genetikk

Question 1

Definer lokus

Answer 1

Et sted på et kromosom hvor et gen ligger

Question 2

Definer allele

Answer 2

Allele er en variant av et gen, autosomale kromosomer består at to alleler, ett fra mor og ett fra far

Question 3

Definer polymorfisme

Answer 3

Polymorfisme er en genetisk variant som er bevart i populasjonen, har en allelfrekvens på over 1%

Question 4

Hva er en nonsense mutasjon?

Answer 4

En punktmutasjon som fører til at kodon for aminosyre erstattes med kodon for stopp.

Question 5

Hva er en splice-site mutasjon?

Answer 5

Når mutasjonen som rammer spleisesetet i overgangen mellom eksoner og introner og fører til “ekson-skipping”.

Question 6

Hva er forskjellen på diagnostisk, presymptomatisk og prediktiv DNA-analyse?

Answer 6

Diagnostisk analyse: For å identifisere genetisk sykdom hos et individ med symptomer
Presymptomatisk analyse: Genetisk test av en person med familiehistorie med høy-penetrant sykdom, men ingen symptomer ved testing
Prediktiv analyse: Genetisk test av en asymptomatisk person for å si noe om fremtidsrisiko for lav-penetrant sykdom

Question 7

Ved autosomal recessiv arvegang, hva er risiko for at friske søsken av affisert person er bærer?

Answer 7

67% risiko for å være bærer

Question 8

Definer penetrans og ekspressivitet

Answer 8

Penetrans: Andelen av individer som har mutasjonen som får kliniske symptomer

Ekspressivitet: Variasjon i fenotype blant individer som bærer samme genotype. Ses blant søsken - ulike debutalder og progresjon.

Question 9

Hva er atypisk og ikke-mendelsk arvegang?

Answer 9

Atypisk mendelsk arvegang er eks. triplettsykdommer med dynamiske mutasjoner der sykdom skyldes varierende antall mutasjoner av tre nukleotider eller genomisk imprinting hvor ekskresjonen til et gen er forskjellig avhengig av om genet er nedarvet fra mor eller far.
Ikke-mendelsk arvegang er mitokondriell arvegang som nedarves fra mor

Question 10

Hvilke kromosomer er akrosentriske?

Answer 10

Kromosom 13, 14, 15, 21 og 22

Question 11

Hva er en robersonsk translokasjon?

Answer 11

Translokasjon mellom to akrosentriske kromosomer (13,14,15,21,22) hvor den lille, korte p-armen forsvinner på bekke kromosomene og de to lange armene slår seg sammen. Er da kliniHsk frisk, men har bare 45 kromosomer

Question 12

Hvilke trisomier er forenelig med liv?

Answer 12

Trisomi 13, 18 og 21

Question 13

Hva er en standard G-båndsanalyse/karyotyping?

Answer 13

Analyse som krever levende celler. Dyrker cellene, arresterer de i metafase og farger slik at båndstrukturene kommer frem. Tar 2-3 uker og resultatet er en grafisk presentasjon av størrelse og antall kromosomer. Egner seg ved mistanke om kromosom-mutasjoner

Question 14

Hva er forskjellen på arvelig og familiær kreft?

Answer 14

Arvelig kreft er opphopning av kreft i en familie som følge av nedarvede mutasjoner.

Familiær kreft er opphopning av kreft i en familie hvor man ikke klarer å påvise genetisk årsak, men det kan skyldes en kombinasjon av gener, livsstil og miljø.

Question 15

Mutasjon i hvilket type gen er vanligste årsak til kreft?

Answer 15

Tumor suppressor gener; BRCA1, BRCA2, TP53, APC
Mutasjon i begge allelene for et tumor suppressor gen fører til at tap av funksjon slik at proteinet ikke lengre klarer å bremse cellesyklus

Question 16

Hva er Knudson’s two hit hypotese for arvelig kreft?

Answer 16

Et den ene mutasjonen i ett av allelene for et tumor suppressor gen er nedarvet, dvs. tilstede i en kjønnscelle. Den andre mutasjonen blir ervervet i somatisk celle.

Question 17

Hva er de to vanligste krefttypene som oppstår ved Lynch syndrom?

Answer 17

Kolorektalkreft og endometriekreft

Question 18

Hvilken mutasjon forårsaker familiær adenomatøs polypose?

Answer 18

Mutasjoner i APC-genet, 20% av mutasjonene oppstår de novo, autosomal dominant arvegang

Question 19

Hva er de to vanligste dystrofinopatiene?

Answer 19

Duchenne og Beckers syndrom. Begge skyldes feil/mangel av proteinet dystrofin, som beskytter muskelcellene ved kontraksjon. Muskelen blir skadet ved hver kontraksjon. X-bundet recessiv arvegang gjør at kun gutter rammes.

Question 20

Hva er den vanligste muskeldystrofien blant voksne?

Answer 20

Dystrofia myotonica

Question 21

Hvilken arvegang er det ved SMA (spinal muskelatrofi)?

Answer 21

Autosomal recessiv, må mangle begge kopier av SMN1 (“survival motor neuron 1”)

Question 22

Hva er et kriterie for å få behandling med Spinraza dersom man har SMA?

Answer 22

2 stk. kopier av SMN2-genet

Question 23

Nevn noen tilstander som skyldes såkalte dynamiske mutasjoner (ikke-mendelsk arvegang)

Answer 23

Fragilt X-syndrom: Kan gi ulike sykdommer avhengig av antall repetisjoner
Huntington Chorea

Question 24

Hva er de to klassiske eksemplene på genomisk imprinting?

