujours sous forme membranaire)
- pas de maturation d affinite
- TCR :
- Variabilite : 10^14 - 10^18
- diff majeures :
- Nombre de segment s de genes pour les TCR
- cf image
- Organisation des genes du TCR åß
- les ruminants ont bcp de recepteurs gamma/ß
- homme : recepteurs å/ß
- cf image
- Le polymorphisme des Ig et TCR :
- diversite totale (estimation)
- Ig : 10^12
- TCRåß : 10^18
- TCRgamma/delta : 10^14
- le TCR n agit pas seul pour transmettre un signal il le fait en s associant avec d autres prot
- Fonctionnement membranaire
- diversite totale (estimation)
- La composition du complexe TCR/CD3
- les prot CD3 permettent lexpression du recept T a la membrane et l initiation de la cascade de signalisation
- motif ITAM sur les parties intracellulaires des prot CD3 : phosphorylation sur tyrosines apres activation
- Le BCR utls Igå et Igß au lieu de CD3
- les prot CD3 permettent lexpression du recept T a la membrane et l initiation de la cascade de signalisation

Le complexe CMH
- complexe CMH peptide
- Reco :
- Les immunoglobulines (secretes ou membranaires) reconnaissent des antiG natifs (intacts)
- le recpteur des cellules T (toujours membr) reco des antiG fragmentes
- Role :
- le role du CMH est de presenter des fragment d antiG (generalement des peptides) aux cellules T
- al aide du TCR, les cellules T peuvent detecter la presence de fragments antiG, uniquement s ils osnt presentes par le CMH.
- si c est une cellule T cytotocique elle va tuer la cellule qui lui est presentee (cad le CMH)
- le role du CMH est de presenter des fragment d antiG (generalement des peptides) aux cellules T
- Distribution des molecules de CMH :
- IFNgamma peut augmenter l expression du CMH de classe 1 et induire l expression du CMH classe 2 sur des cellules qui n en expriment pas normalement
- En cas d infection : l interferon gamma est tres present sur les celluels
- Le CMH 1 et 2 ont des fonctions similaires mais sont fonctionnellement diff
- CMH classe 1 :
- le CMH 1 a la capacite de presenter des peptides avec sillons qui se forment au bord de la molecule
- le CMH est forme d une chaine transmembranaire avec le sillon qui lie le peptide
- CMH classe 2 :
- le CMH 2 a une structure similaire au CMH 1 avec un sillon qui peut lier le peptide mais il est forme de deux chaines transmembranaires
- ses deux chaines forment le sillon
- les helices å forment comme un angle, donc le sillon est ouvert des deux cotes
- il peut donc accomoder des peptides plus haut
- le CMH 2 a une structure similaire au CMH 1 avec un sillon qui peut lier le peptide mais il est forme de deux chaines transmembranaires
- Caract des CMH classe 1 et2 :
- CMH classe 1 : sur presque toutes les cellules (sauf erythrocytes)
- CMH classe 2 : sur les cellules presentatrices d antiG professionnelles (celluels dendritiques, LB, et peu sur les macrophages)
- Inductible sur presque toutes les cellules par l interferon gamma
- (1) Polymorphisme :
- bcp d alleles diff dans la pop (ex : genes responsable des groupes sanguins = oligonorphes)
- l expression de certains alleles de CMH 1 et CMH 2 represente l identite immunologique de chq individe
- chq cellule de notre corps exprime 6 variants de CMH 1 ce qui nous rend unq car pour chq gene il y a des centaines de variation
- (2) Codominance
- (3) Plusieurs isotypes : plusieurs genes pour chq classe de MHC

Le complexe CMH
- caract : variabilite des CMH de classe 1 et 2
- Caract :
- variabilite des CMH de classe 1 et 2 :
- diff alleles capables de lier diff types de peptides
- (1) Polymorphisme genetq du CMH
- le polymorphisme sert a l augmentation de la resistance d une pop aux mutations des pathogenes
- il y a plusieurs centaines d alleles pour les CMH de classe 1 et 2 dans la pop
- pour le CMH 1 les 3 genes principaux sont : B, C,A
- pour le CMH 2, il ya 2 alleles car deux chaines : DPB, DPA, DQB, DQA, DRB, DRA
- polymorphisme genetq du CMH de classe 1 :
