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a23 BIO2162 - BIOCELL > final - cours 6 - CDC > Flashcards

final - cours 6 - CDC Flashcards

1
Q

Vrai ou Faux ?

Il y a des phases distinctes dans le cycle de division cellulaire pour la synthèse d’ADN ( = a) et la séparation des chromosomes (= b)

A

VRAI

a) la phase S
b) mitose

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Q

CDC = a

Interphase = b

A

a) G1 + S + G2 + M

b) G1 + S + G2

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Q

La cellule doit assurer que sa taille à la fin de la phase G2 est …

A

… 2x sa taille au début G1 / fin M

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4
Q

G1=

S =

G2 =

M =

A

G1 = taille de la cellule attient un seuil critique

S = réplication de l’ADN
. synthèse

G2 = cellule doit doubler en taille
. gap

M = cytoplasme et génome dupliqués sont répartis en deux parties égales
. mitose

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5
Q

Le … est le temps nécessaire pour terminer le cycle cellulaire.

A

… temps de génération

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6
Q

Quelles sont les deux façons de déterminer la longueure de chaque phase dans une population de cellules distribuées aléatoirement ?

A

1- Proportion de chaque phase dans une population
. difficile
. mesurer la proportion des cellules dans une certaine phase à n’importe quel moment

2- Cytométrie en flux
. faire passer les cellules une par une devant un laser
. mesurer la fluorescence de l’ADN incoporé

! voir slides 13 - 14 !

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7
Q

Avec une distribution a dans les phases du CDC, la b d’une phase est proportionnelle à sa c.

A

a) aléatoire
b) longueur
c) fraction dans la population

! voir slides 7 à 12 !

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8
Q

Pour des analyses biochimiques, on a souvent besoin de … que l’on fait par :

A

… cultures synchronisées

1- Exploitation de la forme des cellules en culture

2- Trieuse de cellules
. cytométrie en flux
. FACS
= fluorescence activated cell sorter

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9
Q

Comment peut-t-on exploiter la forme des cellules en culture pour déterminer le temps d’une phase ?

A

Cellules en culture ont une forme différente en M :

. fibroblastes ont une conformation ronde en phase M
+ une conformation aplatie en G1 - S - G2

  • Comment compter ?
    . liens c - MEC faibles
    (des sphères)
    . basculer la boite
    = décrochement des cellules en M
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10
Q

Pourquoi les cellules prennent une forme sphérique durant la phase M ?

A

Plus facil de diviser une sphère parfaitement en 2

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11
Q

Vrai ou Faux ?

La cytométrie est meilleur que l’exploitation de la forme.

A

VRAI

! voir slide 12 - 18 !

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12
Q

La division cellulaire chez les cellules animales dépend des a
ex ?

Les cellules se divisent seulement quand les conditions sont b

Les cellules sont capables de recevoir des c, soit sous forme d, soit sous forme de signaux donnés par e

A

a) facteurs externes
ex :
. facteurs de croissances
. dépendance d’ancrage
= nombre de liens c - MEC

b) favorables

c) signaux externes
d) soluble
e) la MEC

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13
Q

Vrai ou Faux ?

L’intégration des signaux externes par les cellules peuvent influencer son choix de commencer un nouveau cycle de division ou non.

A

VRAI

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14
Q

Vrai ou Faux ?

Il y a des facteurs de croissance (GF mitogènes) qui influencent la décision de se diviser dans le sérum (produit par coagulation) mais pas dans le plasma (produit par centrifugation).

A

VRAI

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15
Q

Les cellules en culture poussent en …

À cause de quoi ?

A

monocouche - confluence

à cause de leur dépendance d’ancrage

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16
Q

Comment le cycle de division est déclanchée par le sang ?

A
  1. Coagulation du sang active + libère le PDGF des vésicules des plaquettes
    . facteur de croissance dérivé des plaquettes
  2. PDGF active un RTK
    . pour stimuler la division des cellules entourant les vaisseaux
  3. RTK active Ras
  4. Ras active cascade MAPK
  5. MAPK active UN FT qui cible le gène myc qui produit le FT myc
  6. Myc abouti par et donc la production du FT E2F
  7. E2F cible les gènes encodant les protéines nécessaires pour entrer en phase S
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17
Q

Expliquer la dépendance d’ancrage.

A
  • Relation nombre de liens avec la MEC impacte la décision de rentrer en phase S ou non
    . c - MEC
    = points de contact focaux
  • Cellules aplaties font beaucoup de jonctions c - MEC
  • Sphères (cellules en phase M)
    . très peu de surface de contact avec la MEC
    = moins de chance de renter en phase S
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18
Q

Que sont les deux points de jonctions de la MEC ?