Answer 24

Angelmann syndrom og Prader Willi syndrom - begge tilstander skyldes endringer på samme region av kromosom 15 - Angelmann mangler maternell kopi og Prader Willi mangler paternell kopi.

Question 25

Hva er SNPs?

Answer 25

Single nucleotide polymorphisms er den enkleste polymorfismen, nemlig en punktmutasjon. 99,999% SNPs er nøytrale, men dersom de befinner seg i kodende områder av et gen kan de få konsekvenser.

Question 26

Hva går MLPA ut på og når benyttes denne DNA-analysen?

Answer 26

Lager primere for eksoner og ser om det er ekstra/fravær. Egner seg til å detektere store og små duplikasjoner eller delesjon, eks. Duchenne muskeldystrofi og Charcot Marie tooth

Question 27

Angi to indikasjoner på QF-PCR

Answer 27

QF-PCR er en DNA-basert hurtigtest for aneuploidi. Amplifiserer DNA i spesifikke regioner på kromosom 13, 18, 21, X og Y.
Indikasjoner:
- Prenatal diagnostikk
- Utredning av lærevansker

Question 28

Nevn 3 indikasjoner på G-bånds analyse

Answer 28

• Infertilitet eller >3 spontanaborter
• Mistenkt strukturelt kromosomavvik
• Mistenkt anormalt kjønnskromosom (manglende vekst, pubertet)

Question 29

Hva menes med kopitallvariasjon og hvilken analyse brukes mest for å vurdere kopitall?

Answer 29

Kopitallsvariasjon betyr arvematerialet vårt har ekstra kopier eller mangler kopier av et gen. Kopitallsvariasjon oppstår ved delesjoner eller duplikasjoner. Kopitallsvariasjon er en naturlig del av evolusjon og er som regel ufarlig, men kan noen ganger føre til sykdom. Tilstander assosiert med kopitallsvarianter er Crohns, schizofreni og autisme.
SNP-array er den vanligste metoden for å undersøke mengde DNA - altså kopitallet.

Question 30

Hva er SNP-array?

Answer 30

DNA-analyse som brukes til å analysere mengde DNA (kopitall). «Dipp» i signalet tyder på delesjon, «hopp» i signalet tyder på duplikasjon.

Question 31

Arvegang ved Lynch syndrom?

Answer 31

Autosomal dominant arv, men risiko for kreft avhenger av alder, type genmutasjon, kjønn

Question 32

Lynch syndrom skyldes mutasjoner i hvilke gener?

Answer 32

Mismatch repair gener. Tap av MMR-aktivitet fører til feil under replikasjon, særlig i repeterende sekvenser. Dersom antallet repetisjoner i tumor varierer fra antall repetisjoner i de andre normale cellene i et individ refereres dette til som instabilitet, -derav navnet mikrosatellitt instabilitet. Feil i repeterende sekvenser, MSI, forekommer hos majoriteten av LS-kreft.

Question 33

Hvilket kreftsyndrom gir tilnærmet 100% risiko for kolorektalkreft ved 50 års alder?

Answer 33

FAP - familiær adenomatøs polypose. Ofte total kolektomi eller proktolektomi i tenårene

Question 34

Hva er to hovedgrupper av arvelige nevromuskulær sykdommer?

Answer 34

1) Muskeldystrofier: Økende svakhet og degenerasjon av skjelettmuskel
2) Nevropatier: Påvirker nervebanene (aksonet, myelin)

Question 35

Hva er fragilt X syndrom?

Answer 35

Fagilt X syndrom skyldes en dynamisk mutasjon i FMR1-genet. Er den vanligste formen for psykisk utviklingshemming og autisme.

Question 36

Hva er indikasjoner på cordocentese/navlesnor blodprøve?

Answer 36

• Mistanke om immunisering

- Spørsmål om mosaisisme i fostervannsprøve

Question 37

Hva er risiko for spontanabort ved morkake- og fostervannsprøve?

Answer 37

Opplyser om risiko på 0,5%, er sannsynligvis lavere

Question 38

Hva er Charcot-marie Tooth?

Answer 38

Arvelig perifer nevropati som skyldes skade på aksonet eller myelin (avhengig av undergruppe). Over 40 mutasjoner kjent for å kunne gi diagnosen.

Question 39

Hva er forskjellen på prenatal screening og diagnose?

Answer 39

Screening: selekterte gravide, lav sannsynlighet for avvik, risikofrie metoder
Diagnose: gravide med kjent risiko, høy sannsynlighet for avvik, alvorlige tilstander, lavere terskel for tilleggsrisiko

Question 40

Hva er den viktigste årsaken til falsk positiv NIPT?

Answer 40

Få, men viktige.
Viktigste årsak er biologiske forhold, nemlig mosaisisme i placenta
Andre årsaker er ikke-erkjent maternelt kromosomavvik, maternell neoplasi/kreft

Question 41

Hvilke genetiske tester vil du bestille av et nyfødt barn du tror har downs syndrom

Answer 41

• QF-PCR hurtigtest
• Full karyotyping på en blodprøve for å detektere om det er forårsaket av en translokasjon, ett helt ekstra kromosom eller om det er mosaisisme. Av blodprøven vil ofte 20-24 celler undersøkes – dersom noen ikke har trisomi 21 settes diagnosen mosaisisme

Question 42

Nevn tre årsaker til Downs syndrom

Answer 42

• Trisomi 21 utgjør 95% av tilfellene
• Robersonsk translokasjon utgjør 3-4% av tilfellene
• Resiprok translokasjon hos en av foreldrene som involverer bit på 21q
• Mosaikk-mønstre