- 3 genes principaux : A, B, C qui sont polymorphes mais il y en a d autres qui sont oligomorphes ou monomorphes
- polymorphisme gentq du CMH de classe 2 :
- DP, DQ, DR
- qd on compare les populations on retrouve une diff dans la frqc des alleles du CMH 1
- ca peut etre explq par le fait que la presence de ces alleles peut etre avantageux dans une certaine pop contre certains pathogenes
- Codominance :
- au sein d une fratrie, on partage certains des alleles des parents
- les enfants ont 50% de chance de partager et 50% de ne pas partager un alleles
- Struct genetq du CMH :
- trois genes CMH classe 1 avec bcp d alleles
- Plusieurs autres genes avec moins de polymorphisme
- HLA : Human leukocyte antigen
- Un gene pour une chaine ALPHA et un pour une chaine BETA : DP, DQ, DR (DR a plusieurs gene ß)
- bcp d allelespar locus
- noms : HLA-DRB1*0101
- ou : HLA = Human Leukocyte Antigene / DR = gene/ B1 = chaine ß 1 / Numero = numero de l allele
- un seul allele specifique peut lier toute une gamme de peptides
- trois genes CMH classe 1 avec bcp d alleles
- variabilite des CMH de classe 1 et 2 :
- Structure des peptides dans la poche du CMH de classe 1 :
- le sillon du CMH 1 a une certaine taille donc ca reduit la taille du peptide qui peut etre lie
- le sillon fixe les peptides avec des aa d ancrages. Les aa font le contact physique avec le CMH
- Le peptide a une forme courbee
- Structure des peptides dans la poche du CMH de classe 2 :
- le sillon du CMH 2 est plus long et ouvert des deux cotes
- le sillon accomode donc des peptides plus longs et des peptides dans une conformation allongee et lineaire
- comme il est plus long, il a egalement plusieurs siltes d ancrages (jusq 4)
- Peptides elues d un type de molecules de CMH classe 1 :
- le CMH 1 peut lier toute une gamme de peptides du aux aa des sites d ancrages
- chq allele de CNH1 a sa pref
- Peptides elues d un type de molecules de CMH classe 2 :
- pour le CMH2 est plus complq car il est plus long :
- dans le cas des souris il y a une seqc centrale qui est identq la diff reside donc dans la longueur des peptides
- dans le cas de l homme il y a bcp de variabilite mais aussi des sites dancrages
- pour le CMH2 est plus complq car il est plus long :
- Les molecules CMH de classe 1 presentent des peptides derives de prot cytoplasmq alors que des molecules CMH de classe 2 presentent des peptides derives de prot extracellulaires (phagocytose)
- Les Lt qui expriment CD4 (= LT auxiliaire) reco des CMH de classe 2 charges de peptides derives de prot de l ext et les LT CD8 (=LT tueuse) reco les CMH classe 1 charges de pept cytoplasmq

Le complexe CMH
- la formation des complexes CMH :
- L association CMH peptide est tres lente et de faible affinite : assicoation tres lente, dissociation tres lente. Une fois forme :
- changemnt de conformation donc devient tres stable
- 15-30 minutes pour former le complexe et des heures voire des semaines pour le dissocier
- Formation CMH 1 :
- fixation des peptide en provenance du cytoplasme
- le proteasome produit continuellement des peptd en provenance de toutes les prot cytoplasmq. Il detruit les cellules qui n ont plus de fonction
- Formation CMH 2 :
- presentation des peptides venant d une autre source = extracellulaire
- digestion par le lysosome et ses peptide vont dans un compartiment vesiculaire tres specifique pour se lier au CMH 2
- Formation du complexe CMH classe 1 peptide :
- seulement des CMH classe 1 charges de peptides sont stables a la surface
- le CMH 1 est initialement produit dans le RE et il est libere de la calnexine
- comme il n est pas stable, il s associe a une chaperonne puis a la ß microglobuline
- ensuite le complexe se lie au TAP via la tapasine
- les prot cytosolique vont se degradees en fragements peptidiques par le proteasome une grande protease multicatalytique
- TAP delibre un peptide qui se lie au CMH 1 et termine son repliement. CMH 1 entierement repliee est liberee du complexe TaP et exportee
