Flashcards

Question 1

תא פרוקריוטי

Answer 1

תא שאין בו אברונים וגרעין

Question 2

תא אאוקריוטי

Answer 2

תא שיש בו אברונים וגרעין

Question 3

קשר פוספודיאסטרי

Answer 3

קשר בין זרחן לשלושה חמצנים בקשר רגיל, ולחמצן נוסף בקשר כפול

Question 4

An amphiphile (a.k.a. amphipath)
מולקולה אמפיפטטית/אמפיפילית

Answer 4

מולקולות שיש להן צד אחד שאוהב מים (מקוטב יותר) וצד אחר ששונא מים

Question 5

הממברנה

Answer 5

בנויה משתי שכבות של שומנים הקשורים זה לזה בקשרי מימן ובכוחות אלקטרוסטטים
השומנים הם מולקולות אמפיפטטיות ויש להן צד אחד שאוהב מים הראש (פונה כלפי חוץ הממברנה) וצד אחר ששונא מים הזנב (פונה אל תוך הממברנה)
בתוך הממברנה משובצים חלבונים שונים

Question 6

חלבון

Answer 6

פוליפפטיד
מולקולה גדולה של כמה פפטידים (חומצות אמינו) המחוברות יחדיו בקשר פפטידי, כאשר ההבדל בין חומצה אמיני אחת לשניה תלויה ברכיב מסוים שנקרא R שהוא זה שקובע את התכונות שלה.
כל החלבונים בנויים מחמצן, פחמן, חנקן ומימן

Question 7

פפטיד

Answer 7

כמה חומצות אמינו מחוברות בקשר פפטידי

Question 8

קשר פפטידי

Answer 8

קשר בין הצד האמיני - חנקן עם 2 מימנים (NH2)
לצד הקרבוקסלי - פחמן עם 2 חמצנים (CO2)
כאשר נוצר הקשר הפפטידי, נפלטת מולקולת מים

Question 9

חומצה אמינית

Answer 9

מולקולה הבנויה מחמצן, פחמן, חנקן ומימן ורכיב R שמשפיע על התכונות שלה.
חומצה אמינית היא אבן הבניין של החלבון
ישנן 20 חומצות אמינו המשמשות לבניית החלבונים

Question 10

מבנה ראשוני של החלבון

Answer 10

הסדר של חומצות האמינו השונות שנקבע ע”י הקוד הגנטי

Question 11

מבנה שניוני של החלבון

Answer 11

הסדר הדו מימדי של החלבון - סיבוב או קיפול של המבנה הראשוני
ישנן 2 דרכי עיקריות לסידור:
* BETA SHEETS
* ALPHA HELIX

Question 12

מבנה שלישוני של החלבון

Answer 12

הסדר התלת מידי של החלבון (של המבנים השניונים)
כאשר החלבון נמצא במבנה זה הוא כבר יכול לתפקד
קשרי סולפט או קשרים הידרופוביים (המבנה מתקפל ככה שקבוצות הידרופוביות יהיו רחוקות מהסביבה המימית)

Question 13

מבנה רביעוני של החלבון

Answer 13

קומפלקס של מספר חלבונים ביחד היוצרים תפקיד מסוים - יחידה תפקודית

להוסיף לגבי זה שלא תמיד יש מבנה רבעוני

Question 14

ALPHA HELIX

Answer 14

שרשת מסובבת של חומצות - כל חומצה אמינית נקשרת עם המימן של החומצה האמינו שנמצאת 4 מקומות אחריה בסבב
קשרי מימן

Question 15

BETA SHEETS

Answer 15

סידור בצורה מקבילה של חומצות האמינו
יווצרו משטחים שכוחות הפועלים עליהם יהיו קשרי מימן

Question 16

ליפידים

Answer 16

שם כללי לחומרים פחמניים קטנים עם קצה פולרי

Question 17

חומצת שומן

Answer 17

חומצה המסתיימת בקצה קרבוקסלי (פחמן עם 2 חמצנים)
היחידה הבסיסית היוצרת שומן
חומצות שומן יכולות להיות רוויות - בכל מקום בסידור שיכול להיות מימן (H) יש, או לא רוויות
משתמשים בהן לשם הפקת אנרגיה או בניית מבנים כמו הממברנה

