Genetique 11A: déficience intellectuelle Flashcards
la déficience intellectuelle est caractérisée par un fonctionnement intellectuel ??? et par l’existence concomitante de limitations dans ??? sphères suivantes: communication, autonomie, habiletés sociales, santé et sécurité, utilisation des ressources sociales, apprentissage scolaire, loisirs et travail
sous la normale
2 ou plus
pour être considéré comme de la déficience intellectuelle, le tout doit survenir à quel âge
avant 18 ans
prévalence de la déficience intellectuelle:
- prédite sur base statistique
- observée dans pays d’occident
2,3%
1-3%
vrai ou faux, la déficience intellectuelle est le problème socio-économique le plus important dans les pays d’occident
vrai
(coûts les plus importants pour le diagnostic + coût de la vie estimé à 1M par individu en Europe/Amérique du Nord)
décrit les causes de DI
20% facteurs environnementaux
50% causes génétiques identifiées
reste = probablement causés par facteurs génétiques
est-ce que retard global de développement et DI sont synonymes
non
ce ne sont pas tous les enfants avec un retard de développement qui développeront une DI
retard global de développement est le terme utilisé plus tôt dans la vie quand on ne sait pas encore s’il s’agit d’une DI
compare le IQ d’une déficience légère, modérée ou sévère
légère = 55-70
modérée = 40-55
sévère = plus petit que 40
qu’est-ce qui différencie la forme syndromique ou la forme non-syndromique d’une DI
syndromique = présence d’anomalies structurales ou métaboliques additionnelles
non-syndromique = aucune anomalie additionnelle
décrit l’overlap qui existe entre la DI, l’épilepsie et l’autisme
70% des autistes présentent une DI
20% des autistes sont épilepsiques
20% des sujets avec DI sont épileptiques
quelle est la corrélation entre épilepsie et DI
plus la DI est sévère, plus le risque d’épilepsie est grand
compare les 3 modèles génétiques des désordres du neuro-développement
mendélien = mutation de novo sur un individu ayant un effet important
oligogénétique = mutations de novo des 2 côtés de la parenté de l’individu atteint qui présente 2 mutations rares à effet modéré
polygogénique = multitude de variation communes ancestrales ayant un petit effet qui sont transmises à l’individu affecté
vrai ou faux, les conditions fréquentes comme la DI ou l’epilepsie ont des cibles mutationnelles très restraintes (soit 1 ou 2 gènes)
faux, elles ont des cibles mutationnelles très grandes (comme 1000+ pour la DI) ce qui explique la fréquence dans la population même si chaque mutation est rare
de quelles manières sont identifiables les mutations affectant le nombre de copies (CNV)
ces mutations sont elles plus souvent transmises ou de novo
5% identifiables au caryotype
14% identifiables par hybridation génomique sur micropuces
majorité des cas = de novo mais pas exclusivement
que peut-on dire par rapport aux mutations ponctuelles liées au chromosome X par rapport à la DI
+ de 100 gènes sur chromosome X associés à DI
10% des cas de DI chez les garçons sont expliqués ainsi
ex.: syndrome du X fragile = cause monogénique la plus fréquente de DI
les mutations ponctuelles autosomiques liées à la DI sont elles plutôt récessives ou dominantes
les deux
on estime qu’il y a plus de ??? gènes associés à la DI dont la grande majorité sont des gènes ???
800
autosomiques
le génome diploïde humain contient environ ??? nucléotides ce qui correspond à environ ??? mutations de novo
les régions codantes (exome) représentent environ ?% du génome et donc chaque humain a ? mutation de novo dans son exome
6 milliards
60
2%
1,2
que peut-on dire sur le taux de mutation des sites CpG
il est 10 fois plus grand
décrit les taux de mutations par génération:
- variations de structure (CNV de grande taille)
- variations de structure (CNV petite ou moyenne taille)
- insertions et délétions de 1 à 20 nucléotides
- SNV (variations non-sens/faux sens)
1-2%
16%
3 par individu environ
60-70 par individu
vrai ou faux, tous les SNV sont des SNP
faux, tous les SNP sont des SNV mais le contraire n’est pas vrai
le séquencage de nouvelle génération se fait en ? jour(s) et coute ? $ CAN
1
1500
vrai ou faux, le séquencage de l’exome permet de détecter virtuellement toutes les mutations
faux, le séquencage du génome le permet
l’exome ne représente que 2% du génome même si il représente environ 85% des mutations associées aux maladies
présentemment, quelle est la faiblesse de l’exploration génomique pour le génome entier
expansion de triplets
comment peut-on identifier des mutations de novo par l’étude de cas unique
séquencage en trio pour identifier les mutations de novo (maman, papa et cas-index)
si absents dans maman et papa = mutation de novo
qu’a pu nous révéler le séquencage de l’exome en trio pour l’exploration des enfants avec DI sévère inexpliquée
excès de mutations de novo (moyenne de 2 par cas-index plutôt que 1)
excès de mutations délétères de novo (missense)
une fraction importante des cas de DI serait causée par des ??? touchant ??? gène(s)
mutations de novo
1 seul