- le CMH 1 est initialement produit dans le RE et il est libere de la calnexine
- TAP : transporter associated with antigen processing
- La decouverte du transporteur a permis de comprendre l impotation des peptides dans le RE permettant aux peptides de se lier ensuite au CMH
- seulement des CMH classe 1 charges de peptides sont stables a la surface
- Formation du complexe CMH classe 2 peptide :
- le CMH 2 est destine a l exportation lui aussi est produit dans le RE
- le CMH 2 s associe avec la chaine invariante (stabilise CMH 2)
- celle ci a une partie qui lie le sillon et bloque l acces du sillon aux peptides qui sont dans l env
- le CMH 2 s associe avec la chaine invariante (stabilise CMH 2)
- une preotease va couper la chaine invariante pour laisse seulement un court peptide fragmentee toujours lie a CMH 2
- les antiG endocytes sont degrades en peptides dans les endosomes mais le peptide frgmente bloque la liaison des peptides au CMH 1
- HLA DM se lie a CMH 2, liberant le petide frgmente et permettant a d autres peptides de se lier. Le CMH 2 se rend ensuite a la surface de la cellule
- le CMH 2 est destine a l exportation lui aussi est produit dans le RE

Le complexe CMH
- chaine/ organisation CMH
- corecepteurs CD4 et CD8
- La chaine invariante controle le chargement du CMH 2 :
- la chaine invariante est un trimere qui lie 3 molecules en meme temps
- au debut association avec le CMH 2 puis degradation partielles
- il reste jsute le peptide frgmentee (partie rouge) puis le fragment est remplace
- Organisation genetq du CMH
- les genes codant pour HLA DM, TAP et LMP (sous unites du proteasome) font partie de la region genetq qui contient les genes du CMH
- le CMH restreint la capacte du TCR de reco l antiG
- si l antiG n est pas presente par le bon CMH, le LT ne s alerte pas
- si le peptide n a pas une bonne affinite avec le TCR, le LT ne s alerte pas
- Les corecepteurs CD4 et CD8 :
- CD4 est exprime sur les celluels T auxilliaires et lie le CMH classe 2
- CD8 est exprime sur les cellules T cytotoxiques et lie le CMH classe 1
- CD4 et CD8 se lient physique a leur CMH respectifs
- Reco du CMH par les corecpetuers CD4 et CD8 :
- l interaction physique augmente l avidite du contact et augmente la sensibilite du recept
- CD4 et CD8 stabilisent le contact physique, ils sont donc utiles aux LT
- les corecepteurs stabilisent mais contribuent a la signalisation aussi
- la liaison de CD4 au CMH classe 2 renforce la signalisation

- La reponse immunitaire
- les cellules presentatrices d antigenes
- 3 etapes de l immunite acquise
- DC
- Les 3 etapes de l immunite acquise :
- 1- detection du danger (immunite innee)
- 2- Activation des celluels T et B (immunite acquise)
- 3- elimination du danger et retour a l homeostasie (immunite acquise)
- Les cellules dendritiques (DC) surveillent tous le corps pour des signaux de danger (surtout aux barriers)
- longues dendrites : peut capturer des signaux/pathogenes peut interagir avec plusieurs cellules
- DC : des cellules sentinelles
- capatures de molecules/particules : en homeostasie et apres infection
- Activation et migration : seulement qd il y a des signaux de danger (TLR, NLR) et inflammation (IL-1ß, TNFå)
- DC : des detecteurs de danger
- 2 signaux necessaires pour mobiliser les DC et declancher l immunite adaptative :
- detection de signanux de danger (recepteuers pour PAMP, lectines, complement, cytokines…)
- captures du pathogene (phagocytose, pinocytose)
- la cellule residente se mobilise et migre dans les vaisseaux lymphatiques (gain du recepteur de chimiokine CCR7, perte de CCR1/2/5/6)
- 2 signaux necessaires pour mobiliser les DC et declancher l immunite adaptative :
- DC : amenent les informations aux ganglions
- pendant la migration
- degradation des pathogenes/molecules/ particules/ cellules -> peptides (= formation de peptides qui peuvent etre presentes a la surface des cellules apres)
