Genetics 1.2: DNA condensation

Question 1

What is the 1st level of DNA condensation? What is key here?

Answer 1

First level is histone octamers

Octamer is key in order to take a negatively charged chromosome, neutralize it and thus condense it

Between 2 nucleosomes there is some free DNA called DNA LINKER (internucléosomique)

This compacts the DNA by 10 times!

Question 2

Deuxième niveau of condensation.
What it is called and what happens

Answer 2

Le Solénoïde

histones H1 s’associent à l’ADN internucléosomique (LINKER DNA)

Compact to 60 times!

Question 3

Les Boucles, which level of condensation and what is key.

Answer 3

Troisième niveau: Les Boucles

Taux de compaction: 300 fois

On the turns of the boucles we have decondensed DNA that is accesible -> noyau interphasique

Question 4

What are MARs (Matrix attached regions)

Answer 4

Protéines that connect séquences d’ADN spécifiques et qui se lient à la matrice nucléaire en formant des boucles

This is what allows for certain genes (the outter boucles) to be accesible

Question 5

Quatrième niveau of condensatio. What is the name and what happens?

Answer 5

Quatrième niveau: Le Chromosome

NEEED A SCAFOLD

chromatine décondensée s’enroule en spires pour former des chromatides

Taux de compaction: 3 000 fois (prophase)
10 000 fois (métaphase)

Question 6

Euchromatine vs Hétérochromatine

Answer 6

Euchromatine: Chromatine contenant les gènes. Forme
les bandes R (bandes claires; active) et les bandes G (bandes
foncées; less active/inactive).

• Can be Active or Inactive based on whether the gene is actively transcribed. gènes sont activés à des moments spécifiques durant le développement ou dans certains tissus seulement (exam).
• Gènes activement transcrits seraient répliqués earlier in the cycle cellulaire et ils se
  retrouvent en majorité dans l’euchromatine des bandes R. They have priority.
• gènes inactifs du génome seraient répliqués plus tard

Hétérochromatine: Chromatine très condensée ne
contenant pas ou très peu de gènes. Example the centromere

Question 7

Bandes R vs Bandes G

Answer 7

bandes R (pâles) -> euchromatine active, riches en gènes
bandes G (foncées) -> euchromatine inactive, moins riches en gènes

bande R genes have priority in replication -> gènes activement transcrits

boucles des bandes G seraient attachées de façon plus compacte (condense)
boucles des bandes R seraient plus relâchées (loose)

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