Question 18

גליצרול

Answer 18

מולקולה מאחרת עם 3 קצוות OH
כל קצה כזה יכול להקשר לשייר אחר

Question 19

קשר אסטרי

Answer 19

פחמן שנקשר בקשר כפול לחמצן ובקשר רגיל לחמצן נוסף

Question 20

טריגליצרידים

Answer 20

גליצרול הקשור לשלוש חומצות שומן

Question 21

פוספוליפידים

Answer 21

גליצרול הקשור לשתי חומצות שומן ולקבוצה זרחנית (קוטבית)
בגלל שיש קצה שומני הידרופובי וקצה זרחתי הידרופילי המולקולה היא אמפיפטית

Question 22

מיצלה, שכבות

Answer 22

מבנים שנוצרים באופן ספונטני כאשר מולקולות אמפיפטיות מוכנסות לנוזל

Question 23

הידרוליזה

Answer 23

פירוק באמצעות מים
מים נכנסים פנימה
להוסיף!

Question 24

קבוצה אמינית

Answer 24

קבוצה בסיסית
מקבל H+
מטען חיובי

Question 25

קבוצת האלכוהול

Answer 25

בעלת פולריות שמקנה מסיסות במים וטמפרטורת רתיחה יותר גבוהה.

Question 26

קבוצת האתר

Answer 26

תכונות:
שימש בעבר כחומר הרדמה, נדיף מאוד.

נוצר ע”י:
תגובה של שני מולקולות אלכוהול

Question 27

קבוצת האלדהיד

Answer 27

חמצון של אתנול יתן אלדהיד.
פורם אלדהיד (משמר גופות - מעכב פעילות חלבונים), הוא אלדהיד עם מימן בשתי קבוצות ה-R.
אלדהיד עם קבוצת מתיל בצד אחד ומימן בצד השני נקרא אצטיל, והוא האלדהיד השני הפשוט ביותר.

Question 28

קבוצת הקטון

Answer 28

מתקבל מחמצון של אלכוהול שניוני.

Question 29

מהו די מתיל קטון?

Answer 29

אצטון.

Question 30

הקבוצה הקרבוקסילית

Answer 30

ניתן ליצור ע”י חימצון של אלדהיד - למשל אצט אלדהיד. קבוצה זו מקנה פולריות שמגדילה את המסיסות ואת טמ”פ הרתיחה.
חשוב לזכור:
כל מולקולה שמכילה קבוצה קרבוקסילית היא חומצה חלשה.

Question 31

חומצה

Answer 31

מוגדרת חומר המסוגל לשחרר פרוטון (H+).

Question 32

בסיס

Answer 32

מוגדר חומר המסוגל לקבל פרוטון (H+).

Question 33

כיצד חומצה מתפרקת במים?

Answer 33

חומצה מתפרקת במים ע”י מסירת המימן שבה למולקולות המים, כך שמתקבלים יונים שליליים של אותה חומצה ויוני הידרוניום (H3O+).

Question 34

חומצה חזקה:

Answer 34

חומצה המתפרקת באופן חזק ומהיר במים.

Question 35

חומצה חלשה:

Answer 35

חומצה בה רק חלק קטן מהמולקולה משחרר את הפרוטון.

Question 36

משוואת שווי המשקל

Answer 36

כאשר תגובת הפירוק של החומצה מגיעה למצב של שיווי משקל:
• החומצה תפסיק להתפרק וליצור יוני הידרוניום.
• אם אחוז החומצה בתמיסה יהיה גדול מאחוז היונים שנוצרו ממנה, אז החומצה מוגדרת כחומצה חלשה, ולהיפך.

Question 37

Kw

Answer 37

מכפלת הריכוזים של יוני המימן (H+) וההידרוקסיל (OH-) בתמיסות מימיות מהולות הוא גודל קבוע. KW - נקרא קבוע הדיסוציאציה. KW = [H+] * [OH-] = 10-14 [mole2 / liter2]

Question 38

רמת חומציות ורמת בסיסיות

Answer 38

רמת החומציות – pH מוגדרת כ: pH = -log[H+]
רמת בסיסיות – pOH מוגדרת כ: pOH = -log[OH-]

Question 39

חוזק חומצה

Answer 39

כלומר, ככל שריכוז יוני ההידרוניום גבוה כך החומצה יותר חזקה. ומכך נובע שככל שערך ה-pH יורד כך החומצה יותר חזקה .