. dépendance d’ancrage

A
  • Intégrines - actine
    = contacts focaux
  • Filaments intermédiaires - desmodomes
    = hémidesmosome

! voir slide 27 !

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19
Q

Les liens avec la a utilisent des intégrines =

Les intégrines ont des conformations b, et ils peuvent être activées par des c qui leur permet ensuite de lier des d.

A

a) matrice extracellulaire
= protéines adaptatrices permettant la liaison avec l’actine

b) actives et inactives
c) liens avec la matrice
d) filaments d’actine

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20
Q

Les points de contact focal =

Ils contiennent des a permettant la MEC d’activer des b

A

extrémités des filaments d’actine liés aux intégrines

a) phosphotyrosines
b) voies de signalisation
= FAK

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21
Q

Définir la FAK.

A

= Focal Adhesion Kinase

. tyrosine kinase
. recrutée aux points de contacts focaux

. s’autophosphoryle

. lie la protéine kinase Src

. est probablement utilisée pour défaire les liens avec la MEC

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22
Q

Comparer la voie de signalisation activée par les mitogènes et les FAK.

A
  • Exactement la même protéine est produite à partir de RAS
    . cellule interprète deux informations différentes en donnant un même résultat.
  • Mitogene (GF-P)
    . active RTK
    . active RAS
    . active cascade MAP
  • Contacts focaux
    . activent FAK
    . active RAS
    . active cascade MAP
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23
Q

Décrire la voie FAK en détail.

A
  1. Contacts focaux activent FAK
  2. FAK a une phosphate sur la tyrosine
  3. Src utilise son domaine SH2 pour lier les tyrosine-p de FAK
  4. Src active un échangeur de nuclétodies guanines
    . comme celui dans la voie de RTK
  5. FAK active RAS
  6. RAS active cascade MAPK
  7. Cascade MAPK aboutit par activer E2F
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24
Q

Vrai ou Faux ?

La croissance des cellules chez un organisme multicellulaire est contrôlée par les signaux extérieurs, soit solubles, soit fournis par la MEC.

A

VRAI

! tout avant est chez les multi-cellulaires !

! tout après est chez les uni-cellulaires !

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25
Q

Des composantes cytoplasmiques régulent l’initiation des a

On va fusionner des cellules de différentes phases et voir b

A

a) Phases M et S

b) quelle phase prédominera dans les hétérocaryons

fusion de deux cellules
= hétérocaryon

! voir slide 36 !

26
Q

Quelle est la 1ère preuve de présence d’un facteur SPF ?

A
  • Fusionner un noyau de la phase S avec un de la phase G1
  • Noyau en G1 saute immédiatement en phase S
    . peut importe s’il est au début / fin de la phase
27
Q

Que sont les limites de SPF ?

A
  • Il est actif seulement avec les cellules G1
    . entrée immédiate en phase S présente uniquement avec la fusion des noyau des phases S - G1
  • SPF est capable d’induire un noyau a répliquer son ADN
    À CONDITION que l’ADN n’a pas encore été repliqué
28
Q

Quelle est la 1ère preuve de présence d’un facteur MPF ?

A
  • G1 commence immé diatement a condensé ses chromosomes
    = embarquer en M
  • G1 cellule très éloingée dans le CDC
29
Q

Est-ce-que le facteur MPF a des limites ?

A

Non

  • Peu importe le stade du CDC après fusion avec un noyau de la phase M
    = passage en stade a chromosomes condensés
  • Effet plus puissant que SPF
30
Q

Vrai ou Faux ?

Il y a un inhibiteur de la formation du MPF présent dans les cellules en phase S.

Expliquer.

A

VRAI

Les fusions G2 / S démontrent qu’il y a un inhibiteur de la formation du MPF présent dans les cellules en phase S.

= noyau en G2 n’entre jamais en phase M si l’autre noyau est en phase S.

  • Quelque chose inhibe l’activation de MPF actif
    . jusqu’à que la cellule en phase S fini totalement la replication de son ADN
31
Q

Dans les études du cycle cellulaire, on dit que les activations de SPF et MPF permettent à la cellule de passer des …

A

… points de contrôle
= checkpoints

  • Deux temps très important pour la cellule
    . elle peut prendre une pause pour s’assurer que tout est en place
32
Q

Que sont les points de contrôle ?