- chargement sur CMH 2 et 1 intracellulaire et expression a la surface
- expression de molecules de costimulation (B7.1/2 = CD80/86) et d adhesion pour cellules T (ICAM)
- CCR7 guide la migration dans la zone T du ganglion drainant : rencontre avec cellulese T naives
- pendant la migration
- Proprietes speciales des cellules dendritiques : la capacite d activer les cellules T naives
- localisation dans les tissus non lymphoides, phagocytent, expriment CMH 2
- detection de dangers -> processus de maturation :
- migrent au ganglion (CCR7)
- expriment l antigene d une facon immunogenq (CD80/86, cytokines)
- peuvent activer les cellules T auxiliaires (CMH2) et T cytotoxique (CMH1)
- Forme immature : frome specialisee pour capturer l antigene
- Forme mature : forme pour presenter les antigenes
- DC et LT : se repartissent le travail
- les DC emigrent du derme et migrent assez lentement aux ganglions
- les cellules presentatrices d antigenes (APC)
- 3 types de cellules peuvent presenter des antigenes extracellulaire par CMH classe 2 apres leur absorption et degradation
- DC : abosorbent des antiG par macropinocytose ou a laide de recept Fc (les BEST)
- macrophages : absorbent des antiG couverts d antiB a l aide de recepteurs Fc (plutot des phagocyte)
- LB : internalisent et degradent des antiG captures a laide d anticorps de surface (cellules rares et pas dans tissus non lymphoides)
- 3 types de cellules peuvent presenter des antigenes extracellulaire par CMH classe 2 apres leur absorption et degradation

- La reponse immunitaire
- Activation et differenciation des LT
*organe lymphoides
- Le role cle des tissus lymphoides secondaires dans l immunite acquise
- 2eme phase :
- initiee dans les ganglions, rate ou plaques de Peyer
- selction et amplification clonale
- developpement d une reponse hautement specifique au pathogene
- reponse lente pour etre vraiment efficace pour l elimination des pathogenes
- memoire
- 2eme phase :
- Les organes lymphoides permettent la rencontre des L avec l antigen
- 2 compartiements :
- unn pour LT (zone T) et les DC
- un pour LB (zone B, follicule)
- 2 compartiements :
- Les L naifs surveillent seulement les T lymphoides :
- melange continuel des 10^9 specifites de recepteurs (LT et B)
- constamment mobile et a la recherhce de leur antiG
- apres inflammation, les organes lymphoides gonflent (5 a 10x en qq jours) pour attirer plus de cellules naives pour augmenter la proba de trouver les meilleures spe
- melange continuel des 10^9 specifites de recepteurs (LT et B)
- Selection et amplification clonale des LT et B :
- reponse heterogene (99.9% des L ne reagissent pas)
- la cellule specifique est rare et doit etre amplifiee = reponse lente (jours)
- les cellules dilles gardent le meme specificite du recepteur
- Choix de la reponse T et B : adaptee au type de pathogene
- division du travail entre :
- les LB reco les peptides dans le context de CMH 2 (Ag extracellulaire) Les cellules B sont spe pour secreter des enzymes qui vont attaquer a l exterieur
- les LT CD8+ reconnaissent les peptdies dans le contexte CMH 1 (Ag intracellulaire)
- Les LT CD4+ reco les peptides dans le context CMH 2 (Ag extracellulaire > Ag intracell)
- Les cellules T peuvent tuer une cellule qui contient le pathogene
- division du travail entre :
- CMH 1 et CMH 2 presentent des antiG differents :
- CMH 1 montre les dangers intracellulaires
- cellules T cytotoxiques (CD8) => cytotoxicite
- CMH 2 montre les dangers extracellulaires
- Celluels T aux (CD4)
- cytokines pour aider
- aider les LB : antiB

- La reponse immunitaire
- Activation et differenciation des LT
*activation
- Activation des cellules T : 3 stades diff
- le recpteur T garde sa specificite et son affinite pendant les 3 stades
- une grande partie des effecteurs vont mourir mais une pett partie va devenir une cellule memoire
- la provenance des cellules memoires n et pas tres claire : est ce que ca vient des effeteurs ? des naifs ?