Question 40

סקאלת ה-pH

Answer 40

סקלת ה-pH נעה בין 0 ל-14, כאשר 7 מוגדר כ-pH נטרלי בו ריכוז ההידרוניום הוא [M]10-7.

Question 41

דגשים על חומצות

Answer 41

1. בתמיסות חומציות בהן ריכוז יוני המימן הוא יותר מ- 10-7 [M], ה-pH יהיה קטן מ-7, היות והחזקה היא שלילית.
2. בתמיסות בסיסיות בהן ריכוז יוני המימן הוא פחות מ- 10-7 [M], ה-pH יהיה גדול מ-7, היות והחזקה היא שלילית.
3. בתמיסה ניטרלית, כאשר גם חומצה חזקה וגם הבסיס חזק או חומצה חלשה ובסיס חלש ה- pH=7
4. תמיד pH + pOH = 14

Question 42

חומצות חלשות:

Answer 42

חולשתן של החומצות תלוי בבסיס המצומד שלהן. ככל שהבסיס המצומד יותר חזק, כך החומצה יותר חלשה. כלומר בסיס מצומד חזק פירושו, שהוא תופס חזק מאוד את הפרוטון (H+).

המדד להגדרת חולשתה של חומצה הוא קבוע שיווי המשקל של פירוק החומצה:

לכל חומצה יש את ה-Ka, קבוע הפירוק שלה, בתנאים של טמפרטורה ולחץ אטמוספרי.

ככל שה-Ka יותר גדול החומצה פחות חלשה, ה pKa יותר קטן החומצה פחות חלשה.
ככל שה-Ka יותר קטן החומצה יותר חלשה, ה pKa יותר גדול החומצה יותר חלשה.

הגדרת ה- pKa: pKa = -log Ka

Question 43

תגובת סתירה / טיטרציה

Answer 43

הכוונה היא הוספה של בסיס לתמיסה חומצית. לדוגמא:
HCl + NaOH —> H2O + NaCl.
התוצרים של תגובת סתירה הם מים ומלח.
הטיטרציה מתחילה ממצב של שיווי משקל. כאשר נוסיף בסיס לתמיסה חומצית, רמת ה-pH תעלה בעקבות החיבור שבין ה-OH-, ל-H+.

העלייה תימשך רק עד לשלב מסוים, בו העקומה מתיישרת כמעט ואז שוב עולה.
(סה”כ 3 פאזות).

Question 44

3 פאזות של טיטרציה

Answer 44

פאזה 1# ה-OH- נקשר עם ה-H+, נוצרים מים, ורמת ה-pH עולה.

פאזה 2# למרות שנמשיך להוסיף עוד בסיס, רמת ה-pH לא תעלה, והסיבה היא שאנו עוסקים בחומצה חלשה שרוב המולקולות שלה לא מתפרקות באופן ספונטני. ככל שנוסיף בסיס, פחות פרוטונים ימצאו בתמיסה, וריכוזו היחסי של ה-OH- בתמיסה יעלה. ככל שנמשיך להוסיף OH- לתמיסה, זה ייצור לחץ על הבסיס המצומד החזק לשחרר H+, עד לנקודה שבה, על כל מולקולת בסיס שנוסיף, H+ ישתחרר ויחבור ל-OH- ליצירת מים. לכן במצב זה רמת ה-pH לא משתנה. שלב זה יכול להימשך כל עוד יש מאגר של חומצה שיכולה להתפרק.

פאזה 3# כשמאגר החומצה נגמר ונמשיך להכניס OH- רמת ה-pH תתחיל לעלות בשנית.

השלב בו התמיסה לא משנה את רמת ה-pH, נקראת בופר (שלב הפלאטו). תמיסה זו בעצם מוגנת מפני שינויי pH.