A
  • Pour entrer en phase S
  • Pour entrer en phase M
  • Pour sortir de la phase M
33
Q

Points de contrôle S et M:

. MPF est activé après a, une fois pendant le CDC (sauf en b)

. SPF est activé après c, une fois dans le CDC (d)

A

a) la phase S
b) méiose

c) la phase M
d) l’ADN n’est répliqué qu’une fois

34
Q

MPF et SPF sont des a, des dimères d’une b et un c dont les niveaux cellulaires dépendent de d

A

a) kinases cycline dépendante (CDK)
b) kinase
c) cycline
d) la phase du CDC

35
Q

Qu’est ce qui différencie les deux facteurs SPF et MPF ?

A

L’indentié de la cycline qui active la CDK.

  • La CDK est la même mais la cycline est différente :

. cycline spécifique
. oriente la kinase à des subtrats nécessaires d’êtres phosphorylées pour rentrer dans la phase demandée

36
Q

Par quoi a été faite l’indentification de l’MPF ?

A

À partir d’un facteur ‘promouvoir de la maturation’ des oeufs chez la grenouille

! voir slide 46 à 49 !

37
Q

Expliquer l’activation du MPF.

A
  • MPF actif :
    . au moment ou la cycline attient sont maximum/niveau très élevé dans les extraits
    = kinase cycline dépendante
  • Quantité de cycline
    = facteur qui semble être le plus important pour activer MPF

! voir slide 50 !

38
Q

Vrai ou Faux ?

Chez les cellules animales évoluées il y a plusieurs cycline + plusieurs kinases cyclines dépendantes.

A

VRAI

39
Q

Qu’est la p34 ?

Pourquoi est-t-elle inactive et par quoi est-t-elle activée ?

A

Une serine/thréonine (S/T) kinase

. inactive sans cycline
CAR la boucle T de la protéine bloque le site actif

. p34-cycline est activé par la CAK (CDK activating kinase)
. ATP disponible pour la phosphorylation des substrats

! voir slide 51 - 52 !

40
Q

En plus de ‘T-loop’ qui sert à a, il y a un autre élément structural très important : b , qui sert à c

A

a) bloquer le site actif de la kinase
b) l’hélice PSTAIRE
c) lier la kinase avec une cycline

. MPF

41
Q

Qu’est ce qui différencie les deux cyclines ?

A

Les cyclines de la phase S on une hélice MRAIL ou ‘patch hydrophobe’
. suffisante pour permettre la kinase de reconnaître et lier les substarts nécessaires à la phase S

  • Sans MRAIL
    . liaisons d’autres substrats
  • Structure de tout cycline :
    . deux groupes de cinq hélices
42
Q

Vrai ou Faux ?

La liaison avec la cycline est un élément essentiel pour l’activation de la kinase p34.

A

VRAI

43
Q

Vrai ou Faux ?

Une liaison avec le cycline déplace la boucle T du site active de la kinase.

A

VRAI

44
Q

Quelles substrats sont phosphorylés par MPF pour entrer en phase M ?

A
  1. Condensines
    . associée au chromosomes
    . au début de la phase M
    = lorsqu’ils se condensent
  2. Lamines nucléaires
    . groupes de filaments intermedaires
    . tapissent la surface interne des F intermediares
  3. MAPs
    . associées avec les comportements de microtubules
    . changent l’instabilité dynamique des microtubules

! voir slide 55 !

45
Q

Décrire le 1er substart du MPF.

A

= cohésines et condensines
. condensines activées par phosphorylation

  • Tiennent les chromosomes ensembles
  • Choésines :
    . lie les chromatides soeurs à des brins d’ADN différents
  • Condensines :
    . lie ensemble les différentes parties du même brin d’ADN
    . empilation de l’ADN pour qu’il se condense
    = condensation des chromosomes
46
Q

Décrire le 2ème substart du MPF.

A

= lamines nucléaires
. filaments intermédiaires dans l’enveloppe nucléaire
. maintiennent la structure stable

  1. Phosphorylées pour leur désassamblage
  2. Dissociation du réseau du filaments
  3. Séparation des différentes parties de l’enveloppe nucléaire
  4. Libération des chromosomes condensés dans le cytoplasme
  5. Chromosomes condensés lie les microtubules dans le faisceau
47
Q

Décrire le 3ème substrat du MPF.