- Activation et fonction des LT
- dans les deux phases
- presentation de peptides par des cellules presentatrices
- reco des complexes peptides/CMH par d autres molecules
- la synapse
- contacts necessaires entre cellules
- Les deux phases : diff dans le temps, l espece et l APC
- dans les deux phases
- Le recepteur TR a besoin d aide par d autres molecules
- la synaspse est une plateforme de signalisation :
- agregation de plusieurs TCR + corecepteurs (CD4 ou CD8) + co stimulateurs (CD28)
- secretion dirigee de facteurs soluble (cytokines)
- signalisation prolongee
- SMAC = supramolecular activation cluster (central vs peripheral) or supramolecular adhesion complex
- la synaspse est une plateforme de signalisation :

- La reponse immunitaire
- Activation et differenciation des LT
*trois signaux sont necessaires pour activer un L naif
- Pour les LT naifs : signaux principalement par les cellules dendritiques
- CMH/peptide - TCR, CD4/8 (signal 1)
- costimulation (signal 2)
- cytokines (signal 3)
- Pour les LB naifs : signaux 2 et 3 seulement par les LT auxiliaires
- antiG natif - Ig (signal 1)
- costimulation (signal 2)
- cytokines (signal 3)
- Le signal 1 :
- la signal 1 inclut le corecepteurCD8 ou CD4
- corecepteur (CD4 ou CD8) se lie au CMH (partie peu variable)
- augmenta la basse affinite de l interaction CMH- TCR
- amene une molecule de signalisation essentielle pour lactivation :
- la kinase Ick
- corecepteur (CD4 ou CD8) se lie au CMH (partie peu variable)
- TCR et CD4 se rapprochent pour induire l activation intracellulaire
- SansCMH/Ag : unites separees
- pas de signaux d activation
- avec CMH/Ag : unites rapprochees
- CD4 amene kinase (Ick) pour commener une cascade de signaux d activation (phosphorylayion, P) —> transcription
- SansCMH/Ag : unites separees
- la signal 1 inclut le corecepteurCD8 ou CD4
- Le signal 2 :
- signal 2 : molecule transmembranaire qui fait la costimulation
- inactivation reversible : la cellule survie mais va etre inactivee pendant un certain temps, c est reversible mais ca ne va pas declencher une rep immunitaire
- signal 2 : renforce le signal 1 pour permettre la proliferation et la survie
- cf image
- meca de la costimulation : role pour la cytokines IL-2
- la cytokine IL-2 permet la proliferation et la survie des cellules T
- sans signal 2 et IL 2 : AICD sans pahse effectrice (peu de proliferation possible)
- rep des LT CD8 contre un virus
- signal 2 : molecule transmembranaire qui fait la costimulation
- Le signal 3 :
- signal 3 : les cytokines induisent la diff des cellules T
- iganl 3 par l APC (ou autre cellule) induit la differenciation en cellules effectrices
- dependant du signal/cytokines : differenciation diff
- CD4+ —> Th : T helper (auxiliaire)
- CD8+ —> CTL : cytotoxic T cell
- diff des LT auxiliaires le paradigme Th1-Th2
- une cellule T auxiliaire naive a le potentiel de se diff dans des cellules effectrices distinctes
- molecules effectrices des LT :
- cf image
- Th1 : aide la proliferation des celluels CTL (contre danger intracll)
- Th1 : aider a digerr les macrophages infectes (contre danger intracell)
- Th2 : aider les cellules B a produire des anticorps (contre danger extracell)
- regulation de la reactivite ou rep acquise :
- chq etape est controlable et souvent controlee :
- T lymphoides primaires : tolerance centrale (dvl des T immatures)
- T lymphoides secondaire : DC, Treg, T CD4, antigene, cytokines, recepteurs varies … (activation des T matures)
- chq etape est controlable et souvent controlee :
- tolerance vs immunite forte vs immunite reduite
- voies de signalisation partagees : IL 2, costimulateurs (CD80/86)… DC partages
- Treg : peuvent inhb les rep Th1, Th2, Th17, CTL
- tolerance par defaut, l immunite est plutot l exception
- signal 3 : les cytokines induisent la diff des cellules T
- T regulateurs : diff strategies de suppression
- modultion/suppression des APC :
- via cytokines (IL 10, TGFß)
- via prot de surface (CTLA-4)
- inactivation des cellules T naives/activees :
- en relachant des cytokines suppresseurs (IL 10, TGFß)
- via conso des cytokines stimulantes comme IL2 (IL2 R+)
- en arrachant/bloquant CD28 sur les APC (via CTLA-4)
- modultion/suppression des APC :
- Signaux inhibiteurs : souvent dimineut le signal 2
- inhb les inhb : strategie nouvelles pour aug la rep T contre les cancers
- cf iamge

- La reponse immunitaire
- Activation et differenciation des LB
- Reco de l antiG :
- les cellules T reco des antiG degrades (fragmentes)