Question 45

תמיסת בופר

Answer 45

כל בדיקה ביוכימית שאנו עושים, תתבצע בתמיסת בופר כי אנחנו לא רוצים ששינוי pH ישפיעו על הבדיקה. יותר מזה, כל תגובה ביוכימית בגוף - מתרחשת בסביבה של בופר.
משוואת הנדרסן הסלבך (חישוב ה-pH בכל נקודה בגרף): pH=pKa+log ([A^-])/([AH])

Question 46

נקודת אמצע הטיטרציה

Answer 46

נקודת חצי הטיטרציה:
בנקודת חצי הטיטרציה ריכוז יוני ה-A- שווה לריכוז החומצה שעדיין לא התפרקה (AH)
כלומר ← [AH] = [A-]
ולכן ← log ([A^-])/([AH])=log⁡〖1=0〗
ולכן ← pH=pKa

למעשה, ה- pKa זהו אותו pH שבו חצי ממולקולות החומצה שחררו את הפרוטון (H+).

Question 47

יצירת הבופר:

Answer 47

דרך I: כדי לייצר בופר צריך לחפש את אותה החומצה החלשה שה-pKa שלה קרוב ביותר ל-pH
שבו רוצים לעבוד. בהמשך מתחילים לטטר (לסתור) את החומצה עד לקבלת הבופר.

דרך II: שוב בוחרים את החומצה החלשה בעלת ה-pKa הקרוב ביותר ל-pH הרצוי לעבודה,
ומוסיפים לה את אותו הריכוז של המלח שלה. זוהי הדרך הקלה יותר והמקובלת בכל
העולם.

לדוגמא: חומצה אצטית CH3COOH בעלת pKa – 4.75

בפועל:
נניח שהחומצה האצטית CH3COOH בריכוז 0.1 [M].
וגם המלח שלה CH3COONa בריכוז 0.1 [M].

לכן יוני המלח CH3COO- <– בריכוז 0.1 [M].
וגם החומצה CH3COOH <– בריכוז 0.1 [M].
ה-Na לא משחק תפקיד בתגובה.

לאחר הוספת ה-HCL ה-H+ יתפרק ויתווסף לבסיס המצומד.
לכן ריכוז החומצה יעלה וריכוז הבסיס יופחת.

Question 48

משוואת הפירוק של הבופר

Answer 48

כאשר מוסיפים לבופר חומצה (H+), הפרוטון מתווסף לבסיס המצומד, והמשוואה הולכת שמאלה.
ואילו כאשר מוסיפים בסיס, החומצה מתפרקת והבסיס מתווסף לפרוטון (H+), בנוסף ישנו בסיס מצומד שהתפרק, לכן המשוואה הולכת ימינה.

Question 49

בופרים בגוף:

Answer 49

בגופנו ישנם שני בופרים עיקריים:
• בופר פוספט pH = 7.2
• בופר קרבונט pH = 7.4

Question 50

הומאוסטזיס

Answer 50

הבקרה של הpH ע”י הגוף נקראת הומאוסטזיס.

Question 51

בכלי עם מים, בו קיימת שכבת מים שנוגעת באוויר. מה יווצר בתווך זה:

Answer 51

חד שכבה

Question 52

.מהן פוספטאזות?

Answer 52

אנזימים שתפקידם להסיר קבוצות פוספט למולקולות שונות

Question 53

4 .סמן מהו המשפט הלא נכון ביחס לפונקציות של חלבונים:

Answer 53

ג. אנזימים הופכים תגובה לא ספונטנית )דלתא G חיובי( לתגובה ספונטנית )דלתא G שלישי(

Question 54

4 .סמן מהו המשפט נכון ביחס לפונקציות של חלבונים:

Answer 54

א. משמשים כחומרי תשמורת
ב. יש חלבוני תנועה שנושאים מטען ממקום למקום בתא ונעים על סיבי המיקרוטובולי
ד. חלבונים נשאים מאפשרים העברת מולקולות שומניות בדם

Question 55

נתון הפפטיד Asp-Arg-Glu-Glu-Lys-Val-His-Ala .מה תוכל/י לומר על מטענו החשמלי נטו בתמיסות בעלות pH שונה

Answer 55

ג. ב 5=pH יהיה מטענו 0 ואילו ב 9=pH יהיה מטענו 1-

Question 56

ריכוז יוני H+ בתמיסת בעלת pH=5

Answer 56

א. גדול פי 100מריכוז יוני
+ pH=7 בעל

Question 57

סטודנט שקדן רוצה לבודד חלבון מסוים הקשור לקבוצה סוכרית. כיצד תציע לו לפעול?

