HFD 6: DNA-replicatie en Herstel

Question 1

Replicatievorken

Answer 1

Worden gevormd wanneer nucleotieden uit elkaar worden getrokken

Question 2

Initiator proteins

Answer 2

Eiwitten die vanaf het startcodon de twee strengen uit elkaar halen

Question 3

Okazaki fragmenten

Answer 3

Onstaan op de lagging strand (3’ naar 5’) doordat DNA polymerase maar een richting op kan gaan

Question 4

Lagging strand

Answer 4

DNA-streng dat discontinu gevormd wordt

Question 5

Leading strand

Answer 5

DNA-streng die continu gevormd wordt

Question 6

Proofreading

Answer 6

Kan fouten herstellen die niet opgepakt zijn door DNA-polymerase. Proofreading bevindt zich ook op het DNA-polymerase, maar op een ander molecuul. Dit is de reden waarom DNA-polymerase maar een kant op kan werken.

Question 7

Primase

Answer 7

Een RNA polymerase; fungeert als het startpunt (primer) zodat het DNA polymerase kan starten. Op de leading strand is dit eenmaal nodig, maar op de lagging strand wordt dit telkens herhaald

Question 8

Repair polymerase

Answer 8

Vervangt het RNA die geplaatst is door primase met DNA

Question 9

DNA ligase

Answer 9

Enzym die de fragmenten weer aan elkaar bindt

Question 10

DNA helicases

Answer 10

Bevindt zich voor het DNA polymerase; maakt gebruik van ATP hydrolyse om de dubbele helix uit elkaar te duwen

Question 11

DNA topoisomerases

Answer 11

Zorgen ervoor dat de spanning van de helix afvalt als deze uit elkaar getrokken wordt, zodat het mogelijk blijft om deze te ontwinden

Question 12

Sliding clamp protein

Answer 12

Zorgt ervoor dat DNA polymerase aan het DNA template bevestigd blijft

Question 13

Clamp loader

Answer 13

Eiwit die energie opwerkt voor de sliding clamp protein; hydrolyseert ATP voor iedere keer dat DNA polymerase voor het eerst ergens bevestigd moet worden

Question 14

Telomeren

Answer 14

Repetitieve reeksen van extra nucleotiden aan het einde van de DNA streng

Question 15

Telomerase

Answer 15

Een enzym dat meerdere kopieën van deze zelfde reeksten nucleotide aan het einde bij kan maken; baseparen kunnen zo verloren gaan, maar worden de tekorten door telomerase weer aangevuld; markeert ook het einde van een DNA streng en fungeert het als controle mechanisme door onderscheid te maken tussen de natuurlijke einden en breuken in het DNA.

Question 16

Algemeen DNA herstel

Answer 16

1. Het beschadigde DNA wordt herkend en de foute nucleases worden verwijderd door een van de herstelmechanismen;
2. Herstel van DNA polymerase bindt aan het 3’ eiwit en vult het gat wat ontstaan is op basis van informatie uit de andere, nog intacte, streng;
3. DNA ligase maakt de breuk in de suiker-fosfaat backbone weer dicht.

Question 17

DNA mismatch repair systeem

Answer 17

Eiwitten die een verkeerd geplaatst eiwit verwijderen en het DNA opnieuw maakt. Deze eiwittenherkennen welke streng nieuw gevormd is, omdat deze nog niet gemethyleerd is, en zullen alleen deze nieuwe streng bewerken.

Question 18

Double-strand repair

Answer 18

Vindt plaats wanneer beide strengen van het DNA beschadigd zijn, aangezien reparatie dan niet meer gerepareerd kan worden op basis van de intacte streng. Beschadigingen in beide strengen kunnen ontstaan door bestraling, fouten in de replicatievork en chemische schade. Er zijn twee strategieën om dit te repareren: nonhomologous end joining en homologe recombinatie.

Question 19

Nonhomologous end joining

Answer 19

Gespecialiseerde enzymen die snel twee losse uiteinden weer aan elkaar plakken voordat ze uit elkaar gedreven zijn. Snel, maar niet foutloos; vaak raken nucleotiden verloren op de plaats waar ze weer aan elkaar geplakt worden.

Question 20

Homologe recombinatie

Answer 20

Als het DNA nog pas gerepliceerd is, is er nog een andere dubbele helix aanwezig die gekopieerd kan worden middels het enzym Rad52.
1. Het defecte deel wordt vergeleken met het correcte DNA en als de juiste plaats gevonden is kopieert DNA polymerase precies het deel wat kwijt is, met de andere DNA helix als template;
2. Dit deel wordt vervolgens gebonden aan de gebroken DNA streng;
Dit systeem is zeer effectief en nagenoeg foutloos.

Question 21

Mutatie

Answer 21

Permanente genetische verandering

Question 22

Germline mutatie

Answer 22

Mutatie die aanwezig is in het DNA van de ouders en dus in de stamcellen

Question 23

Somatische mutatie

Answer 23

Een mutatie dat zich plaats vindt in een cel tijdens het leven van het individu; niet van ouders geërfd.