- les cellules B reco dans antiG sous forme native (intacte)
- Reco de l antiG natif par les B : signal 1
- le siganl 1 est indp des signaux 2 et 3
- signalisation similaire au TCR, inclut le besoin pour. dautres signaux
- Des cellules myeloides et stromales capturent l Ag naif : l Ag reste a la surface (pas d endocytose)
- zone B : peu de DC et peu de presentation de peptides / CMH
- Trois signaux necessaires pour l activation des cellules B :
- cellules rare –> selection clonale et amplification
- les signaux 1 et 2 +3 sont recus a des temsp diff
- les celluels T regulent/controlent la rep B
- T auxiliaire pour les LB (signaux 2 et 3)
- T et B se rencontrent au bord des zones T et B
- si la cellules T auxiliaire activee reoc le peptdCMH presente par le B :
- singal 2 : membranaire : via CD40 (T : CD40L) -> signal de proliferation
- signal 3 : soluble : via le recepteur pour cytoines (T : cytokines) synapse secretoire -> signal variable de differenciation
- Activation des LT helper (auxiliaires)
- fonction ; aider les celluels B a produire des anticoprs protecterus, transmettre l info recu par les DC sur le danger (via cytokine)
- Voies de diff des LB actives
- extrafolliculaire : reponse rapide et transitoire de plasmocytes (basse affinite)
- folliculaire : reponse lente de plasmocytes de haute affinite grace a la maturation d affinite (mutations) aussi generation de cellules B a memoire
- La cytokines donnee par le cellule T auxiliaire definit le switch d isotype
- LPS : peut remplacer signal 2 si le signal 1 (antigene) est repetitif ou tres fort
- Differenciation des cellules en B memoire ou plasmocyte
- cf image
- l isotype de l antiB secrete definit sa distribution et fonction
- La memoire immunologuque : la strategie typique des vaccins
- qdd vous immunizez plusieurs fois (2-3x) :
- switch isotypique renforce de IgM a IgM (ou IgA/E)
- 10-1000x olus d IgG dans le serum apres chq vaccination (reponse memoire)
- 10-1000x affinite plus haute de l IgG (maturation d affinite, hypermutation somatique)
- But de la majorite des vaccins (plasmocytes avec 1/2 vie longue et celluels B a memoire0
- vaccin contre le virus de la variole (small pox) :
- reponse pour la mort de 300 a 500 milions de personnes dans le 20eme siecle
- la variole est la seule maldie infectieuse complement eradq de la terre grace au vaccin
- qdd vous immunizez plusieurs fois (2-3x) :

- La reponse immunitaire
- La phase effectrice et la memoire
- la 3eme phase de la reponse : le cercle se ferme
- 3eme phase :
- migration des cellules T effectruces (CTL, partie des celluels T auxiliaire) au site d inflammation
- elimination du daner (pathogen, cancer)
- cellules memoires et plasmocytes qui suivent (les autres effecteurs meurent)
- permettre la repartition complete des tissus
- 3eme phase :
- les L effecteurs : doivent trouver le T enflamme :
- du au changement de molecules de migration
- sortent par les capillaires enflammes dans le T problemq (a travers a barriere endotheliale)
- les L effecterus : sortent du ganglion via la lymphe efferente pour retourner dans la circulation sanguine (importance du code postal)
- du au changement de molecules de migration
- Activation des LT killers (cytotoxiques)
- fonction : elimination de cellules infectees ou cancereuses
- CTL : tuent selectivement les celluels dangeureuses
- cf image
- Les effecteur T auxiliaire : leur fonction depend de la cytokine relachee
- les interaction aveec les LB se passent au nv du ganglion, plaque de peyer ou de la rate
- la plupart des plasmocytes avec une 1/2 vie longue : migrent dans la moelle osseuse ou les muqueuses
- les antiB sont secretes en ++ grd qntt par les plasmocytes (secretion de milles, dix milles Ig par seconde par cell
- l IgG se distribue souvent systemqmt via le sang et participe activement a l elimination des pathg (aussi via FcR des cellules innees)
- La mémoire immunologique
- Propriétés :
- Cellules spécifiques en plus grand nombre
- Longue durée de vie
- Petite réactivation suffisante pour proliférer et devenir effectrices, prêtes plus rapidement que les cellules naïves
- Cellule T mémoire : même récepteur.
- Cellule B mémoire : récepteur typiquement muté, de haute affinité, changé pour l’isotype (IgG/A/E)
- Plasmocytes :
- Typiquement pas considéré comme cellule mémoire…(effecteur)
- Anticorps sécrétés pendant des mois sont une mémoire
- Soluble qui est très efficace pour prévenir une infection
- Propriétés :
- Différence de la réponse : quantitative, qualitative et cinétique. Unique pour les LT et B.