Answer 57

ד. בעזרת לקטין הקשור לגרגירים אינרטים, המזהה את הקבוצות הסוכריות

Question 58

03 .איזה מהמשפטים הבאים העוסקים בדיאליזה אינו נכון?

Answer 58

ו. ככל שנבצע יותר החלפות של הבופר, כך תפחת יעילות הדיאליזה

Question 59

03 .איזה מהמשפטים הבאים העוסקים בדיאליזה נכון?

Answer 59

א. ככל שנפח הבופר בו מתבצעת הדיאליזה גדול יותר כך יעילות הדיאליזה טובה יותר
ב. שיטת הדיאליזה יעילה מאוד בהרחקת מלחים ומולקולות קטנות מהתמיסה
ג. ככל שה- MWCO) off-cut weight molecular (של שקית הדיאליזה גדול יותר מידת הניקיון של החלבונים שנשארו
בשקית תהיה טובה יותר
ד. פשטות שיטת הדיאליזה הוא יתרונה הגדול
ה. לצורך דיאליזה יעילה חשוב שהמולקולות אותן רוצים להפריד תהיינה מסיסות בבופר הדיאליזה

Question 60

04 .לריבוזומים שלושה אתרים מרכזיים: אתר A ,אתר P ,אתר E .בחרו את התשובה הנכונה:

Answer 60

א. באתר P תגיע החומצה האמינית הראשונה

Question 61

:Reverse Transcriptase האנזים.

Answer 61

א. משתמש בTemplate של RNA ומקודד למולקולת DNA

Question 62

06 .בחרו במשפט הנכון מבין המשפטים הבאים:

Answer 62

0 .חלבונים יכולים לחצות את הממברנה הדו-שכבתית
3 .חלבונים יכולים לנוע לטרלית בממברנה

Question 63

משפטים שאינם נכונים לגבי חלבונים:

Answer 63

2 .חלבונים אינטגרליים הם חלבונים ממברנליים הפונים לתוך התא אך לא מחוצה לו
4 .חלבונים אינטגרליים הם חלבונים ממברנליים הפונים לחוץ התא אך לא לתוכו

Question 64

בחרו את התשובה הנכונה. בטרם יציאת מולקולות mRNA מהגרעין לציטופלסמה חלים התהליכים הבאים:

Question 65

בחרו את התשובה הנכונה. מעבר מואץ )transport Facilitated:

Answer 65

א. אינו דורש אנרגיה

Question 66

09 .בחרו את התשובה הנכונה:

Answer 66

א. לחומצות שומן רוויות טמפרטורת התכה גבוהה יחסית

Question 67

30 .איזה מהמשפטים הבאים העוסקים בחומצות חלשות אינו נכון?

Answer 67

א. כל מולקולה המכילה קבוצה קרבוקסילית הנה חומצה חלשה אך לא כל חומצה חלשה מכילה קבוצה קרבוקסילית
ב. בחומצה חלשה רק חלק קטן מאוד מהמולקולות משחרר את הפרוטון לתמיסה
ג. לכל חומצה חלשה בסיס מצומד חזק
ד. ככל שה-pKa של חומצה גבוה יותר כך החומצה חלשה יותר
ו. pKa של חומצה הוא ה-pH שבו חצי ממספר המולקולות שחרר את הפרוטון לתמיסה

Question 68

30 .איזה מהמשפטים הבאים העוסקים בחומצות חלשות אינו נכון?

Answer 68

ה. ככל שה-Ka של חומצה גבוה יותר כך החומצה חלשה יותר

Question 69

32 .בחרו את התשובה הנכונה. רצף Delgarno-Shine:

Answer 69

א. הוא GGAGG והוא נמצא 5 ‘לרצף ה-AUG המקודד לחומצה אמינית Formylmethionine

Question 70

34 .בחרו את התשובה הנכונה. proteins Binding TATA נקשרים ל:

Answer 70

רצפי פרומוטור

Question 71

.שני סוכרים אנומרים הם:

Answer 71

ב. סוכרים השונים ביניהם בקונפיגורצית הפחמן האנומרי.