A

= MAP
. protéine accessoire aux microtubules
. aide à un remodelage du réseau

. infuence l’instabilité dynamique des MT

  1. Phosphoryler MAP
  2. Inhibation de MAP
  3. Augementation de l’instabilité dynamique
    . catastrophine > MAP
  4. MT se dépolymérisent plus rapidement
    = petits MT
  5. Augementation de la quantité de tubuline libre
    + modules de constructions
  6. MT se polymérisent à nouveau

BUT :
7. Plus de possibilité d’attraper un chromosome
. facilite la liaison MT-CR pour permettre les pôles de faisceaux de tirer sur eux

48
Q

Comment permettre la fin de la phase M ?

A
  • MPF est inactivé par une ubiquitine ligase
    = APC
    . cible la cycline pour la dégrader
  1. Liaison APC - CDC20
  2. Activation APC
  3. APC cible la cycline de la phase M liée à la kinase
  4. Ajout d’ubiquitines ciblées au protéasome
    . par liaisons covalentes pour la dégradation
  5. Fin de la phase M
    + déphosphorylation des substarts
    . ils reprennent tous leurs rôles initiaux
49
Q

Expliquer l’activation de l’APC.

A
  • S’active par liaison avec CDC20
  • CDC20 lie APC seulement quand :
  • Il est présent
    . a commencé d’être synthetiisé au début de la phase M
    (fin G2)
  • APC est phosphorylée par MPF
    . CDC20 lie APC-P
50
Q

Nommez d’autres cyclines (que la M) chez la levure bourgeonnante qui oscillent avec des phases différentes

A

Cyclines G1/S + de la phase S
. activent une CDK

MAIS changent la gamme de substrats phosphorylés
(que ceux de la phase M)

51
Q

Vrai ou Faux ?

Il y a une possibilité de phosphoryler plusieurs gammes de protéines différentes selon la quantité de cycline, qui oriente les kinases vers différents substrats.

A

VRAI

52
Q

Par quoi diffèrent les cyclines S et M ?

A

Deux motifs :

  • Site de phosphorylation SPXK
    . entre le site actif de la kinase
  • Motif RXL
    . lie le patch hydrophobe MRAIL sur la cycline de la phase S
53
Q

Expliquer le Rb.

A

= protéine rétinoblastome
. un des substrats de G1/S-CDK

  • Inhibiteur du FT E2F
  • Permet à la cellule de produire des protéines nécessaires à la réplication de l’ADN
    = impossible de rentrer en phase S avec la présence de rb
  • G1/S phosphoryle et inhibe Rb
    = libération d’E2F
    + rentrée en phase S
54
Q

Expliquer la protéine Cdc6.

A
  • Essentielle pour l’initiation de la réplication de l’ADN
  • Cdc6 synthétisée seulement en G1
    . puis ubiquitiné par SCF
    = réplication d’ADN se fait seulement une fois
  • CDC6 est une cible de la phase S
    . présente uniquement en G1
    = SPF permet la réplication de l’ADN seulement chez les noyaux en G1

! voir slide 64 !

55
Q

Que fait SCF ?

A

= ubiquitine ligase

  • Dégrade :

. CDC6
. cyclines G1/S lorsqu’elles sont phosphorylées par S-CDK
+ cyclines S lorsqu’elles sont phosphorylées par M-CDK

56
Q

Différence entre les deux ubiquitines ligases ?

A

= APC et SCF

  • APC
    . dégrade la cycline naturellement
  • SCF
    . cible doit être préalablement phosphorylée par MPF
57
Q

Décrire un survol du cycle cellulaire au niveau moléculaire chez la levure bourgeonnante.

A

! voir slide 67 !

  1. La taille de la cellule active G1/S - CDK
  2. G1/S - CDK active la synthèse de S cyclines
  3. SCF dégrade G1/S -cyclines phosphorylées par S - CDK
  4. S - CDK active la transcription des M-cyclines
  5. M - CDK est activée et phosphoryle S-cyclines et l’APC
  6. SCF dégrade S cyclines phosphorylées
  7. APC dégrade M - cyclines
58
Q

Que sont les substrats de CDK ?

A
  • S - CDK :
    . Rb
    . Cdc6
  • M - CDK
    . cohésines et condensines
    . lamines nucléaires
    . MAP
59
Q
  • MPF et SPF contiennent une a activée par une b
  • Les changements dans les niveaux cellulaires des cyclines sont contrôlés par leur c
  • La cycline détermine la d
A

a) S/T kinase = CDK
b) cycline

c) dégradation

d) spécificité de la kinase pour ses substrats

60
Q

Problèmes

A

20 -21

34

70

a23 BIO2162 - BIOCELL (8 decks)

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