Heredabilidad perdida de las enfermedades complejas Flashcards
Heredabilidad perdida
Es un suceso en el que un solo gen o variación genética encontrada en análisis de asociación no puede explicar de forma fehaciente la heredabilidad de una enfermedad. (un solo gen no determina una enfermedad)
La enfermedad puede depender del efecto combinado de los genes, más que de ellos en su forma individual.
¿En qué ayuda el GWAS a la heredabilidad perdida?
El GWAS analiza millones de polimorfismos, y representan una nueva y poderosa herramienta para investigar la arquitectura genética de enfermedades complejas.
Deficiencias de GWAS
*Carece de información de variantes estructurales.
*Carece de información de interacción gen con gen, ni gen-proteína, ni gen-ambiente.
Problema con GWAS en diabetes
Es mucho más complejas y existen muchas variantes dentro de la enfermedad, por eso es difícil detectar la heredabilidad o todos los polimorfismos con GWAS.
Explicaciones para heredabilidad perdida
*Número mucho mayor de variantes de menor efecto aún por encontrar; variantes más raras presente en el 5% o más de la población.
*Variantes estructurales mal capturadas por arreglos existentes.
*Baja potencia para detectar interacción gen-gen.
*Inadecuada cuantificación del entorno compartido entre parientes.
Variantes en las que se centra GWAS
Variantes que se encuentran en más del 1% de la población y hasta el 5%, más que eso ya se relaciona con un rasgo común y más raras tampoco se detectan. (revisar tablita del apunte pág 26)
Perspectivas para mejorar los estudios GWAS
*Aumentar la disponibilidad de datos de estudios GWAS.
*Aumentar el número de muestra, especialmente en condiciones poco frecuentes.
*Aumentar muestra de sujetos de diversas nacionalidades.
*Mejorar las estrategias de elección de fenotipos.
*Investigar más sobre interacciones gen-gen y procesos de epistasis.
*Determinar CNV y CNP, así como su asociación con el fenotipo.
Objetivo de GWAS
es mejorar comprensión de la fisiología humana y la etiología de la enfermedad para que se utilicen medios más eficaces de diagnóstico, tratamiento y prevención de enfermedades complejas.